MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016833	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016833	TAT	2	6	962	967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016833	AAT	2	6	1012	1017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016833	AAG	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016833	ATG	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016833	TAG	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016833	ATC	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016833	ATA	2	6	2144	2149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016833	CAT	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016833	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016833	TTA	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016833	ATC	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016833	AGG	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016833	CAC	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016833	GAA	2	6	5472	5477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016833	ATC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016833	GGT	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016833	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016833	AGA	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016833	CCT	2	6	7441	7446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016833	AGG	2	6	7451	7456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016833	GAT	2	6	7506	7511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016833	GTG	2	6	7655	7660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016833	CAG	2	6	7691	7696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016833	GGT	2	6	7792	7797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016833	TCT	2	6	7808	7813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016833	ATC	2	6	8582	8587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016833	TCT	2	6	8633	8638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016833	TGG	2	6	8646	8651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016833	CTG	2	6	9511	9516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016833	TTG	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016833	GCA	2	6	10266	10271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016833	ACT	2	6	10333	10338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016833	CTG	2	6	10342	10347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016833	CCT	2	6	10503	10508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016833	CCA	2	6	10596	10601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016833	TCA	3	9	10604	10612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016833	AGC	2	6	10698	10703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016833	ATG	2	6	10782	10787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016833	GAA	2	6	10853	10858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016833	ATC	2	6	10883	10888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016833	CAC	2	6	11007	11012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016833	CAT	2	6	11036	11041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016833	TCA	2	6	11613	11618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016833	AGA	2	6	11632	11637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016833	CTT	2	6	11734	11739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016833	TCC	2	6	11773	11778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016833	AAT	2	6	11790	11795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016833	CAT	2	6	11799	11804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016833	GAT	2	6	12695	12700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016833	TTA	2	6	12776	12781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016833	AGC	2	6	12809	12814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016833	TTA	2	6	14844	14849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016833	CTG	2	6	14912	14917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016833	ATC	2	6	14958	14963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016833	GCA	2	6	15119	15124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016833	GCT	2	6	15171	15176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016833	TTA	2	6	15177	15182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016833	ATT	2	6	15253	15258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016833	TAC	2	6	16215	16220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016833	CAT	2	6	16377	16382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016833	GAC	2	6	16479	16484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016833	CAT	2	6	16996	17001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016833	TTG	2	6	17886	17891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016833	GCT	2	6	18203	18208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016833	GTA	2	6	18268	18273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016833	TGT	2	6	19596	19601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016833	TCC	2	6	19621	19626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016833	TCT	2	6	19679	19684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016833	ATA	2	6	19725	19730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016833	GCA	2	6	20203	20208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016833	CAA	2	6	20214	20219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016833	GTC	2	6	21345	21350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016833	TGG	2	6	21380	21385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016833	ACG	2	6	21629	21634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016833	ACA	2	6	21669	21674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016833	CTG	2	6	21685	21690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016833	GTT	2	6	21691	21696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016833	CAT	2	6	21840	21845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016833	GAT	3	9	21937	21945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016833	CGG	2	6	22046	22051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016833	TCT	2	6	22059	22064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016833	GAA	2	6	22117	22122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016833	GCA	2	6	22172	22177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016833	CGT	3	9	22207	22215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016833	GTA	2	6	22238	22243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016833	TCA	2	6	22266	22271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016833	CTC	2	6	22388	22393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016833	GCT	2	6	22436	22441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016833	TAA	2	6	22513	22518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016833	GTT	2	6	22534	22539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016833	CGC	2	6	22552	22557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016833	TAC	2	6	22583	22588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016833	GAC	2	6	22644	22649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016833	ATG	2	6	22670	22675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016833	CAT	2	6	22745	22750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016833	CGG	2	6	24185	24190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016833	ATT	2	6	24290	24295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016833	TGG	2	6	24400	24405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016833	CGT	2	6	24431	24436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016833	ACA	2	6	24441	24446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016833	GAA	2	6	24879	24884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016833	TGT	2	6	24888	24893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016833	GTG	3	9	24901	24909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016833	ATT	2	6	24916	24921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016833	GAT	2	6	24982	24987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016833	TAA	2	6	24988	24993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016833	TAA	2	6	25074	25079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016833	TTA	2	6	27354	27359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016833	TCT	2	6	27409	27414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016833	ATG	2	6	27504	27509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016833	CCG	2	6	28202	28207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016833	GCT	2	6	28270	28275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016833	GTA	2	6	28335	28340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016833	GTA	2	6	28504	28509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016833	CTT	2	6	28591	28596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016833	TGC	2	6	28621	28626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016833	TTC	2	6	28673	28678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016833	TTC	2	6	28820	28825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016833	TTG	2	6	28830	28835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016833	TAC	2	6	28858	28863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016833	TTA	2	6	28997	29002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016833	GTG	2	6	29079	29084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016833	TTC	2	6	29259	29264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016833	TGG	2	6	29367	29372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016833	TTG	2	6	29479	29484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016833	ATG	2	6	29501	29506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016833	TCT	2	6	29578	29583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016833	TCA	2	6	29633	29638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016833	CTA	2	6	29639	29644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016833	CTG	2	6	29723	29728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016833	TCT	2	6	29766	29771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016833	GGC	2	6	29785	29790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016833	CAT	2	6	29809	29814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016833	CAC	2	6	29906	29911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016833	AGC	2	6	29929	29934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016833	TGT	2	6	30032	30037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016833	CAG	2	6	32313	32318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016833	TTA	2	6	34031	34036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016833	GTG	2	6	35542	35547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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