MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyorhinis GDL-1 chromosome

Total Repeats: 964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016829	ATAAA	2	10	1542	1551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016829	ATTAA	2	10	1901	1910	60 %	40 %	0 %	0 %	378835508
3	NC_016829	CAAAA	2	10	2512	2521	80 %	0 %	0 %	20 %	378835508
4	NC_016829	AAAAG	2	10	4111	4120	80 %	0 %	20 %	0 %	378835510
5	NC_016829	GAATT	2	10	4871	4880	40 %	40 %	20 %	0 %	378835511
6	NC_016829	ATTTA	2	10	5966	5975	40 %	60 %	0 %	0 %	378835512
7	NC_016829	ATTTA	2	10	6686	6695	40 %	60 %	0 %	0 %	378835513
8	NC_016829	AAACA	2	10	6927	6936	80 %	0 %	0 %	20 %	378835513
9	NC_016829	AAATG	2	10	7075	7084	60 %	20 %	20 %	0 %	378835513
10	NC_016829	AAATA	2	10	7224	7233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016829	AAAAT	2	10	7684	7693	80 %	20 %	0 %	0 %	378835514
12	NC_016829	TCCAA	2	10	7721	7730	40 %	20 %	0 %	40 %	378835514
13	NC_016829	TAATT	2	10	9166	9175	40 %	60 %	0 %	0 %	378835515
14	NC_016829	TAATT	2	10	9607	9616	40 %	60 %	0 %	0 %	378835517
15	NC_016829	TTGTT	2	10	10262	10271	0 %	80 %	20 %	0 %	378835517
16	NC_016829	TTTTG	2	10	10312	10321	0 %	80 %	20 %	0 %	378835517
17	NC_016829	GTTTT	2	10	10788	10797	0 %	80 %	20 %	0 %	378835517
18	NC_016829	ATAAA	2	10	10923	10932	80 %	20 %	0 %	0 %	378835517
19	NC_016829	ACTTG	2	10	11155	11164	20 %	40 %	20 %	20 %	378835517
20	NC_016829	TGTTT	2	10	11768	11777	0 %	80 %	20 %	0 %	378835517
21	NC_016829	GATTT	2	10	13036	13045	20 %	60 %	20 %	0 %	378835518
22	NC_016829	TAAAA	2	10	13321	13330	80 %	20 %	0 %	0 %	378835518
23	NC_016829	CATTT	2	10	14478	14487	20 %	60 %	0 %	20 %	378835519
24	NC_016829	ATTTT	2	10	15899	15908	20 %	80 %	0 %	0 %	378835520
25	NC_016829	TTGAA	2	10	15946	15955	40 %	40 %	20 %	0 %	378835520
26	NC_016829	AAATA	2	10	16654	16663	80 %	20 %	0 %	0 %	378835520
27	NC_016829	TAAAA	2	10	16684	16693	80 %	20 %	0 %	0 %	378835520
28	NC_016829	ATTTT	2	10	17020	17029	20 %	80 %	0 %	0 %	378835521
29	NC_016829	TATTT	2	10	17996	18005	20 %	80 %	0 %	0 %	378835522
30	NC_016829	GAAAC	2	10	18389	18398	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016829	AAAAC	2	10	18434	18443	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016829	ACCTA	2	10	18574	18583	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016829	TCGTG	2	10	19518	19527	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016829	TTAAG	2	10	19582	19591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016829	GCTAC	2	10	19807	19816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016829	TAAAT	2	10	20157	20166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016829	GAAAA	2	10	20465	20474	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016829	AAATT	2	10	23267	23276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016829	TTTCT	2	10	25438	25447	0 %	80 %	0 %	20 %	378835526
40	NC_016829	AATTT	2	10	25848	25857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016829	TTTGC	2	10	26027	26036	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016829	ATTTT	2	10	26270	26279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016829	AGAAA	2	10	27359	27368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016829	GATTT	2	10	28293	28302	20 %	60 %	20 %	0 %	378835527
45	NC_016829	AGATT	2	10	29190	29199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016829	TTTGA	2	10	31553	31562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016829	ATTAA	2	10	32785	32794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016829	ATTTA	2	10	32910	32919	40 %	60 %	0 %	0 %	378835529
49	NC_016829	TATTT	2	10	33174	33183	20 %	80 %	0 %	0 %	378835529
50	NC_016829	TTTTG	2	10	33224	33233	0 %	80 %	20 %	0 %	378835529
51	NC_016829	TAAAA	2	10	34284	34293	80 %	20 %	0 %	0 %	378835529
52	NC_016829	AGATT	2	10	36031	36040	40 %	40 %	20 %	0 %	378835531
53	NC_016829	ATCAA	2	10	36314	36323	60 %	20 %	0 %	20 %	378835531
54	NC_016829	TTTTA	2	10	37056	37065	20 %	80 %	0 %	0 %	378835532
55	NC_016829	TTTGT	2	10	40720	40729	0 %	80 %	20 %	0 %	378835536
56	NC_016829	AAAGT	2	10	41898	41907	60 %	20 %	20 %	0 %	378835537
57	NC_016829	TTTTA	2	10	42685	42694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016829	CAAGA	2	10	43165	43174	60 %	0 %	20 %	20 %	378835538
59	NC_016829	TAAAT	2	10	43527	43536	60 %	40 %	0 %	0 %	378835538
60	NC_016829	TAAAA	2	10	43641	43650	80 %	20 %	0 %	0 %	378835538
61	NC_016829	GAATT	2	10	45837	45846	40 %	40 %	20 %	0 %	378835540
62	NC_016829	ATAAA	2	10	48107	48116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016829	TTCTT	2	10	48620	48629	0 %	80 %	0 %	20 %	378835541
64	NC_016829	TATCT	2	10	49604	49613	20 %	60 %	0 %	20 %	378835541
65	NC_016829	ATTTT	2	10	50263	50272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016829	AATTA	2	10	51635	51644	60 %	40 %	0 %	0 %	378835542
67	NC_016829	ATTTT	2	10	53717	53726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016829	AAATT	2	10	54078	54087	60 %	40 %	0 %	0 %	378835543
69	NC_016829	GTTTT	2	10	54558	54567	0 %	80 %	20 %	0 %	378835543
70	NC_016829	GAAGT	2	10	54722	54731	40 %	20 %	40 %	0 %	378835543
71	NC_016829	TTTAA	2	10	54803	54812	40 %	60 %	0 %	0 %	378835543
72	NC_016829	ATAAA	2	10	55170	55179	80 %	20 %	0 %	0 %	378835543
73	NC_016829	AAAAT	2	10	55355	55364	80 %	20 %	0 %	0 %	378835543
74	NC_016829	CAAAA	2	10	55566	55575	80 %	0 %	0 %	20 %	378835543
75	NC_016829	TAAAT	2	10	56005	56014	60 %	40 %	0 %	0 %	378835543
76	NC_016829	TCAAA	2	10	56258	56267	60 %	20 %	0 %	20 %	378835543
77	NC_016829	AAAAT	2	10	56459	56468	80 %	20 %	0 %	0 %	378835543
78	NC_016829	TAAAA	2	10	57021	57030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016829	ACAAA	2	10	57244	57253	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016829	ATTTA	2	10	58634	58643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016829	ATTTA	2	10	58737	58746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016829	AAAAG	2	10	58916	58925	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016829	TAAAA	2	10	59151	59160	80 %	20 %	0 %	0 %	378835544
84	NC_016829	CACAA	2	10	59895	59904	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016829	CATAT	2	10	60004	60013	40 %	40 %	0 %	20 %	378835546
86	NC_016829	TTACT	2	10	60229	60238	20 %	60 %	0 %	20 %	378835546
87	NC_016829	CAAAA	2	10	60484	60493	80 %	0 %	0 %	20 %	378835546
88	NC_016829	ATAAA	2	10	62733	62742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016829	TTTAA	2	10	65258	65267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016829	ATTTT	2	10	65478	65487	20 %	80 %	0 %	0 %	378835549
91	NC_016829	AATTT	2	10	65942	65951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016829	ATTTT	2	10	66453	66462	20 %	80 %	0 %	0 %	378835550
93	NC_016829	TTATT	2	10	66612	66621	20 %	80 %	0 %	0 %	378835550
94	NC_016829	GCAGT	2	10	67948	67957	20 %	20 %	40 %	20 %	378835551
95	NC_016829	AAAAT	2	10	68709	68718	80 %	20 %	0 %	0 %	378835552
96	NC_016829	AAAAG	2	10	69520	69529	80 %	0 %	20 %	0 %	378835554
97	NC_016829	AATTC	2	10	70279	70288	40 %	40 %	0 %	20 %	378835554
98	NC_016829	TCAAA	2	10	71448	71457	60 %	20 %	0 %	20 %	378835554
99	NC_016829	TAAAC	2	10	73702	73711	60 %	20 %	0 %	20 %	378835555
100	NC_016829	TCAAA	2	10	76667	76676	60 %	20 %	0 %	20 %	378835555
101	NC_016829	ATTTT	2	10	77307	77316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016829	TTATT	2	10	77842	77851	20 %	80 %	0 %	0 %	378835557
103	NC_016829	TCTAA	2	10	79731	79740	40 %	40 %	0 %	20 %	378835559
104	NC_016829	TGAAA	2	10	80195	80204	60 %	20 %	20 %	0 %	378835560
105	NC_016829	TTAAT	2	10	80334	80343	40 %	60 %	0 %	0 %	378835560
106	NC_016829	ATATG	2	10	80380	80389	40 %	40 %	20 %	0 %	378835560
107	NC_016829	ATTTG	2	10	80624	80633	20 %	60 %	20 %	0 %	378835560
108	NC_016829	TTTAG	2	10	80933	80942	20 %	60 %	20 %	0 %	378835560
109	NC_016829	AATTT	2	10	82822	82831	40 %	60 %	0 %	0 %	378835561
110	NC_016829	AAAAT	2	10	82928	82937	80 %	20 %	0 %	0 %	378835561
111	NC_016829	TCTTT	2	10	84093	84102	0 %	80 %	0 %	20 %	378835561
112	NC_016829	TAATT	2	10	84237	84246	40 %	60 %	0 %	0 %	378835561
113	NC_016829	TAGAT	2	10	84831	84840	40 %	40 %	20 %	0 %	378835562
114	NC_016829	AATCT	2	10	86216	86225	40 %	40 %	0 %	20 %	378835563
115	NC_016829	TACTT	2	10	87686	87695	20 %	60 %	0 %	20 %	378835564
116	NC_016829	TTTTA	2	10	88699	88708	20 %	80 %	0 %	0 %	378835565
117	NC_016829	TTTTC	2	10	88877	88886	0 %	80 %	0 %	20 %	378835565
118	NC_016829	AACAA	2	10	90235	90244	80 %	0 %	0 %	20 %	378835567
119	NC_016829	AGGAA	2	10	90579	90588	60 %	0 %	40 %	0 %	378835568
120	NC_016829	AATTA	2	10	92145	92154	60 %	40 %	0 %	0 %	378835570
121	NC_016829	AATTT	2	10	93508	93517	40 %	60 %	0 %	0 %	378835571
122	NC_016829	ATTTT	2	10	94259	94268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016829	AGAAA	2	10	94385	94394	80 %	0 %	20 %	0 %	378835572
124	NC_016829	ACAAA	2	10	94418	94427	80 %	0 %	0 %	20 %	378835572
125	NC_016829	AGTTC	2	10	94528	94537	20 %	40 %	20 %	20 %	378835572
126	NC_016829	CAAAG	2	10	95593	95602	60 %	0 %	20 %	20 %	378835573
127	NC_016829	TGTTA	2	10	95862	95871	20 %	60 %	20 %	0 %	378835573
128	NC_016829	AAACA	2	10	97106	97115	80 %	0 %	0 %	20 %	378835574
129	NC_016829	TAAAA	2	10	97844	97853	80 %	20 %	0 %	0 %	378835575
130	NC_016829	AATTT	2	10	97855	97864	40 %	60 %	0 %	0 %	378835575
131	NC_016829	ATTTT	2	10	97879	97888	20 %	80 %	0 %	0 %	378835575
132	NC_016829	CACAA	2	10	99217	99226	60 %	0 %	0 %	40 %	378835575
133	NC_016829	AAAAT	2	10	102328	102337	80 %	20 %	0 %	0 %	378835578
134	NC_016829	TTTAA	2	10	102967	102976	40 %	60 %	0 %	0 %	378835578
135	NC_016829	TATAA	2	10	102988	102997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016829	ACAAA	2	10	103256	103265	80 %	0 %	0 %	20 %	378835579
137	NC_016829	TAATT	2	10	104133	104142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016829	ATAAA	2	10	104228	104237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016829	CTTAC	2	10	105028	105037	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_016829	TTCTT	2	10	106675	106684	0 %	80 %	0 %	20 %	378835581
141	NC_016829	TAATT	2	10	106726	106735	40 %	60 %	0 %	0 %	378835581
142	NC_016829	CTGTT	2	10	106743	106752	0 %	60 %	20 %	20 %	378835581
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