MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103b complete sequence

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016836	CGCCAG	2	12	1218	1229	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378828573
2	NC_016836	TGGTCT	2	12	7521	7532	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378828583
3	NC_016836	TCGATC	2	12	11613	11624	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378828585
4	NC_016836	AGCTGG	2	12	13375	13386	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378828586
5	NC_016836	TTGGAA	2	12	20226	20237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378828596
6	NC_016836	CCTTGG	2	12	25305	25316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828602
7	NC_016836	GCCGAC	2	12	25894	25905	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378828604
8	NC_016836	GCTTGC	2	12	27026	27037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378828605
9	NC_016836	CGGCGC	2	12	31461	31472	0 %	0 %	50 %	50 %	378828609
10	NC_016836	GATCGA	2	12	32001	32012	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378828609
11	NC_016836	TCGACC	2	12	33474	33485	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378828610
12	NC_016836	CGGCAG	2	12	33961	33972	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378828610
13	NC_016836	GGACGT	2	12	36140	36151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378828613
14	NC_016836	ACGTCA	2	12	36196	36207	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378828613
15	NC_016836	CGGAGC	2	12	37549	37560	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378828614
16	NC_016836	ACGGCG	2	12	38767	38778	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378828614
17	NC_016836	GCGCAA	2	12	44935	44946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828620
18	NC_016836	CAGAAA	2	12	50957	50968	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378828621
19	NC_016836	CAGGAG	2	12	53864	53875	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378828623
20	NC_016836	GCCGAA	2	12	54524	54535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378828623
21	NC_016836	CGGAGG	2	12	54744	54755	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378828623
22	NC_016836	CCAGTT	2	12	58216	58227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378828626

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.