MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016843	A	7	7	10333	10339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016843	A	6	6	10354	10359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016843	T	7	7	13934	13940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016843	G	6	6	24748	24753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016843	A	6	6	24828	24833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016843	C	6	6	24861	24866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_016843	G	6	6	24875	24880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016843	A	6	6	25013	25018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016843	G	6	6	29060	29065	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016843	T	9	9	38244	38252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016843	T	6	6	59478	59483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016843	C	6	6	73831	73836	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_016843	T	6	6	78566	78571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016843	T	6	6	78587	78592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016843	C	10	10	94711	94720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_016843	A	6	6	111754	111759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016843	T	6	6	113736	113741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016843	A	6	6	122139	122144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016843	A	6	6	122199	122204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016843	C	9	9	122219	122227	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_016843	T	6	6	132822	132827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016843	C	9	9	136726	136734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_016843	C	9	9	140939	140947	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_016843	A	6	6	142963	142968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016843	C	9	9	154170	154178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_016843	A	6	6	169602	169607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016843	T	8	8	170025	170032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016843	T	6	6	170171	170176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016843	T	7	7	182394	182400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016843	T	6	6	191095	191100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016843	T	6	6	204370	204375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016843	G	9	9	208501	208509	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016843	A	6	6	219022	219027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016843	T	6	6	230125	230130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016843	A	6	6	233832	233837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016843	T	6	6	244220	244225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016843	T	8	8	246414	246421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016843	G	7	7	246658	246664	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016843	T	7	7	254546	254552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016843	A	6	6	282226	282231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016843	T	6	6	298976	298981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016843	T	6	6	304806	304811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016843	T	6	6	305693	305698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016843	T	6	6	323751	323756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016843	T	6	6	326593	326598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016843	T	7	7	326608	326614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016843	G	7	7	326631	326637	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016843	T	6	6	327876	327881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016843	C	10	10	334027	334036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_016843	C	11	11	336337	336347	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_016843	G	6	6	336472	336477	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016843	T	6	6	341530	341535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016843	G	9	9	374437	374445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016843	T	6	6	384252	384257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016843	T	6	6	396350	396355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016843	T	6	6	402480	402485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016843	A	7	7	406830	406836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016843	C	9	9	406866	406874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_016843	C	13	13	409595	409607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_016843	T	6	6	423408	423413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016843	T	6	6	423421	423426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016843	T	8	8	423450	423457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016843	T	6	6	449414	449419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016843	T	6	6	478143	478148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016843	T	6	6	480243	480248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016843	G	6	6	491575	491580	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016843	C	10	10	511474	511483	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_016843	C	6	6	511583	511588	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_016843	G	6	6	542743	542748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016843	A	6	6	547129	547134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016843	A	7	7	550921	550927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016843	T	6	6	562594	562599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016843	T	6	6	563320	563325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016843	T	6	6	563717	563722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016843	A	6	6	569365	569370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016843	A	6	6	577184	577189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016843	T	6	6	583611	583616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016843	A	7	7	600923	600929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016843	T	7	7	635844	635850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016843	T	6	6	643082	643087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016843	A	6	6	644657	644662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016843	T	8	8	644695	644702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016843	C	6	6	648991	648996	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_016843	C	10	10	674996	675005	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_016843	C	11	11	677306	677316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_016843	A	6	6	688937	688942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016843	T	6	6	689066	689071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016843	G	6	6	690671	690676	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016843	T	9	9	699418	699426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016843	A	6	6	725999	726004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016843	A	6	6	735897	735902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016843	C	6	6	748566	748571	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_016843	C	6	6	768161	768166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_016843	A	6	6	768174	768179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016843	C	6	6	768995	769000	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_016843	A	6	6	777063	777068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016843	T	6	6	795656	795661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016843	C	6	6	795681	795686	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_016843	A	7	7	823817	823823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016843	A	6	6	850157	850162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016843	A	7	7	853819	853825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016843	A	6	6	862445	862450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016843	A	8	8	864967	864974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016843	T	6	6	882263	882268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016843	T	8	8	882320	882327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016843	A	6	6	883131	883136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016843	T	6	6	884390	884395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016843	A	6	6	884417	884422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016843	A	6	6	901884	901889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016843	T	6	6	918472	918477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016843	A	6	6	922072	922077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016843	T	7	7	951100	951106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016843	T	7	7	954228	954234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016843	A	6	6	960456	960461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016843	N	7	7	976201	976207	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016843	N	28	28	976218	976245	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016843	N	6	6	976372	976377	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016843	N	20	20	976492	976511	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016843	N	14	14	976720	976733	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016843	C	6	6	976855	976860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_016843	N	30	30	976878	976907	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016843	C	6	6	1004452	1004457	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_016843	C	8	8	1007132	1007139	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_016843	T	7	7	1025832	1025838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016843	A	6	6	1025840	1025845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016843	A	7	7	1025870	1025876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016843	A	6	6	1039806	1039811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016843	T	6	6	1045026	1045031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016843	C	9	9	1050932	1050940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_016843	A	7	7	1055776	1055782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016843	G	10	10	1072328	1072337	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016843	T	6	6	1082738	1082743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016843	T	6	6	1083445	1083450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016843	A	6	6	1084068	1084073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016843	A	6	6	1090316	1090321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016843	A	6	6	1121905	1121910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016843	C	6	6	1121954	1121959	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_016843	C	6	6	1127811	1127816	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_016843	C	6	6	1128795	1128800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_016843	T	6	6	1132768	1132773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016843	A	6	6	1132839	1132844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016843	A	6	6	1136791	1136796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016843	T	7	7	1136844	1136850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016843	T	6	6	1136911	1136916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.