MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens F113 chromosome

Total Repeats: 4162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016830	ACGCA	2	10	931	940	40 %	0 %	20 %	40 %	378947942
2	NC_016830	ACCAC	2	10	1983	1992	40 %	0 %	0 %	60 %	378947942
3	NC_016830	GCCAG	2	10	3809	3818	20 %	0 %	40 %	40 %	378947944
4	NC_016830	AGTTC	2	10	5362	5371	20 %	40 %	20 %	20 %	378947945
5	NC_016830	CCCTG	2	10	5612	5621	0 %	20 %	20 %	60 %	378947945
6	NC_016830	AACGT	2	10	6337	6346	40 %	20 %	20 %	20 %	378947945
7	NC_016830	CATTG	2	10	8194	8203	20 %	40 %	20 %	20 %	378947946
8	NC_016830	CCTCG	2	10	9164	9173	0 %	20 %	20 %	60 %	378947947
9	NC_016830	CAGCG	2	10	10366	10375	20 %	0 %	40 %	40 %	378947948
10	NC_016830	TCTTG	2	10	13659	13668	0 %	60 %	20 %	20 %	378947951
11	NC_016830	TGGCG	2	10	14426	14435	0 %	20 %	60 %	20 %	378947951
12	NC_016830	CCCAG	2	10	15203	15212	20 %	0 %	20 %	60 %	378947952
13	NC_016830	CGACG	2	10	20604	20613	20 %	0 %	40 %	40 %	378947959
14	NC_016830	ACGTT	2	10	22108	22117	20 %	40 %	20 %	20 %	378947960
15	NC_016830	CGATG	2	10	24637	24646	20 %	20 %	40 %	20 %	378947963
16	NC_016830	CGAAC	2	10	28755	28764	40 %	0 %	20 %	40 %	378947968
17	NC_016830	CGACC	2	10	31065	31074	20 %	0 %	20 %	60 %	378947970
18	NC_016830	GCGAT	2	10	31337	31346	20 %	20 %	40 %	20 %	378947970
19	NC_016830	GCACC	2	10	31347	31356	20 %	0 %	20 %	60 %	378947970
20	NC_016830	GCCCG	2	10	31425	31434	0 %	0 %	40 %	60 %	378947970
21	NC_016830	GGCGT	2	10	32038	32047	0 %	20 %	60 %	20 %	378947970
22	NC_016830	TCAAA	2	10	32457	32466	60 %	20 %	0 %	20 %	378947971
23	NC_016830	CGCGG	2	10	34976	34985	0 %	0 %	60 %	40 %	378947974
24	NC_016830	TCCAG	2	10	36874	36883	20 %	20 %	20 %	40 %	378947976
25	NC_016830	CAGCA	2	10	43923	43932	40 %	0 %	20 %	40 %	378947983
26	NC_016830	GCTCG	2	10	44504	44513	0 %	20 %	40 %	40 %	378947984
27	NC_016830	GCAAG	2	10	44863	44872	40 %	0 %	40 %	20 %	378947984
28	NC_016830	TGACC	2	10	45517	45526	20 %	20 %	20 %	40 %	378947984
29	NC_016830	TCGCG	2	10	45958	45967	0 %	20 %	40 %	40 %	378947984
30	NC_016830	ACGGC	2	10	46105	46114	20 %	0 %	40 %	40 %	378947984
31	NC_016830	CGTTT	2	10	47764	47773	0 %	60 %	20 %	20 %	378947986
32	NC_016830	TGCCC	2	10	49132	49141	0 %	20 %	20 %	60 %	378947987
33	NC_016830	CTTGG	2	10	49475	49484	0 %	40 %	40 %	20 %	378947987
34	NC_016830	CGGGC	2	10	51217	51226	0 %	0 %	60 %	40 %	378947988
35	NC_016830	CGGCG	2	10	51413	51422	0 %	0 %	60 %	40 %	378947988
36	NC_016830	TGGCT	2	10	56040	56049	0 %	40 %	40 %	20 %	378947993
37	NC_016830	GACCC	2	10	56526	56535	20 %	0 %	20 %	60 %	378947993
38	NC_016830	CCGGC	2	10	57351	57360	0 %	0 %	40 %	60 %	378947994
39	NC_016830	CGCAG	2	10	62952	62961	20 %	0 %	40 %	40 %	378947999
40	NC_016830	TGCAC	2	10	64212	64221	20 %	20 %	20 %	40 %	378948000
41	NC_016830	GTGGC	2	10	64398	64407	0 %	20 %	60 %	20 %	378948000
42	NC_016830	GCCGT	2	10	64411	64420	0 %	20 %	40 %	40 %	378948000
43	NC_016830	GCCTG	2	10	69160	69169	0 %	20 %	40 %	40 %	378948004
44	NC_016830	ACGAT	2	10	71228	71237	40 %	20 %	20 %	20 %	378948006
45	NC_016830	AGGGC	2	10	71481	71490	20 %	0 %	60 %	20 %	378948006
46	NC_016830	CGGCT	2	10	75690	75699	0 %	20 %	40 %	40 %	378948010
47	NC_016830	GACAT	2	10	76534	76543	40 %	20 %	20 %	20 %	378948010
48	NC_016830	CAGTT	2	10	76717	76726	20 %	40 %	20 %	20 %	378948011
49	NC_016830	GCCCG	2	10	76776	76785	0 %	0 %	40 %	60 %	378948011
50	NC_016830	CGGCG	2	10	77639	77648	0 %	0 %	60 %	40 %	378948011
51	NC_016830	GGGCC	2	10	79272	79281	0 %	0 %	60 %	40 %	378948013
52	NC_016830	GCCGA	2	10	79406	79415	20 %	0 %	40 %	40 %	378948013
53	NC_016830	GAAGG	2	10	82144	82153	40 %	0 %	60 %	0 %	378948016
54	NC_016830	GCGCC	2	10	82691	82700	0 %	0 %	40 %	60 %	378948017
55	NC_016830	GCCGA	2	10	83127	83136	20 %	0 %	40 %	40 %	378948017
56	NC_016830	AAGGC	2	10	84118	84127	40 %	0 %	40 %	20 %	378948018
57	NC_016830	CGCGG	2	10	84792	84801	0 %	0 %	60 %	40 %	378948018
58	NC_016830	TACCG	2	10	87501	87510	20 %	20 %	20 %	40 %	378948020
59	NC_016830	GCCTG	2	10	88702	88711	0 %	20 %	40 %	40 %	378948021
60	NC_016830	ACTGC	2	10	91605	91614	20 %	20 %	20 %	40 %	378948024
61	NC_016830	GGTCG	2	10	94218	94227	0 %	20 %	60 %	20 %	378948026
62	NC_016830	CCCAG	2	10	94735	94744	20 %	0 %	20 %	60 %	378948027
63	NC_016830	GCGCC	2	10	94753	94762	0 %	0 %	40 %	60 %	378948027
64	NC_016830	TGGCC	2	10	94891	94900	0 %	20 %	40 %	40 %	378948027
65	NC_016830	CAGCG	2	10	95279	95288	20 %	0 %	40 %	40 %	378948028
66	NC_016830	GCCAG	2	10	95499	95508	20 %	0 %	40 %	40 %	378948028
67	NC_016830	CGGTG	2	10	97286	97295	0 %	20 %	60 %	20 %	378948030
68	NC_016830	CCACA	2	10	97927	97936	40 %	0 %	0 %	60 %	378948032
69	NC_016830	CTCCA	2	10	99534	99543	20 %	20 %	0 %	60 %	378948034
70	NC_016830	GCGTT	2	10	101221	101230	0 %	40 %	40 %	20 %	378948035
71	NC_016830	ATCGC	2	10	101668	101677	20 %	20 %	20 %	40 %	378948035
72	NC_016830	GTCGG	2	10	104318	104327	0 %	20 %	60 %	20 %	378948037
73	NC_016830	AATCA	2	10	106063	106072	60 %	20 %	0 %	20 %	378948039
74	NC_016830	GAGGC	2	10	107393	107402	20 %	0 %	60 %	20 %	378948040
75	NC_016830	TCAAC	2	10	107928	107937	40 %	20 %	0 %	40 %	378948040
76	NC_016830	TTGCG	2	10	108989	108998	0 %	40 %	40 %	20 %	378948041
77	NC_016830	CGCTG	2	10	109036	109045	0 %	20 %	40 %	40 %	378948041
78	NC_016830	CGACC	2	10	113599	113608	20 %	0 %	20 %	60 %	378948045
79	NC_016830	AGCGC	2	10	114657	114666	20 %	0 %	40 %	40 %	378948046
80	NC_016830	CAGCT	2	10	115176	115185	20 %	20 %	20 %	40 %	378948047
81	NC_016830	GTGGC	2	10	120744	120753	0 %	20 %	60 %	20 %	378948050
82	NC_016830	GGCTG	2	10	122504	122513	0 %	20 %	60 %	20 %	378948052
83	NC_016830	TGGCC	2	10	123214	123223	0 %	20 %	40 %	40 %	378948054
84	NC_016830	AAGCA	2	10	123359	123368	60 %	0 %	20 %	20 %	378948054
85	NC_016830	GTTCA	2	10	124704	124713	20 %	40 %	20 %	20 %	378948055
86	NC_016830	CCAGT	2	10	127648	127657	20 %	20 %	20 %	40 %	378948058
87	NC_016830	GAGTT	2	10	135703	135712	20 %	40 %	40 %	0 %	378948064
88	NC_016830	CGTGG	2	10	135902	135911	0 %	20 %	60 %	20 %	378948064
89	NC_016830	CGGGC	2	10	137306	137315	0 %	0 %	60 %	40 %	378948065
90	NC_016830	CCCAG	2	10	137605	137614	20 %	0 %	20 %	60 %	378948065
91	NC_016830	GCGGG	2	10	137990	137999	0 %	0 %	80 %	20 %	378948066
92	NC_016830	CCAGG	2	10	139174	139183	20 %	0 %	40 %	40 %	378948066
93	NC_016830	TGCCA	2	10	139284	139293	20 %	20 %	20 %	40 %	378948066
94	NC_016830	CGGCG	2	10	139668	139677	0 %	0 %	60 %	40 %	378948067
95	NC_016830	TCCAG	2	10	139875	139884	20 %	20 %	20 %	40 %	378948067
96	NC_016830	CAACG	2	10	139972	139981	40 %	0 %	20 %	40 %	378948067
97	NC_016830	CAGCG	2	10	140749	140758	20 %	0 %	40 %	40 %	378948069
98	NC_016830	AGGCC	2	10	140954	140963	20 %	0 %	40 %	40 %	378948069
99	NC_016830	CGGGG	2	10	142132	142141	0 %	0 %	80 %	20 %	378948070
100	NC_016830	CCTGG	2	10	142903	142912	0 %	20 %	40 %	40 %	378948072
101	NC_016830	GGCTG	2	10	143167	143176	0 %	20 %	60 %	20 %	378948072
102	NC_016830	AGGGC	2	10	143611	143620	20 %	0 %	60 %	20 %	378948072
103	NC_016830	GGATC	2	10	144966	144975	20 %	20 %	40 %	20 %	378948074
104	NC_016830	CCAGC	2	10	144982	144991	20 %	0 %	20 %	60 %	378948074
105	NC_016830	CTTCG	2	10	146555	146564	0 %	40 %	20 %	40 %	378948077
106	NC_016830	TGGCC	2	10	148317	148326	0 %	20 %	40 %	40 %	378948079
107	NC_016830	CGGCC	2	10	148918	148927	0 %	0 %	40 %	60 %	378948081
108	NC_016830	GCTCA	2	10	149574	149583	20 %	20 %	20 %	40 %	378948083
109	NC_016830	GGGCG	2	10	154124	154133	0 %	0 %	80 %	20 %	378948086
110	NC_016830	AGCCG	2	10	158986	158995	20 %	0 %	40 %	40 %	378948092
111	NC_016830	GGCCG	2	10	164108	164117	0 %	0 %	60 %	40 %	378948097
112	NC_016830	GCAAG	2	10	171715	171724	40 %	0 %	40 %	20 %	378948098
113	NC_016830	GCGTC	2	10	171760	171769	0 %	20 %	40 %	40 %	378948098
114	NC_016830	TCGCG	2	10	174098	174107	0 %	20 %	40 %	40 %	378948100
115	NC_016830	GCCAG	2	10	174232	174241	20 %	0 %	40 %	40 %	378948100
116	NC_016830	GGCCT	2	10	174462	174471	0 %	20 %	40 %	40 %	378948100
117	NC_016830	GATCA	2	10	176805	176814	40 %	20 %	20 %	20 %	378948101
118	NC_016830	ACGGC	2	10	177298	177307	20 %	0 %	40 %	40 %	378948101
119	NC_016830	TGGCC	2	10	181073	181082	0 %	20 %	40 %	40 %	378948104
120	NC_016830	GCCAG	2	10	182967	182976	20 %	0 %	40 %	40 %	378948106
121	NC_016830	CCGAT	2	10	183093	183102	20 %	20 %	20 %	40 %	378948107
122	NC_016830	GGTGC	2	10	184114	184123	0 %	20 %	60 %	20 %	378948107
123	NC_016830	GCTGT	2	10	184624	184633	0 %	40 %	40 %	20 %	378948108
124	NC_016830	CCGGG	2	10	185798	185807	0 %	0 %	60 %	40 %	378948109
125	NC_016830	TGCCC	2	10	187685	187694	0 %	20 %	20 %	60 %	378948111
126	NC_016830	CAGCT	2	10	188337	188346	20 %	20 %	20 %	40 %	378948111
127	NC_016830	GGCCT	2	10	191996	192005	0 %	20 %	40 %	40 %	378948114
128	NC_016830	ATCTG	2	10	192203	192212	20 %	40 %	20 %	20 %	378948114
129	NC_016830	TCGGC	2	10	194781	194790	0 %	20 %	40 %	40 %	378948116
130	NC_016830	GCCCA	2	10	196969	196978	20 %	0 %	20 %	60 %	378948118
131	NC_016830	GCCAG	2	10	198703	198712	20 %	0 %	40 %	40 %	378948119
132	NC_016830	GTGTC	2	10	200283	200292	0 %	40 %	40 %	20 %	378948120
133	NC_016830	CGTGG	2	10	204398	204407	0 %	20 %	60 %	20 %	378948124
134	NC_016830	GGTCT	2	10	204974	204983	0 %	40 %	40 %	20 %	378948125
135	NC_016830	ACCGT	2	10	205091	205100	20 %	20 %	20 %	40 %	378948125
136	NC_016830	TGACC	2	10	210723	210732	20 %	20 %	20 %	40 %	378948129
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138	NC_016830	CGGTG	2	10	211759	211768	0 %	20 %	60 %	20 %	378948131
139	NC_016830	GCCAG	2	10	217969	217978	20 %	0 %	40 %	40 %	378948135
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142	NC_016830	GCACC	2	10	220391	220400	20 %	0 %	20 %	60 %	378948137
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149	NC_016830	TCGAG	2	10	233547	233556	20 %	20 %	40 %	20 %	378948146
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151	NC_016830	CGGTG	2	10	236305	236314	0 %	20 %	60 %	20 %	378948146
152	NC_016830	GCGTC	2	10	247965	247974	0 %	20 %	40 %	40 %	378948146
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166	NC_016830	GCCCG	2	10	269028	269037	0 %	0 %	40 %	60 %	378948163
167	NC_016830	GTTCG	2	10	269901	269910	0 %	40 %	40 %	20 %	378948164
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170	NC_016830	TGGCG	2	10	272969	272978	0 %	20 %	60 %	20 %	378948165
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174	NC_016830	CGGCG	2	10	279020	279029	0 %	0 %	60 %	40 %	378948166
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257	NC_016830	GACCG	2	10	416560	416569	20 %	0 %	40 %	40 %	378948292
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261	NC_016830	CCGCA	2	10	422044	422053	20 %	0 %	20 %	60 %	378948298
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