MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103b complete sequence

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016836	GC	3	6	1655	1660	0 %	0 %	50 %	50 %	378828574
2	NC_016836	CT	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378828576
3	NC_016836	GC	4	8	2313	2320	0 %	0 %	50 %	50 %	378828576
4	NC_016836	GT	3	6	5278	5283	0 %	50 %	50 %	0 %	378828581
5	NC_016836	CT	3	6	5447	5452	0 %	50 %	0 %	50 %	378828581
6	NC_016836	GA	3	6	5809	5814	50 %	0 %	50 %	0 %	378828581
7	NC_016836	CG	3	6	7848	7853	0 %	0 %	50 %	50 %	378828584
8	NC_016836	CG	3	6	10381	10386	0 %	0 %	50 %	50 %	378828585
9	NC_016836	GC	3	6	10785	10790	0 %	0 %	50 %	50 %	378828585
10	NC_016836	CG	3	6	12094	12099	0 %	0 %	50 %	50 %	378828585
11	NC_016836	GT	3	6	14446	14451	0 %	50 %	50 %	0 %	378828588
12	NC_016836	CG	3	6	14585	14590	0 %	0 %	50 %	50 %	378828588
13	NC_016836	TC	4	8	15072	15079	0 %	50 %	0 %	50 %	378828589
14	NC_016836	GA	3	6	15107	15112	50 %	0 %	50 %	0 %	378828589
15	NC_016836	GA	3	6	15133	15138	50 %	0 %	50 %	0 %	378828589
16	NC_016836	CT	3	6	15298	15303	0 %	50 %	0 %	50 %	378828589
17	NC_016836	AT	3	6	15548	15553	50 %	50 %	0 %	0 %	378828590
18	NC_016836	GC	3	6	16116	16121	0 %	0 %	50 %	50 %	378828590
19	NC_016836	TC	3	6	16337	16342	0 %	50 %	0 %	50 %	378828591
20	NC_016836	GC	3	6	16473	16478	0 %	0 %	50 %	50 %	378828591
21	NC_016836	GT	3	6	16956	16961	0 %	50 %	50 %	0 %	378828592
22	NC_016836	GC	4	8	17241	17248	0 %	0 %	50 %	50 %	378828593
23	NC_016836	CA	3	6	17494	17499	50 %	0 %	0 %	50 %	378828593
24	NC_016836	GC	3	6	19968	19973	0 %	0 %	50 %	50 %	378828596
25	NC_016836	GC	3	6	22081	22086	0 %	0 %	50 %	50 %	378828598
26	NC_016836	CG	3	6	22395	22400	0 %	0 %	50 %	50 %	378828598
27	NC_016836	GC	3	6	22700	22705	0 %	0 %	50 %	50 %	378828599
28	NC_016836	GC	3	6	25147	25152	0 %	0 %	50 %	50 %	378828602
29	NC_016836	GC	3	6	26328	26333	0 %	0 %	50 %	50 %	378828605
30	NC_016836	CG	3	6	26480	26485	0 %	0 %	50 %	50 %	378828605
31	NC_016836	GA	3	6	26615	26620	50 %	0 %	50 %	0 %	378828605
32	NC_016836	GC	3	6	26980	26985	0 %	0 %	50 %	50 %	378828605
33	NC_016836	TC	3	6	27857	27862	0 %	50 %	0 %	50 %	378828606
34	NC_016836	GC	3	6	27901	27906	0 %	0 %	50 %	50 %	378828606
35	NC_016836	TG	3	6	28578	28583	0 %	50 %	50 %	0 %	378828606
36	NC_016836	CT	3	6	29717	29722	0 %	50 %	0 %	50 %	378828607
37	NC_016836	CT	3	6	30636	30641	0 %	50 %	0 %	50 %	378828608
38	NC_016836	CG	3	6	31578	31583	0 %	0 %	50 %	50 %	378828609
39	NC_016836	GC	3	6	31644	31649	0 %	0 %	50 %	50 %	378828609
40	NC_016836	CG	3	6	32060	32065	0 %	0 %	50 %	50 %	378828609
41	NC_016836	GC	3	6	32974	32979	0 %	0 %	50 %	50 %	378828609
42	NC_016836	CG	4	8	33669	33676	0 %	0 %	50 %	50 %	378828610
43	NC_016836	GC	3	6	33845	33850	0 %	0 %	50 %	50 %	378828610
44	NC_016836	CG	3	6	34113	34118	0 %	0 %	50 %	50 %	378828610
45	NC_016836	GC	3	6	34567	34572	0 %	0 %	50 %	50 %	378828611
46	NC_016836	GC	3	6	36251	36256	0 %	0 %	50 %	50 %	378828613
47	NC_016836	GC	3	6	38568	38573	0 %	0 %	50 %	50 %	378828614
48	NC_016836	GC	4	8	38751	38758	0 %	0 %	50 %	50 %	378828614
49	NC_016836	CG	3	6	39518	39523	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
50	NC_016836	GC	3	6	39907	39912	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
51	NC_016836	GA	3	6	40021	40026	50 %	0 %	50 %	0 %	378828615
52	NC_016836	CG	3	6	40172	40177	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
53	NC_016836	GC	3	6	40201	40206	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
54	NC_016836	CG	3	6	40340	40345	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
55	NC_016836	GC	3	6	40503	40508	0 %	0 %	50 %	50 %	378828615
56	NC_016836	CG	3	6	41421	41426	0 %	0 %	50 %	50 %	378828616
57	NC_016836	AC	3	6	42070	42075	50 %	0 %	0 %	50 %	378828616
58	NC_016836	GC	4	8	42679	42686	0 %	0 %	50 %	50 %	378828616
59	NC_016836	CG	3	6	42729	42734	0 %	0 %	50 %	50 %	378828616
60	NC_016836	CA	3	6	42883	42888	50 %	0 %	0 %	50 %	378828616
61	NC_016836	CT	3	6	43614	43619	0 %	50 %	0 %	50 %	378828616
62	NC_016836	TG	3	6	43804	43809	0 %	50 %	50 %	0 %	378828617
63	NC_016836	CG	3	6	45087	45092	0 %	0 %	50 %	50 %	378828620
64	NC_016836	TC	3	6	46011	46016	0 %	50 %	0 %	50 %	378828621
65	NC_016836	GT	3	6	46184	46189	0 %	50 %	50 %	0 %	378828621
66	NC_016836	GC	3	6	46275	46280	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
67	NC_016836	GT	3	6	46508	46513	0 %	50 %	50 %	0 %	378828621
68	NC_016836	CG	3	6	46583	46588	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
69	NC_016836	GC	3	6	46646	46651	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
70	NC_016836	CG	3	6	47498	47503	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
71	NC_016836	CG	3	6	48948	48953	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
72	NC_016836	CG	3	6	49036	49041	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
73	NC_016836	CG	3	6	49484	49489	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
74	NC_016836	CG	3	6	49767	49772	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
75	NC_016836	CG	3	6	49919	49924	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
76	NC_016836	CG	3	6	50238	50243	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
77	NC_016836	GC	3	6	50402	50407	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
78	NC_016836	GC	3	6	51306	51311	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
79	NC_016836	GC	3	6	51496	51501	0 %	0 %	50 %	50 %	378828621
80	NC_016836	CG	3	6	51809	51814	0 %	0 %	50 %	50 %	378828622
81	NC_016836	CG	3	6	52251	52256	0 %	0 %	50 %	50 %	378828622
82	NC_016836	GC	4	8	52575	52582	0 %	0 %	50 %	50 %	378828622
83	NC_016836	CG	3	6	52775	52780	0 %	0 %	50 %	50 %	378828622
84	NC_016836	AC	3	6	52807	52812	50 %	0 %	0 %	50 %	378828622
85	NC_016836	AG	3	6	53992	53997	50 %	0 %	50 %	0 %	378828623
86	NC_016836	GC	3	6	54300	54305	0 %	0 %	50 %	50 %	378828623
87	NC_016836	CT	3	6	54332	54337	0 %	50 %	0 %	50 %	378828623
88	NC_016836	GA	3	6	54439	54444	50 %	0 %	50 %	0 %	378828623
89	NC_016836	GA	3	6	54936	54941	50 %	0 %	50 %	0 %	378828623
90	NC_016836	GA	3	6	54988	54993	50 %	0 %	50 %	0 %	378828623
91	NC_016836	GC	3	6	55256	55261	0 %	0 %	50 %	50 %	378828623
92	NC_016836	GC	3	6	56099	56104	0 %	0 %	50 %	50 %	378828624
93	NC_016836	CG	3	6	56437	56442	0 %	0 %	50 %	50 %	378828624
94	NC_016836	TG	3	6	56761	56766	0 %	50 %	50 %	0 %	378828626
95	NC_016836	GC	4	8	56971	56978	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
96	NC_016836	GC	3	6	57096	57101	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
97	NC_016836	CG	3	6	57156	57161	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
98	NC_016836	CG	3	6	57318	57323	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
99	NC_016836	CG	3	6	57802	57807	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
100	NC_016836	CG	3	6	58161	58166	0 %	0 %	50 %	50 %	378828626
101	NC_016836	GA	3	6	58469	58474	50 %	0 %	50 %	0 %	378828627
102	NC_016836	TA	3	6	58886	58891	50 %	50 %	0 %	0 %	378828627
103	NC_016836	GC	3	6	59679	59684	0 %	0 %	50 %	50 %	378828628
104	NC_016836	CG	3	6	61386	61391	0 %	0 %	50 %	50 %	378828630

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.