MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016843	AAAGT	2	10	1370	1379	60 %	20 %	20 %	0 %	378973568
2	NC_016843	AGCAC	2	10	1683	1692	40 %	0 %	20 %	40 %	378973569
3	NC_016843	CGAAG	2	10	4771	4780	40 %	0 %	40 %	20 %	378973573
4	NC_016843	ATCGG	2	10	7147	7156	20 %	20 %	40 %	20 %	378973575
5	NC_016843	AAGGA	2	10	9497	9506	60 %	0 %	40 %	0 %	378973576
6	NC_016843	GAAAG	2	10	11082	11091	60 %	0 %	40 %	0 %	378973577
7	NC_016843	CTGTG	2	10	11273	11282	0 %	40 %	40 %	20 %	378973577
8	NC_016843	AGGGA	2	10	12402	12411	40 %	0 %	60 %	0 %	378973578
9	NC_016843	CTGCG	2	10	15903	15912	0 %	20 %	40 %	40 %	378973581
10	NC_016843	GTTTT	2	10	18346	18355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016843	TTGCG	2	10	19722	19731	0 %	40 %	40 %	20 %	378973583
12	NC_016843	GTTTT	2	10	20301	20310	0 %	80 %	20 %	0 %	378973583
13	NC_016843	TGCGA	2	10	22065	22074	20 %	20 %	40 %	20 %	378973584
14	NC_016843	TACCG	2	10	22205	22214	20 %	20 %	20 %	40 %	378973584
15	NC_016843	GCCAC	2	10	22300	22309	20 %	0 %	20 %	60 %	378973584
16	NC_016843	AAGGG	2	10	22902	22911	40 %	0 %	60 %	0 %	378973584
17	NC_016843	CGGTG	2	10	23469	23478	0 %	20 %	60 %	20 %	378973584
18	NC_016843	GTATC	2	10	26079	26088	20 %	40 %	20 %	20 %	378973586
19	NC_016843	GGTGG	2	10	26986	26995	0 %	20 %	80 %	0 %	378973586
20	NC_016843	TATTT	2	10	27712	27721	20 %	80 %	0 %	0 %	378973587
21	NC_016843	CTGCG	2	10	27778	27787	0 %	20 %	40 %	40 %	378973587
22	NC_016843	TGCGC	2	10	29966	29975	0 %	20 %	40 %	40 %	378973589
23	NC_016843	TCCAG	2	10	30792	30801	20 %	20 %	20 %	40 %	378973589
24	NC_016843	TGGGG	2	10	31350	31359	0 %	20 %	80 %	0 %	378973589
25	NC_016843	AAGAT	2	10	33656	33665	60 %	20 %	20 %	0 %	378973590
26	NC_016843	AAAGT	2	10	36210	36219	60 %	20 %	20 %	0 %	378973592
27	NC_016843	GTTGT	2	10	36310	36319	0 %	60 %	40 %	0 %	378973592
28	NC_016843	GATGT	2	10	37373	37382	20 %	40 %	40 %	0 %	378973593
29	NC_016843	TGCAT	2	10	38013	38022	20 %	40 %	20 %	20 %	378973593
30	NC_016843	GGTCA	2	10	39200	39209	20 %	20 %	40 %	20 %	378973594
31	NC_016843	CGGGT	2	10	39310	39319	0 %	20 %	60 %	20 %	378973594
32	NC_016843	TTTTC	2	10	40336	40345	0 %	80 %	0 %	20 %	378973596
33	NC_016843	TGCTG	2	10	43277	43286	0 %	40 %	40 %	20 %	378973599
34	NC_016843	ACGTA	2	10	43478	43487	40 %	20 %	20 %	20 %	378973599
35	NC_016843	CGTCG	2	10	44170	44179	0 %	20 %	40 %	40 %	378973600
36	NC_016843	ACATA	2	10	45641	45650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016843	TTTTG	2	10	46795	46804	0 %	80 %	20 %	0 %	378973603
38	NC_016843	TGTTT	2	10	47641	47650	0 %	80 %	20 %	0 %	378973604
39	NC_016843	AGTTG	2	10	49265	49274	20 %	40 %	40 %	0 %	378973604
40	NC_016843	GCGCA	2	10	49575	49584	20 %	0 %	40 %	40 %	378973605
41	NC_016843	GCGCA	2	10	50735	50744	20 %	0 %	40 %	40 %	378973606
42	NC_016843	TGCAG	2	10	52866	52875	20 %	20 %	40 %	20 %	378973607
43	NC_016843	CGCTG	2	10	53790	53799	0 %	20 %	40 %	40 %	378973607
44	NC_016843	GCTAC	2	10	54154	54163	20 %	20 %	20 %	40 %	378973607
45	NC_016843	TCGCT	2	10	54191	54200	0 %	40 %	20 %	40 %	378973607
46	NC_016843	ATGCT	2	10	55482	55491	20 %	40 %	20 %	20 %	378973609
47	NC_016843	CTGCA	2	10	56885	56894	20 %	20 %	20 %	40 %	378973611
48	NC_016843	ACCCA	2	10	58686	58695	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_016843	GCAGG	2	10	58859	58868	20 %	0 %	60 %	20 %	378973614
50	NC_016843	TCGTG	2	10	59510	59519	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016843	CTGCA	2	10	59839	59848	20 %	20 %	20 %	40 %	378973615
52	NC_016843	TCAAA	2	10	60362	60371	60 %	20 %	0 %	20 %	378973615
53	NC_016843	CCGCG	2	10	61704	61713	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_016843	GCCAC	2	10	63806	63815	20 %	0 %	20 %	60 %	378973618
55	NC_016843	TGCCT	2	10	65579	65588	0 %	40 %	20 %	40 %	378973621
56	NC_016843	TGAAG	2	10	66056	66065	40 %	20 %	40 %	0 %	378973621
57	NC_016843	TGGGG	2	10	66658	66667	0 %	20 %	80 %	0 %	378973622
58	NC_016843	CGTTG	2	10	67713	67722	0 %	40 %	40 %	20 %	378973623
59	NC_016843	TGAGT	2	10	67734	67743	20 %	40 %	40 %	0 %	378973623
60	NC_016843	CACGG	2	10	68032	68041	20 %	0 %	40 %	40 %	378973623
61	NC_016843	CAGAG	2	10	68851	68860	40 %	0 %	40 %	20 %	378973623
62	NC_016843	CGCTT	2	10	69196	69205	0 %	40 %	20 %	40 %	378973625
63	NC_016843	AGCGT	2	10	71082	71091	20 %	20 %	40 %	20 %	378973629
64	NC_016843	GAAAA	2	10	76659	76668	80 %	0 %	20 %	0 %	378973638
65	NC_016843	AATAA	2	10	77713	77722	80 %	20 %	0 %	0 %	378973638
66	NC_016843	GCGCC	2	10	79348	79357	0 %	0 %	40 %	60 %	378973640
67	NC_016843	TGGTG	2	10	80862	80871	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016843	CGTGT	2	10	81004	81013	0 %	40 %	40 %	20 %	378973642
69	NC_016843	ATGCA	2	10	83669	83678	40 %	20 %	20 %	20 %	378973644
70	NC_016843	GCACC	2	10	86609	86618	20 %	0 %	20 %	60 %	378973646
71	NC_016843	CGCAC	2	10	87070	87079	20 %	0 %	20 %	60 %	378973646
72	NC_016843	GTACC	2	10	88946	88955	20 %	20 %	20 %	40 %	378973647
73	NC_016843	TTTGC	2	10	90648	90657	0 %	60 %	20 %	20 %	378973650
74	NC_016843	TGGTG	2	10	92018	92027	0 %	40 %	60 %	0 %	378973650
75	NC_016843	CGTGT	2	10	92274	92283	0 %	40 %	40 %	20 %	378973651
76	NC_016843	GGTAT	2	10	92288	92297	20 %	40 %	40 %	0 %	378973651
77	NC_016843	TCGCT	2	10	93124	93133	0 %	40 %	20 %	40 %	378973652
78	NC_016843	GCACA	2	10	94764	94773	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_016843	CGTAT	2	10	96103	96112	20 %	40 %	20 %	20 %	378973655
80	NC_016843	CGTAC	2	10	96394	96403	20 %	20 %	20 %	40 %	378973656
81	NC_016843	CCCGT	2	10	96561	96570	0 %	20 %	20 %	60 %	378973656
82	NC_016843	AAGGA	2	10	98346	98355	60 %	0 %	40 %	0 %	378973658
83	NC_016843	ACTGC	2	10	100321	100330	20 %	20 %	20 %	40 %	378973660
84	NC_016843	TCCTC	2	10	102354	102363	0 %	40 %	0 %	60 %	378973662
85	NC_016843	CTGCT	2	10	103450	103459	0 %	40 %	20 %	40 %	378973663
86	NC_016843	CTACT	2	10	103513	103522	20 %	40 %	0 %	40 %	378973663
87	NC_016843	GCGGT	2	10	104021	104030	0 %	20 %	60 %	20 %	378973664
88	NC_016843	GTGCT	2	10	105703	105712	0 %	40 %	40 %	20 %	378973664
89	NC_016843	GCGTC	2	10	107111	107120	0 %	20 %	40 %	40 %	378973667
90	NC_016843	ACCTG	2	10	107726	107735	20 %	20 %	20 %	40 %	378973668
91	NC_016843	GAACG	2	10	108042	108051	40 %	0 %	40 %	20 %	378973668
92	NC_016843	GTTCC	2	10	108371	108380	0 %	40 %	20 %	40 %	378973669
93	NC_016843	CCTCG	2	10	110517	110526	0 %	20 %	20 %	60 %	378973671
94	NC_016843	CTGCG	2	10	112591	112600	0 %	20 %	40 %	40 %	378973672
95	NC_016843	TTCGT	2	10	112673	112682	0 %	60 %	20 %	20 %	378973672
96	NC_016843	GGACG	2	10	113190	113199	20 %	0 %	60 %	20 %	378973672
97	NC_016843	GATGT	2	10	113371	113380	20 %	40 %	40 %	0 %	378973672
98	NC_016843	GATTT	2	10	114201	114210	20 %	60 %	20 %	0 %	378973673
99	NC_016843	TCAGA	2	10	117428	117437	40 %	20 %	20 %	20 %	378973674
100	NC_016843	GCAGA	2	10	118428	118437	40 %	0 %	40 %	20 %	378973674
101	NC_016843	ACAGA	2	10	119783	119792	60 %	0 %	20 %	20 %	378973675
102	NC_016843	GGGAG	2	10	119989	119998	20 %	0 %	80 %	0 %	378973675
103	NC_016843	GTGCG	2	10	120120	120129	0 %	20 %	60 %	20 %	378973675
104	NC_016843	AGGAA	2	10	120277	120286	60 %	0 %	40 %	0 %	378973675
105	NC_016843	TACTG	2	10	120814	120823	20 %	40 %	20 %	20 %	378973676
106	NC_016843	CGTCA	2	10	121727	121736	20 %	20 %	20 %	40 %	378973676
107	NC_016843	TCTTT	2	10	122582	122591	0 %	80 %	0 %	20 %	378973677
108	NC_016843	CGCAG	2	10	124386	124395	20 %	0 %	40 %	40 %	378973678
109	NC_016843	AGCAC	2	10	124422	124431	40 %	0 %	20 %	40 %	378973678
110	NC_016843	CATTG	2	10	126716	126725	20 %	40 %	20 %	20 %	378973679
111	NC_016843	CCGTG	2	10	127077	127086	0 %	20 %	40 %	40 %	378973680
112	NC_016843	AACCA	2	10	128801	128810	60 %	0 %	0 %	40 %	378973681
113	NC_016843	AAAAG	2	10	129452	129461	80 %	0 %	20 %	0 %	378973681
114	NC_016843	TTATC	2	10	130067	130076	20 %	60 %	0 %	20 %	378973682
115	NC_016843	CGCGC	2	10	132202	132211	0 %	0 %	40 %	60 %	378973684
116	NC_016843	GCGAT	2	10	134525	134534	20 %	20 %	40 %	20 %	378973685
117	NC_016843	TGTTT	2	10	135947	135956	0 %	80 %	20 %	0 %	378973686
118	NC_016843	GTCTT	2	10	137134	137143	0 %	60 %	20 %	20 %	378973687
119	NC_016843	GGTGC	2	10	139671	139680	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016843	ACCAA	2	10	142258	142267	60 %	0 %	0 %	40 %	378973692
121	NC_016843	AGCCA	2	10	142730	142739	40 %	0 %	20 %	40 %	378973692
122	NC_016843	GCAGC	2	10	145444	145453	20 %	0 %	40 %	40 %	378973693
123	NC_016843	TCCGT	2	10	146687	146696	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016843	GGATC	2	10	147505	147514	20 %	20 %	40 %	20 %	378973695
125	NC_016843	CTTGC	2	10	148892	148901	0 %	40 %	20 %	40 %	378973697
126	NC_016843	GTTTG	2	10	150946	150955	0 %	60 %	40 %	0 %	378973702
127	NC_016843	TGTTT	2	10	153391	153400	0 %	80 %	20 %	0 %	378973707
128	NC_016843	GGTCT	2	10	154426	154435	0 %	40 %	40 %	20 %	378973708
129	NC_016843	GGTCT	2	10	155655	155664	0 %	40 %	40 %	20 %	378973709
130	NC_016843	CGGGG	2	10	157029	157038	0 %	0 %	80 %	20 %	378973710
131	NC_016843	GCAAG	2	10	159505	159514	40 %	0 %	40 %	20 %	378973713
132	NC_016843	TGCCT	2	10	164031	164040	0 %	40 %	20 %	40 %	378973719
133	NC_016843	AGAGG	2	10	166119	166128	40 %	0 %	60 %	0 %	378973721
134	NC_016843	GCAGC	2	10	166823	166832	20 %	0 %	40 %	40 %	378973721
135	NC_016843	TGAAG	2	10	168319	168328	40 %	20 %	40 %	0 %	378973722
136	NC_016843	CGGTA	2	10	171669	171678	20 %	20 %	40 %	20 %	378973723
137	NC_016843	ATTCC	2	10	171772	171781	20 %	40 %	0 %	40 %	378973723
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188	NC_016843	GGGTG	2	10	232991	233000	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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