MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	TACT	3	12	6582	6593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016838	CAAA	2	8	7160	7167	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016838	TGGC	2	8	19762	19769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016838	TACC	2	8	19984	19991	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016838	TTGT	2	8	20056	20063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016838	ATGA	2	8	20310	20317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016838	TGCC	2	8	20514	20521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016838	TACC	2	8	22985	22992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016838	TTAA	2	8	24754	24761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016838	TTCA	2	8	25287	25294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016838	ATTA	2	8	26459	26466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016838	CTTG	2	8	30260	30267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016838	TTTC	2	8	34321	34328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016838	ACTT	2	8	35489	35496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016838	TACT	3	12	37958	37969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016838	ATTC	2	8	38868	38875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016838	GCTG	2	8	40275	40282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016838	TACT	3	12	43734	43745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016838	AATT	2	8	48468	48475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016838	TACA	2	8	48489	48496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016838	TACT	2	8	64398	64405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016838	CCAT	2	8	70047	70054	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016838	TTGT	2	8	73174	73181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016838	GGGC	2	8	73952	73959	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016838	CCCA	2	8	73966	73973	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_016838	GCTG	2	8	76546	76553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016838	ATTA	2	8	79410	79417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016838	TACT	3	12	82950	82961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016838	TATT	2	8	86049	86056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016838	ATTT	2	8	86449	86456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016838	ATTT	2	8	86481	86488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016838	AAAT	2	8	86511	86518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016838	TTAC	2	8	86572	86579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016838	GAAA	2	8	88117	88124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016838	GGTG	2	8	88738	88745	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016838	GGTG	2	8	88767	88774	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016838	TTGT	2	8	90110	90117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016838	CAGC	2	8	91070	91077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016838	AATA	2	8	91171	91178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016838	TTTC	2	8	91560	91567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016838	CTGG	2	8	91770	91777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016838	TTAT	2	8	92064	92071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016838	CGAA	2	8	92415	92422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016838	CAGC	2	8	92508	92515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016838	CTGA	2	8	94468	94475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016838	CCAC	2	8	102468	102475	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_016838	ATGA	2	8	102501	102508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016838	ACTT	2	8	103930	103937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016838	CGAA	2	8	103971	103978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016838	CGAA	2	8	103996	104003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016838	TTAT	2	8	104810	104817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016838	AACT	2	8	104839	104846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016838	AGTA	2	8	110300	110307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016838	TGCG	2	8	116381	116388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016838	TAAG	2	8	119745	119752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016838	TGAG	2	8	119886	119893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.