MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 1180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016835	TCAG	2	8	96	103	25 %	25 %	25 %	25 %	379703933
2	NC_016835	CCCG	2	8	335	342	0 %	0 %	25 %	75 %	379703933
3	NC_016835	GGCT	2	8	379	386	0 %	25 %	50 %	25 %	379703933
4	NC_016835	GCCT	2	8	1237	1244	0 %	25 %	25 %	50 %	379703933
5	NC_016835	CTGT	2	8	1995	2002	0 %	50 %	25 %	25 %	379703933
6	NC_016835	GCCC	2	8	2394	2401	0 %	0 %	25 %	75 %	379703933
7	NC_016835	GCCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	379703933
8	NC_016835	TTTA	2	8	3109	3116	25 %	75 %	0 %	0 %	379703934
9	NC_016835	TCAG	2	8	3119	3126	25 %	25 %	25 %	25 %	379703934
10	NC_016835	CAGC	2	8	3341	3348	25 %	0 %	25 %	50 %	379703934
11	NC_016835	CTGG	2	8	3929	3936	0 %	25 %	50 %	25 %	379703934
12	NC_016835	TGCG	2	8	4363	4370	0 %	25 %	50 %	25 %	379703934
13	NC_016835	CAGA	2	8	4643	4650	50 %	0 %	25 %	25 %	379703934
14	NC_016835	CCGG	2	8	6010	6017	0 %	0 %	50 %	50 %	379703935
15	NC_016835	GCCA	2	8	6781	6788	25 %	0 %	25 %	50 %	379703935
16	NC_016835	ACGG	2	8	6940	6947	25 %	0 %	50 %	25 %	379703935
17	NC_016835	ATAA	2	8	8213	8220	75 %	25 %	0 %	0 %	379703936
18	NC_016835	CCCA	2	8	8749	8756	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_016835	CATT	2	8	8780	8787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016835	AGGA	2	8	9559	9566	50 %	0 %	50 %	0 %	379703937
21	NC_016835	GAAA	2	8	10792	10799	75 %	0 %	25 %	0 %	379703938
22	NC_016835	GCCG	2	8	10822	10829	0 %	0 %	50 %	50 %	379703938
23	NC_016835	CAGA	2	8	10903	10910	50 %	0 %	25 %	25 %	379703938
24	NC_016835	AAAG	2	8	11418	11425	75 %	0 %	25 %	0 %	379703938
25	NC_016835	GGCA	2	8	11768	11775	25 %	0 %	50 %	25 %	379703938
26	NC_016835	TATT	2	8	12023	12030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016835	TAAT	2	8	12449	12456	50 %	50 %	0 %	0 %	379703939
28	NC_016835	GGAA	2	8	12910	12917	50 %	0 %	50 %	0 %	379703940
29	NC_016835	CAAA	2	8	12986	12993	75 %	0 %	0 %	25 %	379703940
30	NC_016835	GTTT	2	8	13332	13339	0 %	75 %	25 %	0 %	379703941
31	NC_016835	AGCC	2	8	13731	13738	25 %	0 %	25 %	50 %	379703941
32	NC_016835	CCGG	2	8	13894	13901	0 %	0 %	50 %	50 %	379703941
33	NC_016835	GCCA	2	8	14665	14672	25 %	0 %	25 %	50 %	379703941
34	NC_016835	ACGG	2	8	14824	14831	25 %	0 %	50 %	25 %	379703941
35	NC_016835	AAAT	2	8	15041	15048	75 %	25 %	0 %	0 %	379703941
36	NC_016835	AAAG	2	8	15211	15218	75 %	0 %	25 %	0 %	379703941
37	NC_016835	CCGG	2	8	16476	16483	0 %	0 %	50 %	50 %	379703943
38	NC_016835	GCCA	2	8	17247	17254	25 %	0 %	25 %	50 %	379703943
39	NC_016835	AGCG	2	8	18587	18594	25 %	0 %	50 %	25 %	379703944
40	NC_016835	TCAA	2	8	18642	18649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016835	CCGG	2	8	19041	19048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016835	AAAT	2	8	19457	19464	75 %	25 %	0 %	0 %	379703945
43	NC_016835	ATTA	2	8	19553	19560	50 %	50 %	0 %	0 %	379703945
44	NC_016835	ATAA	2	8	20622	20629	75 %	25 %	0 %	0 %	379703947
45	NC_016835	CATC	2	8	20714	20721	25 %	25 %	0 %	50 %	379703947
46	NC_016835	CCAG	2	8	20789	20796	25 %	0 %	25 %	50 %	379703947
47	NC_016835	TGGC	2	8	20949	20956	0 %	25 %	50 %	25 %	379703947
48	NC_016835	TGGG	2	8	21036	21043	0 %	25 %	75 %	0 %	379703947
49	NC_016835	GCCT	2	8	21056	21063	0 %	25 %	25 %	50 %	379703947
50	NC_016835	AGGC	2	8	21303	21310	25 %	0 %	50 %	25 %	379703948
51	NC_016835	CCGT	2	8	21622	21629	0 %	25 %	25 %	50 %	379703948
52	NC_016835	ATCA	2	8	22226	22233	50 %	25 %	0 %	25 %	379703948
53	NC_016835	GACA	2	8	22876	22883	50 %	0 %	25 %	25 %	379703948
54	NC_016835	AACA	2	8	23346	23353	75 %	0 %	0 %	25 %	379703948
55	NC_016835	ATAC	2	8	24316	24323	50 %	25 %	0 %	25 %	379703948
56	NC_016835	TCAG	2	8	24584	24591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016835	AGAT	2	8	25110	25117	50 %	25 %	25 %	0 %	379703949
58	NC_016835	ATCT	2	8	25133	25140	25 %	50 %	0 %	25 %	379703949
59	NC_016835	TGAG	2	8	25440	25447	25 %	25 %	50 %	0 %	379703949
60	NC_016835	GAAT	2	8	25558	25565	50 %	25 %	25 %	0 %	379703949
61	NC_016835	CACC	2	8	26576	26583	25 %	0 %	0 %	75 %	379703950
62	NC_016835	TCGC	2	8	27688	27695	0 %	25 %	25 %	50 %	379703951
63	NC_016835	GACC	2	8	28521	28528	25 %	0 %	25 %	50 %	379703952
64	NC_016835	AGGA	2	8	31468	31475	50 %	0 %	50 %	0 %	379703955
65	NC_016835	ATGA	2	8	31695	31702	50 %	25 %	25 %	0 %	379703955
66	NC_016835	AAGC	2	8	31755	31762	50 %	0 %	25 %	25 %	379703955
67	NC_016835	CAAA	2	8	31933	31940	75 %	0 %	0 %	25 %	379703955
68	NC_016835	AGAT	2	8	32425	32432	50 %	25 %	25 %	0 %	379703956
69	NC_016835	GGTT	2	8	32437	32444	0 %	50 %	50 %	0 %	379703956
70	NC_016835	AAAT	2	8	32517	32524	75 %	25 %	0 %	0 %	379703956
71	NC_016835	GGTA	2	8	32947	32954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016835	CTTG	2	8	33520	33527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016835	ATTT	2	8	33546	33553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016835	TGGC	2	8	34050	34057	0 %	25 %	50 %	25 %	379703957
75	NC_016835	CTGG	2	8	34601	34608	0 %	25 %	50 %	25 %	379703957
76	NC_016835	GACG	2	8	34803	34810	25 %	0 %	50 %	25 %	379703957
77	NC_016835	GCAG	2	8	34886	34893	25 %	0 %	50 %	25 %	379703957
78	NC_016835	ACTT	2	8	35029	35036	25 %	50 %	0 %	25 %	379703957
79	NC_016835	TTAA	2	8	35833	35840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016835	AATT	2	8	36324	36331	50 %	50 %	0 %	0 %	379703959
81	NC_016835	GCTG	2	8	36802	36809	0 %	25 %	50 %	25 %	379703960
82	NC_016835	GCTG	2	8	37477	37484	0 %	25 %	50 %	25 %	379703960
83	NC_016835	GTCA	2	8	37724	37731	25 %	25 %	25 %	25 %	379703960
84	NC_016835	CAGC	2	8	38250	38257	25 %	0 %	25 %	50 %	379703961
85	NC_016835	TTAT	2	8	38560	38567	25 %	75 %	0 %	0 %	379703961
86	NC_016835	CCTG	2	8	39007	39014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016835	TTCA	2	8	39133	39140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016835	AAAG	2	8	39364	39371	75 %	0 %	25 %	0 %	379703962
89	NC_016835	CTGG	2	8	40833	40840	0 %	25 %	50 %	25 %	379703963
90	NC_016835	AGCC	2	8	40974	40981	25 %	0 %	25 %	50 %	379703963
91	NC_016835	ACCG	2	8	42997	43004	25 %	0 %	25 %	50 %	379703965
92	NC_016835	TGGA	2	8	43685	43692	25 %	25 %	50 %	0 %	379703966
93	NC_016835	GCAG	2	8	43704	43711	25 %	0 %	50 %	25 %	379703966
94	NC_016835	TGAG	2	8	44239	44246	25 %	25 %	50 %	0 %	379703966
95	NC_016835	TCCC	2	8	44581	44588	0 %	25 %	0 %	75 %	379703967
96	NC_016835	GCTG	2	8	44642	44649	0 %	25 %	50 %	25 %	379703967
97	NC_016835	CCCG	2	8	45278	45285	0 %	0 %	25 %	75 %	379703967
98	NC_016835	CAGA	2	8	46115	46122	50 %	0 %	25 %	25 %	379703968
99	NC_016835	CAGT	2	8	46422	46429	25 %	25 %	25 %	25 %	379703969
100	NC_016835	CAGC	2	8	46585	46592	25 %	0 %	25 %	50 %	379703969
101	NC_016835	GCCA	2	8	46883	46890	25 %	0 %	25 %	50 %	379703969
102	NC_016835	GCAC	2	8	47240	47247	25 %	0 %	25 %	50 %	379703969
103	NC_016835	AAGC	2	8	48126	48133	50 %	0 %	25 %	25 %	379703970
104	NC_016835	GCAG	2	8	48270	48277	25 %	0 %	50 %	25 %	379703970
105	NC_016835	CCTG	2	8	48618	48625	0 %	25 %	25 %	50 %	379703971
106	NC_016835	CCGA	2	8	49048	49055	25 %	0 %	25 %	50 %	379703971
107	NC_016835	GATT	2	8	49378	49385	25 %	50 %	25 %	0 %	379703972
108	NC_016835	ACCC	2	8	49736	49743	25 %	0 %	0 %	75 %	379703972
109	NC_016835	AGAA	2	8	50068	50075	75 %	0 %	25 %	0 %	379703972
110	NC_016835	GCCA	2	8	50556	50563	25 %	0 %	25 %	50 %	379703973
111	NC_016835	TGGC	2	8	50955	50962	0 %	25 %	50 %	25 %	379703973
112	NC_016835	GCTT	2	8	51003	51010	0 %	50 %	25 %	25 %	379703973
113	NC_016835	GCGG	2	8	51193	51200	0 %	0 %	75 %	25 %	379703973
114	NC_016835	ACTC	2	8	51363	51370	25 %	25 %	0 %	50 %	379703973
115	NC_016835	TATT	2	8	51557	51564	25 %	75 %	0 %	0 %	379703973
116	NC_016835	GGTC	2	8	51618	51625	0 %	25 %	50 %	25 %	379703973
117	NC_016835	GGTC	2	8	52569	52576	0 %	25 %	50 %	25 %	379703974
118	NC_016835	ATGG	2	8	52875	52882	25 %	25 %	50 %	0 %	379703974
119	NC_016835	CCCG	2	8	52989	52996	0 %	0 %	25 %	75 %	379703974
120	NC_016835	CCCG	2	8	53267	53274	0 %	0 %	25 %	75 %	379703974
121	NC_016835	GTGG	2	8	53361	53368	0 %	25 %	75 %	0 %	379703974
122	NC_016835	TGAT	2	8	53631	53638	25 %	50 %	25 %	0 %	379703974
123	NC_016835	GATG	2	8	53692	53699	25 %	25 %	50 %	0 %	379703975
124	NC_016835	CTGG	2	8	53803	53810	0 %	25 %	50 %	25 %	379703975
125	NC_016835	TCAG	2	8	54009	54016	25 %	25 %	25 %	25 %	379703975
126	NC_016835	GCTG	2	8	54087	54094	0 %	25 %	50 %	25 %	379703975
127	NC_016835	GGGT	2	8	55139	55146	0 %	25 %	75 %	0 %	379703977
128	NC_016835	TGCC	2	8	55186	55193	0 %	25 %	25 %	50 %	379703977
129	NC_016835	CGTC	2	8	55335	55342	0 %	25 %	25 %	50 %	379703977
130	NC_016835	GTTT	2	8	56464	56471	0 %	75 %	25 %	0 %	379703978
131	NC_016835	CAGT	2	8	57816	57823	25 %	25 %	25 %	25 %	379703980
132	NC_016835	GCTG	2	8	58106	58113	0 %	25 %	50 %	25 %	379703980
133	NC_016835	TGCC	2	8	58500	58507	0 %	25 %	25 %	50 %	379703980
134	NC_016835	TGAT	2	8	58625	58632	25 %	50 %	25 %	0 %	379703980
135	NC_016835	GTCG	2	8	58779	58786	0 %	25 %	50 %	25 %	379703980
136	NC_016835	AGGA	2	8	58828	58835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016835	GCTG	2	8	59028	59035	0 %	25 %	50 %	25 %	379703981
138	NC_016835	TGGC	2	8	59189	59196	0 %	25 %	50 %	25 %	379703981
139	NC_016835	GCAG	2	8	59623	59630	25 %	0 %	50 %	25 %	379703981
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