MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 2670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016832	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378958131
2	NC_016832	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378958132
3	NC_016832	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378958133
4	NC_016832	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	378958135
5	NC_016832	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	378958141
6	NC_016832	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	378958143
7	NC_016832	AATCA	2	10	15512	15521	60 %	20 %	0 %	20 %	378958145
8	NC_016832	GGCTG	2	10	18857	18866	0 %	20 %	60 %	20 %	378958150
9	NC_016832	CCTGA	2	10	19919	19928	20 %	20 %	20 %	40 %	378958150
10	NC_016832	GGCCG	2	10	21680	21689	0 %	0 %	60 %	40 %	378958152
11	NC_016832	CTTTT	2	10	23399	23408	0 %	80 %	0 %	20 %	378958153
12	NC_016832	CGGTA	2	10	24565	24574	20 %	20 %	40 %	20 %	378958154
13	NC_016832	CTGTT	2	10	24604	24613	0 %	60 %	20 %	20 %	378958154
14	NC_016832	ATCTG	2	10	30969	30978	20 %	40 %	20 %	20 %	378958160
15	NC_016832	TTACG	2	10	31024	31033	20 %	40 %	20 %	20 %	378958160
16	NC_016832	GGGCG	2	10	31793	31802	0 %	0 %	80 %	20 %	378958161
17	NC_016832	TGCGT	2	10	32172	32181	0 %	40 %	40 %	20 %	378958162
18	NC_016832	AAAAG	2	10	32566	32575	80 %	0 %	20 %	0 %	378958163
19	NC_016832	TATAA	2	10	34169	34178	60 %	40 %	0 %	0 %	378958164
20	NC_016832	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	378958167
21	NC_016832	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	378958167
22	NC_016832	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	378958168
23	NC_016832	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	378958168
24	NC_016832	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	378958169
25	NC_016832	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	378958170
26	NC_016832	TGAAA	2	10	40124	40133	60 %	20 %	20 %	0 %	378958171
27	NC_016832	ACGGC	2	10	44483	44492	20 %	0 %	40 %	40 %	378958174
28	NC_016832	GGGCT	2	10	46557	46566	0 %	20 %	60 %	20 %	378958175
29	NC_016832	GCGTA	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	378958177
30	NC_016832	GACCA	2	10	49038	49047	40 %	0 %	20 %	40 %	378958177
31	NC_016832	CAGAC	2	10	50370	50379	40 %	0 %	20 %	40 %	378958177
32	NC_016832	GTTTG	2	10	54526	54535	0 %	60 %	40 %	0 %	378958183
33	NC_016832	GTTTG	2	10	55454	55463	0 %	60 %	40 %	0 %	378958183
34	NC_016832	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	378958183
35	NC_016832	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	378958185
36	NC_016832	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	378958187
37	NC_016832	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	378958188
38	NC_016832	CGCTG	2	10	60226	60235	0 %	20 %	40 %	40 %	378958189
39	NC_016832	CGGCG	2	10	63992	64001	0 %	0 %	60 %	40 %	378958192
40	NC_016832	GCGCG	2	10	64939	64948	0 %	0 %	60 %	40 %	378958193
41	NC_016832	ACGGC	2	10	69540	69549	20 %	0 %	40 %	40 %	378958196
42	NC_016832	CGTGC	2	10	71361	71370	0 %	20 %	40 %	40 %	378958199
43	NC_016832	TTGAT	2	10	71531	71540	20 %	60 %	20 %	0 %	378958199
44	NC_016832	ACCGC	2	10	72091	72100	20 %	0 %	20 %	60 %	378958199
45	NC_016832	CGATG	2	10	77570	77579	20 %	20 %	40 %	20 %	378958205
46	NC_016832	GCGAA	2	10	78511	78520	40 %	0 %	40 %	20 %	378958205
47	NC_016832	TTGCC	2	10	81038	81047	0 %	40 %	20 %	40 %	378958207
48	NC_016832	TGGCG	2	10	83086	83095	0 %	20 %	60 %	20 %	378958209
49	NC_016832	TCAGC	2	10	84269	84278	20 %	20 %	20 %	40 %	378958210
50	NC_016832	GTACG	2	10	86988	86997	20 %	20 %	40 %	20 %	378958212
51	NC_016832	CAGAA	2	10	87701	87710	60 %	0 %	20 %	20 %	378958212
52	NC_016832	CCGCA	2	10	89820	89829	20 %	0 %	20 %	60 %	378958215
53	NC_016832	CGGTT	2	10	90325	90334	0 %	40 %	40 %	20 %	378958216
54	NC_016832	TGGCG	2	10	92106	92115	0 %	20 %	60 %	20 %	378958219
55	NC_016832	GTGGC	2	10	96586	96595	0 %	20 %	60 %	20 %	378958224
56	NC_016832	TGCAC	2	10	98502	98511	20 %	20 %	20 %	40 %	378958226
57	NC_016832	TGGCA	2	10	98571	98580	20 %	20 %	40 %	20 %	378958226
58	NC_016832	TCTGT	2	10	98897	98906	0 %	60 %	20 %	20 %	378958227
59	NC_016832	GCGCT	2	10	99207	99216	0 %	20 %	40 %	40 %	378958227
60	NC_016832	GGCGC	2	10	99621	99630	0 %	0 %	60 %	40 %	378958227
61	NC_016832	GCGAC	2	10	99934	99943	20 %	0 %	40 %	40 %	378958227
62	NC_016832	TCTGT	2	10	100226	100235	0 %	60 %	20 %	20 %	378958227
63	NC_016832	AACGT	2	10	102381	102390	40 %	20 %	20 %	20 %	378958231
64	NC_016832	CCCAA	2	10	104531	104540	40 %	0 %	0 %	60 %	378958234
65	NC_016832	TTGTT	2	10	105238	105247	0 %	80 %	20 %	0 %	378958234
66	NC_016832	GCTTC	2	10	106612	106621	0 %	40 %	20 %	40 %	378958235
67	NC_016832	TGCGT	2	10	106899	106908	0 %	40 %	40 %	20 %	378958235
68	NC_016832	TGATC	2	10	108599	108608	20 %	40 %	20 %	20 %	378958237
69	NC_016832	TGGCG	2	10	111759	111768	0 %	20 %	60 %	20 %	378958239
70	NC_016832	AGCGC	2	10	112319	112328	20 %	0 %	40 %	40 %	378958239
71	NC_016832	CCGCG	2	10	113404	113413	0 %	0 %	40 %	60 %	378958240
72	NC_016832	GGGGT	2	10	114800	114809	0 %	20 %	80 %	0 %	378958240
73	NC_016832	ACGGT	2	10	116629	116638	20 %	20 %	40 %	20 %	378958242
74	NC_016832	TGGCG	2	10	116997	117006	0 %	20 %	60 %	20 %	378958242
75	NC_016832	ACAGA	2	10	118348	118357	60 %	0 %	20 %	20 %	378958244
76	NC_016832	CAGCG	2	10	119523	119532	20 %	0 %	40 %	40 %	378958246
77	NC_016832	GCCGG	2	10	119823	119832	0 %	0 %	60 %	40 %	378958246
78	NC_016832	CGAGC	2	10	119948	119957	20 %	0 %	40 %	40 %	378958246
79	NC_016832	ATTTG	2	10	120391	120400	20 %	60 %	20 %	0 %	378958246
80	NC_016832	TTGCC	2	10	124895	124904	0 %	40 %	20 %	40 %	378958250
81	NC_016832	AGTTT	2	10	127802	127811	20 %	60 %	20 %	0 %	378958252
82	NC_016832	TAGTG	2	10	128220	128229	20 %	40 %	40 %	0 %	378958253
83	NC_016832	TCGAT	2	10	129650	129659	20 %	40 %	20 %	20 %	378958254
84	NC_016832	CGTTT	2	10	132422	132431	0 %	60 %	20 %	20 %	378958258
85	NC_016832	ATTCC	2	10	137523	137532	20 %	40 %	0 %	40 %	378958262
86	NC_016832	AAAGC	2	10	139820	139829	60 %	0 %	20 %	20 %	378958265
87	NC_016832	CCGCA	2	10	140353	140362	20 %	0 %	20 %	60 %	378958265
88	NC_016832	AGTTC	2	10	142724	142733	20 %	40 %	20 %	20 %	378958267
89	NC_016832	AAGCG	2	10	147477	147486	40 %	0 %	40 %	20 %	378958271
90	NC_016832	GTTTG	2	10	149380	149389	0 %	60 %	40 %	0 %	378958273
91	NC_016832	CGTAT	2	10	150851	150860	20 %	40 %	20 %	20 %	378958274
92	NC_016832	ATGGC	2	10	152104	152113	20 %	20 %	40 %	20 %	378958275
93	NC_016832	ATCAG	2	10	152687	152696	40 %	20 %	20 %	20 %	378958276
94	NC_016832	CTGCC	2	10	154696	154705	0 %	20 %	20 %	60 %	378958277
95	NC_016832	CGGCG	2	10	157426	157435	0 %	0 %	60 %	40 %	378958280
96	NC_016832	CCGGC	2	10	160783	160792	0 %	0 %	40 %	60 %	378958283
97	NC_016832	CGCTG	2	10	161675	161684	0 %	20 %	40 %	40 %	378958283
98	NC_016832	GAACC	2	10	164642	164651	40 %	0 %	20 %	40 %	378958286
99	NC_016832	GATCA	2	10	165830	165839	40 %	20 %	20 %	20 %	378958288
100	NC_016832	ATCCC	2	10	168276	168285	20 %	20 %	0 %	60 %	378958292
101	NC_016832	AGCGC	2	10	168984	168993	20 %	0 %	40 %	40 %	378958292
102	NC_016832	TGAGC	2	10	170833	170842	20 %	20 %	40 %	20 %	378958293
103	NC_016832	CGCAT	2	10	171095	171104	20 %	20 %	20 %	40 %	378958294
104	NC_016832	CGAAC	2	10	171824	171833	40 %	0 %	20 %	40 %	378958295
105	NC_016832	GTTCA	2	10	172090	172099	20 %	40 %	20 %	20 %	378958295
106	NC_016832	ATGAC	2	10	173056	173065	40 %	20 %	20 %	20 %	378958296
107	NC_016832	ACTGG	2	10	173645	173654	20 %	20 %	40 %	20 %	378958297
108	NC_016832	CAGAA	2	10	175765	175774	60 %	0 %	20 %	20 %	378958299
109	NC_016832	CGAAG	2	10	178636	178645	40 %	0 %	40 %	20 %	378958302
110	NC_016832	GACTG	2	10	180437	180446	20 %	20 %	40 %	20 %	378958303
111	NC_016832	GGCAT	2	10	185917	185926	20 %	20 %	40 %	20 %	378958307
112	NC_016832	GGCCA	2	10	186339	186348	20 %	0 %	40 %	40 %	378958308
113	NC_016832	CGTTT	2	10	186854	186863	0 %	60 %	20 %	20 %	378958308
114	NC_016832	GGGGA	2	10	186906	186915	20 %	0 %	80 %	0 %	378958308
115	NC_016832	TCTGG	2	10	190539	190548	0 %	40 %	40 %	20 %	378958310
116	NC_016832	CGGCG	2	10	192522	192531	0 %	0 %	60 %	40 %	378958313
117	NC_016832	CCGCT	2	10	193229	193238	0 %	20 %	20 %	60 %	378958313
118	NC_016832	GCCCA	2	10	195781	195790	20 %	0 %	20 %	60 %	378958316
119	NC_016832	GCGCA	2	10	196186	196195	20 %	0 %	40 %	40 %	378958316
120	NC_016832	ATCGG	2	10	197577	197586	20 %	20 %	40 %	20 %	378958318
121	NC_016832	GCCGC	2	10	198787	198796	0 %	0 %	40 %	60 %	378958320
122	NC_016832	CAAAC	2	10	200813	200822	60 %	0 %	0 %	40 %	378958321
123	NC_016832	ATCCA	2	10	204137	204146	40 %	20 %	0 %	40 %	378958323
124	NC_016832	CGGCG	2	10	206370	206379	0 %	0 %	60 %	40 %	378958326
125	NC_016832	TGGGC	2	10	206941	206950	0 %	20 %	60 %	20 %	378958327
126	NC_016832	TTCGG	2	10	207250	207259	0 %	40 %	40 %	20 %	378958327
127	NC_016832	CTTGC	2	10	208259	208268	0 %	40 %	20 %	40 %	378958328
128	NC_016832	TGAGC	2	10	208671	208680	20 %	20 %	40 %	20 %	378958329
129	NC_016832	GGCGT	2	10	209874	209883	0 %	20 %	60 %	20 %	378958330
130	NC_016832	TTTTA	2	10	212450	212459	20 %	80 %	0 %	0 %	378958333
131	NC_016832	GTTGC	2	10	213343	213352	0 %	40 %	40 %	20 %	378958335
132	NC_016832	TTCAC	2	10	214773	214782	20 %	40 %	0 %	40 %	378958335
133	NC_016832	GAGTT	2	10	216108	216117	20 %	40 %	40 %	0 %	378958336
134	NC_016832	CGCGG	2	10	218296	218305	0 %	0 %	60 %	40 %	378958339
135	NC_016832	CGCGG	2	10	218480	218489	0 %	0 %	60 %	40 %	378958339
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248	NC_016832	GTGAA	2	10	416850	416859	40 %	20 %	40 %	0 %	378958494
249	NC_016832	CCATG	2	10	417971	417980	20 %	20 %	20 %	40 %	378958495
250	NC_016832	GTTTG	2	10	421994	422003	0 %	60 %	40 %	0 %	378958499
251	NC_016832	ACGTA	2	10	423857	423866	40 %	20 %	20 %	20 %	378958500
252	NC_016832	TGAGA	2	10	424881	424890	40 %	20 %	40 %	0 %	378958501
253	NC_016832	TTCAG	2	10	426034	426043	20 %	40 %	20 %	20 %	378958501
254	NC_016832	CAGCT	2	10	426166	426175	20 %	20 %	20 %	40 %	378958501
255	NC_016832	CTTCG	2	10	426962	426971	0 %	40 %	20 %	40 %	378958502
256	NC_016832	GATGT	2	10	429545	429554	20 %	40 %	40 %	0 %	378958505
257	NC_016832	ATCGA	2	10	430256	430265	40 %	20 %	20 %	20 %	378958505
258	NC_016832	CCATT	2	10	434370	434379	20 %	40 %	0 %	40 %	378958509
259	NC_016832	TGCCC	2	10	436724	436733	0 %	20 %	20 %	60 %	378958510
260	NC_016832	TTCAT	2	10	439116	439125	20 %	60 %	0 %	20 %	378958513
261	NC_016832	GCCGC	2	10	440650	440659	0 %	0 %	40 %	60 %	378958515
262	NC_016832	CGCTA	2	10	440829	440838	20 %	20 %	20 %	40 %	378958515
263	NC_016832	GTTAT	2	10	443059	443068	20 %	60 %	20 %	0 %	378958517
264	NC_016832	GGCGA	2	10	445128	445137	20 %	0 %	60 %	20 %	378958518
265	NC_016832	GGCGC	2	10	446226	446235	0 %	0 %	60 %	40 %	378958520
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271	NC_016832	TTTTA	2	10	456160	456169	20 %	80 %	0 %	0 %	378958525
272	NC_016832	TGCAA	2	10	456251	456260	40 %	20 %	20 %	20 %	378958525
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274	NC_016832	TGACC	2	10	456869	456878	20 %	20 %	20 %	40 %	378958526
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