MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016844	AACAAA	2	12	3231	3242	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378974637
2	NC_016844	TTTGAC	2	12	5642	5653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974639
3	NC_016844	GCAGGC	2	12	5659	5670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378974639
4	NC_016844	GTGTAT	2	12	6685	6696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378974639
5	NC_016844	TTAAAT	2	12	7965	7976	50 %	50 %	0 %	0 %	378974641
6	NC_016844	ATTGAA	2	12	8548	8559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016844	TTGAGA	2	12	27320	27331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974650
8	NC_016844	GAACAG	2	12	31304	31315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378974653
9	NC_016844	GTCTGG	2	12	31539	31550	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974653
10	NC_016844	TTTCCG	2	12	34169	34180	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378974655
11	NC_016844	TTGACG	2	12	38832	38843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974658
12	NC_016844	TGCATG	2	12	42334	42345	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974662
13	NC_016844	CCTCCC	2	12	49438	49449	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
14	NC_016844	CGTGCG	2	12	49793	49804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378974669
15	NC_016844	GTCTGG	2	12	50263	50274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974669
16	NC_016844	GCACGA	2	12	59448	59459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016844	TGTAAC	2	12	62401	62412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378974681
18	NC_016844	AGGGGC	2	12	65736	65747	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378974685
19	NC_016844	GCCATT	2	12	66856	66867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974686
20	NC_016844	TCTTGC	2	12	67085	67096	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378974686
21	NC_016844	TGAGCA	2	12	80020	80031	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378974703
22	NC_016844	CACTTT	2	12	84080	84091	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378974707
23	NC_016844	GGAGTA	2	12	85482	85493	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378974708
24	NC_016844	CGTGAA	2	12	85701	85712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378974708
25	NC_016844	ATTTGT	2	12	86822	86833	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378974709
26	NC_016844	ACGCTT	2	12	87010	87021	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974709
27	NC_016844	CGCTTG	2	12	92929	92940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974715
28	NC_016844	AGGGGA	2	12	97322	97333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974720
29	NC_016844	CGCACG	2	12	104086	104097	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378974727
30	NC_016844	GTCGGT	2	12	107688	107699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974731
31	NC_016844	ATCTGC	2	12	117194	117205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974737
32	NC_016844	TCTCAA	2	12	125129	125140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016844	TTTTAA	2	12	127471	127482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974743
34	NC_016844	TTGTCG	2	12	131511	131522	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378974746
35	NC_016844	TCTTGA	2	12	133366	133377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974748
36	NC_016844	GCAGAC	2	12	134717	134728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974748
37	NC_016844	CCGGAG	2	12	136213	136224	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378974749
38	NC_016844	CAGCTG	2	12	136437	136448	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974749
39	NC_016844	CCGTGC	2	12	147407	147418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974758
40	NC_016844	CGGCTG	2	12	148597	148608	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378974760
41	NC_016844	GGCTGG	4	24	150538	150561	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016844	CGGCTC	2	12	151235	151246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974766
43	NC_016844	CTGCGG	4	24	151751	151774	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016844	CGGCTC	2	12	152256	152267	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016844	CCGGAG	2	12	153614	153625	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378974770
46	NC_016844	CAGCTG	2	12	153838	153849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974770
47	NC_016844	TAAAAA	2	12	154169	154180	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016844	GCAAGC	2	12	155961	155972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974772
49	NC_016844	CGGTGG	2	12	158725	158736	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016844	GGGGGT	2	12	158753	158764	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016844	GTGTGC	2	12	174247	174258	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974789
52	NC_016844	ACTGTT	2	12	178403	178414	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974794
53	NC_016844	TGCGTA	2	12	179428	179439	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974794
54	NC_016844	TTGGGT	2	12	187983	187994	0 %	50 %	50 %	0 %	378974804
55	NC_016844	GGAAGA	2	12	193189	193200	50 %	0 %	50 %	0 %	378974810
56	NC_016844	GACACT	2	12	193350	193361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378974810
57	NC_016844	GGTGAG	2	12	193513	193524	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378974810
58	NC_016844	GAGAAA	2	12	197706	197717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974813
59	NC_016844	CGGTGA	2	12	206268	206279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378974823
60	NC_016844	AAAAGG	2	12	206533	206544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974823
61	NC_016844	TAAGGG	2	12	213320	213331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378974838
62	NC_016844	TTTGGT	2	12	213928	213939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974840
63	NC_016844	GTGTTT	2	12	222878	222889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974852
64	NC_016844	TGCGCT	2	12	223626	223637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974854
65	NC_016844	TCTTGT	2	12	225452	225463	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378974855
66	NC_016844	GTGTTT	2	12	225481	225492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974855
67	NC_016844	TATGCT	2	12	229483	229494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974859
68	NC_016844	GTGCGA	2	12	234733	234744	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016844	TCCTTC	2	12	236114	236125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016844	AGGAGA	2	12	236876	236887	50 %	0 %	50 %	0 %	378974861
71	NC_016844	GCAGAC	2	12	238961	238972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974865
72	NC_016844	GCGGGT	2	12	241602	241613	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378974867
73	NC_016844	GGAAAC	2	12	248153	248164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378974877
74	NC_016844	TTTCTG	2	12	248689	248700	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378974877
75	NC_016844	GGAATG	2	12	250511	250522	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378974878
76	NC_016844	ACCTTG	2	12	250885	250896	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974878
77	NC_016844	GTTTGT	2	12	259163	259174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974882
78	NC_016844	AACGCA	2	12	263032	263043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378974885
79	NC_016844	CATGCG	2	12	265955	265966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974888
80	NC_016844	TTTTTC	2	12	268950	268961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378974892
81	NC_016844	TACAAT	2	12	270146	270157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378974893
82	NC_016844	CCCTGC	2	12	272315	272326	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378974897
83	NC_016844	GTGCGA	2	12	283178	283189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016844	TCCTTC	2	12	284559	284570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016844	TCATTT	2	12	286721	286732	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378974906
86	NC_016844	GGGTGA	2	12	294701	294712	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378974915
87	NC_016844	CTGCCG	2	12	302946	302957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974921
88	NC_016844	ATGCGT	2	12	303084	303095	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974921
89	NC_016844	GCTGCA	2	12	303794	303805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974921
90	NC_016844	TGATGT	2	12	305016	305027	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378974922
91	NC_016844	GCAGTT	2	12	305197	305208	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974922
92	NC_016844	TGCGCT	2	12	306851	306862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974924
93	NC_016844	GGCTGC	2	12	310966	310977	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378974928
94	NC_016844	CTCCGT	2	12	315100	315111	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378974931
95	NC_016844	GAAATC	2	12	317482	317493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378974934
96	NC_016844	GTATGG	2	12	317724	317735	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378974934
97	NC_016844	GTGAAA	2	12	318287	318298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378974934
98	NC_016844	ACGGTC	2	12	321206	321217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974935
99	NC_016844	TGAGCG	2	12	323227	323238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378974936
100	NC_016844	CGGCAC	2	12	323679	323690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378974936
101	NC_016844	TGCAGG	2	12	325538	325549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378974938
102	NC_016844	GCACCG	2	12	331680	331691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378974945
103	NC_016844	CCGGAG	2	12	333054	333065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016844	CAGCTG	2	12	333278	333289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016844	TGGCAT	2	12	337573	337584	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974950
106	NC_016844	GCTGTG	2	12	341098	341109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974953
107	NC_016844	GTGCTC	2	12	341149	341160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974953
108	NC_016844	TGTTCG	2	12	341319	341330	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378974953
109	NC_016844	TTCATG	2	12	341435	341446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974953
110	NC_016844	ACCGTC	2	12	341471	341482	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378974953
111	NC_016844	TTTGGA	2	12	345132	345143	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378974953
112	NC_016844	GAGCGC	2	12	346593	346604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378974954
113	NC_016844	CTTTGA	2	12	347036	347047	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378974954
114	NC_016844	AATATA	2	12	355183	355194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016844	GTGTTG	2	12	372077	372088	0 %	50 %	50 %	0 %	378974974
116	NC_016844	TTTCCG	2	12	372446	372457	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016844	CAGGAG	2	12	374458	374469	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378974978
118	NC_016844	TGGGAG	2	12	374630	374641	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378974978
119	NC_016844	CTTTTG	2	12	377734	377745	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378974982
120	NC_016844	CGTGGT	2	12	380938	380949	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378974989
121	NC_016844	TCGCGT	2	12	390876	390887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975003
122	NC_016844	CTGAGC	2	12	394500	394511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975005
123	NC_016844	GTCATC	2	12	395661	395672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975006
124	NC_016844	GTGCGC	2	12	396243	396254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975007
125	NC_016844	TGCGAA	2	12	397292	397303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975008
126	NC_016844	CCGCGT	2	12	398116	398127	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975009
127	NC_016844	TGCAGA	2	12	399495	399506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975010
128	NC_016844	GCAGGA	2	12	399699	399710	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975010
129	NC_016844	CAGGGG	2	12	403658	403669	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378975015
130	NC_016844	GTACTG	2	12	406976	406987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975016
131	NC_016844	GGGGCG	2	12	410001	410012	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	378975019
132	NC_016844	TGTAGG	2	12	414765	414776	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378975024
133	NC_016844	AAGGGG	2	12	414964	414975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975024
134	NC_016844	ATTAAA	2	12	415444	415455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975024
135	NC_016844	GGGAGA	2	12	416667	416678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975025
136	NC_016844	TATTGA	2	12	419989	420000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378975029
137	NC_016844	GAAGAT	2	12	426897	426908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378975035
138	NC_016844	ACGCGC	2	12	429925	429936	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975038
139	NC_016844	TGCTCG	2	12	431793	431804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975041
140	NC_016844	TTTTTG	2	12	436389	436400	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378975044
141	NC_016844	TGACCG	2	12	437325	437336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975046
142	NC_016844	ACGCTT	2	12	438055	438066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975046
143	NC_016844	TCCGAC	2	12	441651	441662	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975050
144	NC_016844	GCGATT	2	12	442347	442358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975051
145	NC_016844	GGCCCT	2	12	445744	445755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975054
146	NC_016844	GTTGCC	2	12	448872	448883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975056
147	NC_016844	GCGTGT	2	12	451427	451438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378975058
148	NC_016844	TGTGCA	2	12	458004	458015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975065
149	NC_016844	CGTGCG	2	12	470412	470423	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975078
150	NC_016844	CGTGCC	2	12	472500	472511	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975080
151	NC_016844	ACGTGT	2	12	472798	472809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975080
152	NC_016844	CGCGTA	2	12	477567	477578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975085
153	NC_016844	ACAGGA	2	12	478138	478149	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378975086
154	NC_016844	ACTGCA	2	12	480144	480155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975087
155	NC_016844	GTGCGC	2	12	488193	488204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975094
156	NC_016844	ACGTGC	2	12	488862	488873	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975094
157	NC_016844	GGCAGC	2	12	489352	489363	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975094
158	NC_016844	GGTGCG	2	12	489835	489846	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378975094
159	NC_016844	GGGGAA	2	12	492363	492374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975098
160	NC_016844	GTGTGC	2	12	494918	494929	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378975102
161	NC_016844	GAGGGC	2	12	499780	499791	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_016844	TTTGAG	2	12	517295	517306	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378975118
163	NC_016844	GTGACG	2	12	519399	519410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975120
164	NC_016844	GCACCG	2	12	522089	522100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975121
165	NC_016844	CGTGCG	2	12	525737	525748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_016844	TGGAGA	2	12	525979	525990	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378975123
167	NC_016844	CGATGG	2	12	530055	530066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975127
168	NC_016844	CTGACG	2	12	531383	531394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975127
169	NC_016844	CTGTAT	2	12	533520	533531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378975130
170	NC_016844	GAATGG	2	12	537957	537968	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378975134
171	NC_016844	ATATTG	2	12	539887	539898	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378975136
172	NC_016844	TCACCG	2	12	541861	541872	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975138
173	NC_016844	CGTGTA	2	12	542302	542313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975138
174	NC_016844	AGCAGG	2	12	544146	544157	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975140
175	NC_016844	GAAATG	2	12	554260	554271	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378975148
176	NC_016844	TTTCCA	2	12	555477	555488	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378975149
177	NC_016844	ATGTGC	2	12	556353	556364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975149
178	NC_016844	AAAGGT	2	12	556955	556966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378975149
179	NC_016844	TCAGTA	2	12	560852	560863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975152
180	NC_016844	TAACCC	2	12	562644	562655	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_016844	ATACTG	2	12	562738	562749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
182	NC_016844	CGCGTG	2	12	564307	564318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975154
183	NC_016844	TCTTTT	2	12	568364	568375	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378975157
184	NC_016844	TCAGTA	2	12	569571	569582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975158
185	NC_016844	ATACCC	2	12	573734	573745	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378975162
186	NC_016844	AGCACC	2	12	580512	580523	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975169
187	NC_016844	AGCAGA	2	12	585696	585707	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378975178
188	NC_016844	GCGCTC	2	12	587495	587506	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975180
189	NC_016844	AGACAT	2	12	597955	597966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378975187
190	NC_016844	ACTACC	2	12	597983	597994	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378975187
191	NC_016844	ATATCG	2	12	598397	598408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975187
192	NC_016844	GCGCGA	2	12	607540	607551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975196
193	NC_016844	GCCCCT	2	12	607841	607852	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975196
194	NC_016844	CACACG	2	12	608574	608585	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975197
195	NC_016844	ACGGCC	2	12	615718	615729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975202
196	NC_016844	AAAGAA	2	12	616189	616200	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378975203
197	NC_016844	AAATAC	2	12	616694	616705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378975203
198	NC_016844	TCCTTT	2	12	617985	617996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975204
199	NC_016844	CGGTTG	2	12	623011	623022	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378975209
200	NC_016844	TCCGCG	2	12	624381	624392	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975210
201	NC_016844	TTTCAC	2	12	625493	625504	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378975210
202	NC_016844	AGCGCG	2	12	629249	629260	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975214
203	NC_016844	ACGCGC	2	12	632032	632043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975216
204	NC_016844	GTTATT	2	12	635181	635192	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378975219
205	NC_016844	GCACAC	2	12	641302	641313	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975222
206	NC_016844	AGCCAT	2	12	642746	642757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975224
207	NC_016844	TCAGAT	2	12	652671	652682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975231
208	NC_016844	CTCGCT	2	12	652925	652936	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975232
209	NC_016844	CACGCC	2	12	658904	658915	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378975238
210	NC_016844	CTCATC	2	12	659178	659189	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975239
211	NC_016844	CAAAAG	2	12	661081	661092	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378975240
212	NC_016844	CTGCTC	2	12	664072	664083	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975242
213	NC_016844	ACCTAC	2	12	666362	666373	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378975244
214	NC_016844	GGCGCA	2	12	670387	670398	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975247
215	NC_016844	GCACCG	2	12	671534	671545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975249
216	NC_016844	GCACCG	2	12	672322	672333	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975251
217	NC_016844	CAAAAT	2	12	673473	673484	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378975252
218	NC_016844	CCGGAG	2	12	674330	674341	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975252
219	NC_016844	CAGCTG	2	12	674554	674565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975252
220	NC_016844	TGCACG	2	12	681014	681025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975256
221	NC_016844	CGGTGT	2	12	681812	681823	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378975256
222	NC_016844	TGAGCG	2	12	685766	685777	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975259
223	NC_016844	TGCAAT	2	12	687961	687972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975260
224	NC_016844	TGTTTT	2	12	689196	689207	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378975261
225	NC_016844	CGGCCG	2	12	694894	694905	0 %	0 %	50 %	50 %	378975266
226	NC_016844	ATTGAG	2	12	695684	695695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975266
227	NC_016844	GCTTCT	2	12	696564	696575	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975266
228	NC_016844	ATACCC	2	12	697394	697405	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378975267
229	NC_016844	GAAAGA	2	12	697540	697551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975267
230	NC_016844	TTCTCC	2	12	699529	699540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
231	NC_016844	CAGGAT	2	12	712483	712494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975281
232	NC_016844	CCTCCG	2	12	717098	717109	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975284
233	NC_016844	CCTGTA	2	12	720623	720634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975288
234	NC_016844	TGCATT	2	12	723179	723190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378975291
235	NC_016844	CCCATC	2	12	724433	724444	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378975292
236	NC_016844	CTCATC	2	12	724784	724795	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975292
237	NC_016844	GTGTGG	2	12	727869	727880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975295
238	NC_016844	CCGGGC	2	12	728961	728972	0 %	0 %	50 %	50 %	378975297
239	NC_016844	CAGCAA	2	12	732234	732245	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378975300
240	NC_016844	CAGCAT	2	12	732246	732257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975300
241	NC_016844	AAGCGC	2	12	735935	735946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975301
242	NC_016844	TGCATA	2	12	736902	736913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975302
243	NC_016844	GCCAAT	2	12	737429	737440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975303
244	NC_016844	ACCGTA	2	12	738562	738573	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975304
245	NC_016844	AACCGC	2	12	740367	740378	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975305
246	NC_016844	ATACAT	2	12	755277	755288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378975320
247	NC_016844	TCTTGC	2	12	756581	756592	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975320
248	NC_016844	ATCTAG	2	12	760372	760383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975324
249	NC_016844	CCACAC	2	12	763440	763451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975326
250	NC_016844	GCCCCT	2	12	763778	763789	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975327
251	NC_016844	TTTCCG	2	12	764632	764643	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975328
252	NC_016844	ACGCGC	2	12	767033	767044	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
253	NC_016844	GACACC	2	12	768596	768607	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975332
254	NC_016844	GGCACA	2	12	772871	772882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975336
255	NC_016844	TTAAAG	2	12	778567	778578	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378975342
256	NC_016844	ATTCCC	2	12	781219	781230	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975345
257	NC_016844	AGTCCA	2	12	785339	785350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975347
258	NC_016844	CCTGCG	2	12	789730	789741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975353
259	NC_016844	ACGTGC	2	12	791188	791199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975354
260	NC_016844	CTGCGC	2	12	796483	796494	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975361
261	NC_016844	GGGCAG	2	12	796869	796880	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378975361
262	NC_016844	TGTGAC	2	12	799653	799664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975364
263	NC_016844	AACGGC	2	12	800577	800588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975365
264	NC_016844	CGGGGG	2	12	800597	800608	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	378975365
265	NC_016844	TTTCCA	2	12	801184	801195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378975366
266	NC_016844	GCATAC	2	12	803170	803181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975367
267	NC_016844	TTGGAA	2	12	804624	804635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975370
268	NC_016844	TAACGT	2	12	807525	807536	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975373
269	NC_016844	GCACTT	2	12	808553	808564	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975374
270	NC_016844	GAGCAA	2	12	810026	810037	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378975376
271	NC_016844	ACGCAG	2	12	810939	810950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_016844	GCGAGC	2	12	812096	812107	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975380
273	NC_016844	CATCTT	2	12	816059	816070	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378975382
274	NC_016844	AGAGCG	2	12	819534	819545	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975386
275	NC_016844	ACACGC	2	12	819774	819785	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
276	NC_016844	AACTCA	2	12	826107	826118	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378975393
277	NC_016844	GCACAC	2	12	828104	828115	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975395
278	NC_016844	GCAGGG	2	12	828226	828237	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
279	NC_016844	CCAGTC	2	12	833974	833985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975401
280	NC_016844	GCAAGC	2	12	850252	850263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975416
281	NC_016844	ACCCCT	2	12	851585	851596	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378975418
282	NC_016844	CAGAGA	2	12	853971	853982	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
283	NC_016844	GCATCT	2	12	864187	864198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975433
284	NC_016844	GTGCAC	2	12	870252	870263	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_016844	GGTATC	2	12	874076	874087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975441
286	NC_016844	CACGCG	2	12	877573	877584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975443
287	NC_016844	AAAGAC	2	12	882811	882822	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
288	NC_016844	TGCTCC	2	12	883948	883959	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975449
289	NC_016844	AAAACT	2	12	885544	885555	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378975450
290	NC_016844	CAAACA	2	12	886028	886039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975453
291	NC_016844	CCATCC	2	12	890760	890771	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_016844	CACCTT	2	12	892903	892914	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975461
293	NC_016844	CAGGTG	2	12	897107	897118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975466
294	NC_016844	AAAGAC	2	12	899815	899826	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378975470
295	NC_016844	TATCAG	2	12	902250	902261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975472
296	NC_016844	CTGCGC	2	12	905893	905904	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975474
297	NC_016844	GGCGCA	2	12	908056	908067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_016844	GCGATA	2	12	911429	911440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975477
299	NC_016844	TTTTCA	2	12	924577	924588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378975492
300	NC_016844	CTTCTG	3	18	925905	925922	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975493
301	NC_016844	CAAGCT	2	12	928872	928883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975494
302	NC_016844	ACAGGC	2	12	930779	930790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975494
303	NC_016844	GAGTGG	2	12	937418	937429	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378975497
304	NC_016844	CTTGCG	2	12	938617	938628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975499
305	NC_016844	TCGTAT	2	12	938854	938865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378975499
306	NC_016844	GCGCAA	2	12	940529	940540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975500
307	NC_016844	GCTCCT	2	12	941977	941988	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975502
308	NC_016844	GCGCTC	2	12	943099	943110	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975503
309	NC_016844	AAATGC	2	12	943686	943697	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378975504
310	NC_016844	GCAGGA	2	12	945697	945708	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975505
311	NC_016844	AAGCTC	2	12	948401	948412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975506
312	NC_016844	CTGCGC	2	12	951971	951982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975513
313	NC_016844	CAACAT	2	12	956962	956973	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378975519
314	NC_016844	CAAAAA	2	12	962297	962308	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378975524
315	NC_016844	TTCTCC	2	12	967411	967422	0 %	50 %	0 %	50 %	378975528
316	NC_016844	ACTCGA	2	12	967429	967440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975529
317	NC_016844	AGATCA	2	12	968817	968828	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378975530
318	NC_016844	CTGATA	2	12	971579	971590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975532
319	NC_016844	CCGGAG	2	12	978323	978334	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975539
320	NC_016844	GCAGGA	2	12	978670	978681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975539
321	NC_016844	CAGCTC	2	12	979005	979016	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975539
322	NC_016844	CCGGCT	2	12	981218	981229	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975539
323	NC_016844	ACCTGC	2	12	981396	981407	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975539
324	NC_016844	TCTTCA	2	12	982791	982802	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378975540
325	NC_016844	TCTGCG	2	12	989200	989211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975546
326	NC_016844	GGACGT	2	12	989783	989794	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975547
327	NC_016844	ACAAAC	2	12	989967	989978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975548
328	NC_016844	CCACGG	2	12	993297	993308	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975553
329	NC_016844	GAGCAG	2	12	995862	995873	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
330	NC_016844	CTTGCA	2	12	999832	999843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975562
331	NC_016844	CAGCGC	2	12	1000537	1000548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975562
332	NC_016844	GCTAAC	2	12	1004106	1004117	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975565
333	NC_016844	TACCGT	2	12	1004223	1004234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975565
334	NC_016844	TGGCGG	2	12	1010616	1010627	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378975572
335	NC_016844	ACGCTG	2	12	1010940	1010951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975572
336	NC_016844	ACTGAC	2	12	1017848	1017859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975577
337	NC_016844	GCGCGT	2	12	1020495	1020506	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975579
338	NC_016844	AAAAGA	3	18	1031962	1031979	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378975591
339	NC_016844	TGCCTC	2	12	1037920	1037931	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975598
340	NC_016844	CGGTTA	2	12	1045537	1045548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975606
341	NC_016844	CTCGCC	2	12	1046297	1046308	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975606
342	NC_016844	CATGTT	2	12	1051161	1051172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378975611
343	NC_016844	TTCGCC	2	12	1051233	1051244	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975611
344	NC_016844	CCCGCT	2	12	1051927	1051938	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975611
345	NC_016844	TCTTGC	2	12	1053023	1053034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378975612
346	NC_016844	GCCACC	2	12	1060490	1060501	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378975619
347	NC_016844	GGAGCC	2	12	1065331	1065342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975624
348	NC_016844	GGTGCG	2	12	1067547	1067558	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378975627
349	NC_016844	AGAGGA	2	12	1068334	1068345	50 %	0 %	50 %	0 %	378975628
350	NC_016844	GAGGTG	2	12	1070981	1070992	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378975631
351	NC_016844	TCTTTT	2	12	1073062	1073073	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378975632
352	NC_016844	ACGCAG	2	12	1076322	1076333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975637
353	NC_016844	TATGAG	2	12	1081456	1081467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975643
354	NC_016844	TGACGA	2	12	1090175	1090186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975646
355	NC_016844	ATCTGC	2	12	1096321	1096332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975652
356	NC_016844	AACTCC	2	12	1098523	1098534	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378975653
357	NC_016844	AAAGCG	2	12	1099284	1099295	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378975654
358	NC_016844	ACTGCA	2	12	1101329	1101340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975655
359	NC_016844	TAATTC	2	12	1104666	1104677	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378975658
360	NC_016844	CATGCA	2	12	1105781	1105792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975659
361	NC_016844	TTGCCA	2	12	1112907	1112918	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975666
362	NC_016844	GCCCTC	2	12	1114586	1114597	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378975668
363	NC_016844	CTGTGC	2	12	1115510	1115521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975669
364	NC_016844	CGCCTT	2	12	1117004	1117015	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975670
365	NC_016844	TCTGCA	2	12	1118593	1118604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975671
366	NC_016844	ATGCGT	2	12	1120409	1120420	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975675
367	NC_016844	GCTGAC	2	12	1126840	1126851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975679
368	NC_016844	TGCACG	2	12	1127238	1127249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975679
369	NC_016844	AATTTC	2	12	1128093	1128104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378975680
370	NC_016844	AGCCCC	2	12	1128966	1128977	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378975681
371	NC_016844	TCCTCG	2	12	1129981	1129992	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975682

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.