MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016838	CG	3	6	563	568	0 %	0 %	50 %	50 %	378975691
2	NC_016838	CT	3	6	653	658	0 %	50 %	0 %	50 %	378975691
3	NC_016838	GC	3	6	1082	1087	0 %	0 %	50 %	50 %	378975691
4	NC_016838	GA	3	6	2224	2229	50 %	0 %	50 %	0 %	378975693
5	NC_016838	GC	3	6	2279	2284	0 %	0 %	50 %	50 %	378975693
6	NC_016838	AG	3	6	2374	2379	50 %	0 %	50 %	0 %	378975693
7	NC_016838	GC	3	6	3601	3606	0 %	0 %	50 %	50 %	378975695
8	NC_016838	GA	3	6	4294	4299	50 %	0 %	50 %	0 %	378975696
9	NC_016838	GC	3	6	6155	6160	0 %	0 %	50 %	50 %	378975698
10	NC_016838	CA	3	6	6228	6233	50 %	0 %	0 %	50 %	378975698
11	NC_016838	GA	3	6	6695	6700	50 %	0 %	50 %	0 %	378975699
12	NC_016838	CG	4	8	6915	6922	0 %	0 %	50 %	50 %	378975699
13	NC_016838	CG	3	6	8368	8373	0 %	0 %	50 %	50 %	378975702
14	NC_016838	AC	3	6	8876	8881	50 %	0 %	0 %	50 %	378975703
15	NC_016838	CT	3	6	9285	9290	0 %	50 %	0 %	50 %	378975704
16	NC_016838	CG	3	6	9814	9819	0 %	0 %	50 %	50 %	378975704
17	NC_016838	AC	3	6	10239	10244	50 %	0 %	0 %	50 %	378975704
18	NC_016838	CT	3	6	10328	10333	0 %	50 %	0 %	50 %	378975704
19	NC_016838	CG	3	6	10442	10447	0 %	0 %	50 %	50 %	378975704
20	NC_016838	GC	3	6	11595	11600	0 %	0 %	50 %	50 %	378975704
21	NC_016838	GA	3	6	12573	12578	50 %	0 %	50 %	0 %	378975705
22	NC_016838	GC	3	6	12936	12941	0 %	0 %	50 %	50 %	378975705
23	NC_016838	CA	3	6	13921	13926	50 %	0 %	0 %	50 %	378975707
24	NC_016838	GT	3	6	14109	14114	0 %	50 %	50 %	0 %	378975707
25	NC_016838	CG	3	6	14323	14328	0 %	0 %	50 %	50 %	378975707
26	NC_016838	TC	3	6	14374	14379	0 %	50 %	0 %	50 %	378975707
27	NC_016838	GC	3	6	14471	14476	0 %	0 %	50 %	50 %	378975707
28	NC_016838	AG	3	6	16023	16028	50 %	0 %	50 %	0 %	378975708
29	NC_016838	CG	3	6	16091	16096	0 %	0 %	50 %	50 %	378975708
30	NC_016838	GT	3	6	16152	16157	0 %	50 %	50 %	0 %	378975708
31	NC_016838	GT	3	6	18224	18229	0 %	50 %	50 %	0 %	378975711
32	NC_016838	TG	3	6	19417	19422	0 %	50 %	50 %	0 %	378975711
33	NC_016838	TG	3	6	20727	20732	0 %	50 %	50 %	0 %	378975712
34	NC_016838	CT	3	6	21446	21451	0 %	50 %	0 %	50 %	378975713
35	NC_016838	TC	3	6	22021	22026	0 %	50 %	0 %	50 %	378975714
36	NC_016838	AT	3	6	24051	24056	50 %	50 %	0 %	0 %	378975716
37	NC_016838	AT	3	6	24389	24394	50 %	50 %	0 %	0 %	378975716
38	NC_016838	AC	3	6	24596	24601	50 %	0 %	0 %	50 %	378975716
39	NC_016838	CA	3	6	26045	26050	50 %	0 %	0 %	50 %	378975718
40	NC_016838	GC	3	6	26836	26841	0 %	0 %	50 %	50 %	378975719
41	NC_016838	CG	3	6	27433	27438	0 %	0 %	50 %	50 %	378975719
42	NC_016838	GC	3	6	29696	29701	0 %	0 %	50 %	50 %	378975720
43	NC_016838	GC	3	6	31127	31132	0 %	0 %	50 %	50 %	378975723
44	NC_016838	GC	3	6	31549	31554	0 %	0 %	50 %	50 %	378975723
45	NC_016838	CT	3	6	31895	31900	0 %	50 %	0 %	50 %	378975724
46	NC_016838	TC	3	6	32174	32179	0 %	50 %	0 %	50 %	378975724
47	NC_016838	CG	3	6	32248	32253	0 %	0 %	50 %	50 %	378975724
48	NC_016838	CT	3	6	32703	32708	0 %	50 %	0 %	50 %	378975725
49	NC_016838	GT	3	6	32773	32778	0 %	50 %	50 %	0 %	378975725
50	NC_016838	TA	3	6	33278	33283	50 %	50 %	0 %	0 %	378975727
51	NC_016838	TC	4	8	34469	34476	0 %	50 %	0 %	50 %	378975728
52	NC_016838	AC	3	6	34652	34657	50 %	0 %	0 %	50 %	378975728
53	NC_016838	CA	3	6	34851	34856	50 %	0 %	0 %	50 %	378975728
54	NC_016838	CG	3	6	35015	35020	0 %	0 %	50 %	50 %	378975728
55	NC_016838	CA	3	6	35084	35089	50 %	0 %	0 %	50 %	378975728
56	NC_016838	TC	3	6	35964	35969	0 %	50 %	0 %	50 %	378975729
57	NC_016838	TC	3	6	36507	36512	0 %	50 %	0 %	50 %	378975731
58	NC_016838	GA	3	6	36889	36894	50 %	0 %	50 %	0 %	378975731
59	NC_016838	CA	3	6	37179	37184	50 %	0 %	0 %	50 %	378975731
60	NC_016838	CT	3	6	37604	37609	0 %	50 %	0 %	50 %	378975732
61	NC_016838	CG	3	6	38522	38527	0 %	0 %	50 %	50 %	378975733
62	NC_016838	AT	3	6	38685	38690	50 %	50 %	0 %	0 %	378975733
63	NC_016838	AT	3	6	39631	39636	50 %	50 %	0 %	0 %	378975734
64	NC_016838	AT	3	6	39917	39922	50 %	50 %	0 %	0 %	378975734
65	NC_016838	GC	3	6	40685	40690	0 %	0 %	50 %	50 %	378975735
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67	NC_016838	GA	3	6	42167	42172	50 %	0 %	50 %	0 %	378975736
68	NC_016838	GA	3	6	42190	42195	50 %	0 %	50 %	0 %	378975736
69	NC_016838	AG	3	6	42601	42606	50 %	0 %	50 %	0 %	378975736
70	NC_016838	CT	3	6	42621	42626	0 %	50 %	0 %	50 %	378975736
71	NC_016838	GC	3	6	42720	42725	0 %	0 %	50 %	50 %	378975736
72	NC_016838	GC	3	6	43307	43312	0 %	0 %	50 %	50 %	378975737
73	NC_016838	AG	3	6	43387	43392	50 %	0 %	50 %	0 %	378975737
74	NC_016838	GC	3	6	43503	43508	0 %	0 %	50 %	50 %	378975737
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77	NC_016838	CT	3	6	46789	46794	0 %	50 %	0 %	50 %	378975743
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81	NC_016838	AG	3	6	50069	50074	50 %	0 %	50 %	0 %	378975749
82	NC_016838	AG	3	6	51020	51025	50 %	0 %	50 %	0 %	378975749
83	NC_016838	GC	3	6	54340	54345	0 %	0 %	50 %	50 %	378975750
84	NC_016838	AG	3	6	55049	55054	50 %	0 %	50 %	0 %	378975750
85	NC_016838	AG	3	6	55419	55424	50 %	0 %	50 %	0 %	378975750
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87	NC_016838	GA	3	6	57684	57689	50 %	0 %	50 %	0 %	378975751
88	NC_016838	GC	3	6	58590	58595	0 %	0 %	50 %	50 %	378975751
89	NC_016838	AG	3	6	59098	59103	50 %	0 %	50 %	0 %	378975751
90	NC_016838	CG	3	6	59146	59151	0 %	0 %	50 %	50 %	378975751
91	NC_016838	CG	3	6	60443	60448	0 %	0 %	50 %	50 %	378975751
92	NC_016838	AG	3	6	60631	60636	50 %	0 %	50 %	0 %	378975751
93	NC_016838	CG	3	6	60796	60801	0 %	0 %	50 %	50 %	378975751
94	NC_016838	TG	3	6	61903	61908	0 %	50 %	50 %	0 %	378975751
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102	NC_016838	GC	3	6	67368	67373	0 %	0 %	50 %	50 %	378975757
103	NC_016838	AG	3	6	67953	67958	50 %	0 %	50 %	0 %	378975757
104	NC_016838	AG	3	6	69198	69203	50 %	0 %	50 %	0 %	378975757
105	NC_016838	AT	3	6	71757	71762	50 %	50 %	0 %	0 %	378975762
106	NC_016838	AC	3	6	73753	73758	50 %	0 %	0 %	50 %	378975767
107	NC_016838	AT	3	6	73932	73937	50 %	50 %	0 %	0 %	378975767
108	NC_016838	AG	3	6	74064	74069	50 %	0 %	50 %	0 %	378975768
109	NC_016838	CT	3	6	75894	75899	0 %	50 %	0 %	50 %	378975770
110	NC_016838	GC	3	6	76867	76872	0 %	0 %	50 %	50 %	378975771
111	NC_016838	CG	3	6	77107	77112	0 %	0 %	50 %	50 %	378975771
112	NC_016838	GC	3	6	78254	78259	0 %	0 %	50 %	50 %	378975772
113	NC_016838	GC	3	6	78498	78503	0 %	0 %	50 %	50 %	378975772
114	NC_016838	TC	3	6	78543	78548	0 %	50 %	0 %	50 %	378975772
115	NC_016838	GC	3	6	78960	78965	0 %	0 %	50 %	50 %	378975773
116	NC_016838	GC	3	6	79116	79121	0 %	0 %	50 %	50 %	378975773
117	NC_016838	GA	3	6	79139	79144	50 %	0 %	50 %	0 %	378975773
118	NC_016838	GC	4	8	79643	79650	0 %	0 %	50 %	50 %	378975774
119	NC_016838	GT	3	6	79862	79867	0 %	50 %	50 %	0 %	378975775
120	NC_016838	GC	3	6	80171	80176	0 %	0 %	50 %	50 %	378975775
121	NC_016838	CG	3	6	81058	81063	0 %	0 %	50 %	50 %	378975777
122	NC_016838	CT	3	6	81635	81640	0 %	50 %	0 %	50 %	378975779
123	NC_016838	CG	3	6	82777	82782	0 %	0 %	50 %	50 %	378975780
124	NC_016838	AG	3	6	84172	84177	50 %	0 %	50 %	0 %	378975781
125	NC_016838	TG	3	6	84409	84414	0 %	50 %	50 %	0 %	378975781
126	NC_016838	GC	3	6	85139	85144	0 %	0 %	50 %	50 %	378975783
127	NC_016838	CG	3	6	85539	85544	0 %	0 %	50 %	50 %	378975784
128	NC_016838	GT	3	6	85914	85919	0 %	50 %	50 %	0 %	378975784
129	NC_016838	CT	3	6	86950	86955	0 %	50 %	0 %	50 %	378975786
130	NC_016838	TG	3	6	86999	87004	0 %	50 %	50 %	0 %	378975786
131	NC_016838	TG	3	6	87177	87182	0 %	50 %	50 %	0 %	378975786
132	NC_016838	CG	3	6	87373	87378	0 %	0 %	50 %	50 %	378975787
133	NC_016838	TC	3	6	88833	88838	0 %	50 %	0 %	50 %	378975789
134	NC_016838	AG	3	6	89284	89289	50 %	0 %	50 %	0 %	378975791
135	NC_016838	AG	3	6	90589	90594	50 %	0 %	50 %	0 %	378975794
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138	NC_016838	TG	3	6	92883	92888	0 %	50 %	50 %	0 %	378975797
139	NC_016838	TA	3	6	93693	93698	50 %	50 %	0 %	0 %	378975797
140	NC_016838	GC	3	6	95655	95660	0 %	0 %	50 %	50 %	378975798
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142	NC_016838	CA	3	6	98982	98987	50 %	0 %	0 %	50 %	378975801
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.