MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid E

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016834	AT	3	6	351	356	50 %	50 %	0 %	0 %	383181986
2	NC_016834	AT	3	6	442	447	50 %	50 %	0 %	0 %	383181986
3	NC_016834	AC	3	6	656	661	50 %	0 %	0 %	50 %	383181986
4	NC_016834	AT	3	6	3488	3493	50 %	50 %	0 %	0 %	383181991
5	NC_016834	AT	3	6	3585	3590	50 %	50 %	0 %	0 %	383181992
6	NC_016834	TA	3	6	4280	4285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016834	TA	4	8	5075	5082	50 %	50 %	0 %	0 %	383181993
8	NC_016834	TA	3	6	5119	5124	50 %	50 %	0 %	0 %	383181993
9	NC_016834	AG	3	6	5239	5244	50 %	0 %	50 %	0 %	383181993
10	NC_016834	AT	3	6	5675	5680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016834	CA	3	6	6489	6494	50 %	0 %	0 %	50 %	383181994
12	NC_016834	GC	3	6	7491	7496	0 %	0 %	50 %	50 %	383181995
13	NC_016834	GT	4	8	7711	7718	0 %	50 %	50 %	0 %	383181995
14	NC_016834	GA	3	6	7720	7725	50 %	0 %	50 %	0 %	383181995
15	NC_016834	TG	3	6	7840	7845	0 %	50 %	50 %	0 %	383181995
16	NC_016834	CG	3	6	7907	7912	0 %	0 %	50 %	50 %	383181995
17	NC_016834	AG	4	8	8020	8027	50 %	0 %	50 %	0 %	383181996

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.