MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS3

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016839	CGGAG	2	10	1754	1763	20 %	0 %	60 %	20 %	378975835
2	NC_016839	GTCAT	2	10	2858	2867	20 %	40 %	20 %	20 %	378975838
3	NC_016839	ACCAA	2	10	3502	3511	60 %	0 %	0 %	40 %	378975839
4	NC_016839	TTCCC	2	10	4501	4510	0 %	40 %	0 %	60 %	378975841
5	NC_016839	GCTGA	2	10	4718	4727	20 %	20 %	40 %	20 %	378975842
6	NC_016839	CAAAG	2	10	4882	4891	60 %	0 %	20 %	20 %	378975842
7	NC_016839	GTCAG	2	10	5102	5111	20 %	20 %	40 %	20 %	378975842
8	NC_016839	TCTGT	2	10	8427	8436	0 %	60 %	20 %	20 %	378975847
9	NC_016839	AGGTT	2	10	10524	10533	20 %	40 %	40 %	0 %	378975852
10	NC_016839	AGCAA	2	10	11154	11163	60 %	0 %	20 %	20 %	378975853
11	NC_016839	CTTTG	2	10	12254	12263	0 %	60 %	20 %	20 %	378975856
12	NC_016839	TCAGA	2	10	12734	12743	40 %	20 %	20 %	20 %	378975857
13	NC_016839	AGCAA	2	10	16322	16331	60 %	0 %	20 %	20 %	378975865
14	NC_016839	GAAAA	2	10	18123	18132	80 %	0 %	20 %	0 %	378975867
15	NC_016839	TGAGC	2	10	21965	21974	20 %	20 %	40 %	20 %	378975874
16	NC_016839	TTCCC	2	10	22148	22157	0 %	40 %	0 %	60 %	378975875
17	NC_016839	CAGAG	2	10	22505	22514	40 %	0 %	40 %	20 %	378975875
18	NC_016839	ACGGT	2	10	23784	23793	20 %	20 %	40 %	20 %	378975878
19	NC_016839	CGAAA	2	10	26905	26914	60 %	0 %	20 %	20 %	378975881
20	NC_016839	TGCTC	2	10	28437	28446	0 %	40 %	20 %	40 %	378975884
21	NC_016839	AGGCC	2	10	28626	28635	20 %	0 %	40 %	40 %	378975884
22	NC_016839	AGCTC	2	10	31644	31653	20 %	20 %	20 %	40 %	378975888
23	NC_016839	CAGGG	2	10	33857	33866	20 %	0 %	60 %	20 %	378975892
24	NC_016839	CGGGC	2	10	34765	34774	0 %	0 %	60 %	40 %	378975893
25	NC_016839	CTGCT	2	10	36299	36308	0 %	40 %	20 %	40 %	378975895
26	NC_016839	GCGAG	2	10	38482	38491	20 %	0 %	60 %	20 %	378975898
27	NC_016839	CGCTG	2	10	39363	39372	0 %	20 %	40 %	40 %	378975899
28	NC_016839	GGCCT	2	10	43448	43457	0 %	20 %	40 %	40 %	378975907
29	NC_016839	GAGCA	2	10	43637	43646	40 %	0 %	40 %	20 %	378975907
30	NC_016839	TTGCT	2	10	44625	44634	0 %	60 %	20 %	20 %	378975908
31	NC_016839	CTCCC	2	10	51733	51742	0 %	20 %	0 %	80 %	378975918
32	NC_016839	AAGGC	2	10	51965	51974	40 %	0 %	40 %	20 %	378975919
33	NC_016839	CGATG	2	10	54174	54183	20 %	20 %	40 %	20 %	378975921
34	NC_016839	TGACT	2	10	55544	55553	20 %	40 %	20 %	20 %	378975924
35	NC_016839	GAAAA	2	10	56441	56450	80 %	0 %	20 %	0 %	378975925
36	NC_016839	TGACA	2	10	59233	59242	40 %	20 %	20 %	20 %	378975930
37	NC_016839	TTGTC	2	10	61389	61398	0 %	60 %	20 %	20 %	378975935
38	NC_016839	CTTGG	2	10	62097	62106	0 %	40 %	40 %	20 %	378975937
39	NC_016839	GAGAA	2	10	65330	65339	60 %	0 %	40 %	0 %	378975941
40	NC_016839	AAGGG	2	10	68472	68481	40 %	0 %	60 %	0 %	378975948
41	NC_016839	ATCAC	2	10	69090	69099	40 %	20 %	0 %	40 %	378975948
42	NC_016839	CGGCA	2	10	77724	77733	20 %	0 %	40 %	40 %	378975956
43	NC_016839	CAAAG	2	10	77883	77892	60 %	0 %	20 %	20 %	378975956
44	NC_016839	CCCCA	2	10	78478	78487	20 %	0 %	0 %	80 %	378975958
45	NC_016839	AATCT	2	10	78570	78579	40 %	40 %	0 %	20 %	378975958
46	NC_016839	GCTAA	2	10	79626	79635	40 %	20 %	20 %	20 %	378975959
47	NC_016839	CTCAC	2	10	81732	81741	20 %	20 %	0 %	60 %	378975961
48	NC_016839	GCAAA	2	10	83485	83494	60 %	0 %	20 %	20 %	378975964
49	NC_016839	GCCGC	2	10	85044	85053	0 %	0 %	40 %	60 %	378975966
50	NC_016839	CGCGC	2	10	88070	88079	0 %	0 %	40 %	60 %	378975968
51	NC_016839	CCAAA	2	10	92066	92075	60 %	0 %	0 %	40 %	378975971
52	NC_016839	GAAGC	2	10	92086	92095	40 %	0 %	40 %	20 %	378975971
53	NC_016839	AATGA	2	10	93038	93047	60 %	20 %	20 %	0 %	378975972
54	NC_016839	CAACA	2	10	93049	93058	60 %	0 %	0 %	40 %	378975972
55	NC_016839	GCAAA	2	10	94523	94532	60 %	0 %	20 %	20 %	378975973
56	NC_016839	GCCGC	2	10	96692	96701	0 %	0 %	40 %	60 %	378975973
57	NC_016839	CAGGT	2	10	96951	96960	20 %	20 %	40 %	20 %	378975973
58	NC_016839	CTGAA	2	10	97155	97164	40 %	20 %	20 %	20 %	378975973
59	NC_016839	CTTTT	2	10	101336	101345	0 %	80 %	0 %	20 %	378975979
60	NC_016839	AAAAG	2	10	103655	103664	80 %	0 %	20 %	0 %	378975982
61	NC_016839	GCCCT	2	10	103962	103971	0 %	20 %	20 %	60 %	378975983

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.