MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 4197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016843	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	378973568
2	NC_016843	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	378973568
3	NC_016843	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	378973568
4	NC_016843	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	378973568
5	NC_016843	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	378973569
6	NC_016843	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	378973570
7	NC_016843	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	378973570
8	NC_016843	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	378973571
9	NC_016843	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	378973571
10	NC_016843	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	378973571
11	NC_016843	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	378973571
12	NC_016843	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	378973572
13	NC_016843	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	378973572
14	NC_016843	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	378973573
15	NC_016843	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	378973573
16	NC_016843	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	378973573
17	NC_016843	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	378973573
18	NC_016843	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	378973573
19	NC_016843	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	378973575
20	NC_016843	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	378973575
21	NC_016843	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	378973575
22	NC_016843	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	378973576
23	NC_016843	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	378973576
24	NC_016843	AG	4	8	9425	9432	50 %	0 %	50 %	0 %	378973576
25	NC_016843	AC	3	6	9825	9830	50 %	0 %	0 %	50 %	378973576
26	NC_016843	AG	3	6	9888	9893	50 %	0 %	50 %	0 %	378973576
27	NC_016843	TC	3	6	9945	9950	0 %	50 %	0 %	50 %	378973576
28	NC_016843	GC	3	6	10085	10090	0 %	0 %	50 %	50 %	378973576
29	NC_016843	TC	3	6	10702	10707	0 %	50 %	0 %	50 %	378973577
30	NC_016843	GC	3	6	11291	11296	0 %	0 %	50 %	50 %	378973577
31	NC_016843	GT	3	6	11332	11337	0 %	50 %	50 %	0 %	378973577
32	NC_016843	GT	3	6	11522	11527	0 %	50 %	50 %	0 %	378973577
33	NC_016843	TA	3	6	11909	11914	50 %	50 %	0 %	0 %	378973577
34	NC_016843	CA	3	6	12029	12034	50 %	0 %	0 %	50 %	378973577
35	NC_016843	GT	3	6	12355	12360	0 %	50 %	50 %	0 %	378973577
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41	NC_016843	CA	4	8	13237	13244	50 %	0 %	0 %	50 %	378973579
42	NC_016843	GA	3	6	13321	13326	50 %	0 %	50 %	0 %	378973579
43	NC_016843	GC	3	6	13532	13537	0 %	0 %	50 %	50 %	378973579
44	NC_016843	CT	4	8	13581	13588	0 %	50 %	0 %	50 %	378973579
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46	NC_016843	CG	3	6	14302	14307	0 %	0 %	50 %	50 %	378973580
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50	NC_016843	CG	3	6	16497	16502	0 %	0 %	50 %	50 %	378973581
51	NC_016843	GT	4	8	16828	16835	0 %	50 %	50 %	0 %	378973581
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53	NC_016843	GT	3	6	17218	17223	0 %	50 %	50 %	0 %	378973581
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60	NC_016843	GT	3	6	18707	18712	0 %	50 %	50 %	0 %	378973582
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64	NC_016843	GT	3	6	20345	20350	0 %	50 %	50 %	0 %	378973583
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68	NC_016843	GA	3	6	21666	21671	50 %	0 %	50 %	0 %	378973583
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73	NC_016843	CG	3	6	23215	23220	0 %	0 %	50 %	50 %	378973584
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108	NC_016843	AT	3	6	35126	35131	50 %	50 %	0 %	0 %	378973591
109	NC_016843	TA	3	6	35215	35220	50 %	50 %	0 %	0 %	378973591
110	NC_016843	TG	3	6	35371	35376	0 %	50 %	50 %	0 %	378973591
111	NC_016843	TG	3	6	35491	35496	0 %	50 %	50 %	0 %	378973592
112	NC_016843	CT	3	6	35669	35674	0 %	50 %	0 %	50 %	378973592
113	NC_016843	GT	4	8	35869	35876	0 %	50 %	50 %	0 %	378973592
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115	NC_016843	CA	4	8	36065	36072	50 %	0 %	0 %	50 %	378973592
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118	NC_016843	CG	3	6	36636	36641	0 %	0 %	50 %	50 %	378973592
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120	NC_016843	GT	3	6	36967	36972	0 %	50 %	50 %	0 %	378973593
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123	NC_016843	TG	3	6	37976	37981	0 %	50 %	50 %	0 %	378973593
124	NC_016843	GC	3	6	38086	38091	0 %	0 %	50 %	50 %	378973593
125	NC_016843	AG	3	6	38184	38189	50 %	0 %	50 %	0 %	378973593
126	NC_016843	CT	3	6	39422	39427	0 %	50 %	0 %	50 %	378973594
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128	NC_016843	GT	3	6	40601	40606	0 %	50 %	50 %	0 %	378973596
129	NC_016843	TG	3	6	41097	41102	0 %	50 %	50 %	0 %	378973597
130	NC_016843	AT	3	6	41280	41285	50 %	50 %	0 %	0 %	378973597
131	NC_016843	CA	3	6	41617	41622	50 %	0 %	0 %	50 %	378973597
132	NC_016843	CA	3	6	41649	41654	50 %	0 %	0 %	50 %	378973597
133	NC_016843	CA	3	6	41696	41701	50 %	0 %	0 %	50 %	378973597
134	NC_016843	GT	3	6	42369	42374	0 %	50 %	50 %	0 %	378973598
135	NC_016843	CT	3	6	42795	42800	0 %	50 %	0 %	50 %	378973598
136	NC_016843	AG	3	6	42859	42864	50 %	0 %	50 %	0 %	378973598
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139	NC_016843	GC	3	6	43885	43890	0 %	0 %	50 %	50 %	378973600
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141	NC_016843	CA	3	6	44431	44436	50 %	0 %	0 %	50 %	378973600
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