MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 3297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016832	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378958131
2	NC_016832	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378958132
3	NC_016832	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378958133
4	NC_016832	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	378958135
5	NC_016832	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016832	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	378958141
7	NC_016832	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	378958143
8	NC_016832	AATCA	2	10	15512	15521	60 %	20 %	0 %	20 %	378958145
9	NC_016832	TATTG	2	10	17582	17591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016832	GGCTG	2	10	18857	18866	0 %	20 %	60 %	20 %	378958150
11	NC_016832	CCTGA	2	10	19919	19928	20 %	20 %	20 %	40 %	378958150
12	NC_016832	GGCCG	2	10	21680	21689	0 %	0 %	60 %	40 %	378958152
13	NC_016832	CTTTT	2	10	23399	23408	0 %	80 %	0 %	20 %	378958153
14	NC_016832	CGGTA	2	10	24565	24574	20 %	20 %	40 %	20 %	378958154
15	NC_016832	CTGTT	2	10	24604	24613	0 %	60 %	20 %	20 %	378958154
16	NC_016832	GCGTC	2	10	28361	28370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016832	ATCTG	2	10	30969	30978	20 %	40 %	20 %	20 %	378958160
18	NC_016832	TTACG	2	10	31024	31033	20 %	40 %	20 %	20 %	378958160
19	NC_016832	GGGCG	2	10	31793	31802	0 %	0 %	80 %	20 %	378958161
20	NC_016832	TGCGT	2	10	32172	32181	0 %	40 %	40 %	20 %	378958162
21	NC_016832	AAAAG	2	10	32566	32575	80 %	0 %	20 %	0 %	378958163
22	NC_016832	TTTTA	2	10	33215	33224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016832	TATAA	2	10	34169	34178	60 %	40 %	0 %	0 %	378958164
24	NC_016832	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	378958167
25	NC_016832	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	378958167
26	NC_016832	ATTTT	2	10	35222	35231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016832	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	378958168
28	NC_016832	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	378958168
29	NC_016832	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	378958169
30	NC_016832	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	378958170
31	NC_016832	TGAAA	2	10	40124	40133	60 %	20 %	20 %	0 %	378958171
32	NC_016832	TAAAA	2	10	44187	44196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016832	ACGGC	2	10	44483	44492	20 %	0 %	40 %	40 %	378958174
34	NC_016832	GGGCT	2	10	46557	46566	0 %	20 %	60 %	20 %	378958175
35	NC_016832	GAAGG	2	10	47360	47369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016832	GCGTA	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	378958177
37	NC_016832	GACCA	2	10	49038	49047	40 %	0 %	20 %	40 %	378958177
38	NC_016832	CAGAC	2	10	50370	50379	40 %	0 %	20 %	40 %	378958177
39	NC_016832	GTTTG	2	10	54526	54535	0 %	60 %	40 %	0 %	378958183
40	NC_016832	GTTTG	2	10	55454	55463	0 %	60 %	40 %	0 %	378958183
41	NC_016832	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	378958183
42	NC_016832	AGCGC	2	10	57231	57240	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016832	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	378958185
44	NC_016832	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	378958187
45	NC_016832	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	378958188
46	NC_016832	CGCTG	2	10	60226	60235	0 %	20 %	40 %	40 %	378958189
47	NC_016832	CGGCG	2	10	63992	64001	0 %	0 %	60 %	40 %	378958192
48	NC_016832	GCGCG	2	10	64939	64948	0 %	0 %	60 %	40 %	378958193
49	NC_016832	ACGGC	2	10	69540	69549	20 %	0 %	40 %	40 %	378958196
50	NC_016832	CGTGC	2	10	71361	71370	0 %	20 %	40 %	40 %	378958199
51	NC_016832	TTGAT	2	10	71531	71540	20 %	60 %	20 %	0 %	378958199
52	NC_016832	ACCGC	2	10	72091	72100	20 %	0 %	20 %	60 %	378958199
53	NC_016832	ATTTG	2	10	75255	75264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016832	CGATG	2	10	77570	77579	20 %	20 %	40 %	20 %	378958205
55	NC_016832	GCGAA	2	10	78511	78520	40 %	0 %	40 %	20 %	378958205
56	NC_016832	TTGCC	2	10	81038	81047	0 %	40 %	20 %	40 %	378958207
57	NC_016832	AAGCG	2	10	81514	81523	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016832	TGGCG	2	10	83086	83095	0 %	20 %	60 %	20 %	378958209
59	NC_016832	TCAGC	2	10	84269	84278	20 %	20 %	20 %	40 %	378958210
60	NC_016832	GTACG	2	10	86988	86997	20 %	20 %	40 %	20 %	378958212
61	NC_016832	CAGAA	2	10	87701	87710	60 %	0 %	20 %	20 %	378958212
62	NC_016832	CCGCA	2	10	89820	89829	20 %	0 %	20 %	60 %	378958215
63	NC_016832	CGGTT	2	10	90325	90334	0 %	40 %	40 %	20 %	378958216
64	NC_016832	TGGCG	2	10	92106	92115	0 %	20 %	60 %	20 %	378958219
65	NC_016832	TAAAA	2	10	95578	95587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016832	TTTCC	2	10	96017	96026	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016832	GTGGC	2	10	96586	96595	0 %	20 %	60 %	20 %	378958224
68	NC_016832	GCGCT	2	10	97737	97746	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016832	AGCGC	2	10	97804	97813	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016832	TGCAC	2	10	98502	98511	20 %	20 %	20 %	40 %	378958226
71	NC_016832	TGGCA	2	10	98571	98580	20 %	20 %	40 %	20 %	378958226
72	NC_016832	TCTGT	2	10	98897	98906	0 %	60 %	20 %	20 %	378958227
73	NC_016832	GCGCT	2	10	99207	99216	0 %	20 %	40 %	40 %	378958227
74	NC_016832	GGCGC	2	10	99621	99630	0 %	0 %	60 %	40 %	378958227
75	NC_016832	GCGAC	2	10	99934	99943	20 %	0 %	40 %	40 %	378958227
76	NC_016832	TCTGT	2	10	100226	100235	0 %	60 %	20 %	20 %	378958227
77	NC_016832	AACGT	2	10	102381	102390	40 %	20 %	20 %	20 %	378958231
78	NC_016832	CCCAA	2	10	104531	104540	40 %	0 %	0 %	60 %	378958234
79	NC_016832	TTGTT	2	10	105238	105247	0 %	80 %	20 %	0 %	378958234
80	NC_016832	GCTTC	2	10	106612	106621	0 %	40 %	20 %	40 %	378958235
81	NC_016832	TGCGT	2	10	106899	106908	0 %	40 %	40 %	20 %	378958235
82	NC_016832	TGATC	2	10	108599	108608	20 %	40 %	20 %	20 %	378958237
83	NC_016832	AAGCG	2	10	109095	109104	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016832	TGGCG	2	10	111759	111768	0 %	20 %	60 %	20 %	378958239
85	NC_016832	AGCGC	2	10	112319	112328	20 %	0 %	40 %	40 %	378958239
86	NC_016832	CCGCG	2	10	113404	113413	0 %	0 %	40 %	60 %	378958240
87	NC_016832	GGGGT	2	10	114800	114809	0 %	20 %	80 %	0 %	378958240
88	NC_016832	ACGGT	2	10	116629	116638	20 %	20 %	40 %	20 %	378958242
89	NC_016832	TGGCG	2	10	116997	117006	0 %	20 %	60 %	20 %	378958242
90	NC_016832	TAATT	2	10	118139	118148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016832	ATTTT	2	10	118165	118174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016832	ACAGA	2	10	118348	118357	60 %	0 %	20 %	20 %	378958244
93	NC_016832	CAGCG	2	10	119523	119532	20 %	0 %	40 %	40 %	378958246
94	NC_016832	GCCGG	2	10	119823	119832	0 %	0 %	60 %	40 %	378958246
95	NC_016832	CGAGC	2	10	119948	119957	20 %	0 %	40 %	40 %	378958246
96	NC_016832	ATTTG	2	10	120391	120400	20 %	60 %	20 %	0 %	378958246
97	NC_016832	TTGCC	2	10	124895	124904	0 %	40 %	20 %	40 %	378958250
98	NC_016832	AGTTT	2	10	127802	127811	20 %	60 %	20 %	0 %	378958252
99	NC_016832	TAGTG	2	10	128220	128229	20 %	40 %	40 %	0 %	378958253
100	NC_016832	TCGAT	2	10	129650	129659	20 %	40 %	20 %	20 %	378958254
101	NC_016832	CGTTT	2	10	132422	132431	0 %	60 %	20 %	20 %	378958258
102	NC_016832	GGTTT	2	10	135578	135587	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016832	ATTCC	2	10	137523	137532	20 %	40 %	0 %	40 %	378958262
104	NC_016832	CCCAA	2	10	139592	139601	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_016832	AAAGC	2	10	139820	139829	60 %	0 %	20 %	20 %	378958265
106	NC_016832	CCGCA	2	10	140353	140362	20 %	0 %	20 %	60 %	378958265
107	NC_016832	TTGTT	2	10	140939	140948	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016832	AGTTC	2	10	142724	142733	20 %	40 %	20 %	20 %	378958267
109	NC_016832	TGCCT	2	10	142824	142833	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016832	AAGCG	2	10	147477	147486	40 %	0 %	40 %	20 %	378958271
111	NC_016832	GTTTG	2	10	149380	149389	0 %	60 %	40 %	0 %	378958273
112	NC_016832	CGTAT	2	10	150851	150860	20 %	40 %	20 %	20 %	378958274
113	NC_016832	ATGGC	2	10	152104	152113	20 %	20 %	40 %	20 %	378958275
114	NC_016832	ATCAG	2	10	152687	152696	40 %	20 %	20 %	20 %	378958276
115	NC_016832	CTGCC	2	10	154696	154705	0 %	20 %	20 %	60 %	378958277
116	NC_016832	CGGCG	2	10	157426	157435	0 %	0 %	60 %	40 %	378958280
117	NC_016832	CGCGG	2	10	160079	160088	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_016832	CCGGC	2	10	160783	160792	0 %	0 %	40 %	60 %	378958283
119	NC_016832	CGCTG	2	10	161675	161684	0 %	20 %	40 %	40 %	378958283
120	NC_016832	GAACC	2	10	164642	164651	40 %	0 %	20 %	40 %	378958286
121	NC_016832	GATCA	2	10	165830	165839	40 %	20 %	20 %	20 %	378958288
122	NC_016832	ATCCC	2	10	168276	168285	20 %	20 %	0 %	60 %	378958292
123	NC_016832	AGCGC	2	10	168984	168993	20 %	0 %	40 %	40 %	378958292
124	NC_016832	TGAGC	2	10	170833	170842	20 %	20 %	40 %	20 %	378958293
125	NC_016832	CGCAT	2	10	171095	171104	20 %	20 %	20 %	40 %	378958294
126	NC_016832	CGAAC	2	10	171824	171833	40 %	0 %	20 %	40 %	378958295
127	NC_016832	GTTCA	2	10	172090	172099	20 %	40 %	20 %	20 %	378958295
128	NC_016832	ATGAC	2	10	173056	173065	40 %	20 %	20 %	20 %	378958296
129	NC_016832	ACTGG	2	10	173645	173654	20 %	20 %	40 %	20 %	378958297
130	NC_016832	CAGAA	2	10	175765	175774	60 %	0 %	20 %	20 %	378958299
131	NC_016832	CGAAG	2	10	178636	178645	40 %	0 %	40 %	20 %	378958302
132	NC_016832	GACTG	2	10	180437	180446	20 %	20 %	40 %	20 %	378958303
133	NC_016832	GGCAT	2	10	185917	185926	20 %	20 %	40 %	20 %	378958307
134	NC_016832	GGCCA	2	10	186339	186348	20 %	0 %	40 %	40 %	378958308
135	NC_016832	CGTTT	2	10	186854	186863	0 %	60 %	20 %	20 %	378958308
136	NC_016832	GGGGA	2	10	186906	186915	20 %	0 %	80 %	0 %	378958308
137	NC_016832	TCTGG	2	10	190539	190548	0 %	40 %	40 %	20 %	378958310
138	NC_016832	CGGCG	2	10	192522	192531	0 %	0 %	60 %	40 %	378958313
139	NC_016832	CCGCT	2	10	193229	193238	0 %	20 %	20 %	60 %	378958313
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152	NC_016832	CGCGT	2	10	209326	209335	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_016832	GTTGA	2	10	228632	228641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_016832	GCCGG	2	10	273076	273085	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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197	NC_016832	TCCCT	2	10	275992	276001	0 %	40 %	0 %	60 %	378958382
198	NC_016832	GCGCT	2	10	277557	277566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
199	NC_016832	GACCA	2	10	283215	283224	40 %	0 %	20 %	40 %	378958391
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248	NC_016832	GCAGA	2	10	341648	341657	40 %	0 %	40 %	20 %	378958443
249	NC_016832	TGTGT	2	10	347083	347092	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
250	NC_016832	GCATT	2	10	347265	347274	20 %	40 %	20 %	20 %	378958448
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252	NC_016832	TGCTG	2	10	350917	350926	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
253	NC_016832	GCCAG	2	10	351746	351755	20 %	0 %	40 %	40 %	378958451
254	NC_016832	CGCCA	2	10	351915	351924	20 %	0 %	20 %	60 %	378958451
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258	NC_016832	AAGCG	2	10	357227	357236	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
259	NC_016832	CGGGC	2	10	357579	357588	0 %	0 %	60 %	40 %	378958457
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262	NC_016832	GCGCC	2	10	360817	360826	0 %	0 %	40 %	60 %	378958463
263	NC_016832	TGCGC	2	10	362144	362153	0 %	20 %	40 %	40 %	378958463
264	NC_016832	TGCGC	2	10	362724	362733	0 %	20 %	40 %	40 %	378958464
265	NC_016832	CCGTA	2	10	363487	363496	20 %	20 %	20 %	40 %	378958466
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267	NC_016832	AAGCG	2	10	364542	364551	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
268	NC_016832	AGGCG	2	10	364754	364763	20 %	0 %	60 %	20 %	378958467
269	NC_016832	CGGAG	2	10	367426	367435	20 %	0 %	60 %	20 %	378958472
270	NC_016832	TCCTG	2	10	367631	367640	0 %	40 %	20 %	40 %	378958472
271	NC_016832	AAGCG	2	10	368026	368035	40 %	0 %	40 %	20 %	378958473
272	NC_016832	CGGCG	2	10	368149	368158	0 %	0 %	60 %	40 %	378958473
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280	NC_016832	GGGGC	2	10	376458	376467	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_016832	TGCGC	2	10	378853	378862	0 %	20 %	40 %	40 %	378958476
283	NC_016832	ATTTT	2	10	380033	380042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_016832	AGCGC	2	10	389182	389191	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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291	NC_016832	TTATT	2	10	389573	389582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016832	CTTTT	2	10	389700	389709	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_016832	GCGCA	2	10	391145	391154	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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303	NC_016832	CTGCA	2	10	407747	407756	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
304	NC_016832	TGACC	2	10	407907	407916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
305	NC_016832	TTGAG	2	10	409496	409505	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_016832	GGCAG	2	10	513916	513925	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
386	NC_016832	GCATG	2	10	514954	514963	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
387	NC_016832	GCATG	2	10	515072	515081	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
388	NC_016832	CTGGC	2	10	515438	515447	0 %	20 %	40 %	40 %	378958588
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390	NC_016832	TACTG	2	10	518888	518897	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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397	NC_016832	AAAAT	2	10	530607	530616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_016832	AGAAT	2	10	531303	531312	60 %	20 %	20 %	0 %	378958604
399	NC_016832	GCCGG	2	10	533638	533647	0 %	0 %	60 %	40 %	378958606
400	NC_016832	CGCGC	2	10	533875	533884	0 %	0 %	40 %	60 %	378958606
401	NC_016832	CGACT	2	10	535379	535388	20 %	20 %	20 %	40 %	378958607
402	NC_016832	ACTGG	2	10	537921	537930	20 %	20 %	40 %	20 %	378958609
403	NC_016832	ATATT	2	10	538491	538500	40 %	60 %	0 %	0 %	378958609
404	NC_016832	TATAA	2	10	539450	539459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_016832	CATGA	2	10	539877	539886	40 %	20 %	20 %	20 %	378958611
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409	NC_016832	GCCCG	2	10	550356	550365	0 %	0 %	40 %	60 %	378958622
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415	NC_016832	GCGTG	2	10	557893	557902	0 %	20 %	60 %	20 %	378958630
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434	NC_016832	CGCGC	2	10	584149	584158	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
435	NC_016832	CGTCG	2	10	584753	584762	0 %	20 %	40 %	40 %	378958656
436	NC_016832	ACAGG	2	10	585324	585333	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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443	NC_016832	AACGC	2	10	608983	608992	40 %	0 %	20 %	40 %	378958682
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499	NC_016832	GCTGC	2	10	691736	691745	0 %	20 %	40 %	40 %	378958753
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