MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS3

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016839	CA	3	6	3461	3466	50 %	0 %	0 %	50 %	378975839
2	NC_016839	CA	3	6	3610	3615	50 %	0 %	0 %	50 %	378975839
3	NC_016839	AC	3	6	6404	6409	50 %	0 %	0 %	50 %	378975843
4	NC_016839	AC	3	6	6908	6913	50 %	0 %	0 %	50 %	378975844
5	NC_016839	CA	3	6	7939	7944	50 %	0 %	0 %	50 %	378975846
6	NC_016839	GA	3	6	8987	8992	50 %	0 %	50 %	0 %	378975848
7	NC_016839	TA	3	6	9012	9017	50 %	50 %	0 %	0 %	378975848
8	NC_016839	GA	3	6	11010	11015	50 %	0 %	50 %	0 %	378975852
9	NC_016839	GA	3	6	11302	11307	50 %	0 %	50 %	0 %	378975853
10	NC_016839	GA	3	6	11716	11721	50 %	0 %	50 %	0 %	378975854
11	NC_016839	AC	3	6	12777	12782	50 %	0 %	0 %	50 %	378975857
12	NC_016839	AG	3	6	12892	12897	50 %	0 %	50 %	0 %	378975857
13	NC_016839	GA	3	6	16767	16772	50 %	0 %	50 %	0 %	378975866
14	NC_016839	AG	3	6	17069	17074	50 %	0 %	50 %	0 %	378975866
15	NC_016839	CT	3	6	17244	17249	0 %	50 %	0 %	50 %	378975866
16	NC_016839	AG	3	6	17632	17637	50 %	0 %	50 %	0 %	378975867
17	NC_016839	CA	3	6	18045	18050	50 %	0 %	0 %	50 %	378975867
18	NC_016839	GA	3	6	19117	19122	50 %	0 %	50 %	0 %	378975868
19	NC_016839	AG	3	6	19136	19141	50 %	0 %	50 %	0 %	378975868
20	NC_016839	TC	3	6	19402	19407	0 %	50 %	0 %	50 %	378975869
21	NC_016839	AG	3	6	23058	23063	50 %	0 %	50 %	0 %	378975876
22	NC_016839	CG	3	6	24672	24677	0 %	0 %	50 %	50 %	378975879
23	NC_016839	GC	3	6	25078	25083	0 %	0 %	50 %	50 %	378975879
24	NC_016839	CG	4	8	26020	26027	0 %	0 %	50 %	50 %	378975880
25	NC_016839	GC	3	6	26301	26306	0 %	0 %	50 %	50 %	378975880
26	NC_016839	GT	3	6	26471	26476	0 %	50 %	50 %	0 %	378975880
27	NC_016839	GC	3	6	26758	26763	0 %	0 %	50 %	50 %	378975881
28	NC_016839	GA	3	6	27001	27006	50 %	0 %	50 %	0 %	378975881
29	NC_016839	CT	3	6	27255	27260	0 %	50 %	0 %	50 %	378975882
30	NC_016839	TC	3	6	28311	28316	0 %	50 %	0 %	50 %	378975884
31	NC_016839	CG	3	6	28429	28434	0 %	0 %	50 %	50 %	378975884
32	NC_016839	TG	3	6	31251	31256	0 %	50 %	50 %	0 %	378975887
33	NC_016839	TA	3	6	31504	31509	50 %	50 %	0 %	0 %	378975887
34	NC_016839	GC	3	6	32285	32290	0 %	0 %	50 %	50 %	378975889
35	NC_016839	GC	3	6	32840	32845	0 %	0 %	50 %	50 %	378975890
36	NC_016839	CG	3	6	32877	32882	0 %	0 %	50 %	50 %	378975890
37	NC_016839	AG	3	6	33066	33071	50 %	0 %	50 %	0 %	378975891
38	NC_016839	CG	3	6	33120	33125	0 %	0 %	50 %	50 %	378975891
39	NC_016839	GC	3	6	33365	33370	0 %	0 %	50 %	50 %	378975891
40	NC_016839	GT	3	6	33521	33526	0 %	50 %	50 %	0 %	378975892
41	NC_016839	CG	3	6	33968	33973	0 %	0 %	50 %	50 %	378975892
42	NC_016839	GC	3	6	34272	34277	0 %	0 %	50 %	50 %	378975892
43	NC_016839	GC	5	10	34304	34313	0 %	0 %	50 %	50 %	378975892
44	NC_016839	GC	3	6	34995	35000	0 %	0 %	50 %	50 %	378975894
45	NC_016839	AT	3	6	35711	35716	50 %	50 %	0 %	0 %	378975895
46	NC_016839	CT	3	6	36786	36791	0 %	50 %	0 %	50 %	378975896
47	NC_016839	GC	3	6	36802	36807	0 %	0 %	50 %	50 %	378975896
48	NC_016839	GC	3	6	36899	36904	0 %	0 %	50 %	50 %	378975896
49	NC_016839	GA	3	6	36978	36983	50 %	0 %	50 %	0 %	378975896
50	NC_016839	CG	3	6	37714	37719	0 %	0 %	50 %	50 %	378975898
51	NC_016839	GC	4	8	39033	39040	0 %	0 %	50 %	50 %	378975899
52	NC_016839	TG	3	6	41755	41760	0 %	50 %	50 %	0 %	378975904
53	NC_016839	CG	3	6	42755	42760	0 %	0 %	50 %	50 %	378975905
54	NC_016839	GC	3	6	42867	42872	0 %	0 %	50 %	50 %	378975905
55	NC_016839	GC	3	6	43648	43653	0 %	0 %	50 %	50 %	378975907
56	NC_016839	GA	3	6	43767	43772	50 %	0 %	50 %	0 %	378975907
57	NC_016839	GC	3	6	44315	44320	0 %	0 %	50 %	50 %	378975908
58	NC_016839	GC	3	6	44327	44332	0 %	0 %	50 %	50 %	378975908
59	NC_016839	CA	3	6	45347	45352	50 %	0 %	0 %	50 %	378975909
60	NC_016839	GC	3	6	46465	46470	0 %	0 %	50 %	50 %	378975912
61	NC_016839	TG	3	6	47542	47547	0 %	50 %	50 %	0 %	378975913
62	NC_016839	GC	3	6	48618	48623	0 %	0 %	50 %	50 %	378975914
63	NC_016839	TC	3	6	48815	48820	0 %	50 %	0 %	50 %	378975914
64	NC_016839	GA	3	6	51244	51249	50 %	0 %	50 %	0 %	378975918
65	NC_016839	GC	3	6	51518	51523	0 %	0 %	50 %	50 %	378975918
66	NC_016839	GA	3	6	51664	51669	50 %	0 %	50 %	0 %	378975918
67	NC_016839	GC	3	6	52025	52030	0 %	0 %	50 %	50 %	378975919
68	NC_016839	GT	3	6	52864	52869	0 %	50 %	50 %	0 %	378975920
69	NC_016839	GC	4	8	52956	52963	0 %	0 %	50 %	50 %	378975920
70	NC_016839	GC	3	6	53140	53145	0 %	0 %	50 %	50 %	378975920
71	NC_016839	CG	3	6	53411	53416	0 %	0 %	50 %	50 %	378975920
72	NC_016839	CT	3	6	54873	54878	0 %	50 %	0 %	50 %	378975923
73	NC_016839	TG	3	6	55683	55688	0 %	50 %	50 %	0 %	378975924
74	NC_016839	TC	3	6	56945	56950	0 %	50 %	0 %	50 %	378975926
75	NC_016839	GA	3	6	57195	57200	50 %	0 %	50 %	0 %	378975926
76	NC_016839	GA	3	6	57337	57342	50 %	0 %	50 %	0 %	378975926
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81	NC_016839	CT	3	6	63202	63207	0 %	50 %	0 %	50 %	378975938
82	NC_016839	AG	3	6	63234	63239	50 %	0 %	50 %	0 %	378975938
83	NC_016839	TC	3	6	63335	63340	0 %	50 %	0 %	50 %	378975938
84	NC_016839	GA	3	6	65050	65055	50 %	0 %	50 %	0 %	378975941
85	NC_016839	CA	3	6	65230	65235	50 %	0 %	0 %	50 %	378975941
86	NC_016839	GT	3	6	65952	65957	0 %	50 %	50 %	0 %	378975941
87	NC_016839	TC	3	6	66490	66495	0 %	50 %	0 %	50 %	378975943
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91	NC_016839	AC	4	8	70434	70441	50 %	0 %	0 %	50 %	378975948
92	NC_016839	GT	4	8	73288	73295	0 %	50 %	50 %	0 %	378975950
93	NC_016839	AG	3	6	74130	74135	50 %	0 %	50 %	0 %	378975952
94	NC_016839	AG	3	6	76663	76668	50 %	0 %	50 %	0 %	378975955
95	NC_016839	AG	3	6	76998	77003	50 %	0 %	50 %	0 %	378975955
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99	NC_016839	TC	3	6	78546	78551	0 %	50 %	0 %	50 %	378975958
100	NC_016839	TC	4	8	78556	78563	0 %	50 %	0 %	50 %	378975958
101	NC_016839	CT	3	6	78783	78788	0 %	50 %	0 %	50 %	378975959
102	NC_016839	AG	3	6	79110	79115	50 %	0 %	50 %	0 %	378975959
103	NC_016839	AG	3	6	79276	79281	50 %	0 %	50 %	0 %	378975959
104	NC_016839	TG	3	6	80156	80161	0 %	50 %	50 %	0 %	378975960
105	NC_016839	CG	3	6	80225	80230	0 %	0 %	50 %	50 %	378975960
106	NC_016839	TG	3	6	80389	80394	0 %	50 %	50 %	0 %	378975960
107	NC_016839	GT	3	6	80588	80593	0 %	50 %	50 %	0 %	378975960
108	NC_016839	GA	4	8	80769	80776	50 %	0 %	50 %	0 %	378975960
109	NC_016839	TA	3	6	81962	81967	50 %	50 %	0 %	0 %	378975961
110	NC_016839	AG	3	6	82537	82542	50 %	0 %	50 %	0 %	378975963
111	NC_016839	GC	3	6	82594	82599	0 %	0 %	50 %	50 %	378975963
112	NC_016839	CG	3	6	82992	82997	0 %	0 %	50 %	50 %	378975963
113	NC_016839	GA	3	6	83066	83071	50 %	0 %	50 %	0 %	378975963
114	NC_016839	AG	3	6	83345	83350	50 %	0 %	50 %	0 %	378975963
115	NC_016839	GC	3	6	83691	83696	0 %	0 %	50 %	50 %	378975964
116	NC_016839	GC	3	6	84113	84118	0 %	0 %	50 %	50 %	378975964
117	NC_016839	GC	3	6	85544	85549	0 %	0 %	50 %	50 %	378975967
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119	NC_016839	CG	3	6	87807	87812	0 %	0 %	50 %	50 %	378975968
120	NC_016839	GC	3	6	88404	88409	0 %	0 %	50 %	50 %	378975968
121	NC_016839	AC	3	6	90270	90275	50 %	0 %	0 %	50 %	378975970
122	NC_016839	GA	3	6	90692	90697	50 %	0 %	50 %	0 %	378975970
123	NC_016839	CT	3	6	91193	91198	0 %	50 %	0 %	50 %	378975970
124	NC_016839	AC	3	6	95331	95336	50 %	0 %	0 %	50 %	378975973
125	NC_016839	GT	3	6	98306	98311	0 %	50 %	50 %	0 %	378975974
126	NC_016839	CT	3	6	100186	100191	0 %	50 %	0 %	50 %	378975977
127	NC_016839	GA	3	6	100278	100283	50 %	0 %	50 %	0 %	378975977
128	NC_016839	GA	3	6	100317	100322	50 %	0 %	50 %	0 %	378975977
129	NC_016839	AC	3	6	100456	100461	50 %	0 %	0 %	50 %	378975977
130	NC_016839	CA	3	6	100719	100724	50 %	0 %	0 %	50 %	378975978
131	NC_016839	CT	3	6	100739	100744	0 %	50 %	0 %	50 %	378975978
132	NC_016839	CT	3	6	101492	101497	0 %	50 %	0 %	50 %	378975979
133	NC_016839	CT	3	6	101641	101646	0 %	50 %	0 %	50 %	378975980
134	NC_016839	CT	3	6	102469	102474	0 %	50 %	0 %	50 %	378975981
135	NC_016839	TC	3	6	102657	102662	0 %	50 %	0 %	50 %	378975981

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.