MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 plasmid pSICJ18-1

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016837	ATT	2	6	133	138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016837	TTA	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704342
3	NC_016837	AAC	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704342
4	NC_016837	AAG	2	6	317	322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704342
5	NC_016837	CAA	2	6	384	389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016837	ATT	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016837	ATT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016837	ACA	2	6	638	643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704343
9	NC_016837	GCT	2	6	914	919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704343
10	NC_016837	GTC	2	6	1091	1096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704343
11	NC_016837	TTA	2	6	1104	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
12	NC_016837	TAT	3	9	1125	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
13	NC_016837	TGT	2	6	1134	1139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704343
14	NC_016837	TGG	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704343
15	NC_016837	ATT	2	6	1337	1342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
16	NC_016837	CAT	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704343
17	NC_016837	TCT	2	6	1633	1638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704343
18	NC_016837	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
19	NC_016837	ATT	2	6	1808	1813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
20	NC_016837	AAT	2	6	1865	1870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704343
21	NC_016837	TCT	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704343
22	NC_016837	ATT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
23	NC_016837	ATG	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704343
24	NC_016837	TCG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704343
25	NC_016837	TAC	2	6	2130	2135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704343
26	NC_016837	ATT	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
27	NC_016837	TGA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704344
28	NC_016837	TTA	2	6	2642	2647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704344
29	NC_016837	ATA	2	6	2662	2667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016837	TAG	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016837	AGC	2	6	2979	2984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704345
32	NC_016837	CAT	2	6	3008	3013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704345
33	NC_016837	TAA	2	6	3014	3019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704345
34	NC_016837	CAT	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704345
35	NC_016837	AAG	2	6	3208	3213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704345
36	NC_016837	CTT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704345
37	NC_016837	TTA	2	6	3352	3357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704345
38	NC_016837	TGT	2	6	3419	3424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704345
39	NC_016837	ATA	2	6	3505	3510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704345
40	NC_016837	TAT	2	6	3515	3520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704345
41	NC_016837	TCT	2	6	3584	3589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704345
42	NC_016837	TTG	2	6	3612	3617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704345
43	NC_016837	GAC	2	6	3626	3631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704345
44	NC_016837	ATG	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704345
45	NC_016837	AAG	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016837	TTC	2	6	3881	3886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016837	CTT	2	6	3889	3894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016837	CTT	2	6	3943	3948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016837	TCT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016837	ATA	2	6	4024	4029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016837	TAT	2	6	4067	4072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016837	TCT	2	6	4099	4104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016837	AGT	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016837	GAT	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016837	TTA	2	6	4419	4424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704346
56	NC_016837	CAA	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
57	NC_016837	AAC	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
58	NC_016837	AGC	3	9	4508	4516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704346
59	NC_016837	TGC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704346
60	NC_016837	ATG	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704346
61	NC_016837	CAA	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
62	NC_016837	TCT	2	6	4713	4718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704346
63	NC_016837	TTG	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704346
64	NC_016837	TAT	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704346
65	NC_016837	AAG	2	6	5048	5053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704346
66	NC_016837	AGC	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704346
67	NC_016837	CTT	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704346
68	NC_016837	CAA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
69	NC_016837	ACA	2	6	5473	5478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
70	NC_016837	TCT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704346
71	NC_016837	ACT	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704346
72	NC_016837	AAG	2	6	5637	5642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704346
73	NC_016837	AAG	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016837	GAG	2	6	5759	5764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016837	CTT	2	6	5768	5773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016837	CCG	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016837	AAG	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016837	TGA	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704347
79	NC_016837	GTT	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704347
80	NC_016837	AAT	2	6	6141	6146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016837	TTA	2	6	6162	6167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704348
82	NC_016837	CTG	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704348
83	NC_016837	TGG	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016837	CGG	2	6	6378	6383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016837	TTA	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
86	NC_016837	TAA	2	6	6446	6451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
87	NC_016837	TAA	2	6	6459	6464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
88	NC_016837	ATT	2	6	6488	6493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
89	NC_016837	TAA	3	9	6524	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
90	NC_016837	ATT	2	6	6559	6564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
91	NC_016837	TTC	2	6	6581	6586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704349
92	NC_016837	TAA	2	6	6611	6616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
93	NC_016837	ATT	2	6	6710	6715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
94	NC_016837	TTA	2	6	6797	6802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704350
95	NC_016837	GTT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704350
96	NC_016837	AAG	2	6	6886	6891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704350
97	NC_016837	TCC	2	6	6925	6930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704350
98	NC_016837	GTC	2	6	6933	6938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704350
99	NC_016837	TCC	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704350
100	NC_016837	TTC	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704350
101	NC_016837	ACA	2	6	7166	7171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704350
102	NC_016837	TAA	2	6	7449	7454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016837	TAA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016837	TAG	2	6	7602	7607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704351
105	NC_016837	CAA	2	6	7633	7638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704351
106	NC_016837	TAT	3	9	7649	7657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704351
107	NC_016837	ATC	2	6	7700	7705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704351
108	NC_016837	ATT	2	6	7806	7811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016837	TAA	2	6	7823	7828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016837	ATA	2	6	7836	7841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704352
111	NC_016837	CCA	2	6	7850	7855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704352
112	NC_016837	GTG	2	6	7876	7881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704352
113	NC_016837	GAT	2	6	7900	7905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704352
114	NC_016837	ATT	2	6	8033	8038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704352
115	NC_016837	GTT	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704353
116	NC_016837	TAC	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704353
117	NC_016837	ATT	2	6	8369	8374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016837	CTT	2	6	8408	8413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704354
119	NC_016837	CTT	2	6	8526	8531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704354
120	NC_016837	ATA	2	6	8656	8661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704354
121	NC_016837	TAT	2	6	8783	8788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016837	ATA	2	6	8814	8819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016837	TAA	2	6	8917	8922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704355
124	NC_016837	ATT	2	6	8941	8946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704355
125	NC_016837	AGA	2	6	8992	8997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704355
126	NC_016837	ATT	2	6	9107	9112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704355
127	NC_016837	TTA	2	6	9249	9254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704356
128	NC_016837	TAG	2	6	9265	9270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704356
129	NC_016837	TTC	2	6	9331	9336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704356
130	NC_016837	ATA	2	6	9405	9410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704356
131	NC_016837	TTC	2	6	9417	9422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704356
132	NC_016837	ATG	2	6	9448	9453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704356
133	NC_016837	AAT	2	6	9619	9624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016837	CAA	2	6	9638	9643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016837	AAT	2	6	9666	9671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704357
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254	NC_016837	ATA	2	6	19647	19652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_016837	TTC	2	6	19714	19719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_016837	AAC	3	9	19782	19790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.