MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	CGGTA	2	10	232	241	20 %	20 %	40 %	20 %	378975691
2	NC_016838	GAAGA	2	10	822	831	60 %	0 %	40 %	0 %	378975691
3	NC_016838	CGGGT	2	10	3350	3359	0 %	20 %	60 %	20 %	378975695
4	NC_016838	ATCTT	2	10	3440	3449	20 %	60 %	0 %	20 %	378975695
5	NC_016838	TCGAC	2	10	7601	7610	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016838	AGGGC	2	10	8118	8127	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016838	TGCGC	2	10	9825	9834	0 %	20 %	40 %	40 %	378975704
8	NC_016838	CGGCG	2	10	13688	13697	0 %	0 %	60 %	40 %	378975707
9	NC_016838	TGAAC	2	10	14295	14304	40 %	20 %	20 %	20 %	378975707
10	NC_016838	GCCTT	2	10	14750	14759	0 %	40 %	20 %	40 %	378975707
11	NC_016838	ATCGT	2	10	18608	18617	20 %	40 %	20 %	20 %	378975711
12	NC_016838	CCGAT	2	10	18855	18864	20 %	20 %	20 %	40 %	378975711
13	NC_016838	TCTCC	2	10	19522	19531	0 %	40 %	0 %	60 %	378975711
14	NC_016838	GTATT	2	10	21762	21771	20 %	60 %	20 %	0 %	378975714
15	NC_016838	CGCTG	2	10	22642	22651	0 %	20 %	40 %	40 %	378975715
16	NC_016838	GAGAT	2	10	22726	22735	40 %	20 %	40 %	0 %	378975715
17	NC_016838	GAGAG	2	10	22764	22773	40 %	0 %	60 %	0 %	378975715
18	NC_016838	TAAAA	2	10	23480	23489	80 %	20 %	0 %	0 %	378975716
19	NC_016838	CCCAG	2	10	26619	26628	20 %	0 %	20 %	60 %	378975719
20	NC_016838	GCGCG	2	10	27166	27175	0 %	0 %	60 %	40 %	378975719
21	NC_016838	AATAA	2	10	30331	30340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016838	TTTGC	2	10	31751	31760	0 %	60 %	20 %	20 %	378975723
23	NC_016838	TGATC	2	10	31793	31802	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016838	TTAGC	2	10	35610	35619	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016838	TTCCT	2	10	35845	35854	0 %	60 %	0 %	40 %	378975729
26	NC_016838	ACCAC	2	10	38622	38631	40 %	0 %	0 %	60 %	378975733
27	NC_016838	GAAAA	2	10	38944	38953	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016838	GCGTT	2	10	42222	42231	0 %	40 %	40 %	20 %	378975736
29	NC_016838	TCTCT	2	10	42654	42663	0 %	60 %	0 %	40 %	378975736
30	NC_016838	AATTG	2	10	44436	44445	40 %	40 %	20 %	0 %	378975739
31	NC_016838	CGAAG	2	10	45931	45940	40 %	0 %	40 %	20 %	378975742
32	NC_016838	TGAAA	2	10	46261	46270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016838	AATTC	2	10	46749	46758	40 %	40 %	0 %	20 %	378975743
34	NC_016838	CGCTT	2	10	51702	51711	0 %	40 %	20 %	40 %	378975749
35	NC_016838	TGAAC	2	10	52131	52140	40 %	20 %	20 %	20 %	378975749
36	NC_016838	TACCT	2	10	52868	52877	20 %	40 %	0 %	40 %	378975750
37	NC_016838	TACGC	2	10	56769	56778	20 %	20 %	20 %	40 %	378975751
38	NC_016838	CGATA	2	10	57173	57182	40 %	20 %	20 %	20 %	378975751
39	NC_016838	CCTGA	2	10	58718	58727	20 %	20 %	20 %	40 %	378975751
40	NC_016838	GGTTG	2	10	58899	58908	0 %	40 %	60 %	0 %	378975751
41	NC_016838	ATCTT	2	10	59698	59707	20 %	60 %	0 %	20 %	378975751
42	NC_016838	CCCAG	2	10	59824	59833	20 %	0 %	20 %	60 %	378975751
43	NC_016838	CGTCA	2	10	61692	61701	20 %	20 %	20 %	40 %	378975751
44	NC_016838	CGTCT	2	10	62859	62868	0 %	40 %	20 %	40 %	378975752
45	NC_016838	CTGCG	2	10	63389	63398	0 %	20 %	40 %	40 %	378975753
46	NC_016838	CCCAG	2	10	65227	65236	20 %	0 %	20 %	60 %	378975756
47	NC_016838	AGTCC	2	10	65434	65443	20 %	20 %	20 %	40 %	378975756
48	NC_016838	GGCGT	2	10	66225	66234	0 %	20 %	60 %	20 %	378975757
49	NC_016838	CCCAA	2	10	66705	66714	40 %	0 %	0 %	60 %	378975757
50	NC_016838	AAGGT	2	10	72577	72586	40 %	20 %	40 %	0 %	378975764
51	NC_016838	TGTCG	2	10	77099	77108	0 %	40 %	40 %	20 %	378975771
52	NC_016838	ACAAG	2	10	77870	77879	60 %	0 %	20 %	20 %	378975772
53	NC_016838	GTGAA	2	10	79916	79925	40 %	20 %	40 %	0 %	378975775
54	NC_016838	TTCAT	2	10	82181	82190	20 %	60 %	0 %	20 %	378975779
55	NC_016838	AAACC	2	10	83255	83264	60 %	0 %	0 %	40 %	378975781
56	NC_016838	CCGAT	2	10	84943	84952	20 %	20 %	20 %	40 %	378975783
57	NC_016838	GTATT	2	10	85198	85207	20 %	60 %	20 %	0 %	378975783
58	NC_016838	TAAAT	2	10	86386	86395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016838	ATTTT	2	10	86548	86557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016838	TGTCG	2	10	87782	87791	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016838	CCCCT	2	10	88139	88148	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
62	NC_016838	TACAA	2	10	89702	89711	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016838	TTGTT	2	10	91833	91842	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016838	GACCC	2	10	95542	95551	20 %	0 %	20 %	60 %	378975798
65	NC_016838	GCAGA	2	10	95701	95710	40 %	0 %	40 %	20 %	378975798
66	NC_016838	GCGTG	2	10	97938	97947	0 %	20 %	60 %	20 %	378975801
67	NC_016838	ACACA	2	10	101922	101931	60 %	0 %	0 %	40 %	378975806
68	NC_016838	TATGT	2	10	102255	102264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016838	GAATC	2	10	102588	102597	40 %	20 %	20 %	20 %	378975807
70	NC_016838	CATCC	2	10	102604	102613	20 %	20 %	0 %	60 %	378975807
71	NC_016838	AAGAG	2	10	103052	103061	60 %	0 %	40 %	0 %	378975807
72	NC_016838	AGAAA	2	10	103920	103929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016838	GCAAT	2	10	105862	105871	40 %	20 %	20 %	20 %	378975811
74	NC_016838	GTCGA	2	10	106155	106164	20 %	20 %	40 %	20 %	378975811
75	NC_016838	TCGAC	2	10	106183	106192	20 %	20 %	20 %	40 %	378975811
76	NC_016838	CATCA	2	10	108034	108043	40 %	20 %	0 %	40 %	378975814
77	NC_016838	TCCGC	2	10	108071	108080	0 %	20 %	20 %	60 %	378975814
78	NC_016838	TCAGC	2	10	110832	110841	20 %	20 %	20 %	40 %	378975818
79	NC_016838	GCGTT	2	10	112283	112292	0 %	40 %	40 %	20 %	378975819
80	NC_016838	TCAGC	2	10	113010	113019	20 %	20 %	20 %	40 %	378975820
81	NC_016838	TTACG	2	10	114906	114915	20 %	40 %	20 %	20 %	378975820
82	NC_016838	TGCCT	2	10	115987	115996	0 %	40 %	20 %	40 %	378975822
83	NC_016838	GAACA	2	10	121977	121986	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.