MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS3

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016839	TGCCAA	2	12	584	595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975834
2	NC_016839	GAGCTT	2	12	4676	4687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975841
3	NC_016839	ACGGCC	2	12	15083	15094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975863
4	NC_016839	TGCTTT	2	12	15172	15183	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378975863
5	NC_016839	ACAAAG	2	12	19527	19538	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378975870
6	NC_016839	ATCAAG	2	12	19946	19957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378975870
7	NC_016839	TCGAAG	2	12	20040	20051	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975870
8	NC_016839	AGCAGG	2	12	22524	22535	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975875
9	NC_016839	AGCTGA	2	12	24495	24506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975879
10	NC_016839	GCAGAT	2	12	24640	24651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378975879
11	NC_016839	CCTCAC	2	12	27351	27362	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016839	GCTCTG	2	12	27628	27639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016839	CCCATC	2	12	32042	32053	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	378975888
14	NC_016839	TGACCA	2	12	37777	37788	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975898
15	NC_016839	TCTCGC	2	12	40804	40815	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975901
16	NC_016839	ACTACG	2	12	54778	54789	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975923
17	NC_016839	GGAAGC	2	12	59145	59156	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975930
18	NC_016839	GCTGAC	2	12	61300	61311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975935
19	NC_016839	GGTGCT	2	12	67613	67624	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378975946
20	NC_016839	CAGTAC	2	12	69218	69229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975948
21	NC_016839	AGCTAC	2	12	70694	70705	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975948
22	NC_016839	GCTATG	2	12	71310	71321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975948
23	NC_016839	CCTATG	2	12	71967	71978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975948
24	NC_016839	TCTGAA	2	12	72607	72618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378975949
25	NC_016839	TTAAAG	2	12	73019	73030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016839	GCCGCA	2	12	73604	73615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975951
27	NC_016839	AAACAA	2	12	75208	75219	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016839	CCCCTC	2	12	78635	78646	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
29	NC_016839	ACTTCA	2	12	81307	81318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975961
30	NC_016839	ATTGAT	2	12	81399	81410	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378975961
31	NC_016839	TGGACG	2	12	87502	87513	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975968
32	NC_016839	CACCGG	2	12	94435	94446	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378975973
33	NC_016839	CCTTGG	2	12	99546	99557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975976
34	NC_016839	CAAAGA	2	12	104202	104213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378975984
35	NC_016839	GGTGAA	2	12	104421	104432	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378975984

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.