MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyorhinis GDL-1 chromosome

Total Repeats: 615

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016829	GAAAGA	2	12	1356	1367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835507
2	NC_016829	TATTGT	2	12	1514	1525	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016829	GAAAAA	2	12	1592	1603	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378835508
4	NC_016829	TTCAAA	2	12	1639	1650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378835508
5	NC_016829	GTTTAA	2	12	2070	2081	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378835508
6	NC_016829	TCTTTT	2	12	11086	11097	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378835517
7	NC_016829	CATTCA	2	12	15559	15570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378835520
8	NC_016829	AAATAA	2	12	15847	15858	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378835520
9	NC_016829	AATTAA	2	12	16306	16317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835520
10	NC_016829	ATTTTT	2	12	18225	18236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016829	CTGGAG	2	12	22774	22785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016829	AAGTGT	2	12	23081	23092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016829	TTTGAA	2	12	24165	24176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378835523
14	NC_016829	ATATTT	2	12	25913	25924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016829	AAGATG	2	12	26809	26820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016829	TGCAAA	2	12	28165	28176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378835527
17	NC_016829	TCAAGT	2	12	29774	29785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016829	TTTAGA	2	12	33558	33569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378835529
19	NC_016829	GAATTT	2	12	35788	35799	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378835531
20	NC_016829	ATAAAA	2	12	35975	35986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378835531
21	NC_016829	AATTTA	2	12	37418	37429	50 %	50 %	0 %	0 %	378835532
22	NC_016829	TTTATC	2	12	41287	41298	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378835536
23	NC_016829	AAAGCA	2	12	45644	45655	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378835540
24	NC_016829	ATTTCT	2	12	46512	46523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378835540
25	NC_016829	AATTAA	2	12	46757	46768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016829	ATTACA	2	12	48083	48094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016829	CTTATT	2	12	48328	48339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378835541
28	NC_016829	ATTAAT	2	12	48440	48451	50 %	50 %	0 %	0 %	378835541
29	NC_016829	AATGAA	2	12	49245	49256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378835541
30	NC_016829	TTTTGA	2	12	50298	50309	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016829	CTAGAA	2	12	51194	51205	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016829	GATAGA	2	12	51211	51222	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016829	ATTTTT	2	12	53835	53846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016829	ATGGTA	2	12	54444	54455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835543
35	NC_016829	AAATTG	2	12	56922	56933	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378835543
36	NC_016829	AGAAAA	2	12	56995	57006	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378835543
37	NC_016829	TAAATA	2	12	59986	59997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016829	AATTAA	2	12	61424	61435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016829	ATTACA	2	12	62709	62720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016829	ATTTAA	2	12	63086	63097	50 %	50 %	0 %	0 %	378835548
41	NC_016829	TTTCTA	2	12	66138	66149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378835550
42	NC_016829	AGGATT	2	12	69030	69041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378835553
43	NC_016829	TATATG	2	12	72454	72465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378835554
44	NC_016829	GAAAAA	2	12	73799	73810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378835555
45	NC_016829	CTCCTT	2	12	74418	74429	0 %	50 %	0 %	50 %	378835555
46	NC_016829	AAGGTC	2	12	74814	74825	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378835555
47	NC_016829	TTTGTT	2	12	78420	78431	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016829	CTTTGT	2	12	78540	78551	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378835558
49	NC_016829	TCTAAA	2	12	78707	78718	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378835558
50	NC_016829	TCAAGT	2	12	78932	78943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378835558
51	NC_016829	GAAAAT	2	12	79698	79709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378835559
52	NC_016829	TTAAAA	2	12	80300	80311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835560
53	NC_016829	TGCAAA	2	12	80899	80910	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378835560
54	NC_016829	AAAGAA	2	12	81962	81973	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378835560
55	NC_016829	AAGCAA	2	12	82643	82654	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378835561
56	NC_016829	TGAAAA	2	12	85575	85586	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378835562
57	NC_016829	TTTTAA	2	12	88135	88146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378835564
58	NC_016829	AAAAAC	2	12	91271	91282	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378835568
59	NC_016829	TAAAAA	2	12	91716	91727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378835568
60	NC_016829	TGAAAA	2	12	92990	93001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378835571
61	NC_016829	ACAGAT	2	12	94218	94229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378835571
62	NC_016829	AAAGAA	2	12	95776	95787	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378835573
63	NC_016829	TAGGAA	2	12	96543	96554	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378835574
64	NC_016829	TTTTAT	2	12	97964	97975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378835575
65	NC_016829	CAAAAT	2	12	98531	98542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378835575
66	NC_016829	TTAAAT	2	12	98550	98561	50 %	50 %	0 %	0 %	378835575
67	NC_016829	ATTCAA	2	12	98836	98847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378835575
68	NC_016829	CAAAAA	2	12	99420	99431	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378835575
69	NC_016829	TGCAGA	2	12	101746	101757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378835577
70	NC_016829	ACAGCT	2	12	105157	105168	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016829	TAAAGA	2	12	105635	105646	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016829	CAAAAA	2	12	107490	107501	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378835582
73	NC_016829	CCAAAT	2	12	108141	108152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378835582
74	NC_016829	TCAAAA	2	12	108666	108677	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378835583
75	NC_016829	TAAAAT	2	12	109089	109100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835584
76	NC_016829	TACAAA	2	12	109567	109578	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378835584
77	NC_016829	TTGGAG	2	12	110171	110182	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378835584
78	NC_016829	TAAAAG	2	12	112942	112953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378835588
79	NC_016829	AGACAA	2	12	113527	113538	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	378835589
80	NC_016829	ATTCAA	2	12	114819	114830	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378835589
81	NC_016829	TTAATA	2	12	115293	115304	50 %	50 %	0 %	0 %	378835591
82	NC_016829	TTGTTA	2	12	116440	116451	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378835592
83	NC_016829	ATTGAC	2	12	117012	117023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378835592
84	NC_016829	ATTACA	2	12	118595	118606	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016829	AAGGAA	2	12	121578	121589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378835596
86	NC_016829	CTCTTT	2	12	122797	122808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378835597
87	NC_016829	AAAGAA	2	12	124068	124079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378835598
88	NC_016829	TTTTGA	2	12	129179	129190	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378835605
89	NC_016829	TTTTGT	2	12	129693	129704	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378835606
90	NC_016829	AAGAAA	2	12	131307	131318	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378835607
91	NC_016829	ATAATT	2	12	131562	131573	50 %	50 %	0 %	0 %	378835607
92	NC_016829	TTCATA	2	12	134055	134066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378835609
93	NC_016829	TTAAAA	2	12	134633	134644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378835610
94	NC_016829	CTTCAT	2	12	136976	136987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378835610
95	NC_016829	TAAAAA	2	12	138070	138081	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	378835612
96	NC_016829	TAAAAA	2	12	139039	139050	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016829	AGAATT	2	12	141294	141305	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378835615
98	NC_016829	AAATAG	2	12	142934	142945	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378835617
99	NC_016829	CAAAAT	2	12	143544	143555	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378835617
100	NC_016829	ATAAAG	2	12	143985	143996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378835618
101	NC_016829	GTTTTT	2	12	149383	149394	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378835624
102	NC_016829	ATTGAA	2	12	154067	154078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378835627
103	NC_016829	AAAAGA	2	12	154900	154911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378835627
104	NC_016829	TTTTGT	2	12	154915	154926	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	378835627
105	NC_016829	TGTAAT	2	12	159369	159380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016829	TGAAAA	2	12	163564	163575	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378835631
107	NC_016829	AAAAAC	2	12	165517	165528	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	378835632
108	NC_016829	AACTAA	2	12	166868	166879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378835632
109	NC_016829	ATAGCA	2	12	169585	169596	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378835635
110	NC_016829	TTGCAT	2	12	170249	170260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378835636
111	NC_016829	AAATTC	2	12	172764	172775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378835638
112	NC_016829	GAAGGA	2	12	173279	173290	50 %	0 %	50 %	0 %	378835639
113	NC_016829	TCCAAA	2	12	173500	173511	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	378835639
114	NC_016829	ATTTTT	2	12	178703	178714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378835642
115	NC_016829	TGAAAA	2	12	179802	179813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378835642
116	NC_016829	TTTATT	2	12	182095	182106	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378835645
117	NC_016829	GTTTGA	2	12	182460	182471	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378835645
118	NC_016829	AACAAT	2	12	184562	184573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378835646
119	NC_016829	ACAAAA	2	12	188868	188879	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016829	AAGAAA	2	12	190551	190562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016829	ACACAA	2	12	193160	193171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016829	AGTTGA	2	12	193327	193338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016829	CAAGAA	2	12	193891	193902	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016829	ATTGAT	2	12	193942	193953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016829	AAATGA	2	12	194382	194393	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016829	TTACTA	2	12	194615	194626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016829	CTAATT	2	12	194831	194842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016829	AAAAGT	2	12	195057	195068	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_016829	TAAAAT	2	12	196349	196360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016829	AAACCA	2	12	199693	199704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378835650
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153	NC_016829	GTTTTT	2	12	224960	224971	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_016829	TTGTCT	2	12	333629	333640	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378835735
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242	NC_016829	TTTATC	2	12	335968	335979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378835735
243	NC_016829	TCTGTA	2	12	337379	337390	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378835735
244	NC_016829	ATCAAA	2	12	337582	337593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378835735
245	NC_016829	TAAAAA	2	12	341821	341832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_016829	TTTAAT	2	12	652973	652984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378836007
479	NC_016829	CTAATG	2	12	653188	653199	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378836007
480	NC_016829	TTTCTG	2	12	654926	654937	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378836008
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482	NC_016829	AAATTT	2	12	656661	656672	50 %	50 %	0 %	0 %	378836009
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