MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 plasmid pSICJ18-1

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016837	TTA	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704342
2	NC_016837	AAC	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704342
3	NC_016837	AAG	2	6	317	322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704342
4	NC_016837	ACA	2	6	638	643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704343
5	NC_016837	GCT	2	6	914	919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704343
6	NC_016837	GTC	2	6	1091	1096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704343
7	NC_016837	TTA	2	6	1104	1109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
8	NC_016837	TAT	3	9	1125	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
9	NC_016837	TGT	2	6	1134	1139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704343
10	NC_016837	TGG	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704343
11	NC_016837	ATT	2	6	1337	1342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
12	NC_016837	CAT	2	6	1551	1556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704343
13	NC_016837	TCT	2	6	1633	1638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704343
14	NC_016837	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
15	NC_016837	ATT	2	6	1808	1813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
16	NC_016837	AAT	2	6	1865	1870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704343
17	NC_016837	TCT	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704343
18	NC_016837	ATT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
19	NC_016837	ATG	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704343
20	NC_016837	TCG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704343
21	NC_016837	TAC	2	6	2130	2135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704343
22	NC_016837	ATT	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704343
23	NC_016837	TGA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704344
24	NC_016837	TTA	2	6	2642	2647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704344
25	NC_016837	AGC	2	6	2979	2984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704345
26	NC_016837	CAT	2	6	3008	3013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704345
27	NC_016837	TAA	2	6	3014	3019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704345
28	NC_016837	CAT	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704345
29	NC_016837	AAG	2	6	3208	3213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704345
30	NC_016837	CTT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704345
31	NC_016837	TTA	2	6	3352	3357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704345
32	NC_016837	TGT	2	6	3419	3424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704345
33	NC_016837	ATA	2	6	3505	3510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704345
34	NC_016837	TAT	2	6	3515	3520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704345
35	NC_016837	TCT	2	6	3584	3589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704345
36	NC_016837	TTG	2	6	3612	3617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704345
37	NC_016837	GAC	2	6	3626	3631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704345
38	NC_016837	ATG	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704345
39	NC_016837	TTA	2	6	4419	4424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704346
40	NC_016837	CAA	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
41	NC_016837	AAC	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
42	NC_016837	AGC	3	9	4508	4516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704346
43	NC_016837	TGC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704346
44	NC_016837	ATG	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704346
45	NC_016837	CAA	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
46	NC_016837	TCT	2	6	4713	4718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704346
47	NC_016837	TTG	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704346
48	NC_016837	TAT	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704346
49	NC_016837	AAG	2	6	5048	5053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704346
50	NC_016837	AGC	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704346
51	NC_016837	CTT	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704346
52	NC_016837	CAA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
53	NC_016837	ACA	2	6	5473	5478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704346
54	NC_016837	TCT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704346
55	NC_016837	ACT	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704346
56	NC_016837	AAG	2	6	5637	5642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704346
57	NC_016837	TGA	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704347
58	NC_016837	GTT	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704347
59	NC_016837	TTA	2	6	6162	6167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704348
60	NC_016837	CTG	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704348
61	NC_016837	TTA	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
62	NC_016837	TAA	2	6	6446	6451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
63	NC_016837	TAA	2	6	6459	6464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
64	NC_016837	ATT	2	6	6488	6493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
65	NC_016837	TAA	3	9	6524	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
66	NC_016837	ATT	2	6	6559	6564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
67	NC_016837	TTC	2	6	6581	6586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704349
68	NC_016837	TAA	2	6	6611	6616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704349
69	NC_016837	ATT	2	6	6710	6715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704349
70	NC_016837	TTA	2	6	6797	6802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704350
71	NC_016837	GTT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704350
72	NC_016837	AAG	2	6	6886	6891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704350
73	NC_016837	TCC	2	6	6925	6930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704350
74	NC_016837	GTC	2	6	6933	6938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704350
75	NC_016837	TCC	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704350
76	NC_016837	TTC	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704350
77	NC_016837	ACA	2	6	7166	7171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704350
78	NC_016837	TAG	2	6	7602	7607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704351
79	NC_016837	CAA	2	6	7633	7638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704351
80	NC_016837	TAT	3	9	7649	7657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704351
81	NC_016837	ATC	2	6	7700	7705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704351
82	NC_016837	ATA	2	6	7836	7841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704352
83	NC_016837	CCA	2	6	7850	7855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704352
84	NC_016837	GTG	2	6	7876	7881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704352
85	NC_016837	GAT	2	6	7900	7905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704352
86	NC_016837	ATT	2	6	8033	8038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704352
87	NC_016837	GTT	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704353
88	NC_016837	TAC	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704353
89	NC_016837	CTT	2	6	8408	8413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704354
90	NC_016837	CTT	2	6	8526	8531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704354
91	NC_016837	ATA	2	6	8656	8661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704354
92	NC_016837	TAA	2	6	8917	8922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704355
93	NC_016837	ATT	2	6	8941	8946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704355
94	NC_016837	AGA	2	6	8992	8997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704355
95	NC_016837	ATT	2	6	9107	9112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704355
96	NC_016837	TTA	2	6	9249	9254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704356
97	NC_016837	TAG	2	6	9265	9270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704356
98	NC_016837	TTC	2	6	9331	9336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704356
99	NC_016837	ATA	2	6	9405	9410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704356
100	NC_016837	TTC	2	6	9417	9422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704356
101	NC_016837	ATG	2	6	9448	9453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704356
102	NC_016837	AAT	2	6	9666	9671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704357
103	NC_016837	GCA	2	6	9755	9760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704357
104	NC_016837	TTC	2	6	9812	9817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704357
105	NC_016837	CGT	2	6	9928	9933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704357
106	NC_016837	TTC	2	6	10178	10183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704358
107	NC_016837	TAA	2	6	10230	10235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704358
108	NC_016837	TGG	2	6	10239	10244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704358
109	NC_016837	ACA	2	6	10254	10259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704358
110	NC_016837	TGG	2	6	10359	10364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704358
111	NC_016837	TCA	2	6	10441	10446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704358
112	NC_016837	TGG	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704358
113	NC_016837	GTT	2	6	10594	10599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704358
114	NC_016837	GAA	2	6	10600	10605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704358
115	NC_016837	GCT	2	6	10630	10635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704358
116	NC_016837	TAA	2	6	10680	10685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704358
117	NC_016837	CTG	2	6	10877	10882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704358
118	NC_016837	TCA	2	6	10919	10924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704358
119	NC_016837	GGA	2	6	10936	10941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704358
120	NC_016837	ATA	2	6	11052	11057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704358
121	NC_016837	AAC	2	6	11391	11396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704360
122	NC_016837	ATC	2	6	11469	11474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704360
123	NC_016837	CAT	2	6	12139	12144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704361
124	NC_016837	ATA	2	6	12450	12455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704361
125	NC_016837	ATC	2	6	12533	12538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704361
126	NC_016837	TTG	2	6	12557	12562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704361
127	NC_016837	ACA	2	6	12608	12613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704361
128	NC_016837	GCC	2	6	12698	12703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704361
129	NC_016837	TAT	2	6	12717	12722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704361
130	NC_016837	GCA	2	6	12787	12792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704362
131	NC_016837	TTA	2	6	12877	12882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704362
132	NC_016837	TAA	2	6	12912	12917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704362
133	NC_016837	CAC	2	6	12971	12976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704362
134	NC_016837	ATT	2	6	13026	13031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704362
135	NC_016837	GTT	2	6	13127	13132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704362
136	NC_016837	GCC	2	6	13151	13156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704362
137	NC_016837	TAA	2	6	13243	13248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704363
138	NC_016837	CAC	2	6	13260	13265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704363
139	NC_016837	CAT	2	6	13317	13322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704363
140	NC_016837	TAA	2	6	13736	13741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704364
141	NC_016837	CGT	2	6	13751	13756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704364
142	NC_016837	CAA	2	6	13902	13907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704364
143	NC_016837	GCT	2	6	13940	13945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704364
144	NC_016837	TCT	2	6	14084	14089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704365
145	NC_016837	GTA	2	6	14140	14145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704365
146	NC_016837	AAT	2	6	14232	14237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704365
147	NC_016837	CAA	3	9	14429	14437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704366
148	NC_016837	TAT	2	6	14731	14736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704367
149	NC_016837	TAC	2	6	14902	14907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704367
150	NC_016837	GTT	2	6	14929	14934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704367
151	NC_016837	AAC	2	6	14975	14980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704367
152	NC_016837	ATT	2	6	15069	15074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704368
153	NC_016837	TTA	2	6	15147	15152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704368
154	NC_016837	CAG	2	6	15263	15268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704369
155	NC_016837	TAA	2	6	15455	15460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704370
156	NC_016837	AAT	2	6	15462	15467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704370
157	NC_016837	TCG	2	6	15475	15480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704370
158	NC_016837	CAC	2	6	15625	15630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704370
159	NC_016837	TGG	2	6	15665	15670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704370
160	NC_016837	ATG	2	6	15684	15689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704370
161	NC_016837	AAT	2	6	15693	15698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704370
162	NC_016837	GGA	2	6	15761	15766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704370
163	NC_016837	ATC	2	6	15795	15800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704370
164	NC_016837	AAG	2	6	15988	15993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704370
165	NC_016837	ATG	2	6	15997	16002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704370
166	NC_016837	TTG	2	6	16024	16029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704370
167	NC_016837	GTT	2	6	16238	16243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704371
168	NC_016837	TGG	2	6	16333	16338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704371
169	NC_016837	CCA	2	6	16622	16627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704371
170	NC_016837	TTG	2	6	16638	16643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704371
171	NC_016837	TGT	2	6	16654	16659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704371
172	NC_016837	AGC	2	6	16686	16691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704371
173	NC_016837	ATT	2	6	16709	16714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704371
174	NC_016837	TGA	3	9	16810	16818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704371
175	NC_016837	ATA	2	6	16916	16921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704371
176	NC_016837	TGA	2	6	17137	17142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704371
177	NC_016837	AGC	2	6	17272	17277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704371
178	NC_016837	TGC	2	6	17305	17310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704371
179	NC_016837	AGA	2	6	17413	17418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704371
180	NC_016837	ATT	2	6	17476	17481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704371
181	NC_016837	GTT	2	6	18308	18313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704372
182	NC_016837	ATA	2	6	18397	18402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704373
183	NC_016837	TGT	2	6	18421	18426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704373
184	NC_016837	CTT	2	6	18556	18561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704373
185	NC_016837	GAT	2	6	18615	18620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704374
186	NC_016837	AAT	3	9	18707	18715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704374
187	NC_016837	ACG	2	6	18950	18955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704375
188	NC_016837	GTT	2	6	19074	19079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704375
189	NC_016837	AAT	2	6	19117	19122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704375
190	NC_016837	GTT	2	6	19270	19275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704375
191	NC_016837	CAA	2	6	19403	19408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704376
192	NC_016837	CCA	2	6	19471	19476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704376

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.