MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	TCTCAA	2	12	2049	2060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975692
2	NC_016838	CGCCAA	2	12	2177	2188	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378975693
3	NC_016838	TCATCC	2	12	3884	3895	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975695
4	NC_016838	GTCGCC	2	12	5005	5016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378975697
5	NC_016838	AGCCTG	2	12	9868	9879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378975704
6	NC_016838	GACAGA	2	12	10622	10633	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378975704
7	NC_016838	AGATAC	2	12	11275	11286	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378975704
8	NC_016838	ACAATG	2	12	16485	16496	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378975709
9	NC_016838	CTTTTT	2	12	17219	17230	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378975710
10	NC_016838	TGGGCC	2	12	22738	22749	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975715
11	NC_016838	CAGGTG	2	12	28348	28359	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378975719
12	NC_016838	ATCAAT	2	12	33835	33846	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378975727
13	NC_016838	TTGAAG	2	12	33926	33937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975727
14	NC_016838	CAATGA	2	12	44590	44601	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378975739
15	NC_016838	ATTTTT	2	12	44672	44683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378975739
16	NC_016838	GATTTT	2	12	45747	45758	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378975742
17	NC_016838	TTTGTG	2	12	51935	51946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975749
18	NC_016838	TCCATG	2	12	52167	52178	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975749
19	NC_016838	AGCGGC	2	12	55935	55946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378975750
20	NC_016838	GCATCA	2	12	57379	57390	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975751
21	NC_016838	GTATCG	2	12	58084	58095	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975751
22	NC_016838	GCCATT	2	12	61740	61751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378975751
23	NC_016838	GGTTAC	2	12	62706	62717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975752
24	NC_016838	TTCCCA	2	12	65664	65675	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378975756
25	NC_016838	CGCCAT	2	12	69482	69493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378975758
26	NC_016838	CGGCAA	2	12	76096	76107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975770
27	NC_016838	GATGTC	2	12	77736	77747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975772
28	NC_016838	TGGCTC	2	12	79538	79549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975774
29	NC_016838	AGCTAA	2	12	94890	94901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378975798
30	NC_016838	GAAACC	2	12	98902	98913	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378975801
31	NC_016838	GAAGCG	2	12	100323	100334	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378975802
32	NC_016838	ACATCA	2	12	105329	105340	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378975810
33	NC_016838	TCTCGC	2	12	105416	105427	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378975810
34	NC_016838	CCGGTG	2	12	110164	110175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378975817
35	NC_016838	ATCCAG	2	12	115570	115581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975821
36	NC_016838	AATTGA	2	12	115965	115976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378975822
37	NC_016838	TGTGGT	2	12	119013	119024	0 %	50 %	50 %	0 %	378975826
38	NC_016838	ATTTCG	2	12	120757	120768	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378975830

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.