MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016844	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016844	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016844	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016844	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016844	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016844	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016844	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016844	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016844	GA	3	6	12510	12515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016844	GT	3	6	12518	12523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016844	GA	4	8	24345	24352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016844	CA	3	6	24383	24388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016844	TC	3	6	24424	24429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016844	GA	4	8	24489	24496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016844	TC	3	6	24569	24574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016844	AT	3	6	28935	28940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016844	CG	3	6	33998	34003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016844	GC	3	6	35441	35446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016844	GA	3	6	46727	46732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016844	CA	3	6	55782	55787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016844	GT	3	6	55794	55799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016844	TG	3	6	62906	62911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016844	AG	3	6	72828	72833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016844	CG	3	6	72913	72918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016844	GT	3	6	79039	79044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016844	GC	3	6	80798	80803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016844	AG	3	6	82372	82377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016844	CA	3	6	94416	94421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016844	TG	3	6	97422	97427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016844	CG	3	6	102784	102789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016844	GC	3	6	105852	105857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016844	CT	3	6	106674	106679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016844	GA	3	6	106685	106690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016844	TG	3	6	108190	108195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016844	TA	3	6	113760	113765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016844	CA	3	6	122251	122256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016844	GC	3	6	124686	124691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016844	TG	3	6	124752	124757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016844	TG	4	8	124948	124955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016844	GT	3	6	125174	125179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016844	TG	3	6	129817	129822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016844	GT	3	6	129881	129886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016844	AG	3	6	132790	132795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016844	GT	3	6	139646	139651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016844	CG	3	6	140978	140983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016844	CT	3	6	141023	141028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016844	GC	3	6	142957	142962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016844	CT	3	6	143054	143059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016844	CG	3	6	147604	147609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016844	CG	3	6	154311	154316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016844	CG	3	6	157592	157597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016844	GC	3	6	157644	157649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016844	GC	3	6	157699	157704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016844	CG	4	8	157713	157720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016844	GT	3	6	157905	157910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016844	TG	4	8	157935	157942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016844	GC	3	6	157996	158001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016844	GT	3	6	158006	158011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016844	TC	3	6	169294	169299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016844	GC	3	6	169575	169580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016844	TG	3	6	170124	170129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016844	GC	3	6	170187	170192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016844	GC	3	6	170444	170449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016844	CT	3	6	177087	177092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016844	CG	3	6	184500	184505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016844	GC	3	6	204337	204342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016844	GT	3	6	205791	205796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016844	GT	4	8	206158	206165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016844	TC	3	6	219117	219122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016844	GC	3	6	219904	219909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016844	TG	3	6	221903	221908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016844	TG	4	8	222060	222067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016844	TG	3	6	228680	228685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016844	TG	3	6	230313	230318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016844	TG	4	8	231188	231195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016844	GC	3	6	231211	231216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016844	AC	3	6	231624	231629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016844	CA	3	6	232120	232125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016844	AC	3	6	232538	232543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016844	AC	3	6	232707	232712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016844	TC	3	6	232946	232951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016844	AG	3	6	233381	233386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016844	CG	3	6	233453	233458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016844	AG	3	6	233521	233526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016844	AG	3	6	234457	234462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016844	GA	3	6	234870	234875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016844	AC	3	6	234902	234907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016844	AC	3	6	237821	237826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016844	GA	3	6	241512	241517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016844	GT	3	6	242202	242207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016844	GT	3	6	242270	242275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016844	TG	3	6	243031	243036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016844	TG	3	6	246568	246573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016844	TG	3	6	254641	254646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016844	GT	3	6	264072	264077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016844	GT	3	6	264124	264129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016844	GT	3	6	266715	266720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016844	GT	3	6	268302	268307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016844	GC	3	6	271944	271949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016844	CA	3	6	271997	272002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016844	GC	3	6	273456	273461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016844	TG	3	6	275361	275366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016844	TG	4	8	279623	279630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016844	GC	3	6	279646	279651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016844	AC	3	6	280059	280064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016844	CA	3	6	280555	280560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016844	AC	3	6	280973	280978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016844	AC	3	6	281142	281147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016844	TC	3	6	281381	281386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016844	AG	3	6	281826	281831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016844	CG	3	6	281898	281903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016844	AG	3	6	281966	281971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016844	AG	3	6	282902	282907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016844	GA	3	6	283315	283320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016844	AC	3	6	283347	283352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016844	GA	3	6	291408	291413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016844	GC	3	6	293604	293609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016844	TC	3	6	293644	293649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016844	GC	3	6	295366	295371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016844	GT	3	6	298054	298059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016844	GT	3	6	298185	298190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016844	AG	3	6	299080	299085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016844	TC	3	6	312221	312226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016844	GA	3	6	312315	312320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016844	CG	3	6	323919	323924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016844	TG	3	6	323976	323981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016844	GC	4	8	324000	324007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016844	GT	3	6	326797	326802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016844	GT	3	6	327991	327996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016844	GA	3	6	328024	328029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016844	CA	3	6	333143	333148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016844	CA	3	6	335931	335936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016844	GT	3	6	337270	337275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016844	CG	3	6	353108	353113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016844	GT	3	6	378146	378151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016844	TG	3	6	380190	380195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016844	TG	3	6	380781	380786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016844	GT	3	6	380794	380799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016844	CG	3	6	395589	395594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016844	AG	3	6	395941	395946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016844	CG	4	8	397595	397602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016844	CA	5	10	406440	406449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016844	GC	3	6	408348	408353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016844	GT	3	6	423932	423937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016844	GC	3	6	431125	431130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016844	TG	4	8	432076	432083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016844	TG	3	6	432086	432091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016844	AG	3	6	432105	432110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016844	GC	3	6	436191	436196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016844	CG	4	8	436198	436205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016844	CG	3	6	439692	439697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016844	CT	3	6	448983	448988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_016844	GT	3	6	453003	453008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016844	TG	3	6	473060	473065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_016844	CG	3	6	493897	493902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.