MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 11678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016831	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016831	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016831	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016831	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016831	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_016831	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016831	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016831	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016831	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016831	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016831	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016831	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016831	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016831	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016831	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016831	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016831	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016831	TTA	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016831	GTT	2	6	11362	11367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016831	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016831	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016831	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016831	ATG	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016831	TTC	2	6	14755	14760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016831	TTG	2	6	14836	14841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016831	TAT	2	6	14972	14977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016831	ATG	2	6	16003	16008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016831	CCT	2	6	16024	16029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016831	ATT	2	6	16057	16062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016831	ATT	2	6	17614	17619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016831	GTT	2	6	17706	17711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016831	GTT	2	6	17730	17735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016831	ATC	2	6	17759	17764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016831	GAT	2	6	17771	17776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016831	CCA	2	6	20033	20038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016831	TCA	2	6	20127	20132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016831	GCG	2	6	20214	20219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016831	AAC	2	6	20282	20287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016831	ATC	2	6	20288	20293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016831	TAA	2	6	20296	20301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016831	CTT	2	6	20315	20320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016831	AAC	2	6	20481	20486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016831	GAA	2	6	20749	20754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016831	GGC	2	6	20791	20796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016831	CCG	2	6	20805	20810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016831	GCC	2	6	20828	20833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016831	GCT	2	6	20959	20964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016831	ATG	2	6	21072	21077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016831	GCC	2	6	21134	21139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016831	TGA	2	6	21192	21197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016831	CAT	2	6	21323	21328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016831	GAT	2	6	21352	21357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016831	TAA	2	6	21358	21363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016831	CTG	2	6	21405	21410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016831	CGC	2	6	21516	21521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016831	CAG	2	6	21535	21540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016831	ATG	2	6	21621	21626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016831	GTT	2	6	21691	21696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016831	GGC	2	6	21779	21784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016831	GTT	2	6	21841	21846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016831	CGG	3	9	21865	21873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016831	AAG	2	6	21978	21983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016831	GCG	2	6	22032	22037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016831	TTA	2	6	22095	22100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016831	GGC	2	6	22111	22116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016831	GTA	2	6	22214	22219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016831	GGC	3	9	22255	22263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016831	CGA	2	6	22321	22326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016831	CGG	2	6	22422	22427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016831	TGC	2	6	22434	22439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016831	GCT	2	6	22648	22653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016831	GGC	2	6	22682	22687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016831	AGA	2	6	22702	22707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016831	CGG	2	6	22744	22749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016831	GGT	2	6	22949	22954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016831	CTA	2	6	22956	22961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016831	CGG	2	6	22996	23001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016831	TAT	2	6	23027	23032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016831	ATA	2	6	23053	23058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016831	TTA	2	6	23168	23173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016831	GTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016831	ACA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016831	GAT	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016831	TAA	2	6	24261	24266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016831	TAA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016831	ACG	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016831	AAG	2	6	24355	24360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016831	GAA	2	6	24401	24406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016831	CAG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016831	ATA	2	6	33135	33140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016831	CAT	2	6	33202	33207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016831	TAA	2	6	33256	33261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016831	GTG	2	6	33301	33306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016831	ATG	2	6	33328	33333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016831	TAG	2	6	34996	35001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016831	TTG	2	6	35044	35049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016831	AAT	2	6	35056	35061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016831	TAG	2	6	35153	35158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016831	ATT	2	6	35235	35240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016831	TTG	2	6	35254	35259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016831	TGT	2	6	35293	35298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016831	GCT	2	6	35300	35305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016831	TCA	2	6	38755	38760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016831	TGT	2	6	39568	39573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016831	AAG	2	6	39577	39582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016831	TGT	2	6	39673	39678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016831	TTA	2	6	39679	39684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016831	TGT	2	6	39718	39723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016831	AAT	2	6	39769	39774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016831	AAT	2	6	39981	39986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016831	GAA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016831	AAT	2	6	41626	41631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016831	GTA	2	6	42914	42919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016831	TGA	2	6	44203	44208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016831	GTT	2	6	44212	44217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016831	TGT	2	6	44333	44338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016831	AAT	2	6	44382	44387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016831	TGT	2	6	44470	44475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016831	CGC	2	6	44683	44688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016831	TCA	2	6	44704	44709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016831	CCG	2	6	44721	44726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_016831	ACT	2	6	44937	44942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016831	ATG	2	6	44985	44990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016831	TTG	2	6	45064	45069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016831	CGA	2	6	45098	45103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016831	TAC	2	6	45165	45170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016831	ACG	2	6	45192	45197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016831	GTT	2	6	45293	45298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016831	TCA	2	6	45314	45319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016831	GAC	2	6	45390	45395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016831	AGG	2	6	45463	45468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016831	CGT	2	6	45515	45520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016831	AAT	2	6	45531	45536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016831	TGA	2	6	45590	45595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016831	CCG	2	6	45612	45617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016831	GTG	2	6	45645	45650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016831	CAG	2	6	45744	45749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016831	TGA	2	6	45788	45793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016831	GCT	2	6	45869	45874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_016831	GCG	2	6	113249	113254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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