MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 9264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016832	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016832	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016832	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016832	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016832	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016832	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016832	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016832	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016832	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016832	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016832	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016832	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016832	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016832	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016832	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016832	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016832	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016832	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016832	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016832	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016832	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016832	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016832	ATG	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016832	TTC	2	6	14755	14760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016832	TGA	2	6	14924	14929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016832	TAT	2	6	14976	14981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016832	ATG	2	6	16007	16012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016832	ATT	2	6	16061	16066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016832	ATC	2	6	17763	17768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016832	CCA	2	6	20037	20042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016832	TTA	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016832	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016832	AAG	2	6	24128	24133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016832	ATT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016832	ACA	2	6	24201	24206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016832	GAT	2	6	24238	24243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016832	TAA	2	6	24265	24270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016832	TAA	2	6	24272	24277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016832	ACG	2	6	24312	24317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016832	AAG	2	6	24359	24364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016832	GAA	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016832	CAG	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016832	CAT	2	6	26751	26756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016832	GCC	2	6	26772	26777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016832	CCG	2	6	26810	26815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016832	GCG	2	6	26819	26824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016832	CCG	2	6	26885	26890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016832	GGC	2	6	26912	26917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016832	GCG	2	6	26926	26931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016832	TAG	2	6	26955	26960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016832	GCG	2	6	27077	27082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016832	ATA	2	6	27146	27151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016832	GAT	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016832	ATT	2	6	27347	27352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016832	TAT	2	6	27361	27366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016832	AGG	2	6	27370	27375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016832	TTA	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016832	TGA	2	6	27462	27467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016832	TTG	2	6	27478	27483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016832	ACA	2	6	27533	27538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016832	ATG	3	9	27620	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016832	ACT	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016832	ACA	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016832	GCG	2	6	27788	27793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016832	CAG	2	6	27868	27873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016832	GCG	2	6	27890	27895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016832	TGG	2	6	27899	27904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016832	GGT	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016832	CGA	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016832	TGA	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016832	TGA	2	6	28110	28115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016832	TTG	2	6	28271	28276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016832	ATC	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016832	TCC	2	6	28384	28389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016832	GGT	2	6	32468	32473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016832	ATA	2	6	33138	33143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016832	CAT	2	6	33205	33210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016832	TAA	2	6	33259	33264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016832	GTG	2	6	33304	33309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016832	ATG	2	6	33331	33336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016832	TAG	2	6	34995	35000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016832	TTG	2	6	35043	35048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016832	AAT	2	6	35055	35060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016832	ATT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016832	TTG	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016832	TTG	2	6	35291	35296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016832	TAA	2	6	35323	35328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016832	TCA	2	6	38754	38759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016832	TGT	2	6	39567	39572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016832	AAG	2	6	39576	39581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016832	TGT	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016832	TTA	2	6	39678	39683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016832	TGT	2	6	39717	39722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016832	AAT	2	6	39768	39773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016832	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016832	GAA	2	6	40010	40015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016832	AAT	2	6	41625	41630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016832	GTA	2	6	42913	42918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016832	GGC	2	6	43099	43104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016832	TGA	2	6	44201	44206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016832	GTT	2	6	44210	44215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016832	ATC	2	6	46030	46035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016832	TCA	2	6	46100	46105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016832	TAG	2	6	46146	46151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016832	GAA	2	6	46156	46161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016832	CCT	2	6	50415	50420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016832	ATT	2	6	51890	51895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016832	AGT	2	6	51955	51960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016832	CTT	2	6	52604	52609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016832	GCA	2	6	52648	52653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016832	GTG	2	6	57253	57258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016832	GAT	2	6	58769	58774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016832	GTC	2	6	58841	58846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016832	ACG	2	6	66914	66919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016832	GAC	2	6	66928	66933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016832	CCG	2	6	67033	67038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_016832	TAA	2	6	68433	68438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016832	ATT	2	6	68499	68504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016832	TTA	2	6	68506	68511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016832	TCT	2	6	73839	73844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016832	GGC	2	6	73947	73952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016832	TCT	2	6	74976	74981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016832	ATG	2	6	75248	75253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016832	TGT	2	6	75304	75309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016832	GTT	2	6	75376	75381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016832	GTT	2	6	75386	75391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016832	CAA	2	6	76853	76858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016832	GCG	2	6	80097	80102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016832	TAA	2	6	80223	80228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016832	TTA	2	6	80307	80312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016832	CTG	2	6	80770	80775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016832	GGC	2	6	81460	81465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016832	TGT	2	6	81499	81504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016832	CGG	2	6	82354	82359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016832	TAA	2	6	86494	86499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016832	TAT	2	6	88084	88089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016832	TTG	2	6	88097	88102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016832	ATT	2	6	88198	88203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016832	CCG	2	6	88458	88463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_016832	AAC	2	6	93399	93404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_016832	TAA	2	6	211460	211465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_016832	ATC	2	6	212682	212687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_016832	CCG	2	6	292871	292876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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