MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis GDL-1 chromosome

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016829	TATTGT	2	12	1514	1525	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016829	ATTTTT	2	12	18225	18236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016829	CTGGAG	2	12	22774	22785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016829	AAGTGT	2	12	23081	23092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016829	ATATTT	2	12	25913	25924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016829	AAGATG	2	12	26809	26820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016829	TCAAGT	2	12	29774	29785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016829	AATTAA	2	12	46757	46768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016829	ATTACA	2	12	48083	48094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016829	TTTTGA	2	12	50298	50309	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016829	CTAGAA	2	12	51194	51205	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016829	GATAGA	2	12	51211	51222	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016829	ATTTTT	2	12	53835	53846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016829	TAAATA	2	12	59986	59997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016829	AATTAA	2	12	61424	61435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016829	ATTACA	2	12	62709	62720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016829	TTTGTT	2	12	78420	78431	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016829	ACAGCT	2	12	105157	105168	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016829	TAAAGA	2	12	105635	105646	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016829	ATTACA	2	12	118595	118606	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016829	TAAAAA	2	12	139039	139050	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016829	TGTAAT	2	12	159369	159380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016829	ACAAAA	2	12	188868	188879	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016829	AAGAAA	2	12	190551	190562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016829	ACACAA	2	12	193160	193171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016829	AGTTGA	2	12	193327	193338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016829	CAAGAA	2	12	193891	193902	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016829	ATTGAT	2	12	193942	193953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016829	AAATGA	2	12	194382	194393	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016829	TTACTA	2	12	194615	194626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016829	CTAATT	2	12	194831	194842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016829	AAAAGT	2	12	195057	195068	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016829	CAAATG	2	12	196175	196186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016829	ACTAAT	2	12	196213	196224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016829	TAAAAT	2	12	196349	196360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016829	ATTTAA	2	12	209099	209110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016829	TGTAAT	2	12	214097	214108	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016829	TCAAAT	2	12	215527	215538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016829	ATTTAA	2	12	224380	224391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016829	GTTTTT	2	12	224960	224971	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016829	TAAAGC	2	12	227951	227962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016829	AAAAAT	2	12	228480	228491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016829	TCTTTA	2	12	233393	233404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016829	TTTTTA	2	12	234305	234316	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016829	TGTAAT	2	12	242324	242335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016829	TTTCAT	2	12	262445	262456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016829	AAAATA	2	12	303917	303928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016829	TGTAAT	2	12	304118	304129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016829	TGAAAA	2	12	306438	306449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016829	ATTTAA	2	12	308696	308707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016829	ATTTAA	2	12	309761	309772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016829	ATTTAA	2	12	310662	310673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016829	TACAAA	2	12	311268	311279	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016829	AAATTA	2	12	314790	314801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016829	AAAATA	2	12	317005	317016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016829	TAAAGA	2	12	317078	317089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016829	ATATTT	2	12	317131	317142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016829	GGTTCT	2	12	318396	318407	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016829	ATCTAA	2	12	320176	320187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016829	TAAAAA	2	12	341821	341832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016829	TGTCTT	2	12	357148	357159	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016829	TAGTGT	2	12	376531	376542	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016829	TATCAA	2	12	379970	379981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016829	TATTTT	2	12	390546	390557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016829	ATGTTG	2	12	391090	391101	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016829	ATTTTA	2	12	392317	392328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016829	AATTAC	2	12	403804	403815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016829	TTTATA	2	12	421534	421545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016829	TTTTTG	2	12	438424	438435	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016829	TATTTT	2	12	445520	445531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016829	TGTAAT	2	12	447888	447899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016829	AGATTA	2	12	448966	448977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016829	AAATAA	2	12	449479	449490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016829	CAAAAG	2	12	452012	452023	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016829	ACTAAA	2	12	467751	467762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016829	ACTGAT	2	12	481866	481877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016829	TGTAAT	2	12	497744	497755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016829	TAAAAA	2	12	516689	516700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016829	ATTACA	2	12	536084	536095	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016829	ATTTTT	2	12	539270	539281	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016829	TATTAA	2	12	549433	549444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016829	TGTAAT	2	12	551571	551582	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016829	ATCTAA	2	12	553837	553848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016829	AAAATT	2	12	554866	554877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016829	AGCCAA	2	12	561982	561993	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016829	TTTTAA	2	12	562805	562816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016829	TAAAAA	3	18	575604	575621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016829	ATTACA	2	12	578841	578852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016829	AATAAA	2	12	582451	582462	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016829	AATAAA	2	12	584249	584260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016829	TAATTT	2	12	584359	584370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016829	TTTAAA	2	12	606781	606792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016829	AAATAA	2	12	614087	614098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016829	AAATAA	2	12	665538	665549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016829	ATCAAA	2	12	671540	671551	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016829	AATGAT	2	12	672304	672315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016829	GAAATT	2	12	684937	684948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016829	ATTACA	2	12	686224	686235	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016829	TTTTAA	2	12	686433	686444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016829	TAAAGA	2	12	690681	690692	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016829	ATTTGT	2	12	690884	690895	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016829	TTATAA	2	12	698210	698221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016829	TTTGAT	2	12	701677	701688	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016829	TATTTT	2	12	705423	705434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016829	AAGAAA	2	12	708157	708168	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016829	TGCTTA	2	12	709207	709218	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016829	AAAATA	2	12	711279	711290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016829	TAAAAA	2	12	711304	711315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016829	TAAAAT	2	12	711383	711394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016829	ATATCT	2	12	713460	713471	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016829	CAAAAA	2	12	719131	719142	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016829	AAAGAA	2	12	720065	720076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016829	ATGAAA	2	12	720714	720725	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016829	TTAAAT	2	12	745139	745150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016829	ATAAAA	2	12	745251	745262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016829	TAATGT	2	12	751922	751933	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016829	AAAGAA	2	12	754157	754168	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016829	ATTACA	2	12	762407	762418	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016829	TAAAAT	2	12	788047	788058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016829	TTTGAA	2	12	822311	822322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016829	ACTACA	2	12	822665	822676	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016829	TGGTGT	2	12	822706	822717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016829	ATGTAG	2	12	826949	826960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016829	ACAGGT	2	12	828274	828285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016829	TATAAT	2	12	837460	837471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.