MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS3

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016839	AATA	2	8	160	167	75 %	25 %	0 %	0 %	378975833
2	NC_016839	GATC	2	8	432	439	25 %	25 %	25 %	25 %	378975834
3	NC_016839	AACG	2	8	474	481	50 %	0 %	25 %	25 %	378975834
4	NC_016839	ACTC	2	8	542	549	25 %	25 %	0 %	50 %	378975834
5	NC_016839	ATCC	2	8	666	673	25 %	25 %	0 %	50 %	378975834
6	NC_016839	ATCA	2	8	766	773	50 %	25 %	0 %	25 %	378975835
7	NC_016839	ATCC	2	8	2243	2250	25 %	25 %	0 %	50 %	378975837
8	NC_016839	TTGG	2	8	3052	3059	0 %	50 %	50 %	0 %	378975838
9	NC_016839	ATCC	2	8	3749	3756	25 %	25 %	0 %	50 %	378975839
10	NC_016839	TGGC	2	8	4517	4524	0 %	25 %	50 %	25 %	378975841
11	NC_016839	TCCA	2	8	5824	5831	25 %	25 %	0 %	50 %	378975843
12	NC_016839	TGAT	2	8	6335	6342	25 %	50 %	25 %	0 %	378975843
13	NC_016839	CAAA	2	8	6915	6922	75 %	0 %	0 %	25 %	378975844
14	NC_016839	TGGT	2	8	7550	7557	0 %	50 %	50 %	0 %	378975845
15	NC_016839	TGCC	2	8	8509	8516	0 %	25 %	25 %	50 %	378975847
16	NC_016839	CTAT	2	8	9182	9189	25 %	50 %	0 %	25 %	378975848
17	NC_016839	TCAT	2	8	9524	9531	25 %	50 %	0 %	25 %	378975850
18	NC_016839	GTTC	2	8	9594	9601	0 %	50 %	25 %	25 %	378975850
19	NC_016839	ATGG	2	8	9697	9704	25 %	25 %	50 %	0 %	378975850
20	NC_016839	TGCT	2	8	10069	10076	0 %	50 %	25 %	25 %	378975850
21	NC_016839	CTGA	2	8	10656	10663	25 %	25 %	25 %	25 %	378975852
22	NC_016839	GAAC	2	8	11599	11606	50 %	0 %	25 %	25 %	378975854
23	NC_016839	TGAA	2	8	12603	12610	50 %	25 %	25 %	0 %	378975857
24	NC_016839	TGGC	2	8	13298	13305	0 %	25 %	50 %	25 %	378975858
25	NC_016839	GAGC	2	8	14021	14028	25 %	0 %	50 %	25 %	378975860
26	NC_016839	GCAA	2	8	14321	14328	50 %	0 %	25 %	25 %	378975861
27	NC_016839	GGAG	2	8	15146	15153	25 %	0 %	75 %	0 %	378975863
28	NC_016839	CGAC	2	8	15189	15196	25 %	0 %	25 %	50 %	378975863
29	NC_016839	GGAT	2	8	15880	15887	25 %	25 %	50 %	0 %	378975864
30	NC_016839	TCAA	2	8	16206	16213	50 %	25 %	0 %	25 %	378975865
31	NC_016839	CCAG	2	8	16224	16231	25 %	0 %	25 %	50 %	378975865
32	NC_016839	AAGC	2	8	16807	16814	50 %	0 %	25 %	25 %	378975866
33	NC_016839	TGAC	2	8	16994	17001	25 %	25 %	25 %	25 %	378975866
34	NC_016839	GTCA	2	8	17412	17419	25 %	25 %	25 %	25 %	378975866
35	NC_016839	AAAG	2	8	17656	17663	75 %	0 %	25 %	0 %	378975867
36	NC_016839	CTTT	2	8	17778	17785	0 %	75 %	0 %	25 %	378975867
37	NC_016839	AACG	2	8	18005	18012	50 %	0 %	25 %	25 %	378975867
38	NC_016839	TTGA	2	8	18452	18459	25 %	50 %	25 %	0 %	378975867
39	NC_016839	GAGC	2	8	19097	19104	25 %	0 %	50 %	25 %	378975868
40	NC_016839	ACAA	2	8	19160	19167	75 %	0 %	0 %	25 %	378975869
41	NC_016839	GGAG	2	8	19558	19565	25 %	0 %	75 %	0 %	378975870
42	NC_016839	TGGT	2	8	20159	20166	0 %	50 %	50 %	0 %	378975871
43	NC_016839	TTTG	2	8	20386	20393	0 %	75 %	25 %	0 %	378975871
44	NC_016839	GCCA	2	8	20666	20673	25 %	0 %	25 %	50 %	378975872
45	NC_016839	CCTC	2	8	21155	21162	0 %	25 %	0 %	75 %	378975872
46	NC_016839	ACAA	2	8	21614	21621	75 %	0 %	0 %	25 %	378975873
47	NC_016839	TGAG	2	8	22082	22089	25 %	25 %	50 %	0 %	378975874
48	NC_016839	GTTG	2	8	22739	22746	0 %	50 %	50 %	0 %	378975876
49	NC_016839	CTTG	2	8	22967	22974	0 %	50 %	25 %	25 %	378975876
50	NC_016839	AGCG	2	8	24361	24368	25 %	0 %	50 %	25 %	378975879
51	NC_016839	TGAT	2	8	25019	25026	25 %	50 %	25 %	0 %	378975879
52	NC_016839	GAAC	2	8	25151	25158	50 %	0 %	25 %	25 %	378975879
53	NC_016839	CCTG	2	8	25721	25728	0 %	25 %	25 %	50 %	378975880
54	NC_016839	TCTG	2	8	25747	25754	0 %	50 %	25 %	25 %	378975880
55	NC_016839	ACGC	2	8	26286	26293	25 %	0 %	25 %	50 %	378975880
56	NC_016839	ATTT	2	8	26442	26449	25 %	75 %	0 %	0 %	378975880
57	NC_016839	GAAG	2	8	26591	26598	50 %	0 %	50 %	0 %	378975881
58	NC_016839	GCTG	2	8	28098	28105	0 %	25 %	50 %	25 %	378975884
59	NC_016839	ACTT	2	8	30146	30153	25 %	50 %	0 %	25 %	378975886
60	NC_016839	TGAA	2	8	30245	30252	50 %	25 %	25 %	0 %	378975886
61	NC_016839	TGGA	2	8	30367	30374	25 %	25 %	50 %	0 %	378975886
62	NC_016839	GGCT	2	8	30417	30424	0 %	25 %	50 %	25 %	378975886
63	NC_016839	CTGA	2	8	30857	30864	25 %	25 %	25 %	25 %	378975887
64	NC_016839	GCAC	2	8	30908	30915	25 %	0 %	25 %	50 %	378975887
65	NC_016839	GGCG	2	8	31400	31407	0 %	0 %	75 %	25 %	378975887
66	NC_016839	CACC	2	8	31938	31945	25 %	0 %	0 %	75 %	378975888
67	NC_016839	CGCT	2	8	32965	32972	0 %	25 %	25 %	50 %	378975891
68	NC_016839	GGCT	2	8	33545	33552	0 %	25 %	50 %	25 %	378975892
69	NC_016839	ATGG	2	8	33608	33615	25 %	25 %	50 %	0 %	378975892
70	NC_016839	GCTG	2	8	33662	33669	0 %	25 %	50 %	25 %	378975892
71	NC_016839	TGCG	2	8	34017	34024	0 %	25 %	50 %	25 %	378975892
72	NC_016839	GCCG	2	8	34877	34884	0 %	0 %	50 %	50 %	378975893
73	NC_016839	CTTG	2	8	35419	35426	0 %	50 %	25 %	25 %	378975895
74	NC_016839	CCAT	2	8	35512	35519	25 %	25 %	0 %	50 %	378975895
75	NC_016839	GCCC	2	8	35990	35997	0 %	0 %	25 %	75 %	378975895
76	NC_016839	AGCG	2	8	36658	36665	25 %	0 %	50 %	25 %	378975896
77	NC_016839	CGCT	2	8	36711	36718	0 %	25 %	25 %	50 %	378975896
78	NC_016839	CGAC	2	8	36825	36832	25 %	0 %	25 %	50 %	378975896
79	NC_016839	GTCA	2	8	36924	36931	25 %	25 %	25 %	25 %	378975896
80	NC_016839	AGCA	2	8	37009	37016	50 %	0 %	25 %	25 %	378975896
81	NC_016839	GCGA	2	8	38019	38026	25 %	0 %	50 %	25 %	378975898
82	NC_016839	ATGG	2	8	38415	38422	25 %	25 %	50 %	0 %	378975898
83	NC_016839	CGGC	2	8	39574	39581	0 %	0 %	50 %	50 %	378975899
84	NC_016839	TGGC	2	8	39603	39610	0 %	25 %	50 %	25 %	378975899
85	NC_016839	GGAT	2	8	39930	39937	25 %	25 %	50 %	0 %	378975900
86	NC_016839	AGAA	2	8	39949	39956	75 %	0 %	25 %	0 %	378975900
87	NC_016839	AGCC	2	8	40079	40086	25 %	0 %	25 %	50 %	378975900
88	NC_016839	GCTT	2	8	40359	40366	0 %	50 %	25 %	25 %	378975901
89	NC_016839	TGGC	2	8	40672	40679	0 %	25 %	50 %	25 %	378975901
90	NC_016839	CCGC	2	8	41639	41646	0 %	0 %	25 %	75 %	378975904
91	NC_016839	CTGG	2	8	42291	42298	0 %	25 %	50 %	25 %	378975905
92	NC_016839	GGCG	2	8	43661	43668	0 %	0 %	75 %	25 %	378975907
93	NC_016839	CAGC	2	8	43978	43985	25 %	0 %	25 %	50 %	378975907
94	NC_016839	GCTG	2	8	44364	44371	0 %	25 %	50 %	25 %	378975908
95	NC_016839	GTTC	2	8	44433	44440	0 %	50 %	25 %	25 %	378975908
96	NC_016839	GGTG	2	8	44534	44541	0 %	25 %	75 %	0 %	378975908
97	NC_016839	AGCG	2	8	45000	45007	25 %	0 %	50 %	25 %	378975909
98	NC_016839	CTGA	2	8	45124	45131	25 %	25 %	25 %	25 %	378975909
99	NC_016839	GCAA	2	8	46562	46569	50 %	0 %	25 %	25 %	378975912
100	NC_016839	TCTT	2	8	47332	47339	0 %	75 %	0 %	25 %	378975912
101	NC_016839	AGCG	2	8	47607	47614	25 %	0 %	50 %	25 %	378975913
102	NC_016839	GCTG	2	8	48192	48199	0 %	25 %	50 %	25 %	378975914
103	NC_016839	CGAA	2	8	48825	48832	50 %	0 %	25 %	25 %	378975914
104	NC_016839	ACTT	2	8	50220	50227	25 %	50 %	0 %	25 %	378975916
105	NC_016839	TGAA	2	8	50319	50326	50 %	25 %	25 %	0 %	378975916
106	NC_016839	TGGA	2	8	50441	50448	25 %	25 %	50 %	0 %	378975916
107	NC_016839	GGCT	2	8	50491	50498	0 %	25 %	50 %	25 %	378975916
108	NC_016839	CCAG	2	8	51373	51380	25 %	0 %	25 %	50 %	378975918
109	NC_016839	CAGA	2	8	52452	52459	50 %	0 %	25 %	25 %	378975919
110	NC_016839	TTTC	2	8	52812	52819	0 %	75 %	0 %	25 %	378975920
111	NC_016839	ACAG	2	8	52982	52989	50 %	0 %	25 %	25 %	378975920
112	NC_016839	CTGC	2	8	53202	53209	0 %	25 %	25 %	50 %	378975920
113	NC_016839	CGAG	2	8	53358	53365	25 %	0 %	50 %	25 %	378975920
114	NC_016839	GTTT	2	8	54280	54287	0 %	75 %	25 %	0 %	378975922
115	NC_016839	AAAG	2	8	54497	54504	75 %	0 %	25 %	0 %	378975923
116	NC_016839	ATGG	2	8	54519	54526	25 %	25 %	50 %	0 %	378975923
117	NC_016839	TCAT	2	8	54676	54683	25 %	50 %	0 %	25 %	378975923
118	NC_016839	TGAT	2	8	54793	54800	25 %	50 %	25 %	0 %	378975923
119	NC_016839	TGAA	2	8	55759	55766	50 %	25 %	25 %	0 %	378975924
120	NC_016839	ACTG	2	8	55880	55887	25 %	25 %	25 %	25 %	378975924
121	NC_016839	GACC	2	8	56252	56259	25 %	0 %	25 %	50 %	378975924
122	NC_016839	GAAT	2	8	56572	56579	50 %	25 %	25 %	0 %	378975925
123	NC_016839	TCCA	2	8	56984	56991	25 %	25 %	0 %	50 %	378975926
124	NC_016839	AGCA	2	8	57942	57949	50 %	0 %	25 %	25 %	378975928
125	NC_016839	AGGC	2	8	58192	58199	25 %	0 %	50 %	25 %	378975928
126	NC_016839	CAAA	2	8	58692	58699	75 %	0 %	0 %	25 %	378975930
127	NC_016839	GTTC	2	8	58821	58828	0 %	50 %	25 %	25 %	378975930
128	NC_016839	AAGG	2	8	59860	59867	50 %	0 %	50 %	0 %	378975932
129	NC_016839	AGAA	2	8	60399	60406	75 %	0 %	25 %	0 %	378975934
130	NC_016839	GGTT	2	8	62258	62265	0 %	50 %	50 %	0 %	378975937
131	NC_016839	CAGC	2	8	63700	63707	25 %	0 %	25 %	50 %	378975939
132	NC_016839	CAAA	2	8	64028	64035	75 %	0 %	0 %	25 %	378975940
133	NC_016839	CTGG	2	8	65083	65090	0 %	25 %	50 %	25 %	378975941
134	NC_016839	CGCT	2	8	65125	65132	0 %	25 %	25 %	50 %	378975941
135	NC_016839	ATCT	2	8	66969	66976	25 %	50 %	0 %	25 %	378975945
136	NC_016839	CAAG	2	8	67813	67820	50 %	0 %	25 %	25 %	378975946
137	NC_016839	CGAC	2	8	69696	69703	25 %	0 %	25 %	50 %	378975948
138	NC_016839	CTTC	2	8	69707	69714	0 %	50 %	0 %	50 %	378975948
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.