MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 plasmid pSICJ18-1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016837	TTGC	2	8	205	212	0 %	50 %	25 %	25 %	379704342
2	NC_016837	AAGG	2	8	611	618	50 %	0 %	50 %	0 %	379704343
3	NC_016837	AGTC	2	8	644	651	25 %	25 %	25 %	25 %	379704343
4	NC_016837	TATT	2	8	854	861	25 %	75 %	0 %	0 %	379704343
5	NC_016837	CGAG	2	8	962	969	25 %	0 %	50 %	25 %	379704343
6	NC_016837	TTTA	2	8	1065	1072	25 %	75 %	0 %	0 %	379704343
7	NC_016837	TGTT	2	8	1206	1213	0 %	75 %	25 %	0 %	379704343
8	NC_016837	ATTC	2	8	1726	1733	25 %	50 %	0 %	25 %	379704343
9	NC_016837	AATT	2	8	2187	2194	50 %	50 %	0 %	0 %	379704343
10	NC_016837	AAGC	2	8	2299	2306	50 %	0 %	25 %	25 %	379704344
11	NC_016837	ACAA	2	8	2435	2442	75 %	0 %	0 %	25 %	379704344
12	NC_016837	CCAT	2	8	3341	3348	25 %	25 %	0 %	50 %	379704345
13	NC_016837	ATTA	2	8	3381	3388	50 %	50 %	0 %	0 %	379704345
14	NC_016837	AAAC	2	8	4535	4542	75 %	0 %	0 %	25 %	379704346
15	NC_016837	AGCA	2	8	4761	4768	50 %	0 %	25 %	25 %	379704346
16	NC_016837	GAAA	2	8	4923	4930	75 %	0 %	25 %	0 %	379704346
17	NC_016837	ATTC	2	8	5091	5098	25 %	50 %	0 %	25 %	379704346
18	NC_016837	CAAA	2	8	5217	5224	75 %	0 %	0 %	25 %	379704346
19	NC_016837	AAAG	2	8	5260	5267	75 %	0 %	25 %	0 %	379704346
20	NC_016837	CAAA	2	8	7014	7021	75 %	0 %	0 %	25 %	379704350
21	NC_016837	TTTG	2	8	7961	7968	0 %	75 %	25 %	0 %	379704352
22	NC_016837	ATTA	2	8	8419	8426	50 %	50 %	0 %	0 %	379704354
23	NC_016837	CTGA	2	8	8638	8645	25 %	25 %	25 %	25 %	379704354
24	NC_016837	ATTA	2	8	8671	8678	50 %	50 %	0 %	0 %	379704354
25	NC_016837	AACA	2	8	8684	8691	75 %	0 %	0 %	25 %	379704354
26	NC_016837	TGAT	2	8	9174	9181	25 %	50 %	25 %	0 %	379704355
27	NC_016837	AGAA	2	8	9468	9475	75 %	0 %	25 %	0 %	379704356
28	NC_016837	TGAT	2	8	10820	10827	25 %	50 %	25 %	0 %	379704358
29	NC_016837	TGAC	2	8	12039	12046	25 %	25 %	25 %	25 %	379704361
30	NC_016837	GACT	2	8	12153	12160	25 %	25 %	25 %	25 %	379704361
31	NC_016837	TGGT	2	8	12186	12193	0 %	50 %	50 %	0 %	379704361
32	NC_016837	CACG	2	8	12216	12223	25 %	0 %	25 %	50 %	379704361
33	NC_016837	AGCC	2	8	12319	12326	25 %	0 %	25 %	50 %	379704361
34	NC_016837	GTTC	2	8	13006	13013	0 %	50 %	25 %	25 %	379704362
35	NC_016837	TTTC	2	8	13957	13964	0 %	75 %	0 %	25 %	379704364
36	NC_016837	GAAA	2	8	14622	14629	75 %	0 %	25 %	0 %	379704367
37	NC_016837	GATG	2	8	16543	16550	25 %	25 %	50 %	0 %	379704371
38	NC_016837	CTTC	2	8	16798	16805	0 %	50 %	0 %	50 %	379704371
39	NC_016837	GTTC	2	8	16835	16842	0 %	50 %	25 %	25 %	379704371
40	NC_016837	TTAC	2	8	17121	17128	25 %	50 %	0 %	25 %	379704371
41	NC_016837	GTAA	2	8	17153	17160	50 %	25 %	25 %	0 %	379704371
42	NC_016837	GTCT	2	8	17187	17194	0 %	50 %	25 %	25 %	379704371
43	NC_016837	AGAC	2	8	17379	17386	50 %	0 %	25 %	25 %	379704371
44	NC_016837	TAAT	2	8	17430	17437	50 %	50 %	0 %	0 %	379704371
45	NC_016837	TTTG	2	8	17530	17537	0 %	75 %	25 %	0 %	379704371
46	NC_016837	TAAA	2	8	18344	18351	75 %	25 %	0 %	0 %	379704372
47	NC_016837	ATTT	2	8	18468	18475	25 %	75 %	0 %	0 %	379704373
48	NC_016837	TTTC	2	8	19099	19106	0 %	75 %	0 %	25 %	379704375
49	NC_016837	ATAA	2	8	19249	19256	75 %	25 %	0 %	0 %	379704375

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.