MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016833	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016833	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016833	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016833	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	383181733
5	NC_016833	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	383181734
6	NC_016833	GTAG	2	8	968	975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016833	TCTA	2	8	1349	1356	25 %	50 %	0 %	25 %	383181735
8	NC_016833	ACAA	2	8	1658	1665	75 %	0 %	0 %	25 %	383181735
9	NC_016833	TCTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	383181735
10	NC_016833	AATT	2	8	2345	2352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016833	AAAT	2	8	2362	2369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016833	CGCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	383181736
13	NC_016833	TTAT	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	383181736
14	NC_016833	TTGG	2	8	2855	2862	0 %	50 %	50 %	0 %	383181736
15	NC_016833	TAAG	2	8	3655	3662	50 %	25 %	25 %	0 %	383181738
16	NC_016833	TAAA	2	8	3752	3759	75 %	25 %	0 %	0 %	383181738
17	NC_016833	AGGA	2	8	4126	4133	50 %	0 %	50 %	0 %	383181739
18	NC_016833	TGGA	2	8	4400	4407	25 %	25 %	50 %	0 %	383181740
19	NC_016833	GAAA	2	8	4654	4661	75 %	0 %	25 %	0 %	383181740
20	NC_016833	TCGC	2	8	5122	5129	0 %	25 %	25 %	50 %	383181740
21	NC_016833	ATCC	2	8	5201	5208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016833	TATT	2	8	5693	5700	25 %	75 %	0 %	0 %	383181741
23	NC_016833	TGTT	2	8	6653	6660	0 %	75 %	25 %	0 %	383181741
24	NC_016833	AAAT	2	8	6997	7004	75 %	25 %	0 %	0 %	383181741
25	NC_016833	ACAT	2	8	7044	7051	50 %	25 %	0 %	25 %	383181741
26	NC_016833	TTTA	2	8	7368	7375	25 %	75 %	0 %	0 %	383181741
27	NC_016833	CATG	2	8	8271	8278	25 %	25 %	25 %	25 %	383181742
28	NC_016833	ATTG	2	8	8571	8578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016833	CCTG	2	8	9017	9024	0 %	25 %	25 %	50 %	383181743
30	NC_016833	TCAT	2	8	9627	9634	25 %	50 %	0 %	25 %	383181745
31	NC_016833	TCTT	2	8	9966	9973	0 %	75 %	0 %	25 %	383181745
32	NC_016833	CATT	2	8	10301	10308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016833	TTTG	2	8	10766	10773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016833	ATTG	2	8	10922	10929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016833	CCAG	2	8	11420	11427	25 %	0 %	25 %	50 %	383181747
36	NC_016833	CTGT	2	8	11925	11932	0 %	50 %	25 %	25 %	383181748
37	NC_016833	TACT	2	8	12045	12052	25 %	50 %	0 %	25 %	383181748
38	NC_016833	CAGT	2	8	12113	12120	25 %	25 %	25 %	25 %	383181749
39	NC_016833	ACTG	2	8	12127	12134	25 %	25 %	25 %	25 %	383181749
40	NC_016833	CGTC	2	8	12566	12573	0 %	25 %	25 %	50 %	383181749
41	NC_016833	CTGG	2	8	12849	12856	0 %	25 %	50 %	25 %	383181750
42	NC_016833	TCCG	2	8	13557	13564	0 %	25 %	25 %	50 %	383181751
43	NC_016833	ATCC	2	8	14102	14109	25 %	25 %	0 %	50 %	383181751
44	NC_016833	TGCA	2	8	14241	14248	25 %	25 %	25 %	25 %	383181751
45	NC_016833	ATTC	2	8	14417	14424	25 %	50 %	0 %	25 %	383181751
46	NC_016833	TTGA	2	8	14730	14737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016833	AATA	2	8	15437	15444	75 %	25 %	0 %	0 %	383181752
48	NC_016833	TTTC	2	8	15607	15614	0 %	75 %	0 %	25 %	383181752
49	NC_016833	CAGA	2	8	16039	16046	50 %	0 %	25 %	25 %	383181752
50	NC_016833	AAAC	2	8	16188	16195	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016833	ACGA	2	8	16242	16249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016833	ATGA	2	8	17003	17010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016833	AAAT	2	8	17342	17349	75 %	25 %	0 %	0 %	383181754
54	NC_016833	AAGT	2	8	17864	17871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016833	TCAG	2	8	18337	18344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016833	GCAG	2	8	18592	18599	25 %	0 %	50 %	25 %	383181756
57	NC_016833	GCCT	2	8	18986	18993	0 %	25 %	25 %	50 %	383181757
58	NC_016833	GGCT	2	8	19084	19091	0 %	25 %	50 %	25 %	383181757
59	NC_016833	TCGC	2	8	20550	20557	0 %	25 %	25 %	50 %	383181759
60	NC_016833	CATT	2	8	20604	20611	25 %	50 %	0 %	25 %	383181759
61	NC_016833	GCTG	2	8	21117	21124	0 %	25 %	50 %	25 %	383181759
62	NC_016833	AGCC	2	8	21312	21319	25 %	0 %	25 %	50 %	383181759
63	NC_016833	AAAC	2	8	21636	21643	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016833	CAGC	2	8	21700	21707	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016833	ACGC	2	8	21879	21886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016833	GGCA	2	8	23577	23584	25 %	0 %	50 %	25 %	383181761
67	NC_016833	TGTC	2	8	24078	24085	0 %	50 %	25 %	25 %	383181761
68	NC_016833	CAGA	2	8	24327	24334	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016833	CCGT	2	8	24830	24837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016833	ATTC	2	8	24973	24980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016833	TGCA	2	8	25040	25047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016833	TAAG	2	8	25128	25135	50 %	25 %	25 %	0 %	383181763
73	NC_016833	GGAT	2	8	26008	26015	25 %	25 %	50 %	0 %	383181763
74	NC_016833	ACCG	2	8	26324	26331	25 %	0 %	25 %	50 %	383181764
75	NC_016833	ACAG	2	8	26505	26512	50 %	0 %	25 %	25 %	383181764
76	NC_016833	ACGT	2	8	27186	27193	25 %	25 %	25 %	25 %	383181764
77	NC_016833	CTGG	2	8	27663	27670	0 %	25 %	50 %	25 %	383181765
78	NC_016833	GGTT	2	8	27923	27930	0 %	50 %	50 %	0 %	383181765
79	NC_016833	GCCA	2	8	28108	28115	25 %	0 %	25 %	50 %	383181766
80	NC_016833	TCCT	2	8	28370	28377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016833	GCAT	2	8	28641	28648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016833	TCCA	2	8	28909	28916	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016833	TCCA	2	8	29035	29042	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016833	AATG	2	8	29586	29593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016833	CAGT	2	8	29749	29756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016833	ACGG	2	8	30165	30172	25 %	0 %	50 %	25 %	383181767
87	NC_016833	GCCA	2	8	30201	30208	25 %	0 %	25 %	50 %	383181767
88	NC_016833	CGTC	2	8	30379	30386	0 %	25 %	25 %	50 %	383181767
89	NC_016833	GCTG	2	8	30690	30697	0 %	25 %	50 %	25 %	383181767
90	NC_016833	TCAA	2	8	30830	30837	50 %	25 %	0 %	25 %	383181767
91	NC_016833	CTGG	2	8	31148	31155	0 %	25 %	50 %	25 %	383181767
92	NC_016833	GTCA	2	8	31195	31202	25 %	25 %	25 %	25 %	383181767
93	NC_016833	GGCA	2	8	31386	31393	25 %	0 %	50 %	25 %	383181768
94	NC_016833	CTGG	2	8	31506	31513	0 %	25 %	50 %	25 %	383181768
95	NC_016833	CAAA	2	8	31834	31841	75 %	0 %	0 %	25 %	383181768
96	NC_016833	CCAC	2	8	32120	32127	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_016833	CCAC	2	8	32477	32484	25 %	0 %	0 %	75 %	383181770
98	NC_016833	ATAC	2	8	32657	32664	50 %	25 %	0 %	25 %	383181770
99	NC_016833	GTAA	2	8	32844	32851	50 %	25 %	25 %	0 %	383181770
100	NC_016833	CCAC	2	8	32858	32865	25 %	0 %	0 %	75 %	383181770
101	NC_016833	TCTT	2	8	33100	33107	0 %	75 %	0 %	25 %	383181770
102	NC_016833	CCCG	2	8	34269	34276	0 %	0 %	25 %	75 %	383181774
103	NC_016833	TCCT	2	8	34313	34320	0 %	50 %	0 %	50 %	383181774
104	NC_016833	GCGG	2	8	34325	34332	0 %	0 %	75 %	25 %	383181774
105	NC_016833	TGCC	2	8	34468	34475	0 %	25 %	25 %	50 %	383181774
106	NC_016833	CGGC	2	8	34974	34981	0 %	0 %	50 %	50 %	383181774
107	NC_016833	GGAT	2	8	35256	35263	25 %	25 %	50 %	0 %	383181774
108	NC_016833	TCTT	2	8	36102	36109	0 %	75 %	0 %	25 %	383181775
109	NC_016833	AGAT	2	8	36588	36595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016833	TTTA	2	8	36620	36627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016833	GGCA	2	8	37583	37590	25 %	0 %	50 %	25 %	383181776
112	NC_016833	TGTC	2	8	38084	38091	0 %	50 %	25 %	25 %	383181776
113	NC_016833	CAGT	2	8	38634	38641	25 %	25 %	25 %	25 %	383181777
114	NC_016833	GAAG	2	8	38686	38693	50 %	0 %	50 %	0 %	383181777
115	NC_016833	ATAC	2	8	39418	39425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016833	GCGT	2	8	40483	40490	0 %	25 %	50 %	25 %	383181780
117	NC_016833	GCTG	2	8	40662	40669	0 %	25 %	50 %	25 %	383181780
118	NC_016833	GTTT	2	8	40726	40733	0 %	75 %	25 %	0 %	383181780
119	NC_016833	TCCT	2	8	41178	41185	0 %	50 %	0 %	50 %	383181782
120	NC_016833	GCGG	2	8	41190	41197	0 %	0 %	75 %	25 %	383181782
121	NC_016833	TGCC	2	8	41333	41340	0 %	25 %	25 %	50 %	383181782
122	NC_016833	CGGC	2	8	41839	41846	0 %	0 %	50 %	50 %	383181782
123	NC_016833	GGAT	2	8	42121	42128	25 %	25 %	50 %	0 %	383181782
124	NC_016833	CGCC	2	8	42490	42497	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_016833	ATTA	2	8	43184	43191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016833	TACA	2	8	43286	43293	50 %	25 %	0 %	25 %	383181784
127	NC_016833	TTTC	2	8	44323	44330	0 %	75 %	0 %	25 %	383181784
128	NC_016833	AATA	2	8	44617	44624	75 %	25 %	0 %	0 %	383181784
129	NC_016833	ATCA	2	8	44883	44890	50 %	25 %	0 %	25 %	383181785
130	NC_016833	ATAA	2	8	45011	45018	75 %	25 %	0 %	0 %	383181786
131	NC_016833	TGTC	2	8	45145	45152	0 %	50 %	25 %	25 %	383181786
132	NC_016833	AGTG	2	8	45253	45260	25 %	25 %	50 %	0 %	383181786
133	NC_016833	GACA	2	8	45617	45624	50 %	0 %	25 %	25 %	383181786
134	NC_016833	TTAT	2	8	45684	45691	25 %	75 %	0 %	0 %	383181786
135	NC_016833	GGAA	2	8	45925	45932	50 %	0 %	50 %	0 %	383181786
136	NC_016833	AATA	2	8	46024	46031	75 %	25 %	0 %	0 %	383181786
137	NC_016833	ACAG	2	8	46086	46093	50 %	0 %	25 %	25 %	383181786
138	NC_016833	TTGT	2	8	46370	46377	0 %	75 %	25 %	0 %	383181786
139	NC_016833	ATTA	2	8	46501	46508	50 %	50 %	0 %	0 %	383181786
140	NC_016833	CTGT	2	8	46874	46881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016833	CCAC	2	8	47091	47098	25 %	0 %	0 %	75 %	383181787
142	NC_016833	TCTG	2	8	48220	48227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016833	AGGA	2	8	48657	48664	50 %	0 %	50 %	0 %	383181790
144	NC_016833	ATGT	2	8	49038	49045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016833	TTAA	2	8	49051	49058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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