MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 plasmid pSICJ18-1

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016837	T	9	9	540	548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016837	A	6	6	580	585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016837	A	6	6	977	982	100 %	0 %	0 %	0 %	379704343
4	NC_016837	G	6	6	1242	1247	0 %	0 %	100 %	0 %	379704343
5	NC_016837	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	379704343
6	NC_016837	T	7	7	2053	2059	0 %	100 %	0 %	0 %	379704343
7	NC_016837	A	6	6	2174	2179	100 %	0 %	0 %	0 %	379704343
8	NC_016837	A	6	6	2463	2468	100 %	0 %	0 %	0 %	379704344
9	NC_016837	T	6	6	2832	2837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016837	A	6	6	3275	3280	100 %	0 %	0 %	0 %	379704345
11	NC_016837	T	6	6	3765	3770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016837	A	7	7	4245	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016837	T	6	6	4442	4447	0 %	100 %	0 %	0 %	379704346
14	NC_016837	A	6	6	4658	4663	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
15	NC_016837	A	6	6	4871	4876	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
16	NC_016837	A	6	6	5102	5107	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
17	NC_016837	A	6	6	5211	5216	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
18	NC_016837	A	6	6	5240	5245	100 %	0 %	0 %	0 %	379704346
19	NC_016837	A	6	6	6244	6249	100 %	0 %	0 %	0 %	379704348
20	NC_016837	A	6	6	6408	6413	100 %	0 %	0 %	0 %	379704349
21	NC_016837	A	7	7	6650	6656	100 %	0 %	0 %	0 %	379704349
22	NC_016837	A	7	7	6743	6749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016837	T	6	6	7225	7230	0 %	100 %	0 %	0 %	379704350
24	NC_016837	T	6	6	7257	7262	0 %	100 %	0 %	0 %	379704350
25	NC_016837	T	6	6	7273	7278	0 %	100 %	0 %	0 %	379704350
26	NC_016837	T	7	7	7344	7350	0 %	100 %	0 %	0 %	379704350
27	NC_016837	A	7	7	7462	7468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016837	A	6	6	7533	7538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016837	T	7	7	7564	7570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016837	A	7	7	7886	7892	100 %	0 %	0 %	0 %	379704352
31	NC_016837	T	7	7	7948	7954	0 %	100 %	0 %	0 %	379704352
32	NC_016837	A	7	7	8135	8141	100 %	0 %	0 %	0 %	379704353
33	NC_016837	T	7	7	8412	8418	0 %	100 %	0 %	0 %	379704354
34	NC_016837	T	8	8	8563	8570	0 %	100 %	0 %	0 %	379704354
35	NC_016837	A	6	6	9114	9119	100 %	0 %	0 %	0 %	379704355
36	NC_016837	A	6	6	9127	9132	100 %	0 %	0 %	0 %	379704355
37	NC_016837	A	6	6	9483	9488	100 %	0 %	0 %	0 %	379704356
38	NC_016837	A	6	6	9528	9533	100 %	0 %	0 %	0 %	379704356
39	NC_016837	T	7	7	9766	9772	0 %	100 %	0 %	0 %	379704357
40	NC_016837	T	7	7	9794	9800	0 %	100 %	0 %	0 %	379704357
41	NC_016837	T	6	6	10013	10018	0 %	100 %	0 %	0 %	379704357
42	NC_016837	T	7	7	10088	10094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016837	A	6	6	10098	10103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016837	T	6	6	10127	10132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016837	A	6	6	10137	10142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016837	A	6	6	10969	10974	100 %	0 %	0 %	0 %	379704358
47	NC_016837	A	6	6	11057	11062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016837	T	7	7	11083	11089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016837	A	6	6	11167	11172	100 %	0 %	0 %	0 %	379704359
50	NC_016837	T	8	8	11326	11333	0 %	100 %	0 %	0 %	379704360
51	NC_016837	T	6	6	11358	11363	0 %	100 %	0 %	0 %	379704360
52	NC_016837	T	6	6	11486	11491	0 %	100 %	0 %	0 %	379704360
53	NC_016837	A	6	6	11909	11914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016837	T	6	6	12493	12498	0 %	100 %	0 %	0 %	379704361
55	NC_016837	T	6	6	14244	14249	0 %	100 %	0 %	0 %	379704365
56	NC_016837	T	6	6	14295	14300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016837	T	6	6	14323	14328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016837	T	6	6	14335	14340	0 %	100 %	0 %	0 %	379704366
59	NC_016837	T	6	6	14443	14448	0 %	100 %	0 %	0 %	379704366
60	NC_016837	A	9	9	14508	14516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016837	A	6	6	14662	14667	100 %	0 %	0 %	0 %	379704367
62	NC_016837	A	7	7	14748	14754	100 %	0 %	0 %	0 %	379704367
63	NC_016837	A	9	9	14891	14899	100 %	0 %	0 %	0 %	379704367
64	NC_016837	A	8	8	14996	15003	100 %	0 %	0 %	0 %	379704367
65	NC_016837	A	6	6	15188	15193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016837	A	6	6	15341	15346	100 %	0 %	0 %	0 %	379704369
67	NC_016837	A	6	6	16130	16135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016837	A	7	7	16214	16220	100 %	0 %	0 %	0 %	379704371
69	NC_016837	A	6	6	16228	16233	100 %	0 %	0 %	0 %	379704371
70	NC_016837	A	8	8	16422	16429	100 %	0 %	0 %	0 %	379704371
71	NC_016837	A	6	6	16456	16461	100 %	0 %	0 %	0 %	379704371
72	NC_016837	A	6	6	16934	16939	100 %	0 %	0 %	0 %	379704371
73	NC_016837	A	7	7	17554	17560	100 %	0 %	0 %	0 %	379704371
74	NC_016837	A	7	7	17773	17779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016837	T	7	7	17935	17941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016837	A	7	7	18104	18110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016837	T	6	6	18429	18434	0 %	100 %	0 %	0 %	379704373
78	NC_016837	T	6	6	18944	18949	0 %	100 %	0 %	0 %	379704375
79	NC_016837	T	6	6	19383	19388	0 %	100 %	0 %	0 %	379704376
80	NC_016837	T	6	6	19393	19398	0 %	100 %	0 %	0 %	379704376
81	NC_016837	A	7	7	19578	19584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016837	T	6	6	19615	19620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016837	A	6	6	19657	19662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016837	A	6	6	19818	19823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.