MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 plasmid pSICJ18-1

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016837	AAATG	2	10	498	507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016837	GATTG	2	10	2026	2035	20 %	40 %	40 %	0 %	379704343
3	NC_016837	TTGTA	2	10	2939	2948	20 %	60 %	20 %	0 %	379704345
4	NC_016837	GCTTC	2	10	3740	3749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016837	TTTAA	2	10	6661	6670	40 %	60 %	0 %	0 %	379704349
6	NC_016837	TTAAA	2	10	9120	9129	60 %	40 %	0 %	0 %	379704355
7	NC_016837	ACAAA	2	10	9521	9530	80 %	0 %	0 %	20 %	379704356
8	NC_016837	TAGAG	2	10	9886	9895	40 %	20 %	40 %	0 %	379704357
9	NC_016837	ACAAA	2	10	10501	10510	80 %	0 %	0 %	20 %	379704358
10	NC_016837	GAAAA	2	10	10957	10966	80 %	0 %	20 %	0 %	379704358
11	NC_016837	TGTTC	2	10	11001	11010	0 %	60 %	20 %	20 %	379704358
12	NC_016837	TTTTC	2	10	11434	11443	0 %	80 %	0 %	20 %	379704360
13	NC_016837	CCAAG	2	10	12645	12654	40 %	0 %	20 %	40 %	379704361
14	NC_016837	AATCT	2	10	14566	14575	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016837	TGGAT	2	10	14864	14873	20 %	40 %	40 %	0 %	379704367
16	NC_016837	GCAAA	2	10	16506	16515	60 %	0 %	20 %	20 %	379704371
17	NC_016837	AATTG	2	10	17965	17974	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016837	GCATG	2	10	18626	18635	20 %	20 %	40 %	20 %	379704374
19	NC_016837	CCTCA	2	10	19522	19531	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.