MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 2463

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016831	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378953806
2	NC_016831	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378953807
3	NC_016831	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378953808
4	NC_016831	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	378953810
5	NC_016831	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	378953817
6	NC_016831	GGCTG	2	10	18853	18862	0 %	20 %	60 %	20 %	378953823
7	NC_016831	AGAGC	2	10	19374	19383	40 %	0 %	40 %	20 %	378953823
8	NC_016831	CCTGA	2	10	19915	19924	20 %	20 %	20 %	40 %	378953823
9	NC_016831	CTTTT	2	10	23395	23404	0 %	80 %	0 %	20 %	378953824
10	NC_016831	CGGTA	2	10	24563	24572	20 %	20 %	40 %	20 %	378953825
11	NC_016831	CTGTT	2	10	24602	24611	0 %	60 %	20 %	20 %	378953825
12	NC_016831	TATTT	2	10	25436	25445	20 %	80 %	0 %	0 %	378953826
13	NC_016831	ATCTG	2	10	30967	30976	20 %	40 %	20 %	20 %	378953831
14	NC_016831	TTACG	2	10	31022	31031	20 %	40 %	20 %	20 %	378953831
15	NC_016831	GGGCG	2	10	31790	31799	0 %	0 %	80 %	20 %	378953832
16	NC_016831	TGCGT	2	10	32169	32178	0 %	40 %	40 %	20 %	378953833
17	NC_016831	AAAAG	2	10	32563	32572	80 %	0 %	20 %	0 %	378953834
18	NC_016831	TATAA	2	10	34166	34175	60 %	40 %	0 %	0 %	378953835
19	NC_016831	ATCGT	2	10	34919	34928	20 %	40 %	20 %	20 %	378953837
20	NC_016831	ATTTT	2	10	34963	34972	20 %	80 %	0 %	0 %	378953837
21	NC_016831	AGCGA	2	10	35592	35601	40 %	0 %	40 %	20 %	378953838
22	NC_016831	TCCTG	2	10	35802	35811	0 %	40 %	20 %	40 %	378953838
23	NC_016831	GGTCA	2	10	38037	38046	20 %	20 %	40 %	20 %	378953839
24	NC_016831	TTCAT	2	10	39309	39318	20 %	60 %	0 %	20 %	378953840
25	NC_016831	TGAAA	2	10	40125	40134	60 %	20 %	20 %	0 %	378953841
26	NC_016831	GGGCT	2	10	46559	46568	0 %	20 %	60 %	20 %	378953844
27	NC_016831	GCGTA	2	10	48435	48444	20 %	20 %	40 %	20 %	378953846
28	NC_016831	GACCA	2	10	49040	49049	40 %	0 %	20 %	40 %	378953846
29	NC_016831	CCGGC	2	10	49182	49191	0 %	0 %	40 %	60 %	378953846
30	NC_016831	CAGAC	2	10	50372	50381	40 %	0 %	20 %	40 %	378953846
31	NC_016831	TGTGC	2	10	53131	53140	0 %	40 %	40 %	20 %	378953849
32	NC_016831	GTTTG	2	10	55453	55462	0 %	60 %	40 %	0 %	378953850
33	NC_016831	CACTA	2	10	56584	56593	40 %	20 %	0 %	40 %	378953850
34	NC_016831	CGGCG	2	10	57122	57131	0 %	0 %	60 %	40 %	378953851
35	NC_016831	TTCAC	2	10	57377	57386	20 %	40 %	0 %	40 %	378953852
36	NC_016831	AAAAT	2	10	58948	58957	80 %	20 %	0 %	0 %	378953854
37	NC_016831	GGAAA	2	10	59735	59744	60 %	0 %	40 %	0 %	378953855
38	NC_016831	CGCTG	2	10	60225	60234	0 %	20 %	40 %	40 %	378953856
39	NC_016831	CGGCG	2	10	63991	64000	0 %	0 %	60 %	40 %	378953859
40	NC_016831	GCCTG	2	10	64784	64793	0 %	20 %	40 %	40 %	378953859
41	NC_016831	GCGCG	2	10	64938	64947	0 %	0 %	60 %	40 %	378953860
42	NC_016831	CGTGC	2	10	71279	71288	0 %	20 %	40 %	40 %	378953865
43	NC_016831	TTGAT	2	10	71449	71458	20 %	60 %	20 %	0 %	378953865
44	NC_016831	ACCGC	2	10	72009	72018	20 %	0 %	20 %	60 %	378953865
45	NC_016831	CGATG	2	10	77491	77500	20 %	20 %	40 %	20 %	378953872
46	NC_016831	GCGAA	2	10	78432	78441	40 %	0 %	40 %	20 %	378953872
47	NC_016831	CGTAC	2	10	79322	79331	20 %	20 %	20 %	40 %	378953872
48	NC_016831	TTGCC	2	10	80958	80967	0 %	40 %	20 %	40 %	378953874
49	NC_016831	CGTCC	2	10	81068	81077	0 %	20 %	20 %	60 %	378953874
50	NC_016831	TCAGC	2	10	84187	84196	20 %	20 %	20 %	40 %	378953877
51	NC_016831	GGCCA	2	10	84335	84344	20 %	0 %	40 %	40 %	378953877
52	NC_016831	GTACG	2	10	86906	86915	20 %	20 %	40 %	20 %	378953879
53	NC_016831	CAGAA	2	10	87619	87628	60 %	0 %	20 %	20 %	378953879
54	NC_016831	CCGCA	2	10	89738	89747	20 %	0 %	20 %	60 %	378953882
55	NC_016831	CGGTT	2	10	90243	90252	0 %	40 %	40 %	20 %	378953883
56	NC_016831	GCTCC	2	10	91379	91388	0 %	20 %	20 %	60 %	378953883
57	NC_016831	TGGCG	2	10	92023	92032	0 %	20 %	60 %	20 %	378953885
58	NC_016831	TGCAC	2	10	98421	98430	20 %	20 %	20 %	40 %	378953889
59	NC_016831	TGGCA	2	10	98490	98499	20 %	20 %	40 %	20 %	378953889
60	NC_016831	TCTGT	2	10	98816	98825	0 %	60 %	20 %	20 %	378953890
61	NC_016831	GCGCT	2	10	99126	99135	0 %	20 %	40 %	40 %	378953890
62	NC_016831	GGCGC	2	10	99540	99549	0 %	0 %	60 %	40 %	378953890
63	NC_016831	AACGT	2	10	102322	102331	40 %	20 %	20 %	20 %	378953893
64	NC_016831	CCCAA	2	10	104472	104481	40 %	0 %	0 %	60 %	378953896
65	NC_016831	TTGTT	2	10	105179	105188	0 %	80 %	20 %	0 %	378953896
66	NC_016831	GCTTC	2	10	106559	106568	0 %	40 %	20 %	40 %	378953897
67	NC_016831	TGCGT	2	10	106846	106855	0 %	40 %	40 %	20 %	378953897
68	NC_016831	TGATC	2	10	108546	108555	20 %	40 %	20 %	20 %	378953899
69	NC_016831	TGGCG	2	10	111706	111715	0 %	20 %	60 %	20 %	378953901
70	NC_016831	AGCGC	2	10	112266	112275	20 %	0 %	40 %	40 %	378953901
71	NC_016831	ACAGA	2	10	116478	116487	60 %	0 %	20 %	20 %	378953903
72	NC_016831	CAGCG	2	10	117653	117662	20 %	0 %	40 %	40 %	378953905
73	NC_016831	GCCGG	2	10	117953	117962	0 %	0 %	60 %	40 %	378953905
74	NC_016831	CGAGC	2	10	118078	118087	20 %	0 %	40 %	40 %	378953905
75	NC_016831	ATTTG	2	10	118521	118530	20 %	60 %	20 %	0 %	378953905
76	NC_016831	TTGCC	2	10	123024	123033	0 %	40 %	20 %	40 %	378953909
77	NC_016831	AGCAG	2	10	123701	123710	40 %	0 %	40 %	20 %	378953910
78	NC_016831	AGTTT	2	10	125931	125940	20 %	60 %	20 %	0 %	378953911
79	NC_016831	TAGTG	2	10	126349	126358	20 %	40 %	40 %	0 %	378953912
80	NC_016831	TCGAT	2	10	127779	127788	20 %	40 %	20 %	20 %	378953913
81	NC_016831	CGGCG	2	10	130409	130418	0 %	0 %	60 %	40 %	378953917
82	NC_016831	CGTTT	2	10	130871	130880	0 %	60 %	20 %	20 %	378953917
83	NC_016831	ATTGG	2	10	131135	131144	20 %	40 %	40 %	0 %	378953918
84	NC_016831	AAAGC	2	10	138279	138288	60 %	0 %	20 %	20 %	378953922
85	NC_016831	CCGCA	2	10	138812	138821	20 %	0 %	20 %	60 %	378953922
86	NC_016831	AGTTC	2	10	141183	141192	20 %	40 %	20 %	20 %	378953924
87	NC_016831	AAGCG	2	10	145936	145945	40 %	0 %	40 %	20 %	378953928
88	NC_016831	GTTTG	2	10	147839	147848	0 %	60 %	40 %	0 %	378953930
89	NC_016831	CGTAT	2	10	149310	149319	20 %	40 %	20 %	20 %	378953931
90	NC_016831	ATCAG	2	10	151146	151155	40 %	20 %	20 %	20 %	378953933
91	NC_016831	CGGCG	2	10	155885	155894	0 %	0 %	60 %	40 %	378953936
92	NC_016831	CCGGC	2	10	159240	159249	0 %	0 %	40 %	60 %	378953939
93	NC_016831	CGCTG	2	10	160132	160141	0 %	20 %	40 %	40 %	378953939
94	NC_016831	GATCA	2	10	164284	164293	40 %	20 %	20 %	20 %	378953943
95	NC_016831	CGTCA	2	10	165030	165039	20 %	20 %	20 %	40 %	378953944
96	NC_016831	ATCCC	2	10	166730	166739	20 %	20 %	0 %	60 %	378953946
97	NC_016831	AGCGC	2	10	167438	167447	20 %	0 %	40 %	40 %	378953946
98	NC_016831	TGAGC	2	10	169287	169296	20 %	20 %	40 %	20 %	378953947
99	NC_016831	CGCAT	2	10	169549	169558	20 %	20 %	20 %	40 %	378953948
100	NC_016831	CGAAC	2	10	170278	170287	40 %	0 %	20 %	40 %	378953949
101	NC_016831	GTTCA	2	10	170544	170553	20 %	40 %	20 %	20 %	378953949
102	NC_016831	ATGAC	2	10	171510	171519	40 %	20 %	20 %	20 %	378953950
103	NC_016831	CTGGA	2	10	172100	172109	20 %	20 %	40 %	20 %	378953951
104	NC_016831	CAGAA	2	10	174219	174228	60 %	0 %	20 %	20 %	378953953
105	NC_016831	CGAAG	2	10	177090	177099	40 %	0 %	40 %	20 %	378953957
106	NC_016831	GACTG	2	10	178891	178900	20 %	20 %	40 %	20 %	378953958
107	NC_016831	AGCAA	2	10	179303	179312	60 %	0 %	20 %	20 %	378953958
108	NC_016831	GGCAT	2	10	184365	184374	20 %	20 %	40 %	20 %	378953962
109	NC_016831	GGCCA	2	10	184787	184796	20 %	0 %	40 %	40 %	378953963
110	NC_016831	GCGCC	2	10	184800	184809	0 %	0 %	40 %	60 %	378953963
111	NC_016831	CGTTT	2	10	185302	185311	0 %	60 %	20 %	20 %	378953963
112	NC_016831	GGGGA	2	10	185354	185363	20 %	0 %	80 %	0 %	378953963
113	NC_016831	CTGGT	2	10	188989	188998	0 %	40 %	40 %	20 %	378953964
114	NC_016831	CGGCG	2	10	192298	192307	0 %	0 %	60 %	40 %	378953970
115	NC_016831	CCGCT	2	10	193005	193014	0 %	20 %	20 %	60 %	378953970
116	NC_016831	GCCCA	2	10	195557	195566	20 %	0 %	20 %	60 %	378953973
117	NC_016831	GCGCA	2	10	195962	195971	20 %	0 %	40 %	40 %	378953973
118	NC_016831	ATCGG	2	10	197353	197362	20 %	20 %	40 %	20 %	378953975
119	NC_016831	GCCGC	2	10	198563	198572	0 %	0 %	40 %	60 %	378953977
120	NC_016831	ATCCA	2	10	203913	203922	40 %	20 %	0 %	40 %	378953980
121	NC_016831	CGGCG	2	10	206033	206042	0 %	0 %	60 %	40 %	378953983
122	NC_016831	TGGTC	2	10	206899	206908	0 %	40 %	40 %	20 %	378953983
123	NC_016831	GTGTT	2	10	209932	209941	0 %	60 %	40 %	0 %	378953984
124	NC_016831	CGGCG	2	10	211462	211471	0 %	0 %	60 %	40 %	378953986
125	NC_016831	TTCGG	2	10	212342	212351	0 %	40 %	40 %	20 %	378953987
126	NC_016831	CTTGC	2	10	213351	213360	0 %	40 %	20 %	40 %	378953988
127	NC_016831	TGAGC	2	10	213763	213772	20 %	20 %	40 %	20 %	378953989
128	NC_016831	CGGCA	2	10	214848	214857	20 %	0 %	40 %	40 %	378953990
129	NC_016831	GCACG	2	10	215027	215036	20 %	0 %	40 %	40 %	378953990
130	NC_016831	AGATC	2	10	215432	215441	40 %	20 %	20 %	20 %	378953991
131	NC_016831	CGCGG	2	10	215854	215863	0 %	0 %	60 %	40 %	378953992
132	NC_016831	CGCGG	2	10	216038	216047	0 %	0 %	60 %	40 %	378953992
133	NC_016831	GCCAG	2	10	218022	218031	20 %	0 %	40 %	40 %	378953993
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259	NC_016831	TGAGA	2	10	427046	427055	40 %	20 %	40 %	0 %	378954159
260	NC_016831	TTCAG	2	10	428199	428208	20 %	40 %	20 %	20 %	378954159
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262	NC_016831	CGGAG	2	10	429303	429312	20 %	0 %	60 %	20 %	378954161
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