MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016842	AACAAA	2	12	3231	3242	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378972505
2	NC_016842	TTTGAC	2	12	5642	5653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378972507
3	NC_016842	GCAGGC	2	12	5659	5670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378972507
4	NC_016842	GTGTAT	2	12	6685	6696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378972507
5	NC_016842	TTAAAT	2	12	7965	7976	50 %	50 %	0 %	0 %	378972509
6	NC_016842	ATTGAA	2	12	8548	8559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378972510
7	NC_016842	TTGAGA	2	12	27323	27334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972520
8	NC_016842	GAACAG	2	12	31307	31318	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378972523
9	NC_016842	GTCTGG	2	12	31542	31553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378972523
10	NC_016842	TTTCCG	2	12	34169	34180	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378972525
11	NC_016842	TTGACG	2	12	38832	38843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378972528
12	NC_016842	TGCATG	2	12	42334	42345	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378972532
13	NC_016842	CCTCCC	2	12	49437	49448	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
14	NC_016842	CGTGCG	2	12	49792	49803	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378972539
15	NC_016842	GTCTGG	2	12	50262	50273	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378972539
16	NC_016842	GCACGA	2	12	59447	59458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016842	TGTAAC	2	12	62400	62411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378972551
18	NC_016842	AGGGGC	2	12	65735	65746	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378972555
19	NC_016842	GCCATT	2	12	66855	66866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378972556
20	NC_016842	TCTTGC	2	12	67084	67095	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378972556
21	NC_016842	TGAGCA	2	12	79709	79720	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378972574
22	NC_016842	CACTTT	2	12	83769	83780	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378972578
23	NC_016842	GGAGTA	2	12	85171	85182	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378972579
24	NC_016842	CGTGAA	2	12	85390	85401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378972579
25	NC_016842	ATTTGT	2	12	86511	86522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378972580
26	NC_016842	ACGCTT	2	12	86699	86710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378972580
27	NC_016842	CGCTTG	2	12	92618	92629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972586
28	NC_016842	AGGGGA	2	12	97012	97023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378972591
29	NC_016842	CGCACG	2	12	103776	103787	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378972598
30	NC_016842	GTCGGT	2	12	107378	107389	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378972602
31	NC_016842	ATCTGC	2	12	116883	116894	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378972608
32	NC_016842	TCTCAA	2	12	124817	124828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016842	TTTTAA	2	12	127159	127170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378972614
34	NC_016842	TTGTCG	2	12	131199	131210	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378972617
35	NC_016842	TCTTGA	2	12	133054	133065	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378972619
36	NC_016842	GCAGAC	2	12	134405	134416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972619
37	NC_016842	CCGGAG	2	12	135901	135912	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378972620
38	NC_016842	CAGCTG	2	12	136125	136136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378972620
39	NC_016842	CCGTGC	2	12	147095	147106	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378972629
40	NC_016842	CGGCTG	2	12	148286	148297	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378972630
41	NC_016842	GGCTGG	2	12	150292	150303	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016842	TCGGGC	2	12	150307	150318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016842	CGGCTC	2	12	150965	150976	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378972636
44	NC_016842	CTGCGG	4	24	151484	151507	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016842	CGGCTC	2	12	151989	152000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016842	TGGTTG	2	12	152243	152254	0 %	50 %	50 %	0 %	378972640
47	NC_016842	CCGGAG	2	12	153341	153352	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378972640
48	NC_016842	CAGCTG	2	12	153565	153576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378972640
49	NC_016842	GCAAGC	2	12	155649	155660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972642
50	NC_016842	GGGGGT	2	12	158369	158380	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	378972645
51	NC_016842	GTGTGC	2	12	173802	173813	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378972660
52	NC_016842	ACTGTT	2	12	177958	177969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378972665
53	NC_016842	TGCGTA	2	12	178983	178994	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378972665
54	NC_016842	TTGGGT	2	12	187538	187549	0 %	50 %	50 %	0 %	378972675
55	NC_016842	GGAAGA	2	12	192744	192755	50 %	0 %	50 %	0 %	378972681
56	NC_016842	GACACT	2	12	192905	192916	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378972681
57	NC_016842	GGTGAG	2	12	193068	193079	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378972681
58	NC_016842	GAGAAA	2	12	197261	197272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972684
59	NC_016842	CGGTGA	2	12	205824	205835	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378972694
60	NC_016842	AAAAGG	2	12	206089	206100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972694
61	NC_016842	TAAGGG	2	12	212876	212887	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378972709
62	NC_016842	TTTGGT	2	12	213484	213495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972711
63	NC_016842	GTGTTT	2	12	222435	222446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972723
64	NC_016842	TGCGCT	2	12	223183	223194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972725
65	NC_016842	TCTTGT	2	12	225009	225020	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378972726
66	NC_016842	GTGTTT	2	12	225038	225049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972726
67	NC_016842	TATGCT	2	12	229040	229051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378972730
68	NC_016842	GTGCGA	2	12	234291	234302	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016842	TCCTTC	2	12	235672	235683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016842	AGGAGA	2	12	236434	236445	50 %	0 %	50 %	0 %	378972732
71	NC_016842	GCAGAC	2	12	238519	238530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972736
72	NC_016842	GCGGGT	2	12	241160	241171	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378972738
73	NC_016842	GGAAAC	2	12	247711	247722	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378972748
74	NC_016842	TTTCTG	2	12	248247	248258	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378972748
75	NC_016842	GGAATG	2	12	250069	250080	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378972749
76	NC_016842	ACCTTG	2	12	250443	250454	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378972749
77	NC_016842	GTTTGT	2	12	258721	258732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972753
78	NC_016842	AACGCA	2	12	262590	262601	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378972756
79	NC_016842	CATGCG	2	12	265513	265524	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378972759
80	NC_016842	TTTTTC	2	12	268508	268519	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378972763
81	NC_016842	TACAAT	2	12	269704	269715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378972764
82	NC_016842	CCCTGC	2	12	271873	271884	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378972768
83	NC_016842	GTGCGA	2	12	282703	282714	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016842	TCCTTC	2	12	284084	284095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016842	TCATTT	2	12	286246	286257	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378972777
86	NC_016842	GGGTGA	2	12	294226	294237	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378972786
87	NC_016842	CTGCCG	2	12	302471	302482	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378972792
88	NC_016842	ATGCGT	2	12	302609	302620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378972792
89	NC_016842	GCTGCA	2	12	303319	303330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378972792
90	NC_016842	TGATGT	2	12	304541	304552	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378972793
91	NC_016842	GCAGTT	2	12	304722	304733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378972793
92	NC_016842	TGCGCT	2	12	306376	306387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972795
93	NC_016842	GGCTGC	2	12	310491	310502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378972799
94	NC_016842	CTCCGT	2	12	314625	314636	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378972802
95	NC_016842	GAAATC	2	12	317007	317018	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378972805
96	NC_016842	GTATGG	2	12	317249	317260	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378972805
97	NC_016842	GTGAAA	2	12	317812	317823	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378972805
98	NC_016842	ACGGTC	2	12	320728	320739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378972806
99	NC_016842	TGAGCG	2	12	322749	322760	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378972807
100	NC_016842	CGGCAC	2	12	323201	323212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378972807
101	NC_016842	TGCAGG	2	12	325060	325071	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378972809
102	NC_016842	GCACCG	2	12	331201	331212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378972816
103	NC_016842	CAAAAT	2	12	332349	332360	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378972817
104	NC_016842	CCGGAG	2	12	333206	333217	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378972817
105	NC_016842	CAGCTG	2	12	333430	333441	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378972817
106	NC_016842	TGGCAT	2	12	337726	337737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378972821
107	NC_016842	GCTGTG	2	12	341251	341262	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378972824
108	NC_016842	GTGCTC	2	12	341302	341313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972824
109	NC_016842	TGTTCG	2	12	341472	341483	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378972824
110	NC_016842	TTCATG	2	12	341588	341599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378972824
111	NC_016842	ACCGTC	2	12	341624	341635	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378972824
112	NC_016842	TTTGGA	2	12	345285	345296	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378972824
113	NC_016842	GAGCGC	2	12	346746	346757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378972825
114	NC_016842	CTTTGA	2	12	347189	347200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378972825
115	NC_016842	AATATA	2	12	355324	355335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016842	GTGTTG	2	12	372218	372229	0 %	50 %	50 %	0 %	378972845
117	NC_016842	TTTCCG	2	12	372587	372598	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016842	CAGGAG	2	12	374599	374610	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378972849
119	NC_016842	TGGGAG	2	12	374771	374782	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378972849
120	NC_016842	CTTTTG	2	12	377875	377886	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378972853
121	NC_016842	CGTGGT	2	12	381079	381090	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378972860
122	NC_016842	TCGCGT	2	12	391017	391028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972874
123	NC_016842	CTGAGC	2	12	394641	394652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378972876
124	NC_016842	GTCATC	2	12	395802	395813	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378972877
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127	NC_016842	CCGCGT	2	12	398257	398268	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378972880
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181	NC_016842	TAACCC	2	12	562236	562247	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_016842	ATACTG	2	12	562330	562341	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
183	NC_016842	CGCGTG	2	12	563899	563910	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378973026
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219	NC_016842	CAAAAT	2	12	673128	673139	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378973127
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222	NC_016842	TGCACG	2	12	680665	680676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378973131
223	NC_016842	CGGTGT	2	12	681463	681474	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378973131
224	NC_016842	TGAGCG	2	12	685417	685428	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378973134
225	NC_016842	TGCAAT	2	12	687612	687623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378973135
226	NC_016842	TGTTTT	2	12	688847	688858	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378973136
227	NC_016842	CGGCCG	2	12	694546	694557	0 %	0 %	50 %	50 %	378973141
228	NC_016842	ATTGAG	2	12	695336	695347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973141
229	NC_016842	GCTTCT	2	12	696216	696227	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378973141
230	NC_016842	ATACCC	2	12	697046	697057	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378973142
231	NC_016842	GAAAGA	2	12	697192	697203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973142
232	NC_016842	TTCTCC	2	12	699181	699192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
233	NC_016842	CAGGAT	2	12	712135	712146	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378973156
234	NC_016842	CCTCCG	2	12	716750	716761	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378973159
235	NC_016842	CCTGTA	2	12	720275	720286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973163
236	NC_016842	TGCATT	2	12	722831	722842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378973166
237	NC_016842	CCCATC	2	12	724085	724096	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378973167
238	NC_016842	CTCATC	2	12	724436	724447	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378973167
239	NC_016842	GTGTGG	2	12	727521	727532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973170
240	NC_016842	CAGCAT	2	12	731892	731903	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973175
241	NC_016842	AAGCGC	2	12	735581	735592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973176
242	NC_016842	TGCATA	2	12	736548	736559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378973177
243	NC_016842	GCCAAT	2	12	737075	737086	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973178
244	NC_016842	ACCGTA	2	12	738208	738219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973179
245	NC_016842	AACCGC	2	12	740013	740024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378973180
246	NC_016842	ATACAT	2	12	754923	754934	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378973195
247	NC_016842	TCTTGC	2	12	756227	756238	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378973195
248	NC_016842	ATCTAG	2	12	760018	760029	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378973199
249	NC_016842	CCACAC	2	12	763086	763097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973201
250	NC_016842	GCCCCT	2	12	763424	763435	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378973202
251	NC_016842	TTTCCG	2	12	764278	764289	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378973203
252	NC_016842	ACGCGC	2	12	766679	766690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
253	NC_016842	GACACC	2	12	768242	768253	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378973207
254	NC_016842	GGCACA	2	12	772517	772528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973211
255	NC_016842	TTAAAG	2	12	778213	778224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378973217
256	NC_016842	ATTCCC	2	12	780865	780876	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378973220
257	NC_016842	AGTCCA	2	12	784985	784996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973222
258	NC_016842	CCTGCG	2	12	789376	789387	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378973228
259	NC_016842	ACGTGC	2	12	790834	790845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378973229
260	NC_016842	CTGCGC	2	12	796129	796140	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378973236
261	NC_016842	GGGCAG	2	12	796515	796526	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378973236
262	NC_016842	TGTGAC	2	12	799299	799310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378973239
263	NC_016842	CGGGGG	2	12	800243	800254	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	378973240
264	NC_016842	TTTCCA	2	12	800830	800841	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378973241
265	NC_016842	GCATAC	2	12	802816	802827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973242
266	NC_016842	TTGGAA	2	12	804270	804281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973245
267	NC_016842	TAACGT	2	12	807171	807182	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378973248
268	NC_016842	GCACTT	2	12	808199	808210	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973249
269	NC_016842	GAGCAA	2	12	809672	809683	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378973251
270	NC_016842	ACGCAG	2	12	810585	810596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_016842	GCGAGC	2	12	811742	811753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378973255
272	NC_016842	CATCTT	2	12	815705	815716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378973257
273	NC_016842	AGAGCG	2	12	819180	819191	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378973261
274	NC_016842	ACACGC	2	12	819420	819431	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
275	NC_016842	AACTCA	2	12	825753	825764	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378973268
276	NC_016842	GCACAC	2	12	827750	827761	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378973270
277	NC_016842	GCAGGG	2	12	827872	827883	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
278	NC_016842	CCAGTC	2	12	833620	833631	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378973276
279	NC_016842	GCAAGC	2	12	849898	849909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973291
280	NC_016842	ACCCCT	2	12	851231	851242	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378973293
281	NC_016842	CAGAGA	2	12	853617	853628	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
282	NC_016842	GCATCT	2	12	863833	863844	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973308
283	NC_016842	GTGCAC	2	12	869898	869909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_016842	GGTATC	2	12	873722	873733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378973316
285	NC_016842	CACGCG	2	12	877219	877230	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378973318
286	NC_016842	AAAGAC	2	12	882457	882468	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
287	NC_016842	TGCTCC	2	12	883594	883605	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378973324
288	NC_016842	AAAACT	2	12	885190	885201	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378973325
289	NC_016842	CAAACA	2	12	885674	885685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973328
290	NC_016842	CCATCC	2	12	890406	890417	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_016842	CACCTT	2	12	892549	892560	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378973336
292	NC_016842	CAGGTG	2	12	896753	896764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378973341
293	NC_016842	AAAGAC	2	12	899461	899472	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378973345
294	NC_016842	TATCAG	2	12	901896	901907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378973347
295	NC_016842	CTGCGC	2	12	905539	905550	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378973349
296	NC_016842	GGCGCA	2	12	907702	907713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_016842	GCGATA	2	12	911075	911086	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378973352
298	NC_016842	TTTTCA	2	12	924223	924234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378973367
299	NC_016842	CTTCTG	3	18	925551	925568	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378973368
300	NC_016842	CAAGCT	2	12	928518	928529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973369
301	NC_016842	ACAGGC	2	12	930425	930436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973369
302	NC_016842	GAGTGG	2	12	937067	937078	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378973372
303	NC_016842	CTTGCG	2	12	938281	938292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973374
304	NC_016842	TCGTAT	2	12	938518	938529	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378973374
305	NC_016842	GCGCAA	2	12	940191	940202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973375
306	NC_016842	GCTCCT	2	12	941639	941650	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378973377
307	NC_016842	GCGCTC	2	12	942761	942772	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378973378
308	NC_016842	AAATGC	2	12	943348	943359	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378973379
309	NC_016842	GCAGGA	2	12	945359	945370	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378973380
310	NC_016842	AAGCTC	2	12	948069	948080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973381
311	NC_016842	CTGCGC	2	12	951639	951650	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378973388
312	NC_016842	CAACAT	2	12	956630	956641	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378973394
313	NC_016842	CAAAAA	2	12	961965	961976	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378973399
314	NC_016842	TTCTCC	2	12	967079	967090	0 %	50 %	0 %	50 %	378973403
315	NC_016842	ACTCGA	2	12	967097	967108	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973404
316	NC_016842	AGATCA	2	12	968485	968496	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378973405
317	NC_016842	CTGATA	2	12	971247	971258	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378973407
318	NC_016842	CCGGAG	2	12	978066	978077	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378973414
319	NC_016842	GCAGGA	2	12	978413	978424	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378973414
320	NC_016842	CAGCTC	2	12	978748	978759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378973414
321	NC_016842	CCGGCT	2	12	980961	980972	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378973414
322	NC_016842	ACCTGC	2	12	981139	981150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378973414
323	NC_016842	TCTTCA	2	12	982534	982545	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378973415
324	NC_016842	TCTGCG	2	12	988943	988954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973421
325	NC_016842	GGACGT	2	12	989526	989537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378973422
326	NC_016842	ACAAAC	2	12	989710	989721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973423
327	NC_016842	CCACGG	2	12	993039	993050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378973429
328	NC_016842	GAGCAG	2	12	995604	995615	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
329	NC_016842	CTTGCA	2	12	999574	999585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973438
330	NC_016842	CAGCGC	2	12	1000279	1000290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378973438
331	NC_016842	GCTAAC	2	12	1003848	1003859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973441
332	NC_016842	TACCGT	2	12	1003965	1003976	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973441
333	NC_016842	TGGCGG	2	12	1010358	1010369	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378973449
334	NC_016842	ACGCTG	2	12	1010682	1010693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378973449
335	NC_016842	ACTGAC	2	12	1017590	1017601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973454
336	NC_016842	GCGCGT	2	12	1020237	1020248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378973456
337	NC_016842	AAAAGA	3	18	1031704	1031721	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378973468
338	NC_016842	TGCCTC	2	12	1037662	1037673	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378973475
339	NC_016842	CGGTTA	2	12	1045279	1045290	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378973483
340	NC_016842	CTCGCC	2	12	1046039	1046050	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378973483
341	NC_016842	TTGATC	2	12	1050299	1050310	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378973487
342	NC_016842	CATGTT	2	12	1050903	1050914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378973488
343	NC_016842	TTCGCC	2	12	1050975	1050986	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378973488
344	NC_016842	CCCGCT	2	12	1051669	1051680	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378973488
345	NC_016842	TCTTGC	2	12	1052759	1052770	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378973489
346	NC_016842	GCCACC	2	12	1060226	1060237	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378973496
347	NC_016842	GGAGCC	2	12	1065067	1065078	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378973501
348	NC_016842	GGTGCG	2	12	1067283	1067294	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378973504
349	NC_016842	AGAGGA	2	12	1068070	1068081	50 %	0 %	50 %	0 %	378973505
350	NC_016842	GAGGTG	2	12	1070717	1070728	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378973508
351	NC_016842	TCTTTT	2	12	1072799	1072810	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378973509
352	NC_016842	ACGCAG	2	12	1076059	1076070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973514
353	NC_016842	TATGAG	2	12	1081193	1081204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973520
354	NC_016842	TGACGA	2	12	1089912	1089923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378973523
355	NC_016842	ATCTGC	2	12	1096058	1096069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973529
356	NC_016842	AACTCC	2	12	1098260	1098271	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	378973530
357	NC_016842	AAAGCG	2	12	1099021	1099032	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378973531
358	NC_016842	ACTGCA	2	12	1101066	1101077	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973532
359	NC_016842	TAATTC	2	12	1104403	1104414	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378973535
360	NC_016842	CATGCA	2	12	1105518	1105529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378973536
361	NC_016842	TTGCCA	2	12	1112644	1112655	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973543
362	NC_016842	GCCCTC	2	12	1114323	1114334	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	378973545
363	NC_016842	CTGTGC	2	12	1115247	1115258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973546
364	NC_016842	CGCCTT	2	12	1116741	1116752	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378973547
365	NC_016842	TCTGCA	2	12	1118330	1118341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378973548
366	NC_016842	ATGCGT	2	12	1120146	1120157	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378973552
367	NC_016842	GCTGAC	2	12	1126199	1126210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378973556
368	NC_016842	TGCACG	2	12	1126597	1126608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378973556
369	NC_016842	AATTTC	2	12	1127452	1127463	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378973557
370	NC_016842	AGCCCC	2	12	1128325	1128336	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378973558
371	NC_016842	TCCTCG	2	12	1129340	1129351	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378973559

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.