MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103b complete sequence

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016836	GC	3	6	1655	1660	0 %	0 %	50 %	50 %	378828574
2	NC_016836	CT	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378828576
3	NC_016836	GC	4	8	2313	2320	0 %	0 %	50 %	50 %	378828576
4	NC_016836	GA	3	6	2830	2835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016836	AG	3	6	2886	2891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016836	AG	3	6	4721	4726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016836	GT	3	6	5278	5283	0 %	50 %	50 %	0 %	378828581
8	NC_016836	CT	3	6	5447	5452	0 %	50 %	0 %	50 %	378828581
9	NC_016836	GA	3	6	5809	5814	50 %	0 %	50 %	0 %	378828581
10	NC_016836	CG	3	6	7848	7853	0 %	0 %	50 %	50 %	378828584
11	NC_016836	TG	3	6	8714	8719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016836	TC	3	6	9051	9056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016836	CG	3	6	10381	10386	0 %	0 %	50 %	50 %	378828585
14	NC_016836	GC	3	6	10785	10790	0 %	0 %	50 %	50 %	378828585
15	NC_016836	CG	3	6	12094	12099	0 %	0 %	50 %	50 %	378828585
16	NC_016836	GA	3	6	12975	12980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016836	GT	3	6	14446	14451	0 %	50 %	50 %	0 %	378828588
18	NC_016836	CG	3	6	14585	14590	0 %	0 %	50 %	50 %	378828588
19	NC_016836	TC	4	8	15072	15079	0 %	50 %	0 %	50 %	378828589
20	NC_016836	GA	3	6	15107	15112	50 %	0 %	50 %	0 %	378828589
21	NC_016836	GA	3	6	15133	15138	50 %	0 %	50 %	0 %	378828589
22	NC_016836	CT	3	6	15298	15303	0 %	50 %	0 %	50 %	378828589
23	NC_016836	AT	3	6	15548	15553	50 %	50 %	0 %	0 %	378828590
24	NC_016836	GC	3	6	16116	16121	0 %	0 %	50 %	50 %	378828590
25	NC_016836	TC	3	6	16337	16342	0 %	50 %	0 %	50 %	378828591
26	NC_016836	GC	3	6	16473	16478	0 %	0 %	50 %	50 %	378828591
27	NC_016836	GT	3	6	16956	16961	0 %	50 %	50 %	0 %	378828592
28	NC_016836	GC	4	8	17241	17248	0 %	0 %	50 %	50 %	378828593
29	NC_016836	CA	3	6	17494	17499	50 %	0 %	0 %	50 %	378828593
30	NC_016836	TC	3	6	18772	18777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016836	GC	3	6	19968	19973	0 %	0 %	50 %	50 %	378828596
32	NC_016836	GC	3	6	22081	22086	0 %	0 %	50 %	50 %	378828598
33	NC_016836	CG	3	6	22395	22400	0 %	0 %	50 %	50 %	378828598
34	NC_016836	GC	3	6	22700	22705	0 %	0 %	50 %	50 %	378828599
35	NC_016836	AT	3	6	24815	24820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016836	GC	3	6	25147	25152	0 %	0 %	50 %	50 %	378828602
37	NC_016836	GC	3	6	26328	26333	0 %	0 %	50 %	50 %	378828605
38	NC_016836	CG	3	6	26480	26485	0 %	0 %	50 %	50 %	378828605
39	NC_016836	GA	3	6	26615	26620	50 %	0 %	50 %	0 %	378828605
40	NC_016836	GC	3	6	26980	26985	0 %	0 %	50 %	50 %	378828605
41	NC_016836	TC	3	6	27857	27862	0 %	50 %	0 %	50 %	378828606
42	NC_016836	GC	3	6	27901	27906	0 %	0 %	50 %	50 %	378828606
43	NC_016836	TG	3	6	28578	28583	0 %	50 %	50 %	0 %	378828606
44	NC_016836	CT	3	6	29717	29722	0 %	50 %	0 %	50 %	378828607
45	NC_016836	CT	3	6	30636	30641	0 %	50 %	0 %	50 %	378828608
46	NC_016836	CG	3	6	31578	31583	0 %	0 %	50 %	50 %	378828609
47	NC_016836	GC	3	6	31644	31649	0 %	0 %	50 %	50 %	378828609
48	NC_016836	CG	3	6	32060	32065	0 %	0 %	50 %	50 %	378828609
49	NC_016836	GC	3	6	32974	32979	0 %	0 %	50 %	50 %	378828609
50	NC_016836	CG	4	8	33669	33676	0 %	0 %	50 %	50 %	378828610
51	NC_016836	GC	3	6	33845	33850	0 %	0 %	50 %	50 %	378828610
52	NC_016836	CG	3	6	34113	34118	0 %	0 %	50 %	50 %	378828610
53	NC_016836	GC	3	6	34567	34572	0 %	0 %	50 %	50 %	378828611
54	NC_016836	TA	3	6	34989	34994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016836	TA	3	6	35182	35187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016836	AG	3	6	35627	35632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016836	GC	3	6	36251	36256	0 %	0 %	50 %	50 %	378828613
58	NC_016836	GC	3	6	36379	36384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016836	CA	3	6	37309	37314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016836	GA	3	6	37431	37436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016836	GC	3	6	38568	38573	0 %	0 %	50 %	50 %	378828614
62	NC_016836	GC	4	8	38751	38758	0 %	0 %	50 %	50 %	378828614
63	NC_016836	CG	3	6	39518	39523	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
64	NC_016836	GC	3	6	39907	39912	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
65	NC_016836	GA	3	6	40021	40026	50 %	0 %	50 %	0 %	378828615
66	NC_016836	CG	3	6	40172	40177	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
67	NC_016836	GC	3	6	40201	40206	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
68	NC_016836	CG	3	6	40340	40345	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
69	NC_016836	GC	3	6	40503	40508	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
70	NC_016836	CG	3	6	41421	41426	0 %	0 %	50 %	50 %	378828616
71	NC_016836	AC	3	6	42070	42075	50 %	0 %	0 %	50 %	378828616
72	NC_016836	GC	4	8	42679	42686	0 %	0 %	50 %	50 %	378828616
73	NC_016836	CG	3	6	42729	42734	0 %	0 %	50 %	50 %	378828616
74	NC_016836	CA	3	6	42883	42888	50 %	0 %	0 %	50 %	378828616
75	NC_016836	CT	3	6	43614	43619	0 %	50 %	0 %	50 %	378828616
76	NC_016836	TG	3	6	43804	43809	0 %	50 %	50 %	0 %	378828617
77	NC_016836	CG	3	6	45087	45092	0 %	0 %	50 %	50 %	378828620
78	NC_016836	TC	3	6	46011	46016	0 %	50 %	0 %	50 %	378828621
79	NC_016836	GT	3	6	46184	46189	0 %	50 %	50 %	0 %	378828621
80	NC_016836	GC	3	6	46275	46280	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
81	NC_016836	GT	3	6	46508	46513	0 %	50 %	50 %	0 %	378828621
82	NC_016836	CG	3	6	46583	46588	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
83	NC_016836	GC	3	6	46646	46651	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
84	NC_016836	CG	3	6	47498	47503	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
85	NC_016836	CG	3	6	48948	48953	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
86	NC_016836	CG	3	6	49036	49041	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
87	NC_016836	CG	3	6	49484	49489	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
88	NC_016836	CG	3	6	49767	49772	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
89	NC_016836	CG	3	6	49919	49924	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
90	NC_016836	CG	3	6	50238	50243	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
91	NC_016836	GC	3	6	50402	50407	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
92	NC_016836	GC	3	6	51306	51311	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
93	NC_016836	GC	3	6	51496	51501	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
94	NC_016836	CG	3	6	51809	51814	0 %	0 %	50 %	50 %	378828622
95	NC_016836	CG	3	6	52251	52256	0 %	0 %	50 %	50 %	378828622
96	NC_016836	GC	4	8	52575	52582	0 %	0 %	50 %	50 %	378828622
97	NC_016836	CG	3	6	52775	52780	0 %	0 %	50 %	50 %	378828622
98	NC_016836	AC	3	6	52807	52812	50 %	0 %	0 %	50 %	378828622
99	NC_016836	AG	3	6	53992	53997	50 %	0 %	50 %	0 %	378828623
100	NC_016836	GC	3	6	54300	54305	0 %	0 %	50 %	50 %	378828623
101	NC_016836	CT	3	6	54332	54337	0 %	50 %	0 %	50 %	378828623
102	NC_016836	GA	3	6	54439	54444	50 %	0 %	50 %	0 %	378828623
103	NC_016836	GA	3	6	54936	54941	50 %	0 %	50 %	0 %	378828623
104	NC_016836	GA	3	6	54988	54993	50 %	0 %	50 %	0 %	378828623
105	NC_016836	GC	3	6	55256	55261	0 %	0 %	50 %	50 %	378828623
106	NC_016836	GC	3	6	56099	56104	0 %	0 %	50 %	50 %	378828624
107	NC_016836	CG	3	6	56437	56442	0 %	0 %	50 %	50 %	378828624
108	NC_016836	CG	3	6	56497	56502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016836	TG	3	6	56761	56766	0 %	50 %	50 %	0 %	378828626
110	NC_016836	GC	4	8	56971	56978	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
111	NC_016836	GC	3	6	57096	57101	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
112	NC_016836	CG	3	6	57156	57161	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
113	NC_016836	CG	3	6	57318	57323	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
114	NC_016836	CG	3	6	57802	57807	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
115	NC_016836	CG	3	6	58161	58166	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
116	NC_016836	GA	3	6	58469	58474	50 %	0 %	50 %	0 %	378828627
117	NC_016836	TA	3	6	58886	58891	50 %	50 %	0 %	0 %	378828627
118	NC_016836	AT	3	6	59363	59368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016836	GC	3	6	59679	59684	0 %	0 %	50 %	50 %	378828628
120	NC_016836	AG	3	6	60503	60508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016836	AT	3	6	60624	60629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016836	CG	3	6	61386	61391	0 %	0 %	50 %	50 %	378828630

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.