MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016831	CCTTC	2	10	8674	8683	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016831	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016831	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016831	TATTG	2	10	17578	17587	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016831	TACCG	2	10	21052	21061	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016831	GGCCG	2	10	21676	21685	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016831	TTTTA	2	10	35224	35233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016831	TAAAA	2	10	44189	44198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016831	ACGGC	2	10	44485	44494	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016831	TTTTA	2	10	44811	44820	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016831	AGCGC	2	10	57230	57239	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016831	AAGCG	2	10	81432	81441	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016831	TAAAA	2	10	95496	95505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016831	TTTCC	2	10	95935	95944	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016831	GTGGC	2	10	96504	96513	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016831	GCGCT	2	10	97656	97665	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016831	AGCGC	2	10	97723	97732	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016831	AAGCG	2	10	109042	109051	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016831	ACGTT	2	10	113083	113092	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016831	CCGCG	2	10	113352	113361	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_016831	GGGGT	2	10	114748	114757	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016831	TAATT	2	10	116269	116278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016831	ATTTT	2	10	116295	116304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016831	AAATG	2	10	117588	117597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016831	GGTTT	2	10	134027	134036	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016831	ATTCC	2	10	135983	135992	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016831	CCCAA	2	10	138051	138060	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_016831	TTGTT	2	10	139398	139407	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016831	TGCCT	2	10	141283	141292	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016831	CTGCC	2	10	153155	153164	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016831	CGCGG	2	10	158536	158545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016831	TTTTA	2	10	191458	191467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016831	TATTG	2	10	198390	198399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016831	CGTCA	2	10	208597	208606	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016831	AGCGC	2	10	209548	209557	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016831	GCGCT	2	10	214366	214375	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016831	CGCGT	2	10	214418	214427	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016831	ATATA	2	10	232503	232512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016831	GCACC	2	10	235275	235284	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016831	TGCTC	2	10	247995	248004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016831	GTCTG	2	10	259056	259065	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016831	GCGCT	2	10	281932	281941	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016831	TGTGT	2	10	288323	288332	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016831	AGCGA	2	10	294411	294420	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016831	AGTCG	2	10	294438	294447	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016831	AAGGA	2	10	296285	296294	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016831	ATAAA	2	10	312613	312622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016831	TTTGG	2	10	312914	312923	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016831	TGTAG	2	10	315777	315786	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016831	CGCTA	2	10	344531	344540	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016831	TTGTG	2	10	350774	350783	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016831	ACGAA	2	10	357618	357627	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016831	AAACT	2	10	357975	357984	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016831	AAGCG	2	10	368289	368298	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016831	ATTTA	2	10	378965	378974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016831	ATTTT	2	10	383780	383789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016831	GCGCT	2	10	392958	392967	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016831	GCAGA	2	10	393258	393267	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016831	TTATT	2	10	393348	393357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016831	CTTTT	2	10	393475	393484	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016831	ACTGA	2	10	402669	402678	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016831	ACCGC	2	10	402964	402973	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_016831	ACCGA	2	10	404028	404037	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016831	GGCGT	2	10	406192	406201	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016831	AACGA	2	10	421326	421335	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016831	ACAAA	2	10	421419	421428	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016831	GTTTG	2	10	424159	424168	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016831	TCGAA	2	10	438056	438065	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016831	TTTTA	2	10	457543	457552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016831	TTTTA	2	10	458412	458421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016831	ATGGG	2	10	458575	458584	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016831	AAAGT	2	10	464197	464206	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016831	GCGGT	2	10	483197	483206	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016831	TATCG	2	10	484548	484557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016831	TTTCA	2	10	484599	484608	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016831	TGGTT	2	10	485746	485755	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016831	CGCTT	2	10	486240	486249	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016831	AGGTG	2	10	500870	500879	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016831	AGCGC	2	10	512826	512835	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016831	GGCAG	2	10	514894	514903	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016831	GCATG	2	10	515932	515941	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016831	TACTG	2	10	519748	519757	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016831	ACGCT	2	10	521075	521084	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016831	ATATG	2	10	527329	527338	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016831	AAATG	2	10	529013	529022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016831	AGAAT	2	10	531499	531508	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016831	ACCCG	2	10	553217	553226	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_016831	GAAAG	2	10	563602	563611	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016831	TGATA	2	10	571110	571119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016831	AGGGC	2	10	571264	571273	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016831	AATAA	2	10	576064	576073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016831	GCGGT	2	10	576756	576765	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016831	GGCCT	2	10	576784	576793	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016831	ATGGA	2	10	579215	579224	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016831	ACTAC	2	10	579333	579342	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_016831	CGCGC	2	10	584466	584475	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
97	NC_016831	CGTCG	2	10	585070	585079	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_016831	ACAGG	2	10	585641	585650	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016831	GCAAA	2	10	598403	598412	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016831	CTGTA	2	10	628318	628327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016831	CGGGC	2	10	629810	629819	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016831	ATTAA	2	10	646115	646124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016831	GGCCT	2	10	654142	654151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016831	TGAGC	2	10	663541	663550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016831	TTCTC	2	10	672671	672680	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016831	GTATC	2	10	672722	672731	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016831	GGCGC	2	10	702120	702129	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016831	TTACC	2	10	704149	704158	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_016831	GGTGC	2	10	708784	708793	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016831	TGATG	2	10	709104	709113	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016831	TTTAT	2	10	717873	717882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016831	CGACC	2	10	727090	727099	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_016831	TCCGC	2	10	729558	729567	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_016831	GAGAG	2	10	760055	760064	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016831	CGTAG	2	10	768264	768273	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016831	AAAGA	2	10	787481	787490	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016831	GTTAA	2	10	796442	796451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016831	AGGTA	2	10	803584	803593	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016831	TTCGG	2	10	804326	804335	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016831	CTGAC	2	10	804472	804481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016831	CCAGA	2	10	806787	806796	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016831	TTAAT	2	10	807481	807490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016831	GCCGC	2	10	816510	816519	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_016831	AATGC	2	10	835683	835692	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016831	GTGGA	2	10	835802	835811	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016831	TATTT	2	10	877718	877727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016831	AGCGC	2	10	889580	889589	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016831	TGTTT	2	10	898263	898272	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016831	CGGGT	2	10	898710	898719	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016831	TAAAA	2	10	898999	899008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016831	ATTTA	2	10	923379	923388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016831	TGTTT	2	10	924726	924735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016831	AGGCG	2	10	944664	944673	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016831	GCGCG	2	10	945601	945610	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016831	GTAAA	2	10	955059	955068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016831	CATTT	2	10	957803	957812	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016831	GTTAG	2	10	959664	959673	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016831	TAGAT	2	10	960280	960289	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016831	AAATA	2	10	961742	961751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016831	GTATT	2	10	963653	963662	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016831	CAGTT	2	10	965189	965198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016831	TTTAA	2	10	968452	968461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016831	TTAAA	2	10	973147	973156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016831	AAAAT	2	10	973363	973372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016831	TATTT	2	10	973449	973458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016831	CAATT	2	10	983243	983252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016831	ATTCT	2	10	985189	985198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_016831	GAAAA	2	10	986233	986242	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016831	ATAAA	2	10	993456	993465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016831	ATTTT	2	10	993774	993783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016831	GGATC	2	10	999385	999394	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_016831	TTTGA	2	10	1004208	1004217	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016831	CAGCG	2	10	1013229	1013238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_016831	GTAAA	2	10	1092839	1092848	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_016831	ACGTT	2	10	1096992	1097001	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_016831	TCATT	2	10	1097985	1097994	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_016831	CCAGA	2	10	1100827	1100836	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_016831	GATTT	2	10	1225244	1225253	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016831	GCGCT	2	10	1238153	1238162	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_016831	CAACC	2	10	1849274	1849283	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
283	NC_016831	GGACA	2	10	1855718	1855727	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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406	NC_016831	TGGCT	2	10	2617293	2617302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
407	NC_016831	ACTTT	2	10	2619009	2619018	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
408	NC_016831	GTACC	2	10	2620405	2620414	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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410	NC_016831	AAGCC	2	10	2632549	2632558	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
411	NC_016831	GCATC	2	10	2634406	2634415	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
412	NC_016831	CCAGT	2	10	2642760	2642769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
413	NC_016831	TTTCA	2	10	2646069	2646078	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
414	NC_016831	ACATT	2	10	2646353	2646362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
415	NC_016831	ATTGA	2	10	2646516	2646525	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
416	NC_016831	CGTTG	2	10	2650037	2650046	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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421	NC_016831	ACAAG	2	10	2686806	2686815	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
422	NC_016831	AAACA	2	10	2691082	2691091	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
423	NC_016831	GATTC	2	10	2703945	2703954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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453	NC_016831	TTTAC	2	10	2873831	2873840	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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462	NC_016831	GTAGC	2	10	3003148	3003157	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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465	NC_016831	GAATT	2	10	3044841	3044850	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
466	NC_016831	TGGCC	2	10	3050169	3050178	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
467	NC_016831	CCGTT	2	10	3057616	3057625	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
468	NC_016831	TAATT	2	10	3063412	3063421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_016831	CCTTT	2	10	3074528	3074537	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
470	NC_016831	AGCGC	2	10	3090975	3090984	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
471	NC_016831	TGTTT	2	10	3097337	3097346	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
472	NC_016831	GCATC	2	10	3098143	3098152	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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475	NC_016831	TCACG	2	10	3125584	3125593	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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485	NC_016831	AATGA	2	10	3185505	3185514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
486	NC_016831	GCGCT	2	10	3201521	3201530	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
487	NC_016831	CTTTA	2	10	3213904	3213913	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
488	NC_016831	GCGCT	2	10	3239751	3239760	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
489	NC_016831	CATGT	2	10	3242732	3242741	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
490	NC_016831	AGCGC	2	10	3253433	3253442	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
491	NC_016831	ATCCT	2	10	3262851	3262860	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
492	NC_016831	TATGA	2	10	3289531	3289540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_016831	GACAG	2	10	3331378	3331387	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
497	NC_016831	TGTTT	2	10	3333252	3333261	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
498	NC_016831	TCCTC	2	10	3345597	3345606	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
499	NC_016831	ATGAC	2	10	3345747	3345756	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
500	NC_016831	GCGCT	2	10	3358658	3358667	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

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