MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103b complete sequence

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016836	ACGG	2	8	41	48	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016836	GAAC	2	8	113	120	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016836	CCGG	2	8	260	267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016836	TCGA	2	8	277	284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016836	TCAA	2	8	640	647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016836	CAGA	2	8	663	670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016836	TGAA	2	8	842	849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016836	ATGA	2	8	2738	2745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016836	ATCA	2	8	2747	2754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016836	TGCT	2	8	2755	2762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016836	CGAT	2	8	2819	2826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016836	ATCT	2	8	3271	3278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016836	ATCA	2	8	4389	4396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016836	CGAG	2	8	12776	12783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016836	GCAG	2	8	12842	12849	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016836	AAGC	2	8	13086	13093	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016836	GCTG	2	8	15457	15464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016836	GGAA	2	8	21932	21939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016836	CGCA	2	8	23403	23410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016836	CGTC	2	8	26100	26107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016836	CGGC	2	8	30703	30710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016836	CGCC	2	8	30912	30919	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_016836	CGCC	2	8	35059	35066	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_016836	GTCT	2	8	35149	35156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016836	CGGT	2	8	35558	35565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016836	CCAG	2	8	36476	36483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016836	GCAA	2	8	36751	36758	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016836	GATT	2	8	36964	36971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016836	CGAG	2	8	40846	40853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016836	CGAG	2	8	40965	40972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016836	GGAC	2	8	44384	44391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016836	GTGC	2	8	61528	61535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.