MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 3027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016844	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	378974634
2	NC_016844	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	378974634
3	NC_016844	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	378974634
4	NC_016844	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	378974634
5	NC_016844	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	378974634
6	NC_016844	TTTG	2	8	1530	1537	0 %	75 %	25 %	0 %	378974635
7	NC_016844	AACT	2	8	1633	1640	50 %	25 %	0 %	25 %	378974635
8	NC_016844	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	378974636
9	NC_016844	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	378974636
10	NC_016844	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	378974637
11	NC_016844	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	378974638
12	NC_016844	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	378974638
13	NC_016844	GCCC	2	8	4382	4389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_016844	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	378974639
15	NC_016844	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	378974639
16	NC_016844	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	378974639
17	NC_016844	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	378974639
18	NC_016844	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	378974639
19	NC_016844	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	378974639
20	NC_016844	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	378974639
21	NC_016844	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	378974639
22	NC_016844	GCGT	2	8	6765	6772	0 %	25 %	50 %	25 %	378974639
23	NC_016844	AGTT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	378974641
24	NC_016844	TTAC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	378974641
25	NC_016844	TTGC	2	8	7317	7324	0 %	50 %	25 %	25 %	378974641
26	NC_016844	GTCA	2	8	7488	7495	25 %	25 %	25 %	25 %	378974641
27	NC_016844	GGTT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016844	CCGT	2	8	9126	9133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016844	GGTA	2	8	9207	9214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016844	GCAT	2	8	10132	10139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016844	ATGT	2	8	10211	10218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016844	GTGG	2	8	10238	10245	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016844	GCTT	2	8	10621	10628	0 %	50 %	25 %	25 %	378974642
34	NC_016844	TGGA	2	8	11618	11625	25 %	25 %	50 %	0 %	378974642
35	NC_016844	AAGT	2	8	11842	11849	50 %	25 %	25 %	0 %	378974642
36	NC_016844	GAGC	2	8	12343	12350	25 %	0 %	50 %	25 %	378974642
37	NC_016844	GCGT	2	8	13219	13226	0 %	25 %	50 %	25 %	378974643
38	NC_016844	GTTT	2	8	13596	13603	0 %	75 %	25 %	0 %	378974643
39	NC_016844	GAAG	2	8	13654	13661	50 %	0 %	50 %	0 %	378974643
40	NC_016844	ACAT	2	8	13689	13696	50 %	25 %	0 %	25 %	378974643
41	NC_016844	AGGG	2	8	14107	14114	25 %	0 %	75 %	0 %	378974644
42	NC_016844	TTTC	2	8	14322	14329	0 %	75 %	0 %	25 %	378974644
43	NC_016844	AGAT	2	8	14980	14987	50 %	25 %	25 %	0 %	378974644
44	NC_016844	GCTC	2	8	15782	15789	0 %	25 %	25 %	50 %	378974644
45	NC_016844	GCTG	2	8	16212	16219	0 %	25 %	50 %	25 %	378974645
46	NC_016844	GTAC	2	8	16310	16317	25 %	25 %	25 %	25 %	378974645
47	NC_016844	TGCG	2	8	16694	16701	0 %	25 %	50 %	25 %	378974645
48	NC_016844	TTGG	2	8	17146	17153	0 %	50 %	50 %	0 %	378974645
49	NC_016844	GCAG	2	8	17501	17508	25 %	0 %	50 %	25 %	378974645
50	NC_016844	AAGG	2	8	17680	17687	50 %	0 %	50 %	0 %	378974645
51	NC_016844	GTGC	2	8	18154	18161	0 %	25 %	50 %	25 %	378974645
52	NC_016844	TTTA	2	8	18325	18332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016844	CGAT	2	8	18415	18422	25 %	25 %	25 %	25 %	378974646
54	NC_016844	CGTT	2	8	18638	18645	0 %	50 %	25 %	25 %	378974646
55	NC_016844	TATG	2	8	18684	18691	25 %	50 %	25 %	0 %	378974646
56	NC_016844	GTTA	2	8	19789	19796	25 %	50 %	25 %	0 %	378974647
57	NC_016844	GAAA	2	8	20641	20648	75 %	0 %	25 %	0 %	378974647
58	NC_016844	TGCG	2	8	20853	20860	0 %	25 %	50 %	25 %	378974647
59	NC_016844	GCTT	2	8	21173	21180	0 %	50 %	25 %	25 %	378974647
60	NC_016844	ACAA	2	8	22719	22726	75 %	0 %	0 %	25 %	378974648
61	NC_016844	GCAC	2	8	22858	22865	25 %	0 %	25 %	50 %	378974648
62	NC_016844	ATGT	2	8	23079	23086	25 %	50 %	25 %	0 %	378974648
63	NC_016844	CTTC	2	8	24290	24297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016844	AAAG	2	8	25260	25267	75 %	0 %	25 %	0 %	378974649
65	NC_016844	TTAT	2	8	25313	25320	25 %	75 %	0 %	0 %	378974649
66	NC_016844	GATT	2	8	25859	25866	25 %	50 %	25 %	0 %	378974650
67	NC_016844	AGCG	2	8	25997	26004	25 %	0 %	50 %	25 %	378974650
68	NC_016844	CCTT	2	8	26833	26840	0 %	50 %	0 %	50 %	378974650
69	NC_016844	GCAC	2	8	26939	26946	25 %	0 %	25 %	50 %	378974650
70	NC_016844	AGCG	2	8	27252	27259	25 %	0 %	50 %	25 %	378974650
71	NC_016844	CAGT	2	8	27343	27350	25 %	25 %	25 %	25 %	378974650
72	NC_016844	TGCG	2	8	27791	27798	0 %	25 %	50 %	25 %	378974651
73	NC_016844	CATC	2	8	27820	27827	25 %	25 %	0 %	50 %	378974651
74	NC_016844	AGTG	2	8	28053	28060	25 %	25 %	50 %	0 %	378974651
75	NC_016844	TTTG	2	8	28437	28444	0 %	75 %	25 %	0 %	378974651
76	NC_016844	AAAG	2	8	30937	30944	75 %	0 %	25 %	0 %	378974653
77	NC_016844	GCGG	2	8	31113	31120	0 %	0 %	75 %	25 %	378974653
78	NC_016844	TCGT	2	8	31279	31286	0 %	50 %	25 %	25 %	378974653
79	NC_016844	TGTC	2	8	31419	31426	0 %	50 %	25 %	25 %	378974653
80	NC_016844	ATCC	2	8	32109	32116	25 %	25 %	0 %	50 %	378974653
81	NC_016844	CTCG	2	8	32118	32125	0 %	25 %	25 %	50 %	378974653
82	NC_016844	GTAC	2	8	32142	32149	25 %	25 %	25 %	25 %	378974653
83	NC_016844	TTCA	2	8	32454	32461	25 %	50 %	0 %	25 %	378974653
84	NC_016844	GTTG	2	8	32483	32490	0 %	50 %	50 %	0 %	378974653
85	NC_016844	CAAA	2	8	32792	32799	75 %	0 %	0 %	25 %	378974653
86	NC_016844	TGCG	2	8	33239	33246	0 %	25 %	50 %	25 %	378974654
87	NC_016844	CCGC	2	8	33642	33649	0 %	0 %	25 %	75 %	378974654
88	NC_016844	GCCG	2	8	34514	34521	0 %	0 %	50 %	50 %	378974655
89	NC_016844	ATTG	2	8	34800	34807	25 %	50 %	25 %	0 %	378974655
90	NC_016844	GACG	2	8	34951	34958	25 %	0 %	50 %	25 %	378974655
91	NC_016844	CGTG	2	8	35745	35752	0 %	25 %	50 %	25 %	378974656
92	NC_016844	GGGT	2	8	36288	36295	0 %	25 %	75 %	0 %	378974656
93	NC_016844	GACA	2	8	36430	36437	50 %	0 %	25 %	25 %	378974656
94	NC_016844	TAAG	2	8	36813	36820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016844	GTGC	2	8	37189	37196	0 %	25 %	50 %	25 %	378974657
96	NC_016844	GCGA	2	8	37471	37478	25 %	0 %	50 %	25 %	378974657
97	NC_016844	ACGT	2	8	37679	37686	25 %	25 %	25 %	25 %	378974657
98	NC_016844	GAGC	2	8	37734	37741	25 %	0 %	50 %	25 %	378974657
99	NC_016844	TGCG	2	8	38048	38055	0 %	25 %	50 %	25 %	378974657
100	NC_016844	CTTG	2	8	38422	38429	0 %	50 %	25 %	25 %	378974658
101	NC_016844	ACGA	2	8	38549	38556	50 %	0 %	25 %	25 %	378974658
102	NC_016844	GACT	2	8	39606	39613	25 %	25 %	25 %	25 %	378974658
103	NC_016844	GGTT	2	8	39625	39632	0 %	50 %	50 %	0 %	378974658
104	NC_016844	GTAT	2	8	39936	39943	25 %	50 %	25 %	0 %	378974658
105	NC_016844	TTTC	2	8	40096	40103	0 %	75 %	0 %	25 %	378974659
106	NC_016844	TCGG	2	8	40169	40176	0 %	25 %	50 %	25 %	378974659
107	NC_016844	TCCA	2	8	40473	40480	25 %	25 %	0 %	50 %	378974660
108	NC_016844	GAAA	2	8	41026	41033	75 %	0 %	25 %	0 %	378974660
109	NC_016844	AGAA	2	8	41217	41224	75 %	0 %	25 %	0 %	378974661
110	NC_016844	GAAA	2	8	41625	41632	75 %	0 %	25 %	0 %	378974661
111	NC_016844	CATC	2	8	43822	43829	25 %	25 %	0 %	50 %	378974664
112	NC_016844	GCTC	2	8	44238	44245	0 %	25 %	25 %	50 %	378974664
113	NC_016844	GGGT	2	8	44280	44287	0 %	25 %	75 %	0 %	378974664
114	NC_016844	ACCC	2	8	44489	44496	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_016844	GCAC	2	8	45359	45366	25 %	0 %	25 %	50 %	378974665
116	NC_016844	AGGA	2	8	45741	45748	50 %	0 %	50 %	0 %	378974666
117	NC_016844	TTAC	2	8	47158	47165	25 %	50 %	0 %	25 %	378974668
118	NC_016844	TCCC	2	8	47202	47209	0 %	25 %	0 %	75 %	378974668
119	NC_016844	TGGG	2	8	47826	47833	0 %	25 %	75 %	0 %	378974668
120	NC_016844	GTCG	2	8	48719	48726	0 %	25 %	50 %	25 %	378974668
121	NC_016844	GGAC	2	8	48769	48776	25 %	0 %	50 %	25 %	378974668
122	NC_016844	CGCC	2	8	49293	49300	0 %	0 %	25 %	75 %	378974668
123	NC_016844	AGCG	2	8	49426	49433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016844	CGGG	2	8	49494	49501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016844	GAGG	2	8	49931	49938	25 %	0 %	75 %	0 %	378974669
126	NC_016844	GCAG	2	8	50847	50854	25 %	0 %	50 %	25 %	378974670
127	NC_016844	TTCT	2	8	51461	51468	0 %	75 %	0 %	25 %	378974670
128	NC_016844	GGGC	2	8	52165	52172	0 %	0 %	75 %	25 %	378974670
129	NC_016844	ATGC	2	8	52822	52829	25 %	25 %	25 %	25 %	378974671
130	NC_016844	AATC	2	8	53324	53331	50 %	25 %	0 %	25 %	378974671
131	NC_016844	ATTA	2	8	53352	53359	50 %	50 %	0 %	0 %	378974671
132	NC_016844	CAAA	2	8	53694	53701	75 %	0 %	0 %	25 %	378974671
133	NC_016844	GGAA	2	8	54317	54324	50 %	0 %	50 %	0 %	378974671
134	NC_016844	CAGG	2	8	54521	54528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016844	GTAC	2	8	54534	54541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016844	CATC	2	8	54678	54685	25 %	25 %	0 %	50 %	378974672
137	NC_016844	TTTC	2	8	54767	54774	0 %	75 %	0 %	25 %	378974672
138	NC_016844	CTTT	2	8	54897	54904	0 %	75 %	0 %	25 %	378974672
139	NC_016844	TCGT	2	8	55363	55370	0 %	50 %	25 %	25 %	378974672
140	NC_016844	CTAA	2	8	56043	56050	50 %	25 %	0 %	25 %	378974674
141	NC_016844	TATG	2	8	56200	56207	25 %	50 %	25 %	0 %	378974674
142	NC_016844	TCCT	2	8	56417	56424	0 %	50 %	0 %	50 %	378974674
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