MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 3040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016843	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	378973568
2	NC_016843	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	378973568
3	NC_016843	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	378973568
4	NC_016843	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	378973568
5	NC_016843	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	378973568
6	NC_016843	TTTG	2	8	1530	1537	0 %	75 %	25 %	0 %	378973569
7	NC_016843	AACT	2	8	1633	1640	50 %	25 %	0 %	25 %	378973569
8	NC_016843	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	378973570
9	NC_016843	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	378973570
10	NC_016843	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	378973571
11	NC_016843	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	378973572
12	NC_016843	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	378973572
13	NC_016843	GCCC	2	8	4382	4389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_016843	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	378973573
15	NC_016843	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	378973573
16	NC_016843	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	378973573
17	NC_016843	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	378973573
18	NC_016843	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	378973573
19	NC_016843	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	378973573
20	NC_016843	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	378973573
21	NC_016843	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	378973573
22	NC_016843	GCGT	2	8	6765	6772	0 %	25 %	50 %	25 %	378973573
23	NC_016843	AGTT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	378973575
24	NC_016843	TTAC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	378973575
25	NC_016843	TTGC	2	8	7317	7324	0 %	50 %	25 %	25 %	378973575
26	NC_016843	GTCA	2	8	7488	7495	25 %	25 %	25 %	25 %	378973575
27	NC_016843	GGTT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	50 %	0 %	378973576
28	NC_016843	CCGT	2	8	9126	9133	0 %	25 %	25 %	50 %	378973576
29	NC_016843	GGTA	2	8	9207	9214	25 %	25 %	50 %	0 %	378973576
30	NC_016843	GCAT	2	8	10134	10141	25 %	25 %	25 %	25 %	378973576
31	NC_016843	ATGT	2	8	10213	10220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016843	GTGG	2	8	10240	10247	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016843	GCTT	2	8	10623	10630	0 %	50 %	25 %	25 %	378973577
34	NC_016843	TGGA	2	8	11620	11627	25 %	25 %	50 %	0 %	378973577
35	NC_016843	AAGT	2	8	11844	11851	50 %	25 %	25 %	0 %	378973577
36	NC_016843	GAGC	2	8	12345	12352	25 %	0 %	50 %	25 %	378973577
37	NC_016843	GCGT	2	8	13222	13229	0 %	25 %	50 %	25 %	378973579
38	NC_016843	GTTT	2	8	13599	13606	0 %	75 %	25 %	0 %	378973579
39	NC_016843	GAAG	2	8	13657	13664	50 %	0 %	50 %	0 %	378973579
40	NC_016843	ACAT	2	8	13692	13699	50 %	25 %	0 %	25 %	378973579
41	NC_016843	AGGG	2	8	14110	14117	25 %	0 %	75 %	0 %	378973580
42	NC_016843	TTTC	2	8	14325	14332	0 %	75 %	0 %	25 %	378973580
43	NC_016843	AGAT	2	8	14983	14990	50 %	25 %	25 %	0 %	378973580
44	NC_016843	GCTC	2	8	15785	15792	0 %	25 %	25 %	50 %	378973580
45	NC_016843	GCTG	2	8	16215	16222	0 %	25 %	50 %	25 %	378973581
46	NC_016843	GTAC	2	8	16313	16320	25 %	25 %	25 %	25 %	378973581
47	NC_016843	TGCG	2	8	16697	16704	0 %	25 %	50 %	25 %	378973581
48	NC_016843	TGGT	2	8	17150	17157	0 %	50 %	50 %	0 %	378973581
49	NC_016843	GCAG	2	8	17504	17511	25 %	0 %	50 %	25 %	378973581
50	NC_016843	AAGG	2	8	17683	17690	50 %	0 %	50 %	0 %	378973581
51	NC_016843	GTGC	2	8	18157	18164	0 %	25 %	50 %	25 %	378973581
52	NC_016843	TTTA	2	8	18328	18335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016843	CGAT	2	8	18418	18425	25 %	25 %	25 %	25 %	378973582
54	NC_016843	CGTT	2	8	18641	18648	0 %	50 %	25 %	25 %	378973582
55	NC_016843	TATG	2	8	18687	18694	25 %	50 %	25 %	0 %	378973582
56	NC_016843	GTTA	2	8	19792	19799	25 %	50 %	25 %	0 %	378973583
57	NC_016843	GAAA	2	8	20644	20651	75 %	0 %	25 %	0 %	378973583
58	NC_016843	TGCG	2	8	20856	20863	0 %	25 %	50 %	25 %	378973583
59	NC_016843	GCTT	2	8	21176	21183	0 %	50 %	25 %	25 %	378973583
60	NC_016843	ACAA	2	8	22722	22729	75 %	0 %	0 %	25 %	378973584
61	NC_016843	GCAC	2	8	22861	22868	25 %	0 %	25 %	50 %	378973584
62	NC_016843	ATGT	2	8	23082	23089	25 %	50 %	25 %	0 %	378973584
63	NC_016843	CTTC	2	8	24293	24300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016843	AAAG	2	8	25263	25270	75 %	0 %	25 %	0 %	378973585
65	NC_016843	TTAT	2	8	25316	25323	25 %	75 %	0 %	0 %	378973585
66	NC_016843	GATT	2	8	25862	25869	25 %	50 %	25 %	0 %	378973586
67	NC_016843	AGCG	2	8	26000	26007	25 %	0 %	50 %	25 %	378973586
68	NC_016843	CCTT	2	8	26836	26843	0 %	50 %	0 %	50 %	378973586
69	NC_016843	GCAC	2	8	26942	26949	25 %	0 %	25 %	50 %	378973586
70	NC_016843	AGCG	2	8	27255	27262	25 %	0 %	50 %	25 %	378973586
71	NC_016843	CAGT	2	8	27346	27353	25 %	25 %	25 %	25 %	378973586
72	NC_016843	TGCG	2	8	27794	27801	0 %	25 %	50 %	25 %	378973587
73	NC_016843	CATC	2	8	27823	27830	25 %	25 %	0 %	50 %	378973587
74	NC_016843	AGTG	2	8	28056	28063	25 %	25 %	50 %	0 %	378973587
75	NC_016843	TTTG	2	8	28440	28447	0 %	75 %	25 %	0 %	378973587
76	NC_016843	AAAG	2	8	30940	30947	75 %	0 %	25 %	0 %	378973589
77	NC_016843	GCGG	2	8	31116	31123	0 %	0 %	75 %	25 %	378973589
78	NC_016843	TCGT	2	8	31282	31289	0 %	50 %	25 %	25 %	378973589
79	NC_016843	TGTC	2	8	31422	31429	0 %	50 %	25 %	25 %	378973589
80	NC_016843	ATCC	2	8	32112	32119	25 %	25 %	0 %	50 %	378973589
81	NC_016843	CTCG	2	8	32121	32128	0 %	25 %	25 %	50 %	378973589
82	NC_016843	GTAC	2	8	32145	32152	25 %	25 %	25 %	25 %	378973589
83	NC_016843	TTCA	2	8	32457	32464	25 %	50 %	0 %	25 %	378973589
84	NC_016843	GTTG	2	8	32486	32493	0 %	50 %	50 %	0 %	378973589
85	NC_016843	CAAA	2	8	32795	32802	75 %	0 %	0 %	25 %	378973589
86	NC_016843	TGCG	2	8	33242	33249	0 %	25 %	50 %	25 %	378973590
87	NC_016843	CCGC	2	8	33645	33652	0 %	0 %	25 %	75 %	378973590
88	NC_016843	GCCG	2	8	34514	34521	0 %	0 %	50 %	50 %	378973591
89	NC_016843	ATTG	2	8	34800	34807	25 %	50 %	25 %	0 %	378973591
90	NC_016843	GACG	2	8	34951	34958	25 %	0 %	50 %	25 %	378973591
91	NC_016843	CGTG	2	8	35745	35752	0 %	25 %	50 %	25 %	378973592
92	NC_016843	GGGT	2	8	36288	36295	0 %	25 %	75 %	0 %	378973592
93	NC_016843	GACA	2	8	36430	36437	50 %	0 %	25 %	25 %	378973592
94	NC_016843	TAAG	2	8	36813	36820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016843	GTGC	2	8	37189	37196	0 %	25 %	50 %	25 %	378973593
96	NC_016843	GCGA	2	8	37471	37478	25 %	0 %	50 %	25 %	378973593
97	NC_016843	ACGT	2	8	37679	37686	25 %	25 %	25 %	25 %	378973593
98	NC_016843	GAGC	2	8	37734	37741	25 %	0 %	50 %	25 %	378973593
99	NC_016843	TGCG	2	8	38048	38055	0 %	25 %	50 %	25 %	378973593
100	NC_016843	CTTG	2	8	38422	38429	0 %	50 %	25 %	25 %	378973594
101	NC_016843	ACGA	2	8	38549	38556	50 %	0 %	25 %	25 %	378973594
102	NC_016843	GACT	2	8	39606	39613	25 %	25 %	25 %	25 %	378973594
103	NC_016843	GGTT	2	8	39625	39632	0 %	50 %	50 %	0 %	378973594
104	NC_016843	GTAT	2	8	39936	39943	25 %	50 %	25 %	0 %	378973594
105	NC_016843	TTTC	2	8	40096	40103	0 %	75 %	0 %	25 %	378973595
106	NC_016843	TCGG	2	8	40169	40176	0 %	25 %	50 %	25 %	378973595
107	NC_016843	TCCA	2	8	40473	40480	25 %	25 %	0 %	50 %	378973596
108	NC_016843	GAAA	2	8	41026	41033	75 %	0 %	25 %	0 %	378973596
109	NC_016843	AGAA	2	8	41217	41224	75 %	0 %	25 %	0 %	378973597
110	NC_016843	GAAA	2	8	41625	41632	75 %	0 %	25 %	0 %	378973597
111	NC_016843	CATC	2	8	43822	43829	25 %	25 %	0 %	50 %	378973600
112	NC_016843	GCTC	2	8	44238	44245	0 %	25 %	25 %	50 %	378973600
113	NC_016843	GGGT	2	8	44280	44287	0 %	25 %	75 %	0 %	378973600
114	NC_016843	ACCC	2	8	44489	44496	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_016843	GCAC	2	8	45359	45366	25 %	0 %	25 %	50 %	378973601
116	NC_016843	AGGA	2	8	45741	45748	50 %	0 %	50 %	0 %	378973602
117	NC_016843	TTAC	2	8	47157	47164	25 %	50 %	0 %	25 %	378973604
118	NC_016843	TCCC	2	8	47201	47208	0 %	25 %	0 %	75 %	378973604
119	NC_016843	TGGG	2	8	47825	47832	0 %	25 %	75 %	0 %	378973604
120	NC_016843	GTCG	2	8	48718	48725	0 %	25 %	50 %	25 %	378973604
121	NC_016843	GGAC	2	8	48768	48775	25 %	0 %	50 %	25 %	378973604
122	NC_016843	CGCC	2	8	49292	49299	0 %	0 %	25 %	75 %	378973604
123	NC_016843	AGCG	2	8	49424	49431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016843	CGGG	2	8	49492	49499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016843	GAGG	2	8	49929	49936	25 %	0 %	75 %	0 %	378973605
126	NC_016843	GCAG	2	8	50845	50852	25 %	0 %	50 %	25 %	378973606
127	NC_016843	TTCT	2	8	51459	51466	0 %	75 %	0 %	25 %	378973606
128	NC_016843	GGGC	2	8	52163	52170	0 %	0 %	75 %	25 %	378973606
129	NC_016843	ATGC	2	8	52820	52827	25 %	25 %	25 %	25 %	378973607
130	NC_016843	AATC	2	8	53322	53329	50 %	25 %	0 %	25 %	378973607
131	NC_016843	ATTA	2	8	53350	53357	50 %	50 %	0 %	0 %	378973607
132	NC_016843	CAAA	2	8	53692	53699	75 %	0 %	0 %	25 %	378973607
133	NC_016843	GGAA	2	8	54315	54322	50 %	0 %	50 %	0 %	378973607
134	NC_016843	CAGG	2	8	54519	54526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016843	GTAC	2	8	54532	54539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016843	CATC	2	8	54676	54683	25 %	25 %	0 %	50 %	378973608
137	NC_016843	TTTC	2	8	54765	54772	0 %	75 %	0 %	25 %	378973608
138	NC_016843	CTTT	2	8	54895	54902	0 %	75 %	0 %	25 %	378973608
139	NC_016843	TCGT	2	8	55361	55368	0 %	50 %	25 %	25 %	378973608
140	NC_016843	CTAA	2	8	56041	56048	50 %	25 %	0 %	25 %	378973610
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142	NC_016843	TCCT	2	8	56415	56422	0 %	50 %	0 %	50 %	378973610
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