MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 4159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016844	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	378974634
2	NC_016844	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	378974634
3	NC_016844	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	378974634
4	NC_016844	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	378974634
5	NC_016844	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	378974635
6	NC_016844	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	378974636
7	NC_016844	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	378974636
8	NC_016844	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	378974637
9	NC_016844	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	378974637
10	NC_016844	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	378974637
11	NC_016844	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	378974637
12	NC_016844	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	378974638
13	NC_016844	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	378974638
14	NC_016844	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	378974639
15	NC_016844	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	378974639
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17	NC_016844	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	378974639
18	NC_016844	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	378974639
19	NC_016844	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	378974641
20	NC_016844	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	378974641
21	NC_016844	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	378974641
22	NC_016844	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	378974642
23	NC_016844	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	378974642
24	NC_016844	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	378974642
25	NC_016844	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	378974642
26	NC_016844	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	378974642
27	NC_016844	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	378974642
28	NC_016844	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	378974642
29	NC_016844	GC	3	6	12612	12617	0 %	0 %	50 %	50 %	378974643
30	NC_016844	GC	3	6	13059	13064	0 %	0 %	50 %	50 %	378974643
31	NC_016844	GT	3	6	13142	13147	0 %	50 %	50 %	0 %	378974643
32	NC_016844	CA	4	8	13234	13241	50 %	0 %	0 %	50 %	378974643
33	NC_016844	GA	3	6	13318	13323	50 %	0 %	50 %	0 %	378974643
34	NC_016844	GC	3	6	13529	13534	0 %	0 %	50 %	50 %	378974643
35	NC_016844	CT	4	8	13578	13585	0 %	50 %	0 %	50 %	378974643
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41	NC_016844	CG	3	6	16494	16499	0 %	0 %	50 %	50 %	378974645
42	NC_016844	GT	4	8	16825	16832	0 %	50 %	50 %	0 %	378974645
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49	NC_016844	GT	3	6	18261	18266	0 %	50 %	50 %	0 %	378974645
50	NC_016844	AT	3	6	18648	18653	50 %	50 %	0 %	0 %	378974646
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52	NC_016844	GC	3	6	18754	18759	0 %	0 %	50 %	50 %	378974646
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61	NC_016844	CG	3	6	22422	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	378974648
62	NC_016844	AC	3	6	22429	22434	50 %	0 %	0 %	50 %	378974648
63	NC_016844	GT	3	6	22592	22597	0 %	50 %	50 %	0 %	378974648
64	NC_016844	CG	3	6	23212	23217	0 %	0 %	50 %	50 %	378974648
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109	NC_016844	CG	3	6	36636	36641	0 %	0 %	50 %	50 %	378974656
110	NC_016844	TG	3	6	36893	36898	0 %	50 %	50 %	0 %	378974657
111	NC_016844	GT	3	6	36967	36972	0 %	50 %	50 %	0 %	378974657
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119	NC_016844	TG	3	6	41097	41102	0 %	50 %	50 %	0 %	378974661
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122	NC_016844	CA	3	6	41649	41654	50 %	0 %	0 %	50 %	378974661
123	NC_016844	CA	3	6	41696	41701	50 %	0 %	0 %	50 %	378974661
124	NC_016844	GT	3	6	42369	42374	0 %	50 %	50 %	0 %	378974662
125	NC_016844	CT	3	6	42795	42800	0 %	50 %	0 %	50 %	378974662
126	NC_016844	AG	3	6	42859	42864	50 %	0 %	50 %	0 %	378974662
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133	NC_016844	CG	3	6	45196	45201	0 %	0 %	50 %	50 %	378974665
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