MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid E

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016834	A	7	7	378	384	100 %	0 %	0 %	0 %	383181986
2	NC_016834	A	7	7	539	545	100 %	0 %	0 %	0 %	383181986
3	NC_016834	A	7	7	729	735	100 %	0 %	0 %	0 %	383181986
4	NC_016834	A	6	6	1006	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	383181987
5	NC_016834	A	7	7	1078	1084	100 %	0 %	0 %	0 %	383181987
6	NC_016834	A	6	6	1212	1217	100 %	0 %	0 %	0 %	383181987
7	NC_016834	A	6	6	1584	1589	100 %	0 %	0 %	0 %	383181988
8	NC_016834	A	6	6	2101	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016834	T	6	6	2340	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	383181990
10	NC_016834	T	6	6	2370	2375	0 %	100 %	0 %	0 %	383181990
11	NC_016834	T	7	7	2398	2404	0 %	100 %	0 %	0 %	383181990
12	NC_016834	T	8	8	2700	2707	0 %	100 %	0 %	0 %	383181990
13	NC_016834	T	8	8	2709	2716	0 %	100 %	0 %	0 %	383181990
14	NC_016834	A	6	6	3014	3019	100 %	0 %	0 %	0 %	383181990
15	NC_016834	A	6	6	3060	3065	100 %	0 %	0 %	0 %	383181990
16	NC_016834	A	8	8	3099	3106	100 %	0 %	0 %	0 %	383181990
17	NC_016834	T	6	6	3139	3144	0 %	100 %	0 %	0 %	383181990
18	NC_016834	T	7	7	3229	3235	0 %	100 %	0 %	0 %	383181990
19	NC_016834	T	6	6	3493	3498	0 %	100 %	0 %	0 %	383181991
20	NC_016834	T	7	7	3604	3610	0 %	100 %	0 %	0 %	383181992
21	NC_016834	T	6	6	3770	3775	0 %	100 %	0 %	0 %	383181992
22	NC_016834	A	6	6	3831	3836	100 %	0 %	0 %	0 %	383181992
23	NC_016834	T	7	7	3878	3884	0 %	100 %	0 %	0 %	383181992
24	NC_016834	A	6	6	3918	3923	100 %	0 %	0 %	0 %	383181992
25	NC_016834	A	7	7	4721	4727	100 %	0 %	0 %	0 %	383181993
26	NC_016834	A	6	6	4731	4736	100 %	0 %	0 %	0 %	383181993
27	NC_016834	A	6	6	4918	4923	100 %	0 %	0 %	0 %	383181993
28	NC_016834	A	6	6	4980	4985	100 %	0 %	0 %	0 %	383181993
29	NC_016834	T	6	6	5463	5468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016834	A	8	8	5645	5652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016834	C	6	6	5877	5882	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_016834	T	6	6	6022	6027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016834	T	7	7	6151	6157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016834	G	6	6	6158	6163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016834	T	8	8	6176	6183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016834	A	6	6	6983	6988	100 %	0 %	0 %	0 %	383181995
37	NC_016834	T	6	6	7671	7676	0 %	100 %	0 %	0 %	383181995
38	NC_016834	A	6	6	7983	7988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016834	A	7	7	8520	8526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016834	T	7	7	8714	8720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016834	T	6	6	8762	8767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016834	A	11	11	8771	8781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016834	A	6	6	8876	8881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.