MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 11209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016832	ATTG	2	8	40	47	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016832	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016832	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	378958131
4	NC_016832	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	378958131
5	NC_016832	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	378958132
6	NC_016832	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	378958133
7	NC_016832	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	378958133
8	NC_016832	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	378958133
9	NC_016832	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	378958133
10	NC_016832	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	378958133
11	NC_016832	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	378958135
12	NC_016832	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	378958135
13	NC_016832	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	378958135
14	NC_016832	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	378958136
15	NC_016832	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	378958136
16	NC_016832	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016832	CCTT	2	8	8674	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016832	TGGC	2	8	8819	8826	0 %	25 %	50 %	25 %	378958137
19	NC_016832	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	378958138
20	NC_016832	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	378958139
21	NC_016832	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	378958140
22	NC_016832	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	378958140
23	NC_016832	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	378958141
24	NC_016832	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	378958142
25	NC_016832	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	378958142
26	NC_016832	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	378958142
27	NC_016832	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	378958142
28	NC_016832	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	378958142
29	NC_016832	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	378958142
30	NC_016832	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	378958143
31	NC_016832	GTAT	2	8	14770	14777	25 %	50 %	25 %	0 %	378958144
32	NC_016832	TCAG	2	8	15249	15256	25 %	25 %	25 %	25 %	378958145
33	NC_016832	TTTG	2	8	15539	15546	0 %	75 %	25 %	0 %	378958145
34	NC_016832	CGAA	2	8	15754	15761	50 %	0 %	25 %	25 %	378958145
35	NC_016832	ATTG	2	8	15766	15773	25 %	50 %	25 %	0 %	378958145
36	NC_016832	ATAA	2	8	16526	16533	75 %	25 %	0 %	0 %	378958147
37	NC_016832	CAGC	2	8	16733	16740	25 %	0 %	25 %	50 %	378958147
38	NC_016832	AATA	2	8	18002	18009	75 %	25 %	0 %	0 %	378958150
39	NC_016832	GGGC	2	8	18588	18595	0 %	0 %	75 %	25 %	378958150
40	NC_016832	CGTG	2	8	19288	19295	0 %	25 %	50 %	25 %	378958150
41	NC_016832	TCCA	2	8	20073	20080	25 %	25 %	0 %	50 %	378958151
42	NC_016832	CCAA	2	8	21289	21296	50 %	0 %	0 %	50 %	378958152
43	NC_016832	GACG	2	8	21635	21642	25 %	0 %	50 %	25 %	378958152
44	NC_016832	GCCG	2	8	21887	21894	0 %	0 %	50 %	50 %	378958152
45	NC_016832	TGGC	2	8	22288	22295	0 %	25 %	50 %	25 %	378958152
46	NC_016832	TGGC	2	8	22394	22401	0 %	25 %	50 %	25 %	378958152
47	NC_016832	CGCC	2	8	22660	22667	0 %	0 %	25 %	75 %	378958152
48	NC_016832	CTGG	2	8	23006	23013	0 %	25 %	50 %	25 %	378958152
49	NC_016832	TTAT	2	8	23271	23278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016832	TTTA	2	8	23504	23511	25 %	75 %	0 %	0 %	378958153
51	NC_016832	TTTC	2	8	23558	23565	0 %	75 %	0 %	25 %	378958153
52	NC_016832	TCTG	2	8	23961	23968	0 %	50 %	25 %	25 %	378958153
53	NC_016832	TGAA	2	8	24470	24477	50 %	25 %	25 %	0 %	378958154
54	NC_016832	CCAG	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	378958154
55	NC_016832	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	378958155
56	NC_016832	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	378958155
57	NC_016832	TCTG	2	8	25935	25942	0 %	50 %	25 %	25 %	378958156
58	NC_016832	GCCT	2	8	26116	26123	0 %	25 %	25 %	50 %	378958156
59	NC_016832	CCTT	2	8	26622	26629	0 %	50 %	0 %	50 %	378958156
60	NC_016832	TCAG	2	8	26981	26988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016832	ATCA	2	8	27394	27401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016832	AGCC	2	8	27928	27935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016832	CCGA	2	8	28135	28142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016832	GCGT	2	8	28181	28188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016832	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	378958157
66	NC_016832	GGCG	2	8	28770	28777	0 %	0 %	75 %	25 %	378958157
67	NC_016832	ATGA	2	8	29975	29982	50 %	25 %	25 %	0 %	378958158
68	NC_016832	TGCT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016832	TATC	2	8	30601	30608	25 %	50 %	0 %	25 %	378958160
70	NC_016832	GTAA	2	8	30638	30645	50 %	25 %	25 %	0 %	378958160
71	NC_016832	TTCG	2	8	30900	30907	0 %	50 %	25 %	25 %	378958160
72	NC_016832	GTCA	2	8	31410	31417	25 %	25 %	25 %	25 %	378958161
73	NC_016832	ACCG	2	8	32230	32237	25 %	0 %	25 %	50 %	378958162
74	NC_016832	AGGC	2	8	32268	32275	25 %	0 %	50 %	25 %	378958162
75	NC_016832	CCTG	2	8	32704	32711	0 %	25 %	25 %	50 %	378958163
76	NC_016832	CGCA	2	8	32894	32901	25 %	0 %	25 %	50 %	378958163
77	NC_016832	TAAA	2	8	32964	32971	75 %	25 %	0 %	0 %	378958163
78	NC_016832	CCAG	2	8	33350	33357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016832	TTAT	2	8	33533	33540	25 %	75 %	0 %	0 %	378958164
80	NC_016832	TTGG	2	8	33917	33924	0 %	50 %	50 %	0 %	378958164
81	NC_016832	CTTT	2	8	34297	34304	0 %	75 %	0 %	25 %	378958164
82	NC_016832	GAAG	2	8	34337	34344	50 %	0 %	50 %	0 %	378958164
83	NC_016832	TAAA	2	8	34389	34396	75 %	25 %	0 %	0 %	378958165
84	NC_016832	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	378958166
85	NC_016832	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	378958166
86	NC_016832	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	378958166
87	NC_016832	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016832	TGAC	2	8	35736	35743	25 %	25 %	25 %	25 %	378958168
89	NC_016832	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	378958168
90	NC_016832	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	378958169
91	NC_016832	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	378958169
92	NC_016832	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	378958169
93	NC_016832	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	378958169
94	NC_016832	TCGT	2	8	38559	38566	0 %	50 %	25 %	25 %	378958169
95	NC_016832	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016832	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016832	AATT	2	8	40045	40052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016832	GCGG	2	8	40536	40543	0 %	0 %	75 %	25 %	378958171
99	NC_016832	CTGG	2	8	40754	40761	0 %	25 %	50 %	25 %	378958171
100	NC_016832	CCGA	2	8	41271	41278	25 %	0 %	25 %	50 %	378958171
101	NC_016832	ATCG	2	8	41427	41434	25 %	25 %	25 %	25 %	378958171
102	NC_016832	TCAA	2	8	41488	41495	50 %	25 %	0 %	25 %	378958171
103	NC_016832	AACC	2	8	41754	41761	50 %	0 %	0 %	50 %	378958172
104	NC_016832	GAAA	2	8	41806	41813	75 %	0 %	25 %	0 %	378958172
105	NC_016832	GGTC	2	8	42378	42385	0 %	25 %	50 %	25 %	378958172
106	NC_016832	TTTG	2	8	42902	42909	0 %	75 %	25 %	0 %	378958172
107	NC_016832	GTAT	2	8	43196	43203	25 %	50 %	25 %	0 %	378958173
108	NC_016832	TCCG	2	8	43590	43597	0 %	25 %	25 %	50 %	378958173
109	NC_016832	ATGA	2	8	45652	45659	50 %	25 %	25 %	0 %	378958174
110	NC_016832	AACG	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	378958174
111	NC_016832	TGAC	2	8	46038	46045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016832	GAAA	2	8	46902	46909	75 %	0 %	25 %	0 %	378958175
113	NC_016832	GCTG	2	8	47108	47115	0 %	25 %	50 %	25 %	378958175
114	NC_016832	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	378958176
115	NC_016832	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	378958176
116	NC_016832	CCTG	3	12	47969	47980	0 %	25 %	25 %	50 %	378958176
117	NC_016832	TACC	2	8	48317	48324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016832	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	378958177
119	NC_016832	AAGT	2	8	49332	49339	50 %	25 %	25 %	0 %	378958177
120	NC_016832	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	378958177
121	NC_016832	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	378958177
122	NC_016832	GAAA	2	8	50506	50513	75 %	0 %	25 %	0 %	378958178
123	NC_016832	GCCA	2	8	50847	50854	25 %	0 %	25 %	50 %	378958178
124	NC_016832	TAAA	2	8	51240	51247	75 %	25 %	0 %	0 %	378958178
125	NC_016832	AGTA	2	8	51933	51940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016832	ATCA	2	8	51973	51980	50 %	25 %	0 %	25 %	378958179
127	NC_016832	GAAA	2	8	52093	52100	75 %	0 %	25 %	0 %	378958179
128	NC_016832	AGGG	2	8	52126	52133	25 %	0 %	75 %	0 %	378958179
129	NC_016832	CATA	2	8	52886	52893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016832	TCAG	2	8	52897	52904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016832	GCCC	2	8	53069	53076	0 %	0 %	25 %	75 %	378958182
132	NC_016832	TGGC	2	8	53611	53618	0 %	25 %	50 %	25 %	378958182
133	NC_016832	AGCC	2	8	57438	57445	25 %	0 %	25 %	50 %	378958185
134	NC_016832	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	378958185
135	NC_016832	ATGG	2	8	57650	57657	25 %	25 %	50 %	0 %	378958185
136	NC_016832	TGAT	2	8	58322	58329	25 %	50 %	25 %	0 %	378958186
137	NC_016832	GCTG	2	8	58419	58426	0 %	25 %	50 %	25 %	378958186
138	NC_016832	TGGA	2	8	58991	58998	25 %	25 %	50 %	0 %	378958188
139	NC_016832	GATT	2	8	59389	59396	25 %	50 %	25 %	0 %	378958188
140	NC_016832	GATC	2	8	59758	59765	25 %	25 %	25 %	25 %	378958188
141	NC_016832	CTGC	2	8	60776	60783	0 %	25 %	25 %	50 %	378958189
142	NC_016832	CTGG	2	8	60883	60890	0 %	25 %	50 %	25 %	378958189
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