MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid E

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016834	TGC	2	6	1283	1288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016834	ATG	2	6	1308	1313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016834	TAT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016834	ATT	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016834	TAT	2	6	4042	4047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016834	CAT	2	6	4057	4062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016834	AAT	2	6	4070	4075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016834	TTA	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016834	GAT	2	6	4151	4156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016834	CTT	2	6	4189	4194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016834	ATA	3	9	4215	4223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016834	TAA	2	6	4224	4229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016834	TTC	2	6	5392	5397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016834	GAT	2	6	5440	5445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016834	GGC	2	6	5501	5506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016834	AGA	2	6	5543	5548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016834	TGA	2	6	5557	5562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016834	TAT	2	6	5726	5731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016834	TAT	2	6	5735	5740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016834	ACA	2	6	5763	5768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016834	TAA	2	6	5789	5794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016834	ATT	2	6	5808	5813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016834	CTG	2	6	6013	6018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016834	AAT	2	6	6119	6124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016834	TCA	3	9	6135	6143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016834	TTA	2	6	6144	6149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016834	TGT	2	6	6171	6176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016834	AAC	2	6	6213	6218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016834	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016834	TTG	2	6	8412	8417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016834	AGA	2	6	8461	8466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016834	ACC	2	6	8474	8479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016834	GCG	2	6	8529	8534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016834	GTT	2	6	8638	8643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016834	TAC	2	6	8933	8938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.