MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid E

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016834	GCAC	2	8	166	173	25 %	0 %	25 %	50 %	383181986
2	NC_016834	ATTT	2	8	227	234	25 %	75 %	0 %	0 %	383181986
3	NC_016834	AATT	2	8	248	255	50 %	50 %	0 %	0 %	383181986
4	NC_016834	AAAT	2	8	423	430	75 %	25 %	0 %	0 %	383181986
5	NC_016834	GCTG	2	8	1696	1703	0 %	25 %	50 %	25 %	383181989
6	NC_016834	TGGC	2	8	1829	1836	0 %	25 %	50 %	25 %	383181989
7	NC_016834	ATTA	2	8	2087	2094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016834	GAAT	2	8	2212	2219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016834	GGAA	2	8	2527	2534	50 %	0 %	50 %	0 %	383181990
10	NC_016834	TTAA	2	8	2609	2616	50 %	50 %	0 %	0 %	383181990
11	NC_016834	ATGA	2	8	2771	2778	50 %	25 %	25 %	0 %	383181990
12	NC_016834	TATC	2	8	2874	2881	25 %	50 %	0 %	25 %	383181990
13	NC_016834	TAAA	2	8	3009	3016	75 %	25 %	0 %	0 %	383181990
14	NC_016834	GTTT	2	8	4092	4099	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016834	ACTA	2	8	4532	4539	50 %	25 %	0 %	25 %	383181993
16	NC_016834	GAAT	2	8	4688	4695	50 %	25 %	25 %	0 %	383181993
17	NC_016834	TATT	2	8	4800	4807	25 %	75 %	0 %	0 %	383181993
18	NC_016834	CTTT	2	8	5195	5202	0 %	75 %	0 %	25 %	383181993
19	NC_016834	TCCC	2	8	5296	5303	0 %	25 %	0 %	75 %	383181993
20	NC_016834	TTGC	2	8	5534	5541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016834	AGGA	2	8	5657	5664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016834	TTAT	2	8	5814	5821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016834	TCAA	2	8	5975	5982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016834	CATT	2	8	6357	6364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016834	CAAC	2	8	6790	6797	50 %	0 %	0 %	50 %	383181995
26	NC_016834	TCCT	2	8	6810	6817	0 %	50 %	0 %	50 %	383181995
27	NC_016834	TGCC	2	8	6965	6972	0 %	25 %	25 %	50 %	383181995
28	NC_016834	GCTG	2	8	7099	7106	0 %	25 %	50 %	25 %	383181995
29	NC_016834	GGAT	2	8	7753	7760	25 %	25 %	50 %	0 %	383181995
30	NC_016834	ATCA	2	8	8176	8183	50 %	25 %	0 %	25 %	383181996
31	NC_016834	AAAG	2	8	8558	8565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016834	TTCT	2	8	8729	8736	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.