MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	CGGTA	2	10	232	241	20 %	20 %	40 %	20 %	378975691
2	NC_016838	GAAGA	2	10	822	831	60 %	0 %	40 %	0 %	378975691
3	NC_016838	CGGGT	2	10	3350	3359	0 %	20 %	60 %	20 %	378975695
4	NC_016838	ATCTT	2	10	3440	3449	20 %	60 %	0 %	20 %	378975695
5	NC_016838	TGCGC	2	10	9825	9834	0 %	20 %	40 %	40 %	378975704
6	NC_016838	CGGCG	2	10	13688	13697	0 %	0 %	60 %	40 %	378975707
7	NC_016838	TGAAC	2	10	14295	14304	40 %	20 %	20 %	20 %	378975707
8	NC_016838	GCCTT	2	10	14750	14759	0 %	40 %	20 %	40 %	378975707
9	NC_016838	ATCGT	2	10	18608	18617	20 %	40 %	20 %	20 %	378975711
10	NC_016838	CCGAT	2	10	18855	18864	20 %	20 %	20 %	40 %	378975711
11	NC_016838	TCTCC	2	10	19522	19531	0 %	40 %	0 %	60 %	378975711
12	NC_016838	GTATT	2	10	21762	21771	20 %	60 %	20 %	0 %	378975714
13	NC_016838	CGCTG	2	10	22642	22651	0 %	20 %	40 %	40 %	378975715
14	NC_016838	GAGAT	2	10	22726	22735	40 %	20 %	40 %	0 %	378975715
15	NC_016838	GAGAG	2	10	22764	22773	40 %	0 %	60 %	0 %	378975715
16	NC_016838	TAAAA	2	10	23480	23489	80 %	20 %	0 %	0 %	378975716
17	NC_016838	CCCAG	2	10	26619	26628	20 %	0 %	20 %	60 %	378975719
18	NC_016838	GCGCG	2	10	27166	27175	0 %	0 %	60 %	40 %	378975719
19	NC_016838	TTTGC	2	10	31751	31760	0 %	60 %	20 %	20 %	378975723
20	NC_016838	TTCCT	2	10	35845	35854	0 %	60 %	0 %	40 %	378975729
21	NC_016838	ACCAC	2	10	38622	38631	40 %	0 %	0 %	60 %	378975733
22	NC_016838	GCGTT	2	10	42222	42231	0 %	40 %	40 %	20 %	378975736
23	NC_016838	TCTCT	2	10	42654	42663	0 %	60 %	0 %	40 %	378975736
24	NC_016838	AATTG	2	10	44436	44445	40 %	40 %	20 %	0 %	378975739
25	NC_016838	CGAAG	2	10	45931	45940	40 %	0 %	40 %	20 %	378975742
26	NC_016838	AATTC	2	10	46749	46758	40 %	40 %	0 %	20 %	378975743
27	NC_016838	CGCTT	2	10	51702	51711	0 %	40 %	20 %	40 %	378975749
28	NC_016838	TGAAC	2	10	52131	52140	40 %	20 %	20 %	20 %	378975749
29	NC_016838	TACCT	2	10	52868	52877	20 %	40 %	0 %	40 %	378975750
30	NC_016838	TACGC	2	10	56769	56778	20 %	20 %	20 %	40 %	378975751
31	NC_016838	CGATA	2	10	57173	57182	40 %	20 %	20 %	20 %	378975751
32	NC_016838	CCTGA	2	10	58718	58727	20 %	20 %	20 %	40 %	378975751
33	NC_016838	GGTTG	2	10	58899	58908	0 %	40 %	60 %	0 %	378975751
34	NC_016838	ATCTT	2	10	59698	59707	20 %	60 %	0 %	20 %	378975751
35	NC_016838	CCCAG	2	10	59824	59833	20 %	0 %	20 %	60 %	378975751
36	NC_016838	CGTCA	2	10	61692	61701	20 %	20 %	20 %	40 %	378975751
37	NC_016838	CGTCT	2	10	62859	62868	0 %	40 %	20 %	40 %	378975752
38	NC_016838	CTGCG	2	10	63389	63398	0 %	20 %	40 %	40 %	378975753
39	NC_016838	CCCAG	2	10	65227	65236	20 %	0 %	20 %	60 %	378975756
40	NC_016838	AGTCC	2	10	65434	65443	20 %	20 %	20 %	40 %	378975756
41	NC_016838	GGCGT	2	10	66225	66234	0 %	20 %	60 %	20 %	378975757
42	NC_016838	CCCAA	2	10	66705	66714	40 %	0 %	0 %	60 %	378975757
43	NC_016838	AAGGT	2	10	72577	72586	40 %	20 %	40 %	0 %	378975764
44	NC_016838	TGTCG	2	10	77099	77108	0 %	40 %	40 %	20 %	378975771
45	NC_016838	ACAAG	2	10	77870	77879	60 %	0 %	20 %	20 %	378975772
46	NC_016838	GTGAA	2	10	79916	79925	40 %	20 %	40 %	0 %	378975775
47	NC_016838	TTCAT	2	10	82181	82190	20 %	60 %	0 %	20 %	378975779
48	NC_016838	AAACC	2	10	83255	83264	60 %	0 %	0 %	40 %	378975781
49	NC_016838	CCGAT	2	10	84943	84952	20 %	20 %	20 %	40 %	378975783
50	NC_016838	GTATT	2	10	85198	85207	20 %	60 %	20 %	0 %	378975783
51	NC_016838	GACCC	2	10	95542	95551	20 %	0 %	20 %	60 %	378975798
52	NC_016838	GCAGA	2	10	95701	95710	40 %	0 %	40 %	20 %	378975798
53	NC_016838	GCGTG	2	10	97938	97947	0 %	20 %	60 %	20 %	378975801
54	NC_016838	ACACA	2	10	101922	101931	60 %	0 %	0 %	40 %	378975806
55	NC_016838	GAATC	2	10	102588	102597	40 %	20 %	20 %	20 %	378975807
56	NC_016838	CATCC	2	10	102604	102613	20 %	20 %	0 %	60 %	378975807
57	NC_016838	AAGAG	2	10	103052	103061	60 %	0 %	40 %	0 %	378975807
58	NC_016838	GCAAT	2	10	105862	105871	40 %	20 %	20 %	20 %	378975811
59	NC_016838	GTCGA	2	10	106155	106164	20 %	20 %	40 %	20 %	378975811
60	NC_016838	TCGAC	2	10	106183	106192	20 %	20 %	20 %	40 %	378975811
61	NC_016838	CATCA	2	10	108034	108043	40 %	20 %	0 %	40 %	378975814
62	NC_016838	TCCGC	2	10	108071	108080	0 %	20 %	20 %	60 %	378975814
63	NC_016838	TCAGC	2	10	110832	110841	20 %	20 %	20 %	40 %	378975818
64	NC_016838	GCGTT	2	10	112283	112292	0 %	40 %	40 %	20 %	378975819
65	NC_016838	TCAGC	2	10	113010	113019	20 %	20 %	20 %	40 %	378975820
66	NC_016838	TTACG	2	10	114906	114915	20 %	40 %	20 %	20 %	378975820
67	NC_016838	TGCCT	2	10	115987	115996	0 %	40 %	20 %	40 %	378975822

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.