MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS3

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016839	GTT	2	6	1907	1912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016839	TAT	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016839	GGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016839	AGG	2	6	3894	3899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016839	AGG	2	6	10304	10309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016839	CGG	2	6	12507	12512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016839	CGA	2	6	13468	13473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016839	GAG	2	6	13484	13489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016839	GGC	2	6	15989	15994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016839	ATG	2	6	16041	16046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016839	GAT	2	6	16109	16114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016839	CAT	2	6	17473	17478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016839	ATG	2	6	17490	17495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016839	CAA	2	6	17505	17510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016839	TTC	2	6	25481	25486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016839	CCG	2	6	27033	27038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016839	CGC	2	6	27372	27377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016839	CTC	2	6	27396	27401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016839	GGT	2	6	27441	27446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016839	ATT	2	6	27589	27594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016839	TAT	2	6	27720	27725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016839	AGG	2	6	27743	27748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016839	GGT	2	6	27953	27958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016839	ATC	2	6	27968	27973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016839	TAA	2	6	28959	28964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016839	ATA	2	6	29593	29598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016839	AAT	2	6	29723	29728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016839	ATC	2	6	31548	31553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016839	GTC	2	6	32587	32592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016839	TGT	2	6	32691	32696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016839	CGC	2	6	32702	32707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016839	GCG	2	6	34400	34405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016839	TCA	2	6	35141	35146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016839	GAT	2	6	35168	35173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016839	GTC	2	6	37341	37346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016839	CAA	3	9	38645	38653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016839	CTG	2	6	38677	38682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016839	GTT	2	6	38748	38753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016839	TTA	2	6	40119	40124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016839	ATA	2	6	40138	40143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016839	GCC	2	6	40213	40218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016839	ATG	2	6	41046	41051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016839	GTG	2	6	41365	41370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016839	GCA	2	6	41422	41427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016839	CTG	2	6	41979	41984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016839	TGC	2	6	41996	42001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016839	TGC	2	6	42040	42045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016839	GCT	2	6	43253	43258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016839	TCT	2	6	43294	43299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016839	GGT	2	6	43315	43320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016839	ATC	2	6	45474	45479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016839	GAC	2	6	45506	45511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016839	ACC	2	6	45553	45558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016839	CGC	2	6	45567	45572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016839	TGA	2	6	45577	45582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016839	GCC	2	6	45631	45636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016839	CTG	2	6	45767	45772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016839	TTC	2	6	45858	45863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016839	CGG	2	6	46338	46343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016839	CAG	2	6	49105	49110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016839	GCT	2	6	49307	49312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016839	AGC	2	6	49372	49377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016839	GTT	2	6	49378	49383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016839	CGG	2	6	49386	49391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016839	GAA	2	6	49395	49400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016839	TAG	2	6	49411	49416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016839	GAT	2	6	49479	49484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016839	TCC	2	6	49618	49623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016839	ATA	2	6	49667	49672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016839	AAT	2	6	49797	49802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016839	TGA	2	6	52755	52760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016839	TAA	4	12	53622	53633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016839	AGG	2	6	56376	56381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016839	AGC	2	6	56704	56709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016839	CGG	2	6	56734	56739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016839	GAA	2	6	57426	57431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016839	CCG	2	6	57434	57439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016839	TGT	2	6	57643	57648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016839	ATT	2	6	57694	57699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016839	CAT	2	6	57704	57709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016839	ATA	2	6	57713	57718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016839	ACT	2	6	58374	58379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016839	GAT	2	6	61476	61481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016839	TGG	2	6	61484	61489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016839	CAT	2	6	61830	61835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016839	GTG	2	6	61847	61852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016839	TCT	2	6	63396	63401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016839	TCC	2	6	63436	63441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016839	TTA	2	6	63501	63506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016839	CTG	2	6	63528	63533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016839	CCT	2	6	64281	64286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016839	CCT	2	6	66421	66426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016839	GGC	2	6	67378	67383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016839	TTA	2	6	72902	72907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016839	GCA	2	6	73086	73091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016839	GCC	3	9	73435	73443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016839	CAT	2	6	73470	73475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016839	TAT	2	6	73513	73518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016839	ATG	2	6	74662	74667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016839	GTT	2	6	74679	74684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016839	TGT	2	6	74806	74811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016839	TTA	2	6	74817	74822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016839	GCT	2	6	75264	75269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016839	GAT	2	6	75472	75477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016839	GTC	2	6	78420	78425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016839	CCG	2	6	78605	78610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016839	ATG	2	6	78652	78657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016839	CTA	2	6	78670	78675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016839	GGC	2	6	78712	78717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016839	ATA	2	6	80978	80983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016839	AGT	2	6	80992	80997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016839	GGT	2	6	82387	82392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016839	AAT	2	6	82397	82402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016839	TTC	2	6	82430	82435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016839	TAA	2	6	82458	82463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016839	TTG	2	6	83409	83414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016839	CAG	2	6	88835	88840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016839	TAT	2	6	88868	88873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016839	AGA	2	6	89987	89992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016839	GAG	2	6	90030	90035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016839	TGG	2	6	90132	90137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016839	GAA	2	6	90171	90176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016839	AAG	2	6	90207	90212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016839	AAT	2	6	97987	97992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016839	CAG	2	6	98001	98006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016839	CTT	2	6	98475	98480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016839	CAT	2	6	98676	98681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016839	CTC	2	6	98719	98724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016839	CTG	2	6	98730	98735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016839	TTG	2	6	98955	98960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016839	CAT	2	6	98965	98970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016839	AGA	2	6	99015	99020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016839	AAC	2	6	99063	99068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016839	AGA	2	6	101086	101091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016839	GCG	2	6	101108	101113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016839	CCT	2	6	101843	101848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016839	TCC	2	6	102842	102847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016839	GGT	2	6	103080	103085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016839	AAT	2	6	103264	103269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016839	CCA	2	6	105253	105258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_016839	AGA	2	6	105317	105322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016839	ACG	2	6	105497	105502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016839	TGC	2	6	105517	105522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.