MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	TTG	2	6	17	22	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016838	AAT	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016838	CGC	2	6	158	163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016838	TGC	2	6	1643	1648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016838	TTC	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016838	CCA	2	6	2977	2982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016838	GTT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016838	ATA	2	6	3085	3090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016838	TTG	2	6	6497	6502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016838	ATA	3	9	6567	6575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016838	GAA	2	6	7080	7085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016838	TGG	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016838	CCG	2	6	7172	7177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016838	CTG	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016838	ATG	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016838	TTA	2	6	7910	7915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016838	TTG	2	6	7985	7990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016838	GAC	2	6	12134	12139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016838	TGG	2	6	12180	12185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016838	AAC	2	6	12253	12258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016838	TTG	2	6	13518	13523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016838	GGA	2	6	15950	15955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016838	TAC	2	6	16256	16261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016838	TAA	2	6	16278	16283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016838	AAC	2	6	16420	16425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016838	CTC	2	6	19550	19555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016838	CCG	2	6	19657	19662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016838	ATG	2	6	19694	19699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016838	TCA	2	6	20031	20036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016838	GAT	2	6	20225	20230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016838	ATT	2	6	20242	20247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016838	ATT	2	6	20496	20501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016838	CAA	2	6	23007	23012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016838	ATA	2	6	23037	23042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016838	TTA	2	6	23055	23060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016838	ACT	2	6	23088	23093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016838	CTA	2	6	23135	23140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016838	TTA	2	6	24797	24802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016838	ATT	2	6	24887	24892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016838	AAG	2	6	24922	24927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016838	GCA	2	6	25189	25194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016838	GAG	2	6	25277	25282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016838	ACA	2	6	25346	25351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016838	TAA	2	6	25850	25855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016838	TAT	2	6	25869	25874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016838	GTT	2	6	26004	26009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016838	GTC	2	6	26020	26025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016838	TGA	2	6	26452	26457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016838	CAA	2	6	31831	31836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016838	ATT	2	6	32843	32848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016838	ACC	2	6	32853	32858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016838	TAC	2	6	34247	34252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016838	TAT	2	6	34262	34267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016838	CTT	2	6	35699	35704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016838	GAT	2	6	35720	35725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016838	TCC	2	6	38812	38817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016838	ATT	2	6	38833	38838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016838	GTG	2	6	39027	39032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016838	GCC	2	6	40286	40291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016838	AGC	2	6	40294	40299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016838	TAT	2	6	42930	42935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016838	ACT	2	6	43732	43737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016838	ATA	2	6	43845	43850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016838	AAT	2	6	44080	44085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016838	AAC	2	6	44121	44126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016838	TTA	2	6	44754	44759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016838	AGT	2	6	44858	44863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016838	TCG	2	6	46192	46197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016838	AAC	2	6	46203	46208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016838	TCG	2	6	46390	46395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016838	TCC	2	6	48418	48423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016838	GCC	2	6	50050	50055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016838	ATC	2	6	56558	56563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016838	TGG	2	6	56593	56598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016838	ATA	3	9	64383	64391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016838	GCC	2	6	64775	64780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016838	GGC	2	6	64787	64792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016838	GTC	2	6	72112	72117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016838	ACG	2	6	72181	72186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016838	CTC	2	6	73182	73187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016838	CCA	2	6	73250	73255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016838	ATA	2	6	73981	73986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016838	TAT	2	6	74001	74006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016838	AAT	2	6	76568	76573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016838	TAA	2	6	79459	79464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016838	TTA	2	6	79470	79475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016838	CTC	2	6	84882	84887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016838	TTC	2	6	85331	85336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016838	CAA	2	6	85383	85388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016838	AGA	2	6	85424	85429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016838	CTG	2	6	86064	86069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016838	ACG	2	6	86112	86117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016838	TCG	2	6	86126	86131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016838	TTA	2	6	86360	86365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016838	CCA	2	6	87556	87561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016838	CCA	2	6	87600	87605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016838	CAA	2	6	87614	87619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016838	GTA	2	6	87707	87712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016838	CCA	2	6	87962	87967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016838	CGA	2	6	87973	87978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016838	CCG	2	6	88023	88028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016838	TGG	2	6	88108	88113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016838	AAC	2	6	88648	88653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016838	TGG	2	6	88719	88724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016838	GGT	2	6	88796	88801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016838	CCA	2	6	88811	88816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016838	CTC	2	6	88829	88834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016838	TTG	2	6	89152	89157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016838	TTA	2	6	89161	89166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016838	AAC	2	6	89189	89194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016838	CGT	2	6	89671	89676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016838	ATA	2	6	90122	90127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016838	CCA	2	6	90143	90148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_016838	CTG	2	6	90203	90208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016838	TCC	2	6	90437	90442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016838	GTT	2	6	90686	90691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016838	TTG	2	6	90695	90700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016838	TTA	2	6	90704	90709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016838	GAA	2	6	90748	90753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016838	ATT	2	6	90801	90806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016838	TGG	2	6	90830	90835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016838	CTG	2	6	90861	90866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016838	CAG	2	6	90908	90913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016838	GAA	2	6	90927	90932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016838	TTA	2	6	91274	91279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016838	TTC	2	6	91415	91420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016838	TGT	2	6	91503	91508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016838	TTC	2	6	91630	91635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016838	TGG	3	9	91702	91710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016838	TGG	2	6	91920	91925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016838	TCG	2	6	91950	91955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016838	GCT	2	6	91977	91982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016838	AAG	2	6	91993	91998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016838	GAA	2	6	92142	92147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016838	CTT	2	6	92342	92347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016838	TCA	2	6	92381	92386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016838	TCA	2	6	94540	94545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016838	ACA	2	6	94594	94599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016838	AAG	2	6	100213	100218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016838	TTG	2	6	100225	100230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016838	TGA	2	6	100253	100258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.