MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016835	AAATG	2	10	11965	11974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016835	AAACA	2	10	35778	35787	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016835	TGGGG	2	10	60861	60870	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016835	GATCG	2	10	65055	65064	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016835	GAGCG	2	10	66966	66975	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016835	AAATC	2	10	70832	70841	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016835	GCAAC	2	10	74160	74169	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016835	TTTTA	2	10	76084	76093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016835	TTGAA	2	10	116474	116483	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016835	TTTAT	2	10	117579	117588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016835	TAATC	2	10	117628	117637	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016835	ACCAA	2	10	117797	117806	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016835	ACTGC	2	10	124258	124267	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016835	GTAAA	2	10	141037	141046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016835	CTTCG	2	10	141336	141345	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016835	CTGCC	2	10	141791	141800	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_016835	AAACA	2	10	142199	142208	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016835	AGATG	2	10	143520	143529	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016835	ATGCA	2	10	143826	143835	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016835	GTACT	2	10	144305	144314	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016835	TTTCA	2	10	165126	165135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016835	CAGGT	2	10	166639	166648	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016835	AAAAG	2	10	171064	171073	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016835	CATCC	2	10	197912	197921	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_016835	ATGAA	2	10	220073	220082	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016835	ATAAC	2	10	226738	226747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016835	GATCA	2	10	237039	237048	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016835	ATTCT	2	10	240869	240878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016835	TCTGG	2	10	253776	253785	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016835	TTATT	2	10	275106	275115	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016835	TATTT	2	10	299287	299296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016835	CGCAT	2	10	305680	305689	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016835	CCAGG	2	10	306402	306411	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016835	TTGAG	2	10	315691	315700	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016835	ATGGA	2	10	315889	315898	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016835	AAAAT	2	10	315945	315954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016835	CTGAA	2	10	349709	349718	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016835	GTATT	2	10	418127	418136	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016835	ATGAA	2	10	418163	418172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016835	CGCCA	2	10	419936	419945	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_016835	CAATT	2	10	457334	457343	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.