MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016842	A	7	7	10333	10339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016842	A	6	6	10354	10359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016842	T	7	7	13934	13940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016842	G	6	6	24748	24753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016842	A	6	6	24828	24833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016842	C	6	6	24861	24866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_016842	G	6	6	24875	24880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016842	A	6	6	25013	25018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016842	G	6	6	29060	29065	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016842	T	9	9	38244	38252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016842	T	6	6	59479	59484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016842	C	6	6	73529	73534	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_016842	T	6	6	78264	78269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016842	T	6	6	78285	78290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016842	C	10	10	94409	94418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_016842	A	6	6	111452	111457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016842	T	6	6	113434	113439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016842	A	6	6	121837	121842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016842	A	6	6	121897	121902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016842	C	9	9	121917	121925	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_016842	T	6	6	132520	132525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016842	C	10	10	136424	136433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_016842	C	9	9	140638	140646	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_016842	A	6	6	142662	142667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016842	C	10	10	153864	153873	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_016842	A	6	6	169297	169302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016842	T	8	8	169720	169727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016842	T	6	6	169866	169871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016842	T	7	7	182089	182095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016842	T	6	6	190790	190795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016842	T	6	6	204065	204070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016842	G	8	8	208196	208203	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016842	A	6	6	218716	218721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016842	T	6	6	229819	229824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016842	A	6	6	233516	233521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016842	T	6	6	243904	243909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016842	T	8	8	246098	246105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016842	G	6	6	246342	246347	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016842	T	7	7	254229	254235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016842	A	6	6	281928	281933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016842	T	6	6	298678	298683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016842	T	6	6	304508	304513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016842	T	6	6	305395	305400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016842	T	6	6	323453	323458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016842	T	6	6	326295	326300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016842	T	7	7	326310	326316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016842	G	7	7	326333	326339	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016842	T	6	6	327578	327583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016842	C	10	10	333729	333738	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_016842	C	10	10	336039	336048	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_016842	G	6	6	336173	336178	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016842	T	6	6	341231	341236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016842	G	9	9	374141	374149	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016842	T	6	6	383956	383961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016842	T	6	6	396054	396059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016842	T	6	6	402184	402189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016842	A	7	7	406534	406540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016842	C	9	9	406570	406578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_016842	C	13	13	409299	409311	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_016842	T	6	6	423112	423117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016842	T	6	6	423125	423130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016842	T	8	8	423154	423161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016842	T	6	6	449118	449123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016842	T	6	6	477967	477972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016842	T	6	6	480067	480072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016842	G	6	6	491399	491404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016842	C	6	6	511095	511100	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_016842	G	6	6	542255	542260	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016842	A	6	6	546641	546646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016842	A	7	7	550433	550439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016842	T	6	6	562106	562111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016842	T	6	6	562832	562837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016842	T	6	6	563229	563234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016842	A	6	6	568877	568882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016842	A	6	6	576696	576701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016842	T	6	6	583123	583128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016842	A	7	7	600435	600441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016842	T	7	7	635356	635362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016842	T	6	6	642594	642599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016842	A	6	6	644169	644174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016842	T	8	8	644207	644214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016842	C	6	6	648503	648508	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_016842	C	9	9	674508	674516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_016842	C	11	11	676817	676827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_016842	A	6	6	688448	688453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016842	G	6	6	690484	690489	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016842	T	9	9	699231	699239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016842	A	6	6	725812	725817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016842	A	6	6	735710	735715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016842	C	6	6	748379	748384	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_016842	C	6	6	767974	767979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_016842	A	6	6	767987	767992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016842	C	6	6	768808	768813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_016842	A	6	6	776876	776881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016842	T	6	6	795469	795474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016842	C	6	6	795494	795499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_016842	A	7	7	823630	823636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016842	A	6	6	849970	849975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016842	A	7	7	853632	853638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016842	A	6	6	862258	862263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016842	A	8	8	864780	864787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016842	T	6	6	882076	882081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016842	T	8	8	882133	882140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016842	A	6	6	882944	882949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016842	T	6	6	884203	884208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016842	A	6	6	884230	884235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016842	A	6	6	901697	901702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016842	T	6	6	918285	918290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016842	A	6	6	921885	921890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016842	T	7	7	950992	950998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016842	T	7	7	954120	954126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016842	A	6	6	960348	960353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016842	N	47	47	976111	976157	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016842	N	59	59	976259	976317	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016842	N	44	44	976427	976470	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016842	N	25	25	976656	976680	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016842	C	6	6	976782	976787	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_016842	N	30	30	976809	976838	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016842	N	25	25	977277	977301	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016842	C	6	6	1004385	1004390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_016842	T	7	7	1025766	1025772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016842	A	6	6	1025774	1025779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016842	A	7	7	1025804	1025810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016842	A	6	6	1039740	1039745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016842	T	6	6	1044960	1044965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016842	C	6	6	1050866	1050871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_016842	A	7	7	1055689	1055695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016842	G	9	9	1072241	1072249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016842	T	6	6	1082650	1082655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016842	T	6	6	1083357	1083362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016842	A	6	6	1083980	1083985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016842	A	6	6	1090228	1090233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016842	A	6	6	1121817	1121822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016842	C	6	6	1121866	1121871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_016842	C	6	6	1127723	1127728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_016842	C	6	6	1128707	1128712	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_016842	T	6	6	1132680	1132685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016842	A	6	6	1132751	1132756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016842	A	6	6	1136703	1136708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016842	T	7	7	1136756	1136762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016842	T	6	6	1136823	1136828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.