MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 68605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016832	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016832	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016832	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016832	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016832	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016832	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
7	NC_016832	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958131
8	NC_016832	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
9	NC_016832	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
10	NC_016832	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
11	NC_016832	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
12	NC_016832	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
13	NC_016832	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
14	NC_016832	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958131
15	NC_016832	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
16	NC_016832	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
17	NC_016832	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
18	NC_016832	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958131
19	NC_016832	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958131
20	NC_016832	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
21	NC_016832	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
22	NC_016832	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
23	NC_016832	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958131
24	NC_016832	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958131
25	NC_016832	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
26	NC_016832	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
27	NC_016832	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958131
28	NC_016832	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958131
29	NC_016832	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958131
30	NC_016832	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958131
31	NC_016832	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958131
32	NC_016832	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958131
33	NC_016832	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
34	NC_016832	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
35	NC_016832	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958131
36	NC_016832	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
37	NC_016832	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958131
38	NC_016832	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958131
39	NC_016832	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
40	NC_016832	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958131
41	NC_016832	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
42	NC_016832	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
43	NC_016832	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
44	NC_016832	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958131
45	NC_016832	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
46	NC_016832	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
47	NC_016832	ATT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958131
48	NC_016832	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
49	NC_016832	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
50	NC_016832	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
51	NC_016832	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958132
52	NC_016832	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958132
53	NC_016832	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958132
54	NC_016832	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958132
55	NC_016832	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958132
56	NC_016832	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958132
57	NC_016832	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958132
58	NC_016832	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958132
59	NC_016832	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958132
60	NC_016832	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958132
61	NC_016832	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958132
62	NC_016832	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958132
63	NC_016832	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958132
64	NC_016832	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958132
65	NC_016832	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958133
66	NC_016832	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958133
67	NC_016832	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958133
68	NC_016832	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
69	NC_016832	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
70	NC_016832	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958133
71	NC_016832	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
72	NC_016832	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958133
73	NC_016832	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958133
74	NC_016832	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958133
75	NC_016832	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958133
76	NC_016832	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958133
77	NC_016832	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958133
78	NC_016832	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958133
79	NC_016832	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958133
80	NC_016832	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
81	NC_016832	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958133
82	NC_016832	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
83	NC_016832	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958133
84	NC_016832	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958133
85	NC_016832	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958133
86	NC_016832	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016832	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958134
88	NC_016832	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958134
89	NC_016832	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958134
90	NC_016832	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958134
91	NC_016832	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958134
92	NC_016832	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958134
93	NC_016832	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958134
94	NC_016832	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958134
95	NC_016832	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958134
96	NC_016832	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958134
97	NC_016832	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958134
98	NC_016832	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016832	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958135
100	NC_016832	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958135
101	NC_016832	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958135
102	NC_016832	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958135
103	NC_016832	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958135
104	NC_016832	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958135
105	NC_016832	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958135
106	NC_016832	GAT	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958135
107	NC_016832	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958135
108	NC_016832	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958135
109	NC_016832	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958135
110	NC_016832	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958135
111	NC_016832	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958135
112	NC_016832	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958135
113	NC_016832	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958135
114	NC_016832	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958135
115	NC_016832	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958135
116	NC_016832	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958135
117	NC_016832	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016832	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016832	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016832	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016832	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016832	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958136
123	NC_016832	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958136
124	NC_016832	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958136
125	NC_016832	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958136
126	NC_016832	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958136
127	NC_016832	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958136
128	NC_016832	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958136
129	NC_016832	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958136
130	NC_016832	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958136
131	NC_016832	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958136
132	NC_016832	GCA	2	6	8513	8518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958136
133	NC_016832	CTG	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958136
134	NC_016832	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016832	GCG	2	6	8778	8783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958137
136	NC_016832	ACC	2	6	8837	8842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958137
137	NC_016832	ATC	2	6	8885	8890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958137
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140	NC_016832	GTC	2	6	9310	9315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958137
141	NC_016832	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016832	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_016832	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016832	CAG	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958138
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153	NC_016832	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_016832	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016832	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_016832	TGA	2	6	15741	15746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958145
258	NC_016832	ATC	2	6	15810	15815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958145
259	NC_016832	GAA	2	6	15889	15894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958145
260	NC_016832	TAG	2	6	15898	15903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958145
261	NC_016832	CGA	2	6	15912	15917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958145
262	NC_016832	TCC	2	6	15950	15955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958145
263	NC_016832	ATG	2	6	16007	16012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_016832	ATT	2	6	16061	16066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_016832	TAT	2	6	16159	16164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958146
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267	NC_016832	GGC	2	6	16345	16350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958146
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270	NC_016832	AAT	2	6	16424	16429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958146
271	NC_016832	AGT	2	6	16570	16575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958147
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276	NC_016832	GTC	2	6	17098	17103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958148
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280	NC_016832	TAA	2	6	17408	17413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958148
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284	NC_016832	ATC	2	6	17763	17768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_016832	CAA	2	6	17946	17951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958150
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287	NC_016832	TTA	2	6	18043	18048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958150
288	NC_016832	TTG	2	6	18162	18167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958150
289	NC_016832	AGA	2	6	18196	18201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958150
290	NC_016832	CGT	2	6	18208	18213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958150
291	NC_016832	CGG	2	6	18439	18444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958150
292	NC_016832	CCG	2	6	18474	18479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958150
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294	NC_016832	AGA	2	6	18610	18615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958150
295	NC_016832	GCT	2	6	18631	18636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958150
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299	NC_016832	CCA	2	6	18823	18828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958150
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301	NC_016832	CGC	2	6	18978	18983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958150
302	NC_016832	TAC	2	6	19015	19020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958150
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311	NC_016832	GAT	2	6	19775	19780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958150
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315	NC_016832	CCA	2	6	20037	20042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
316	NC_016832	TCA	2	6	20131	20136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958151
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321	NC_016832	TAA	2	6	20300	20305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958151
322	NC_016832	CTT	2	6	20319	20324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958151
323	NC_016832	CCG	2	6	20389	20394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958151
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337	NC_016832	CTG	2	6	21409	21414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958152
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339	NC_016832	CAG	2	6	21539	21544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958152
340	NC_016832	ATG	2	6	21625	21630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958152
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366	NC_016832	ATA	2	6	23057	23062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958152
367	NC_016832	TTA	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
368	NC_016832	TGA	2	6	23351	23356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958153
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371	NC_016832	TTA	2	6	23389	23394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958153
372	NC_016832	CAG	2	6	23413	23418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958153
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376	NC_016832	ACG	2	6	23759	23764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958153
377	NC_016832	TGA	2	6	23795	23800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958153
378	NC_016832	GCT	2	6	23853	23858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958153
379	NC_016832	GGC	2	6	24005	24010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958153
380	NC_016832	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_016832	ATT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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